MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_016445	ATG	2	6	1145839	1145844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035454
19503	NC_016445	CTGG	2	8	1146090	1146097	0 %	25 %	50 %	25 %	360035454
19504	NC_016445	ACCGT	2	10	1146144	1146153	20 %	20 %	20 %	40 %	360035454
19505	NC_016445	GAA	2	6	1146273	1146278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035454
19506	NC_016445	CTG	2	6	1146300	1146305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035454
19507	NC_016445	TGG	2	6	1146338	1146343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035454
19508	NC_016445	ACTA	2	8	1146360	1146367	50 %	25 %	0 %	25 %	360035454
19509	NC_016445	ACCG	2	8	1146393	1146400	25 %	0 %	25 %	50 %	360035454
19510	NC_016445	TTC	2	6	1146423	1146428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035454
19511	NC_016445	TTG	2	6	1146487	1146492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035454
19512	NC_016445	AAGTG	2	10	1146508	1146517	40 %	20 %	40 %	0 %	360035454
19513	NC_016445	GAC	2	6	1146591	1146596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035454
19514	NC_016445	TTG	2	6	1146622	1146627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035454
19515	NC_016445	AATG	2	8	1146644	1146651	50 %	25 %	25 %	0 %	360035454
19516	NC_016445	ATT	2	6	1146738	1146743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035455
19517	NC_016445	TGA	2	6	1146794	1146799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035455
19518	NC_016445	TGA	2	6	1146812	1146817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035455
19519	NC_016445	CCA	2	6	1146987	1146992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035455
19520	NC_016445	ATGG	2	8	1147116	1147123	25 %	25 %	50 %	0 %	360035455
19521	NC_016445	TAAA	2	8	1147155	1147162	75 %	25 %	0 %	0 %	360035455
19522	NC_016445	GCT	2	6	1147164	1147169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035455
19523	NC_016445	TGG	2	6	1147179	1147184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035455
19524	NC_016445	TCA	2	6	1147190	1147195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035455
19525	NC_016445	CAG	2	6	1147204	1147209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035455
19526	NC_016445	GTT	2	6	1147293	1147298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035455
19527	NC_016445	CAA	2	6	1147309	1147314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035455
19528	NC_016445	ATC	4	12	1147325	1147336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035455
19529	NC_016445	AC	3	6	1147362	1147367	50 %	0 %	0 %	50 %	360035455
19530	NC_016445	TC	3	6	1147429	1147434	0 %	50 %	0 %	50 %	360035455
19531	NC_016445	T	6	6	1147481	1147486	0 %	100 %	0 %	0 %	360035455
19532	NC_016445	CAG	2	6	1147495	1147500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035455
19533	NC_016445	CGG	2	6	1147545	1147550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035455
19534	NC_016445	TAA	2	6	1147621	1147626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035455
19535	NC_016445	TGC	2	6	1147638	1147643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035455
19536	NC_016445	GCA	2	6	1147816	1147821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035456
19537	NC_016445	TACT	2	8	1147823	1147830	25 %	50 %	0 %	25 %	360035456
19538	NC_016445	CG	3	6	1147870	1147875	0 %	0 %	50 %	50 %	360035456
19539	NC_016445	T	7	7	1147877	1147883	0 %	100 %	0 %	0 %	360035456
19540	NC_016445	A	6	6	1147958	1147963	100 %	0 %	0 %	0 %	360035456
19541	NC_016445	TAA	2	6	1147965	1147970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035456
19542	NC_016445	AGCCA	2	10	1147996	1148005	40 %	0 %	20 %	40 %	360035456
19543	NC_016445	ATT	2	6	1148048	1148053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035456
19544	NC_016445	GGT	2	6	1148206	1148211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035456
19545	NC_016445	CAAC	2	8	1148214	1148221	50 %	0 %	0 %	50 %	360035456
19546	NC_016445	TTAA	2	8	1148230	1148237	50 %	50 %	0 %	0 %	360035456
19547	NC_016445	CAAC	2	8	1148301	1148308	50 %	0 %	0 %	50 %	360035456
19548	NC_016445	GAT	2	6	1148418	1148423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035456
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19550	NC_016445	TTA	2	6	1148618	1148623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035456
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19552	NC_016445	TTTG	2	8	1148758	1148765	0 %	75 %	25 %	0 %	360035456
19553	NC_016445	AC	3	6	1148863	1148868	50 %	0 %	0 %	50 %	360035456
19554	NC_016445	TGAT	2	8	1148891	1148898	25 %	50 %	25 %	0 %	360035456
19555	NC_016445	CTT	2	6	1149099	1149104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035457
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19557	NC_016445	TTGGC	2	10	1149121	1149130	0 %	40 %	40 %	20 %	360035457
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19560	NC_016445	CG	3	6	1149498	1149503	0 %	0 %	50 %	50 %	360035457
19561	NC_016445	AAGC	2	8	1149522	1149529	50 %	0 %	25 %	25 %	360035457
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19565	NC_016445	ATC	2	6	1149669	1149674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035457
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19574	NC_016445	TCCT	2	8	1150385	1150392	0 %	50 %	0 %	50 %	360035458
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19584	NC_016445	GC	3	6	1151001	1151006	0 %	0 %	50 %	50 %	360035458
19585	NC_016445	GATT	2	8	1151076	1151083	25 %	50 %	25 %	0 %	360035458
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19588	NC_016445	CAG	2	6	1151197	1151202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035458
19589	NC_016445	GCA	2	6	1151217	1151222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035458
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19593	NC_016445	GTA	2	6	1151818	1151823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035459
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19601	NC_016445	GTG	2	6	1152247	1152252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035459
19602	NC_016445	CGC	2	6	1152296	1152301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035459
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19604	NC_016445	ATG	2	6	1152348	1152353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035459
19605	NC_016445	CAG	2	6	1152429	1152434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035459
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19614	NC_016445	AGT	2	6	1152666	1152671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035459
19615	NC_016445	GGC	2	6	1152716	1152721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035460
19616	NC_016445	CGGT	2	8	1152793	1152800	0 %	25 %	50 %	25 %	360035460
19617	NC_016445	GCG	2	6	1152865	1152870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035460
19618	NC_016445	TC	3	6	1152918	1152923	0 %	50 %	0 %	50 %	360035460
19619	NC_016445	CTTC	2	8	1152975	1152982	0 %	50 %	0 %	50 %	360035460
19620	NC_016445	GAT	2	6	1153028	1153033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035460
19621	NC_016445	CGG	2	6	1153088	1153093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035460
19622	NC_016445	TGA	2	6	1153112	1153117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035460
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19625	NC_016445	CGC	2	6	1153460	1153465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035460
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19629	NC_016445	CATGGG	2	12	1153721	1153732	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	360035460
19630	NC_016445	CGC	2	6	1153778	1153783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035460
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19632	NC_016445	GCCA	2	8	1153907	1153914	25 %	0 %	25 %	50 %	360035460
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19636	NC_016445	TGA	2	6	1154124	1154129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035461
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19644	NC_016445	GTC	2	6	1154636	1154641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035461
19645	NC_016445	TGA	2	6	1154644	1154649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035461
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19650	NC_016445	TGA	2	6	1154856	1154861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035462
19651	NC_016445	CTG	2	6	1154868	1154873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035462
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19682	NC_016445	CGC	2	6	1156304	1156309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035463
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19727	NC_016445	A	6	6	1159241	1159246	100 %	0 %	0 %	0 %	360035465
19728	NC_016445	CG	3	6	1159262	1159267	0 %	0 %	50 %	50 %	360035465
19729	NC_016445	GCT	2	6	1159321	1159326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035465
19730	NC_016445	CA	3	6	1159342	1159347	50 %	0 %	0 %	50 %	360035465
19731	NC_016445	TGC	2	6	1159522	1159527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035466
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19850	NC_016445	GCA	2	6	1166753	1166758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035474
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