MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016445	TCAC	2	8	680099	680106	25 %	25 %	0 %	50 %	360035036
11502	NC_016445	ACT	2	6	680127	680132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035036
11503	NC_016445	ACCA	2	8	680258	680265	50 %	0 %	0 %	50 %	360035036
11504	NC_016445	TTGC	2	8	680369	680376	0 %	50 %	25 %	25 %	360035036
11505	NC_016445	GTA	2	6	680384	680389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035036
11506	NC_016445	GCGGAA	2	12	680396	680407	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	360035036
11507	NC_016445	CAA	2	6	680492	680497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035037
11508	NC_016445	CGT	2	6	680528	680533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035037
11509	NC_016445	TGG	2	6	680536	680541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035037
11510	NC_016445	GTG	2	6	680544	680549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035037
11511	NC_016445	GC	3	6	680606	680611	0 %	0 %	50 %	50 %	360035037
11512	NC_016445	GAT	2	6	680644	680649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035037
11513	NC_016445	CG	3	6	680700	680705	0 %	0 %	50 %	50 %	360035037
11514	NC_016445	TTCTG	2	10	680766	680775	0 %	60 %	20 %	20 %	360035037
11515	NC_016445	A	6	6	680831	680836	100 %	0 %	0 %	0 %	360035037
11516	NC_016445	ACT	2	6	680846	680851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035037
11517	NC_016445	TG	3	6	680911	680916	0 %	50 %	50 %	0 %	360035037
11518	NC_016445	CAT	2	6	680959	680964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035037
11519	NC_016445	CTG	2	6	680969	680974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035037
11520	NC_016445	CG	3	6	680990	680995	0 %	0 %	50 %	50 %	360035037
11521	NC_016445	GATG	2	8	681004	681011	25 %	25 %	50 %	0 %	360035037
11522	NC_016445	CT	3	6	681092	681097	0 %	50 %	0 %	50 %	360035037
11523	NC_016445	TCA	2	6	681153	681158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035037
11524	NC_016445	CG	4	8	681244	681251	0 %	0 %	50 %	50 %	360035037
11525	NC_016445	CT	3	6	681305	681310	0 %	50 %	0 %	50 %	360035037
11526	NC_016445	CTAT	2	8	681349	681356	25 %	50 %	0 %	25 %	360035037
11527	NC_016445	GCG	2	6	681392	681397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035037
11528	NC_016445	ATT	2	6	681410	681415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035037
11529	NC_016445	TG	3	6	681440	681445	0 %	50 %	50 %	0 %	360035037
11530	NC_016445	A	6	6	681477	681482	100 %	0 %	0 %	0 %	360035037
11531	NC_016445	ACT	2	6	681501	681506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035037
11532	NC_016445	ACA	2	6	681574	681579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035038
11533	NC_016445	A	6	6	681579	681584	100 %	0 %	0 %	0 %	360035038
11534	NC_016445	TTG	2	6	681615	681620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035038
11535	NC_016445	GCC	2	6	681622	681627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035038
11536	NC_016445	CAAACT	2	12	681655	681666	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	360035038
11537	NC_016445	TGGTGA	2	12	681720	681731	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	360035038
11538	NC_016445	ATG	3	9	681794	681802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035038
11539	NC_016445	ATG	2	6	681834	681839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035038
11540	NC_016445	CTTGG	2	10	681893	681902	0 %	40 %	40 %	20 %	360035038
11541	NC_016445	ACC	2	6	682014	682019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035038
11542	NC_016445	CAC	2	6	682057	682062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035038
11543	NC_016445	GTG	2	6	682082	682087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035038
11544	NC_016445	T	6	6	682169	682174	0 %	100 %	0 %	0 %	360035038
11545	NC_016445	CGG	2	6	682204	682209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035038
11546	NC_016445	CAACTG	2	12	682214	682225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360035038
11547	NC_016445	GTG	2	6	682229	682234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035038
11548	NC_016445	TGA	2	6	682249	682254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035038
11549	NC_016445	CAC	2	6	682256	682261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035038
11550	NC_016445	TC	3	6	682387	682392	0 %	50 %	0 %	50 %	360035038
11551	NC_016445	GCC	2	6	682395	682400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035038
11552	NC_016445	GCC	2	6	682428	682433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035038
11553	NC_016445	CTT	2	6	682471	682476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035038
11554	NC_016445	CT	3	6	682514	682519	0 %	50 %	0 %	50 %	360035038
11555	NC_016445	CAC	2	6	682538	682543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035038
11556	NC_016445	TGA	2	6	682637	682642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035038
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11558	NC_016445	CTC	2	6	682683	682688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360035039
11559	NC_016445	CG	3	6	682733	682738	0 %	0 %	50 %	50 %	360035039
11560	NC_016445	AGCGA	2	10	682795	682804	40 %	0 %	40 %	20 %	360035039
11561	NC_016445	GAA	2	6	682906	682911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035039
11562	NC_016445	TGC	2	6	682973	682978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035039
11563	NC_016445	CA	3	6	683000	683005	50 %	0 %	0 %	50 %	360035039
11564	NC_016445	ATT	2	6	683296	683301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035040
11565	NC_016445	TTGA	2	8	683314	683321	25 %	50 %	25 %	0 %	360035040
11566	NC_016445	ACC	2	6	683405	683410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035040
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11568	NC_016445	TGG	2	6	683435	683440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035040
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11572	NC_016445	GC	3	6	683576	683581	0 %	0 %	50 %	50 %	360035040
11573	NC_016445	GTG	3	9	683587	683595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035040
11574	NC_016445	TGA	2	6	683688	683693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035040
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11576	NC_016445	TGAT	2	8	683759	683766	25 %	50 %	25 %	0 %	360035040
11577	NC_016445	GGTT	2	8	683778	683785	0 %	50 %	50 %	0 %	360035040
11578	NC_016445	GTC	2	6	683864	683869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035040
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11580	NC_016445	CG	3	6	683968	683973	0 %	0 %	50 %	50 %	360035040
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11584	NC_016445	CGGG	2	8	684250	684257	0 %	0 %	75 %	25 %	360035041
11585	NC_016445	TGC	2	6	684275	684280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035041
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11592	NC_016445	ACCG	2	8	684812	684819	25 %	0 %	25 %	50 %	360035042
11593	NC_016445	ATTG	2	8	684821	684828	25 %	50 %	25 %	0 %	360035042
11594	NC_016445	ATG	2	6	684890	684895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035042
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11605	NC_016445	TTG	2	6	685340	685345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035042
11606	NC_016445	TGC	2	6	685350	685355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035042
11607	NC_016445	ATGA	2	8	685373	685380	50 %	25 %	25 %	0 %	360035042
11608	NC_016445	CGT	2	6	685724	685729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035043
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11612	NC_016445	CT	3	6	685907	685912	0 %	50 %	0 %	50 %	360035043
11613	NC_016445	CAT	2	6	685992	685997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035043
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11619	NC_016445	T	8	8	686201	686208	0 %	100 %	0 %	0 %	360035043
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11621	NC_016445	GAA	2	6	686300	686305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035043
11622	NC_016445	GAG	2	6	686306	686311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360035043
11623	NC_016445	ATT	2	6	686669	686674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035044
11624	NC_016445	TGA	2	6	686686	686691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035044
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11983	NC_016445	TGC	2	6	708748	708753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035062
11984	NC_016445	CG	3	6	708805	708810	0 %	0 %	50 %	50 %	360035062
11985	NC_016445	CTT	3	9	708833	708841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035062
11986	NC_016445	GCTG	2	8	708894	708901	0 %	25 %	50 %	25 %	360035062
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