MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20117	NC_016445	CT	3	6	1182299	1182304	0 %	50 %	0 %	50 %	360035488
20118	NC_016445	GTTC	2	8	1182322	1182329	0 %	50 %	25 %	25 %	360035488
20119	NC_016445	TGT	2	6	1182382	1182387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035488
20120	NC_016445	GCT	2	6	1182465	1182470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035488
20121	NC_016445	TCA	2	6	1182481	1182486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035488
20122	NC_016445	GCA	2	6	1182489	1182494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035488
20123	NC_016445	TTGG	2	8	1182558	1182565	0 %	50 %	50 %	0 %	360035488
20124	NC_016445	CAT	2	6	1182583	1182588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035488
20125	NC_016445	AGCG	2	8	1182602	1182609	25 %	0 %	50 %	25 %	360035488
20126	NC_016445	GGTGA	2	10	1182649	1182658	20 %	20 %	60 %	0 %	360035488
20127	NC_016445	GAT	2	6	1182703	1182708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035488
20128	NC_016445	ATC	2	6	1183198	1183203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035489
20129	NC_016445	GC	3	6	1183220	1183225	0 %	0 %	50 %	50 %	360035489
20130	NC_016445	AGC	2	6	1183253	1183258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035489
20131	NC_016445	CCGCAA	2	12	1183260	1183271	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	360035489
20132	NC_016445	AAAG	2	8	1183378	1183385	75 %	0 %	25 %	0 %	360035489
20133	NC_016445	CCGA	2	8	1183391	1183398	25 %	0 %	25 %	50 %	360035489
20134	NC_016445	TGCC	2	8	1183455	1183462	0 %	25 %	25 %	50 %	360035489
20135	NC_016445	GCCTAA	2	12	1183501	1183512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360035489
20136	NC_016445	GCA	2	6	1183523	1183528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035489
20137	NC_016445	CAC	2	6	1183537	1183542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035489
20138	NC_016445	AG	3	6	1183549	1183554	50 %	0 %	50 %	0 %	360035489
20139	NC_016445	CCA	2	6	1183664	1183669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035489
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20141	NC_016445	TGC	2	6	1183711	1183716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035489
20142	NC_016445	A	7	7	1183739	1183745	100 %	0 %	0 %	0 %	360035489
20143	NC_016445	AGA	2	6	1183755	1183760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035489
20144	NC_016445	CAAA	2	8	1183767	1183774	75 %	0 %	0 %	25 %	360035489
20145	NC_016445	ACG	2	6	1183819	1183824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035489
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20147	NC_016445	GAT	2	6	1183972	1183977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035489
20148	NC_016445	TCA	2	6	1183983	1183988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035489
20149	NC_016445	AGGT	2	8	1184129	1184136	25 %	25 %	50 %	0 %	360035489
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20152	NC_016445	GCC	2	6	1184269	1184274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035489
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20157	NC_016445	A	6	6	1184569	1184574	100 %	0 %	0 %	0 %	360035489
20158	NC_016445	TCTA	2	8	1184593	1184600	25 %	50 %	0 %	25 %	360035489
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20187	NC_016445	CT	3	6	1186625	1186630	0 %	50 %	0 %	50 %	360035491
20188	NC_016445	CTTTG	2	10	1186649	1186658	0 %	60 %	20 %	20 %	360035491
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20191	NC_016445	TCAC	2	8	1186775	1186782	25 %	25 %	0 %	50 %	360035491
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20203	NC_016445	TG	3	6	1187393	1187398	0 %	50 %	50 %	0 %	360035492
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20220	NC_016445	TGC	2	6	1188281	1188286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035493
20221	NC_016445	CG	3	6	1188339	1188344	0 %	0 %	50 %	50 %	360035493
20222	NC_016445	AGT	2	6	1188348	1188353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035493
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20231	NC_016445	ATA	2	6	1188760	1188765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035493
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20233	NC_016445	CAT	2	6	1189029	1189034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035494
20234	NC_016445	ATC	2	6	1189107	1189112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035494
20235	NC_016445	TCA	2	6	1189115	1189120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035494
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20464	NC_016445	GTC	2	6	1201836	1201841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035507
20465	NC_016445	AAT	2	6	1201865	1201870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035507
20466	NC_016445	GGC	2	6	1201903	1201908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035507
20467	NC_016445	TTG	2	6	1201958	1201963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035507
20468	NC_016445	CAA	2	6	1202020	1202025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035507
20469	NC_016445	GATA	2	8	1202029	1202036	50 %	25 %	25 %	0 %	360035507
20470	NC_016445	GGGC	2	8	1202150	1202157	0 %	0 %	75 %	25 %	360035507
20471	NC_016445	GATCG	2	10	1202237	1202246	20 %	20 %	40 %	20 %	360035507
20472	NC_016445	TCA	2	6	1202281	1202286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035507
20473	NC_016445	GGC	2	6	1202412	1202417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035507
20474	NC_016445	TGC	2	6	1202427	1202432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035507
20475	NC_016445	T	6	6	1202473	1202478	0 %	100 %	0 %	0 %	360035507
20476	NC_016445	TGCC	2	8	1202514	1202521	0 %	25 %	25 %	50 %	360035508
20477	NC_016445	CAT	2	6	1202536	1202541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035508
20478	NC_016445	TGT	2	6	1202613	1202618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035508
20479	NC_016445	TTCT	2	8	1202620	1202627	0 %	75 %	0 %	25 %	360035508
20480	NC_016445	T	6	6	1202714	1202719	0 %	100 %	0 %	0 %	360035508
20481	NC_016445	ATT	2	6	1202773	1202778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035508
20482	NC_016445	AT	3	6	1202834	1202839	50 %	50 %	0 %	0 %	360035508
20483	NC_016445	T	6	6	1202843	1202848	0 %	100 %	0 %	0 %	360035508
20484	NC_016445	GCT	2	6	1202910	1202915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035508
20485	NC_016445	CAA	2	6	1202964	1202969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035508
20486	NC_016445	TGA	2	6	1203364	1203369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035509
20487	NC_016445	CAG	2	6	1203404	1203409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035509
20488	NC_016445	CTT	2	6	1203506	1203511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035510
20489	NC_016445	GCCAA	2	10	1203515	1203524	40 %	0 %	20 %	40 %	360035510
20490	NC_016445	CGG	2	6	1203543	1203548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035510
20491	NC_016445	A	6	6	1203759	1203764	100 %	0 %	0 %	0 %	360035510
20492	NC_016445	GAC	2	6	1203782	1203787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035510
20493	NC_016445	AG	3	6	1203834	1203839	50 %	0 %	50 %	0 %	360035510
20494	NC_016445	AGC	2	6	1203910	1203915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035510
20495	NC_016445	CAT	2	6	1204017	1204022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035510
20496	NC_016445	TCA	2	6	1204069	1204074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035510
20497	NC_016445	CAT	2	6	1204088	1204093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035510
20498	NC_016445	TTG	2	6	1204098	1204103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035510
20499	NC_016445	TTTC	2	8	1204159	1204166	0 %	75 %	0 %	25 %	360035510
20500	NC_016445	GCT	3	9	1204193	1204201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035510

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