MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_016445	GGAA	2	8	999685	999692	50 %	0 %	50 %	0 %	360035319
17003	NC_016445	GTAG	2	8	999754	999761	25 %	25 %	50 %	0 %	360035319
17004	NC_016445	TCT	2	6	999797	999802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035319
17005	NC_016445	AT	3	6	999818	999823	50 %	50 %	0 %	0 %	360035319
17006	NC_016445	CATTG	2	10	999862	999871	20 %	40 %	20 %	20 %	360035319
17007	NC_016445	GTG	2	6	999872	999877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035319
17008	NC_016445	TGC	3	9	999883	999891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035319
17009	NC_016445	TCT	2	6	1000124	1000129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035320
17010	NC_016445	ATC	2	6	1000247	1000252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035320
17011	NC_016445	TG	3	6	1000254	1000259	0 %	50 %	50 %	0 %	360035320
17012	NC_016445	AGA	2	6	1000282	1000287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035320
17013	NC_016445	CAACC	2	10	1000302	1000311	40 %	0 %	0 %	60 %	360035320
17014	NC_016445	CTT	2	6	1000320	1000325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035320
17015	NC_016445	CTT	2	6	1000353	1000358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035320
17016	NC_016445	GCC	2	6	1000364	1000369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035320
17017	NC_016445	GCT	2	6	1000370	1000375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035320
17018	NC_016445	TCA	2	6	1000490	1000495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035320
17019	NC_016445	GTC	2	6	1000504	1000509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035320
17020	NC_016445	ATC	2	6	1000567	1000572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035320
17021	NC_016445	AGT	2	6	1000695	1000700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035320
17022	NC_016445	GTT	2	6	1000702	1000707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035320
17023	NC_016445	T	6	6	1000776	1000781	0 %	100 %	0 %	0 %	360035320
17024	NC_016445	GCA	2	6	1000782	1000787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035320
17025	NC_016445	TCA	2	6	1000793	1000798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035320
17026	NC_016445	GTAG	2	8	1000816	1000823	25 %	25 %	50 %	0 %	360035320
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17032	NC_016445	TGA	2	6	1001337	1001342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035321
17033	NC_016445	CAT	2	6	1001346	1001351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035321
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17040	NC_016445	CAT	2	6	1001629	1001634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035321
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17098	NC_016445	AAAG	2	8	1004766	1004773	75 %	0 %	25 %	0 %	360035324
17099	NC_016445	CTAT	2	8	1004840	1004847	25 %	50 %	0 %	25 %	360035324
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17107	NC_016445	TGGTT	2	10	1005063	1005072	0 %	60 %	40 %	0 %	360035325
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17109	NC_016445	T	7	7	1005214	1005220	0 %	100 %	0 %	0 %	360035325
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17113	NC_016445	A	6	6	1005292	1005297	100 %	0 %	0 %	0 %	360035325
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17235	NC_016445	GGC	2	6	1012457	1012462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035332
17236	NC_016445	GTA	2	6	1012616	1012621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035332
17237	NC_016445	GCA	2	6	1012673	1012678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035332
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17239	NC_016445	CAT	2	6	1012832	1012837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035333
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17243	NC_016445	GAC	2	6	1013166	1013171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035333
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17345	NC_016445	TAC	2	6	1019405	1019410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035340
17346	NC_016445	CA	3	6	1019428	1019433	50 %	0 %	0 %	50 %	360035340
17347	NC_016445	TTG	2	6	1019448	1019453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035340
17348	NC_016445	GTA	2	6	1019492	1019497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035340
17349	NC_016445	CGT	2	6	1019518	1019523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035340
17350	NC_016445	ATT	2	6	1019575	1019580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035340
17351	NC_016445	TGG	2	6	1019623	1019628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035340
17352	NC_016445	CTTTA	2	10	1019719	1019728	20 %	60 %	0 %	20 %	360035340
17353	NC_016445	TA	3	6	1019727	1019732	50 %	50 %	0 %	0 %	360035340
17354	NC_016445	CAA	2	6	1019783	1019788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035340
17355	NC_016445	A	6	6	1019800	1019805	100 %	0 %	0 %	0 %	360035340
17356	NC_016445	TCA	2	6	1019806	1019811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035340
17357	NC_016445	TTG	2	6	1019817	1019822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035340
17358	NC_016445	TAC	2	6	1019859	1019864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035340
17359	NC_016445	ATG	2	6	1019880	1019885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035340
17360	NC_016445	A	7	7	1019928	1019934	100 %	0 %	0 %	0 %	360035340
17361	NC_016445	ATGG	2	8	1019978	1019985	25 %	25 %	50 %	0 %	360035340
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17366	NC_016445	GAAT	2	8	1020090	1020097	50 %	25 %	25 %	0 %	360035340
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17370	NC_016445	TTC	2	6	1020284	1020289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035341
17371	NC_016445	TGT	2	6	1020334	1020339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035341
17372	NC_016445	CAG	2	6	1020464	1020469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035341
17373	NC_016445	GGTT	2	8	1020558	1020565	0 %	50 %	50 %	0 %	360035341
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17453	NC_016445	A	6	6	1025166	1025171	100 %	0 %	0 %	0 %	360035343
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17463	NC_016445	TTA	2	6	1025569	1025574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035343
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17465	NC_016445	TAA	2	6	1025615	1025620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035343
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17469	NC_016445	TGA	2	6	1025801	1025806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035343
17470	NC_016445	TAAA	2	8	1025811	1025818	75 %	25 %	0 %	0 %	360035343
17471	NC_016445	AATG	2	8	1025819	1025826	50 %	25 %	25 %	0 %	360035343
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