MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_016445	CAT	2	6	1116749	1116754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035421
19003	NC_016445	AGT	2	6	1116776	1116781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035421
19004	NC_016445	TGG	2	6	1116788	1116793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035421
19005	NC_016445	T	7	7	1116827	1116833	0 %	100 %	0 %	0 %	360035421
19006	NC_016445	ACT	2	6	1116834	1116839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035421
19007	NC_016445	CTG	2	6	1116846	1116851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035421
19008	NC_016445	GTA	2	6	1116856	1116861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035421
19009	NC_016445	ACA	2	6	1116874	1116879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035421
19010	NC_016445	GTT	2	6	1116911	1116916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035421
19011	NC_016445	TGG	2	6	1116920	1116925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035421
19012	NC_016445	CTT	2	6	1116929	1116934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035421
19013	NC_016445	T	6	6	1116948	1116953	0 %	100 %	0 %	0 %	360035421
19014	NC_016445	TTG	2	6	1116996	1117001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035421
19015	NC_016445	TC	3	6	1117019	1117024	0 %	50 %	0 %	50 %	360035422
19016	NC_016445	CCAAT	2	10	1117029	1117038	40 %	20 %	0 %	40 %	360035422
19017	NC_016445	TAA	2	6	1117063	1117068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035422
19018	NC_016445	ATC	2	6	1117103	1117108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035422
19019	NC_016445	GT	3	6	1117141	1117146	0 %	50 %	50 %	0 %	360035422
19020	NC_016445	CAT	2	6	1117255	1117260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035422
19021	NC_016445	AGG	2	6	1117283	1117288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360035422
19022	NC_016445	TAGAC	2	10	1117435	1117444	40 %	20 %	20 %	20 %	360035422
19023	NC_016445	CA	3	6	1117447	1117452	50 %	0 %	0 %	50 %	360035423
19024	NC_016445	AAAG	2	8	1117548	1117555	75 %	0 %	25 %	0 %	360035423
19025	NC_016445	TGC	2	6	1117566	1117571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035423
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19028	NC_016445	TGACC	2	10	1117758	1117767	20 %	20 %	20 %	40 %	360035424
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19032	NC_016445	AG	3	6	1118217	1118222	50 %	0 %	50 %	0 %	360035425
19033	NC_016445	TTC	2	6	1118250	1118255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035425
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19036	NC_016445	TGA	2	6	1118405	1118410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035425
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19038	NC_016445	AG	3	6	1118472	1118477	50 %	0 %	50 %	0 %	360035425
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19043	NC_016445	CAT	2	6	1118726	1118731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035425
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19051	NC_016445	T	6	6	1119543	1119548	0 %	100 %	0 %	0 %	360035426
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19055	NC_016445	TCAAC	2	10	1119827	1119836	40 %	20 %	0 %	40 %	360035426
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19061	NC_016445	GCTG	2	8	1120156	1120163	0 %	25 %	50 %	25 %	360035427
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19063	NC_016445	TTGG	2	8	1120274	1120281	0 %	50 %	50 %	0 %	360035427
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19118	NC_016445	ATTG	2	8	1123139	1123146	25 %	50 %	25 %	0 %	360035429
19119	NC_016445	CAC	2	6	1123201	1123206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035429
19120	NC_016445	T	6	6	1123271	1123276	0 %	100 %	0 %	0 %	360035429
19121	NC_016445	TGT	2	6	1123431	1123436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035429
19122	NC_016445	AATG	2	8	1123443	1123450	50 %	25 %	25 %	0 %	360035429
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19124	NC_016445	CTT	2	6	1123597	1123602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035430
19125	NC_016445	ATG	2	6	1123659	1123664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035430
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19134	NC_016445	AATG	2	8	1124408	1124415	50 %	25 %	25 %	0 %	360035431
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19231	NC_016445	CGC	2	6	1130458	1130463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035436
19232	NC_016445	CTT	2	6	1130565	1130570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035436
19233	NC_016445	CAC	2	6	1130605	1130610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035436
19234	NC_016445	GTC	2	6	1130648	1130653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035436
19235	NC_016445	AG	3	6	1130665	1130670	50 %	0 %	50 %	0 %	360035436
19236	NC_016445	TCG	2	6	1130689	1130694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035436
19237	NC_016445	CCA	2	6	1130837	1130842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035437
19238	NC_016445	CG	3	6	1130852	1130857	0 %	0 %	50 %	50 %	360035437
19239	NC_016445	CTG	2	6	1130964	1130969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035437
19240	NC_016445	GCC	2	6	1131073	1131078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035437
19241	NC_016445	CGGT	2	8	1131206	1131213	0 %	25 %	50 %	25 %	360035437
19242	NC_016445	CCG	2	6	1131229	1131234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035437
19243	NC_016445	CCA	2	6	1131239	1131244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035437
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19245	NC_016445	CCG	2	6	1131328	1131333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035438
19246	NC_016445	AATGC	2	10	1131336	1131345	40 %	20 %	20 %	20 %	360035438
19247	NC_016445	CGC	2	6	1131365	1131370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035438
19248	NC_016445	TCA	2	6	1131408	1131413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035438
19249	NC_016445	AAC	2	6	1131447	1131452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035438
19250	NC_016445	GAA	2	6	1131629	1131634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035438
19251	NC_016445	GATC	2	8	1131673	1131680	25 %	25 %	25 %	25 %	360035438
19252	NC_016445	CTT	3	9	1131685	1131693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035438
19253	NC_016445	ATTTC	2	10	1131747	1131756	20 %	60 %	0 %	20 %	360035439
19254	NC_016445	CCA	2	6	1131813	1131818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035439
19255	NC_016445	ACT	2	6	1131877	1131882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035439
19256	NC_016445	CATCA	2	10	1131895	1131904	40 %	20 %	0 %	40 %	360035439
19257	NC_016445	CCA	2	6	1131960	1131965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035439
19258	NC_016445	TTAA	2	8	1131971	1131978	50 %	50 %	0 %	0 %	360035439
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19261	NC_016445	ACC	2	6	1132173	1132178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035439
19262	NC_016445	GCC	2	6	1132189	1132194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035439
19263	NC_016445	TCA	2	6	1132254	1132259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035439
19264	NC_016445	TGC	2	6	1132270	1132275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035440
19265	NC_016445	CAC	2	6	1132305	1132310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035440
19266	NC_016445	TGCT	2	8	1132321	1132328	0 %	50 %	25 %	25 %	360035440
19267	NC_016445	GC	3	6	1132383	1132388	0 %	0 %	50 %	50 %	360035440
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19270	NC_016445	ATC	2	6	1132525	1132530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035441
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19272	NC_016445	TGC	2	6	1132669	1132674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035441
19273	NC_016445	TGT	2	6	1132679	1132684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035441
19274	NC_016445	GCT	2	6	1132721	1132726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035441
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19282	NC_016445	CTG	2	6	1133235	1133240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035441
19283	NC_016445	TGAT	2	8	1133268	1133275	25 %	50 %	25 %	0 %	360035441
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19287	NC_016445	GTTGT	2	10	1133511	1133520	0 %	60 %	40 %	0 %	360035441
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19292	NC_016445	TTGC	2	8	1133752	1133759	0 %	50 %	25 %	25 %	360035442
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19300	NC_016445	CGCA	2	8	1134236	1134243	25 %	0 %	25 %	50 %	360035442
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19302	NC_016445	CGCTTG	2	12	1134320	1134331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035442
19303	NC_016445	GA	3	6	1134381	1134386	50 %	0 %	50 %	0 %	360035442
19304	NC_016445	T	6	6	1134765	1134770	0 %	100 %	0 %	0 %	360035443
19305	NC_016445	TGG	2	6	1134803	1134808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035443
19306	NC_016445	GGT	2	6	1134818	1134823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035443
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19309	NC_016445	TGA	2	6	1135041	1135046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035443
19310	NC_016445	TAC	2	6	1135163	1135168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035443
19311	NC_016445	AGC	2	6	1135218	1135223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035443
19312	NC_016445	TGC	2	6	1135234	1135239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035443
19313	NC_016445	TC	3	6	1135360	1135365	0 %	50 %	0 %	50 %	360035443
19314	NC_016445	A	6	6	1135409	1135414	100 %	0 %	0 %	0 %	360035443
19315	NC_016445	TAC	2	6	1135439	1135444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035443
19316	NC_016445	CCAA	2	8	1135470	1135477	50 %	0 %	0 %	50 %	360035443
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19318	NC_016445	GGT	2	6	1135532	1135537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035443
19319	NC_016445	ACCT	2	8	1135571	1135578	25 %	25 %	0 %	50 %	360035443
19320	NC_016445	ACCCA	2	10	1135605	1135614	40 %	0 %	0 %	60 %	360035443
19321	NC_016445	TGG	2	6	1135624	1135629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035443
19322	NC_016445	CGC	2	6	1135630	1135635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035443
19323	NC_016445	TTC	2	6	1135688	1135693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035443
19324	NC_016445	CTA	2	6	1135792	1135797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035443
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19327	NC_016445	AGC	2	6	1135952	1135957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035443
19328	NC_016445	ACA	2	6	1136107	1136112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035444
19329	NC_016445	TGC	2	6	1136139	1136144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035444
19330	NC_016445	ATC	2	6	1136162	1136167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035444
19331	NC_016445	TTTA	2	8	1136177	1136184	25 %	75 %	0 %	0 %	360035444
19332	NC_016445	TC	3	6	1136206	1136211	0 %	50 %	0 %	50 %	360035444
19333	NC_016445	CTC	2	6	1136239	1136244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360035444
19334	NC_016445	GTTTG	2	10	1136252	1136261	0 %	60 %	40 %	0 %	360035444
19335	NC_016445	CTG	2	6	1136318	1136323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035444
19336	NC_016445	TCTTT	2	10	1136339	1136348	0 %	80 %	0 %	20 %	360035444
19337	NC_016445	ACA	2	6	1136385	1136390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035444
19338	NC_016445	TCAT	2	8	1136391	1136398	25 %	50 %	0 %	25 %	360035444
19339	NC_016445	CAT	2	6	1136461	1136466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035444
19340	NC_016445	GACC	2	8	1136545	1136552	25 %	0 %	25 %	50 %	360035444
19341	NC_016445	GCG	2	6	1136663	1136668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035444
19342	NC_016445	GCT	2	6	1136719	1136724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035444
19343	NC_016445	T	6	6	1136770	1136775	0 %	100 %	0 %	0 %	360035444
19344	NC_016445	GGC	2	6	1136810	1136815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035444
19345	NC_016445	CGG	2	6	1136818	1136823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035444
19346	NC_016445	ACC	2	6	1136828	1136833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035444
19347	NC_016445	TTG	2	6	1136865	1136870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035444
19348	NC_016445	GGC	2	6	1136882	1136887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035444
19349	NC_016445	GGT	2	6	1136902	1136907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035444
19350	NC_016445	TTG	2	6	1136952	1136957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035444
19351	NC_016445	GAT	2	6	1137217	1137222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035445
19352	NC_016445	GAT	2	6	1137262	1137267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035445
19353	NC_016445	CTG	2	6	1137341	1137346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035445
19354	NC_016445	ATT	2	6	1137362	1137367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035445
19355	NC_016445	GTG	2	6	1137380	1137385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035445
19356	NC_016445	TTC	2	6	1137458	1137463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035445
19357	NC_016445	T	6	6	1137470	1137475	0 %	100 %	0 %	0 %	360035445
19358	NC_016445	T	7	7	1137535	1137541	0 %	100 %	0 %	0 %	360035445
19359	NC_016445	ATG	2	6	1137572	1137577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035445
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19363	NC_016445	ACA	2	6	1137657	1137662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035445
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19365	NC_016445	TGG	3	9	1137771	1137779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035445
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19368	NC_016445	TCA	2	6	1137956	1137961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035446
19369	NC_016445	AG	3	6	1138034	1138039	50 %	0 %	50 %	0 %	360035446
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19398	NC_016445	TGA	2	6	1140008	1140013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035448
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19422	NC_016445	CTGTG	2	10	1141636	1141645	0 %	40 %	40 %	20 %	360035451
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19424	NC_016445	TTGC	2	8	1141688	1141695	0 %	50 %	25 %	25 %	360035451
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19451	NC_016445	GC	4	8	1142712	1142719	0 %	0 %	50 %	50 %	360035452
19452	NC_016445	CAT	2	6	1142734	1142739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035452
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19454	NC_016445	GTG	2	6	1142787	1142792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035452
19455	NC_016445	AG	3	6	1142885	1142890	50 %	0 %	50 %	0 %	360035452
19456	NC_016445	ATC	2	6	1142906	1142911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035452
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19458	NC_016445	GC	3	6	1142944	1142949	0 %	0 %	50 %	50 %	360035452
19459	NC_016445	CAAA	2	8	1143085	1143092	75 %	0 %	0 %	25 %	360035452
19460	NC_016445	GGT	2	6	1143095	1143100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035452
19461	NC_016445	GTA	2	6	1143143	1143148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035452
19462	NC_016445	TCA	2	6	1143192	1143197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035452
19463	NC_016445	CAA	2	6	1143317	1143322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035452
19464	NC_016445	CAT	2	6	1143359	1143364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035452
19465	NC_016445	TGC	2	6	1143373	1143378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035452
19466	NC_016445	CAC	2	6	1143416	1143421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035452
19467	NC_016445	TCA	2	6	1143598	1143603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035452
19468	NC_016445	ATCA	2	8	1143629	1143636	50 %	25 %	0 %	25 %	360035452
19469	NC_016445	TCA	2	6	1143735	1143740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035452
19470	NC_016445	ATC	2	6	1143746	1143751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035452
19471	NC_016445	TCT	2	6	1143867	1143872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035452
19472	NC_016445	TGA	2	6	1143879	1143884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035452
19473	NC_016445	CAC	2	6	1143964	1143969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035452
19474	NC_016445	CAA	2	6	1143982	1143987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035452
19475	NC_016445	ACC	2	6	1144001	1144006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035452
19476	NC_016445	CAC	2	6	1144045	1144050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035452
19477	NC_016445	A	6	6	1144056	1144061	100 %	0 %	0 %	0 %	360035452
19478	NC_016445	GCA	2	6	1144452	1144457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035453
19479	NC_016445	AAT	2	6	1144475	1144480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035453
19480	NC_016445	TGG	2	6	1144584	1144589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035454
19481	NC_016445	TCA	2	6	1144616	1144621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035454
19482	NC_016445	GTG	2	6	1144739	1144744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035454
19483	NC_016445	GCCG	2	8	1144745	1144752	0 %	0 %	50 %	50 %	360035454
19484	NC_016445	CGG	2	6	1144766	1144771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035454
19485	NC_016445	TGA	2	6	1144774	1144779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035454
19486	NC_016445	ATGGC	2	10	1144785	1144794	20 %	20 %	40 %	20 %	360035454
19487	NC_016445	TACC	2	8	1144805	1144812	25 %	25 %	0 %	50 %	360035454
19488	NC_016445	GGC	3	9	1144830	1144838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035454
19489	NC_016445	CAAA	2	8	1144925	1144932	75 %	0 %	0 %	25 %	360035454
19490	NC_016445	TGA	2	6	1144963	1144968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035454
19491	NC_016445	ATG	2	6	1145160	1145165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035454
19492	NC_016445	TGGA	2	8	1145194	1145201	25 %	25 %	50 %	0 %	360035454
19493	NC_016445	AATG	2	8	1145258	1145265	50 %	25 %	25 %	0 %	360035454
19494	NC_016445	GGC	2	6	1145292	1145297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035454
19495	NC_016445	AAC	2	6	1145391	1145396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035454
19496	NC_016445	TACT	2	8	1145490	1145497	25 %	50 %	0 %	25 %	360035454
19497	NC_016445	ATG	2	6	1145619	1145624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035454
19498	NC_016445	CTCA	2	8	1145736	1145743	25 %	25 %	0 %	50 %	360035454
19499	NC_016445	GC	3	6	1145763	1145768	0 %	0 %	50 %	50 %	360035454
19500	NC_016445	AGA	2	6	1145792	1145797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035454

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