MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016445	TCA	2	6	1232820	1232825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035528
21003	NC_016445	CAT	2	6	1232891	1232896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035528
21004	NC_016445	ACG	2	6	1232947	1232952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035528
21005	NC_016445	CAC	2	6	1232971	1232976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035528
21006	NC_016445	T	6	6	1232977	1232982	0 %	100 %	0 %	0 %	360035528
21007	NC_016445	CAC	2	6	1232984	1232989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035528
21008	NC_016445	ATC	2	6	1232990	1232995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035528
21009	NC_016445	CAC	2	6	1233007	1233012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035528
21010	NC_016445	CA	3	6	1233058	1233063	50 %	0 %	0 %	50 %	360035528
21011	NC_016445	CTG	2	6	1233094	1233099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035527
21012	NC_016445	TAT	2	6	1233109	1233114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035527
21013	NC_016445	CA	3	6	1233123	1233128	50 %	0 %	0 %	50 %	360035527
21014	NC_016445	TTGC	2	8	1233146	1233153	0 %	50 %	25 %	25 %	360035527
21015	NC_016445	CGT	2	6	1233257	1233262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035527
21016	NC_016445	GC	3	6	1233345	1233350	0 %	0 %	50 %	50 %	360035527
21017	NC_016445	GTTG	2	8	1233392	1233399	0 %	50 %	50 %	0 %	360035527
21018	NC_016445	T	6	6	1233445	1233450	0 %	100 %	0 %	0 %	360035527
21019	NC_016445	CAA	2	6	1233480	1233485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035527
21020	NC_016445	GTG	2	6	1233486	1233491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035527
21021	NC_016445	GGT	2	6	1233509	1233514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035527
21022	NC_016445	TGAT	2	8	1233556	1233563	25 %	50 %	25 %	0 %	360035527
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21024	NC_016445	GGGAT	2	10	1233681	1233690	20 %	20 %	60 %	0 %	360035527
21025	NC_016445	T	6	6	1233740	1233745	0 %	100 %	0 %	0 %	360035527
21026	NC_016445	TATT	2	8	1233777	1233784	25 %	75 %	0 %	0 %	360035527
21027	NC_016445	ATTG	2	8	1233812	1233819	25 %	50 %	25 %	0 %	360035527
21028	NC_016445	TTG	2	6	1233934	1233939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035527
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21051	NC_016445	CGC	2	6	1235609	1235614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035529
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21053	NC_016445	GTT	2	6	1235696	1235701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035530
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21063	NC_016445	GATG	2	8	1236497	1236504	25 %	25 %	50 %	0 %	360035531
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21087	NC_016445	GTA	2	6	1238734	1238739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035533
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21090	NC_016445	TTTC	2	8	1238945	1238952	0 %	75 %	0 %	25 %	360035533
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21099	NC_016445	TC	3	6	1239558	1239563	0 %	50 %	0 %	50 %	360035534
21100	NC_016445	GATG	2	8	1239828	1239835	25 %	25 %	50 %	0 %	360035535
21101	NC_016445	AAT	2	6	1239871	1239876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035535
21102	NC_016445	GTG	2	6	1239929	1239934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035535
21103	NC_016445	TTCTT	2	10	1239951	1239960	0 %	80 %	0 %	20 %	360035535
21104	NC_016445	GC	4	8	1240074	1240081	0 %	0 %	50 %	50 %	360035535
21105	NC_016445	CTG	2	6	1240088	1240093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035535
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21107	NC_016445	ATC	2	6	1240140	1240145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035535
21108	NC_016445	GAAA	2	8	1240264	1240271	75 %	0 %	25 %	0 %	360035535
21109	NC_016445	A	6	6	1240391	1240396	100 %	0 %	0 %	0 %	360035535
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21112	NC_016445	A	6	6	1240435	1240440	100 %	0 %	0 %	0 %	360035535
21113	NC_016445	ACT	2	6	1240534	1240539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035535
21114	NC_016445	AAT	2	6	1240556	1240561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035535
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21116	NC_016445	AAG	2	6	1240692	1240697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035535
21117	NC_016445	TCG	2	6	1240785	1240790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035535
21118	NC_016445	CAG	2	6	1240793	1240798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035535
21119	NC_016445	TGC	2	6	1240816	1240821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035535
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21123	NC_016445	GCC	2	6	1240988	1240993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035535
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21152	NC_016445	GAT	2	6	1242834	1242839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035536
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21202	NC_016445	TGC	2	6	1245630	1245635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035539
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21213	NC_016445	CGG	2	6	1246158	1246163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035539
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21219	NC_016445	TCT	2	6	1246435	1246440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035540
21220	NC_016445	CATA	2	8	1246470	1246477	50 %	25 %	0 %	25 %	360035540
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21225	NC_016445	TAT	2	6	1246704	1246709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035540
21226	NC_016445	TAT	2	6	1246816	1246821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035540
21227	NC_016445	TAT	2	6	1246911	1246916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035540
21228	NC_016445	GCA	2	6	1246925	1246930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035540
21229	NC_016445	CAA	3	9	1246950	1246958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035540
21230	NC_016445	TAC	2	6	1247038	1247043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035540
21231	NC_016445	GATAG	2	10	1247064	1247073	40 %	20 %	40 %	0 %	360035540
21232	NC_016445	ATC	2	6	1247086	1247091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035540
21233	NC_016445	C	6	6	1247157	1247162	0 %	0 %	0 %	100 %	360035540
21234	NC_016445	AAC	2	6	1247167	1247172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035540
21235	NC_016445	TTG	2	6	1247192	1247197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035540
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21239	NC_016445	TC	3	6	1247590	1247595	0 %	50 %	0 %	50 %	360035540
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21243	NC_016445	GCA	2	6	1247675	1247680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035540
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21246	NC_016445	A	6	6	1247718	1247723	100 %	0 %	0 %	0 %	360035540
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21250	NC_016445	ACTGA	2	10	1247833	1247842	40 %	20 %	20 %	20 %	360035540
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21255	NC_016445	CTC	2	6	1248291	1248296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360035541
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21261	NC_016445	TGG	2	6	1248695	1248700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035541
21262	NC_016445	GAT	2	6	1248735	1248740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035541
21263	NC_016445	GCC	2	6	1248862	1248867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035541
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21267	NC_016445	ATT	2	6	1249210	1249215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035541
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21314	NC_016445	CA	3	6	1251897	1251902	50 %	0 %	0 %	50 %	360035542
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21317	NC_016445	CTTG	2	8	1252107	1252114	0 %	50 %	25 %	25 %	360035542
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21320	NC_016445	TCG	2	6	1252319	1252324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035542
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21332	NC_016445	GAC	2	6	1252976	1252981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035543
21333	NC_016445	GCG	2	6	1253029	1253034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035543
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21335	NC_016445	CGA	2	6	1253105	1253110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035543
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21338	NC_016445	GTTG	2	8	1253175	1253182	0 %	50 %	50 %	0 %	360035543
21339	NC_016445	ATC	2	6	1253271	1253276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035543
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21342	NC_016445	CTG	2	6	1253573	1253578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035543
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21346	NC_016445	TGT	2	6	1253855	1253860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035543
21347	NC_016445	CAC	2	6	1253901	1253906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035543
21348	NC_016445	CATC	2	8	1253954	1253961	25 %	25 %	0 %	50 %	360035543
21349	NC_016445	GCA	2	6	1254022	1254027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035543
21350	NC_016445	ATC	2	6	1254105	1254110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035543
21351	NC_016445	CTA	2	6	1254113	1254118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035543
21352	NC_016445	ATT	2	6	1254121	1254126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035543
21353	NC_016445	TGA	2	6	1254152	1254157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035543
21354	NC_016445	TGT	2	6	1254164	1254169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035543
21355	NC_016445	CATG	2	8	1254186	1254193	25 %	25 %	25 %	25 %	360035543
21356	NC_016445	TGC	2	6	1254206	1254211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035544
21357	NC_016445	GTT	2	6	1254225	1254230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035544
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21360	NC_016445	GCT	2	6	1254554	1254559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035544
21361	NC_016445	TCT	2	6	1254569	1254574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035544
21362	NC_016445	CAGT	2	8	1254665	1254672	25 %	25 %	25 %	25 %	360035544
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21367	NC_016445	CT	3	6	1254880	1254885	0 %	50 %	0 %	50 %	360035544
21368	NC_016445	AGC	2	6	1254896	1254901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035544
21369	NC_016445	TCA	2	6	1255031	1255036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035544
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21371	NC_016445	TCA	2	6	1255116	1255121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035544
21372	NC_016445	CCA	2	6	1255163	1255168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035544
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21375	NC_016445	AGAA	2	8	1255336	1255343	75 %	0 %	25 %	0 %	360035544
21376	NC_016445	CTG	2	6	1255516	1255521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035544
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21379	NC_016445	CGC	2	6	1255660	1255665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035544
21380	NC_016445	TGAC	2	8	1255685	1255692	25 %	25 %	25 %	25 %	360035544
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21385	NC_016445	CAAC	2	8	1256086	1256093	50 %	0 %	0 %	50 %	360035544
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21389	NC_016445	AT	3	6	1256215	1256220	50 %	50 %	0 %	0 %	360035544
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21417	NC_016445	TGT	2	6	1258396	1258401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035546
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21424	NC_016445	CTTGG	2	10	1258622	1258631	0 %	40 %	40 %	20 %	360035546
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21452	NC_016445	TCG	2	6	1259960	1259965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035547
21453	NC_016445	AC	3	6	1260023	1260028	50 %	0 %	0 %	50 %	360035547
21454	NC_016445	GTC	2	6	1260133	1260138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035547
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21459	NC_016445	CAA	2	6	1260424	1260429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035547
21460	NC_016445	A	6	6	1260428	1260433	100 %	0 %	0 %	0 %	360035547
21461	NC_016445	CAA	2	6	1260519	1260524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035547
21462	NC_016445	GCTT	2	8	1260586	1260593	0 %	50 %	25 %	25 %	360035547
21463	NC_016445	TAA	2	6	1260618	1260623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035547
21464	NC_016445	GGT	2	6	1260624	1260629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035547
21465	NC_016445	CAA	2	6	1260632	1260637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035547
21466	NC_016445	GCA	2	6	1260638	1260643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035547
21467	NC_016445	CAG	2	6	1260647	1260652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035547
21468	NC_016445	AAG	2	6	1260685	1260690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035548
21469	NC_016445	TGC	2	6	1261036	1261041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035549
21470	NC_016445	CAG	2	6	1261098	1261103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035549
21471	NC_016445	ATTTT	2	10	1261115	1261124	20 %	80 %	0 %	0 %	360035549
21472	NC_016445	TCA	2	6	1261232	1261237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035549
21473	NC_016445	GATT	2	8	1261299	1261306	25 %	50 %	25 %	0 %	360035549
21474	NC_016445	T	6	6	1261318	1261323	0 %	100 %	0 %	0 %	360035549
21475	NC_016445	CGC	2	6	1261410	1261415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035549
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21477	NC_016445	TGC	2	6	1261485	1261490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035549
21478	NC_016445	GC	3	6	1261489	1261494	0 %	0 %	50 %	50 %	360035549
21479	NC_016445	CAT	2	6	1261501	1261506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035549
21480	NC_016445	GGC	2	6	1261519	1261524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035549
21481	NC_016445	TGGC	2	8	1261616	1261623	0 %	25 %	50 %	25 %	360035549
21482	NC_016445	GTG	2	6	1261634	1261639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035549
21483	NC_016445	TGC	2	6	1261654	1261659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035549
21484	NC_016445	CGT	2	6	1261688	1261693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035549
21485	NC_016445	TGT	3	9	1261767	1261775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035549
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21487	NC_016445	AAG	2	6	1261818	1261823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035549
21488	NC_016445	CTTC	2	8	1261926	1261933	0 %	50 %	0 %	50 %	360035549
21489	NC_016445	CTT	2	6	1261942	1261947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035549
21490	NC_016445	ATG	2	6	1262084	1262089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035549
21491	NC_016445	GAT	2	6	1262137	1262142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035549
21492	NC_016445	GCCC	2	8	1262158	1262165	0 %	0 %	25 %	75 %	360035549
21493	NC_016445	TTC	2	6	1262195	1262200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035549
21494	NC_016445	TCTGC	2	10	1262228	1262237	0 %	40 %	20 %	40 %	360035549
21495	NC_016445	TC	4	8	1262435	1262442	0 %	50 %	0 %	50 %	360035550
21496	NC_016445	TGC	2	6	1262463	1262468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035550
21497	NC_016445	CAA	2	6	1262663	1262668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035550
21498	NC_016445	TCGCG	2	10	1262740	1262749	0 %	20 %	40 %	40 %	360035550
21499	NC_016445	AAG	2	6	1262769	1262774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035550
21500	NC_016445	TGG	2	6	1262805	1262810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035550

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