MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_016445	CGGA	2	8	652987	652994	25 %	0 %	50 %	25 %	360035008
11003	NC_016445	GCA	3	9	653047	653055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035008
11004	NC_016445	ATT	2	6	653340	653345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035009
11005	NC_016445	GATC	2	8	653350	653357	25 %	25 %	25 %	25 %	360035009
11006	NC_016445	GTG	2	6	653402	653407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035009
11007	NC_016445	CGC	2	6	653410	653415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035009
11008	NC_016445	TTA	2	6	653486	653491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035009
11009	NC_016445	GCT	2	6	653527	653532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035009
11010	NC_016445	TTG	2	6	653552	653557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035009
11011	NC_016445	TTG	2	6	653561	653566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035009
11012	NC_016445	GCA	2	6	653653	653658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035009
11013	NC_016445	ATT	2	6	653698	653703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035009
11014	NC_016445	ACC	2	6	653705	653710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035009
11015	NC_016445	TGA	2	6	653725	653730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035009
11016	NC_016445	CGG	2	6	653835	653840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035009
11017	NC_016445	ATG	2	6	653901	653906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035009
11018	NC_016445	A	6	6	653927	653932	100 %	0 %	0 %	0 %	360035009
11019	NC_016445	GCC	2	6	654097	654102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035010
11020	NC_016445	GAA	2	6	654343	654348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035010
11021	NC_016445	TGC	2	6	654371	654376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035010
11022	NC_016445	TAA	2	6	654384	654389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035010
11023	NC_016445	GAA	2	6	654418	654423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035010
11024	NC_016445	GGT	2	6	654504	654509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035010
11025	NC_016445	CAG	2	6	654541	654546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035010
11026	NC_016445	CAG	2	6	654574	654579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035010
11027	NC_016445	CGAGT	2	10	654665	654674	20 %	20 %	40 %	20 %	360035011
11028	NC_016445	CGA	2	6	654702	654707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035011
11029	NC_016445	GCT	2	6	654724	654729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035011
11030	NC_016445	TA	3	6	654757	654762	50 %	50 %	0 %	0 %	360035011
11031	NC_016445	GAT	2	6	654831	654836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035011
11032	NC_016445	CGG	2	6	654920	654925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035011
11033	NC_016445	CGA	2	6	655011	655016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035011
11034	NC_016445	TAA	2	6	655029	655034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035011
11035	NC_016445	GCA	2	6	655038	655043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035011
11036	NC_016445	CTT	2	6	655109	655114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035011
11037	NC_016445	TAA	2	6	655122	655127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035011
11038	NC_016445	GCT	2	6	655131	655136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035011
11039	NC_016445	CG	4	8	655141	655148	0 %	0 %	50 %	50 %	360035011
11040	NC_016445	CTCAC	2	10	655159	655168	20 %	20 %	0 %	60 %	360035011
11041	NC_016445	TCAA	2	8	655169	655176	50 %	25 %	0 %	25 %	360035011
11042	NC_016445	GGC	2	6	655239	655244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035011
11043	NC_016445	GC	3	6	655297	655302	0 %	0 %	50 %	50 %	360035011
11044	NC_016445	CTG	2	6	655324	655329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035011
11045	NC_016445	GAT	2	6	655348	655353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035011
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11047	NC_016445	GAT	2	6	655515	655520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035011
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11049	NC_016445	GC	3	6	655665	655670	0 %	0 %	50 %	50 %	360035011
11050	NC_016445	CCG	2	6	655780	655785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035011
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11052	NC_016445	ATG	2	6	655853	655858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035011
11053	NC_016445	TGC	2	6	655872	655877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035011
11054	NC_016445	CCA	2	6	655894	655899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035011
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11060	NC_016445	GAC	2	6	656477	656482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035013
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11063	NC_016445	CTGA	2	8	656798	656805	25 %	25 %	25 %	25 %	360035013
11064	NC_016445	TGA	2	6	656815	656820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035013
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11084	NC_016445	GATA	2	8	658160	658167	50 %	25 %	25 %	0 %	360035014
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11089	NC_016445	TTG	2	6	658525	658530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035014
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11094	NC_016445	TTGA	2	8	658632	658639	25 %	50 %	25 %	0 %	360035014
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11111	NC_016445	CAT	2	6	659441	659446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035015
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11119	NC_016445	CTG	2	6	659820	659825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035015
11120	NC_016445	ACC	2	6	659826	659831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035015
11121	NC_016445	TGC	2	6	659857	659862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035015
11122	NC_016445	GTT	2	6	659930	659935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035015
11123	NC_016445	CG	3	6	659960	659965	0 %	0 %	50 %	50 %	360035015
11124	NC_016445	ATTT	2	8	659980	659987	25 %	75 %	0 %	0 %	360035015
11125	NC_016445	ATG	2	6	660155	660160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035016
11126	NC_016445	GC	3	6	660193	660198	0 %	0 %	50 %	50 %	360035016
11127	NC_016445	GCAG	2	8	660205	660212	25 %	0 %	50 %	25 %	360035016
11128	NC_016445	CGAG	2	8	660291	660298	25 %	0 %	50 %	25 %	360035016
11129	NC_016445	CTG	2	6	660337	660342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035016
11130	NC_016445	TGC	3	9	660368	660376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035016
11131	NC_016445	CCT	2	6	660395	660400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360035016
11132	NC_016445	CCA	2	6	660428	660433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035016
11133	NC_016445	GAGCA	2	10	660484	660493	40 %	0 %	40 %	20 %	360035016
11134	NC_016445	GTG	2	6	660502	660507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035016
11135	NC_016445	ATGG	2	8	660526	660533	25 %	25 %	50 %	0 %	360035016
11136	NC_016445	GC	3	6	660576	660581	0 %	0 %	50 %	50 %	360035016
11137	NC_016445	TGG	2	6	660590	660595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035016
11138	NC_016445	ATG	2	6	660596	660601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035016
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11140	NC_016445	TG	3	6	660722	660727	0 %	50 %	50 %	0 %	360035016
11141	NC_016445	CCA	2	6	660765	660770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035016
11142	NC_016445	TGC	2	6	660819	660824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035016
11143	NC_016445	GAT	2	6	660828	660833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035016
11144	NC_016445	AGTC	2	8	660838	660845	25 %	25 %	25 %	25 %	360035016
11145	NC_016445	GCT	2	6	660870	660875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035016
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11154	NC_016445	GTG	2	6	661368	661373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035017
11155	NC_016445	AGCA	2	8	661402	661409	50 %	0 %	25 %	25 %	360035017
11156	NC_016445	TGA	2	6	661424	661429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035017
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11159	NC_016445	ATCA	2	8	661677	661684	50 %	25 %	0 %	25 %	360035017
11160	NC_016445	ACTTAG	2	12	661726	661737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	360035017
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11162	NC_016445	GTTT	2	8	661917	661924	0 %	75 %	25 %	0 %	360035017
11163	NC_016445	TTC	2	6	662007	662012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035018
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11168	NC_016445	GATT	2	8	662218	662225	25 %	50 %	25 %	0 %	360035018
11169	NC_016445	GCT	2	6	662230	662235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035018
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11175	NC_016445	CTG	3	9	662765	662773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035019
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11179	NC_016445	CAAC	2	8	663178	663185	50 %	0 %	0 %	50 %	360035020
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11184	NC_016445	ATTT	2	8	663305	663312	25 %	75 %	0 %	0 %	360035020
11185	NC_016445	CTG	2	6	663315	663320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035020
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11187	NC_016445	GTC	2	6	663357	663362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035020
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11190	NC_016445	TGC	2	6	663535	663540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035020
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11192	NC_016445	TGA	2	6	663554	663559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035020
11193	NC_016445	GTG	2	6	663636	663641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035020
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11201	NC_016445	GAT	2	6	663917	663922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035020
11202	NC_016445	CT	3	6	663947	663952	0 %	50 %	0 %	50 %	360035020
11203	NC_016445	ATG	2	6	663963	663968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035020
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11205	NC_016445	GCA	2	6	663996	664001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035020
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11208	NC_016445	ATC	2	6	664308	664313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035021
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11211	NC_016445	ATT	2	6	664566	664571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035021
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11213	NC_016445	AAC	2	6	664694	664699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035022
11214	NC_016445	TACA	2	8	664772	664779	50 %	25 %	0 %	25 %	360035022
11215	NC_016445	ATC	2	6	664820	664825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035022
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11219	NC_016445	GCG	2	6	664969	664974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035022
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11222	NC_016445	CAC	2	6	665177	665182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035022
11223	NC_016445	ATC	2	6	665215	665220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035022
11224	NC_016445	GCC	2	6	665233	665238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035022
11225	NC_016445	GC	3	6	665260	665265	0 %	0 %	50 %	50 %	360035022
11226	NC_016445	GT	3	6	665267	665272	0 %	50 %	50 %	0 %	360035022
11227	NC_016445	TAA	2	6	665374	665379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035022
11228	NC_016445	TGG	2	6	665491	665496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035023
11229	NC_016445	TCA	2	6	665589	665594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035023
11230	NC_016445	ATG	2	6	665597	665602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035023
11231	NC_016445	ATG	2	6	665655	665660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035023
11232	NC_016445	GAC	2	6	665692	665697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035023
11233	NC_016445	GCGT	2	8	665783	665790	0 %	25 %	50 %	25 %	360035023
11234	NC_016445	GCG	2	6	665888	665893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035023
11235	NC_016445	CT	3	6	665905	665910	0 %	50 %	0 %	50 %	360035023
11236	NC_016445	CG	3	6	665944	665949	0 %	0 %	50 %	50 %	360035023
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11238	NC_016445	TGA	2	6	666145	666150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035023
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11350	NC_016445	GGC	2	6	671518	671523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035029
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11358	NC_016445	ATC	2	6	672037	672042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035030
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11361	NC_016445	GCC	2	6	672452	672457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035031
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11460	NC_016445	CAT	2	6	678369	678374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035035
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11472	NC_016445	CG	4	8	678746	678753	0 %	0 %	50 %	50 %	360035035
11473	NC_016445	GAAGTG	2	12	678820	678831	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	360035035
11474	NC_016445	TGC	2	6	678876	678881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035035
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11477	NC_016445	CAT	2	6	678954	678959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035035
11478	NC_016445	TTG	2	6	679000	679005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035035
11479	NC_016445	AGC	2	6	679106	679111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035035
11480	NC_016445	A	6	6	679154	679159	100 %	0 %	0 %	0 %	360035035
11481	NC_016445	GATG	2	8	679381	679388	25 %	25 %	50 %	0 %	360035036
11482	NC_016445	CG	3	6	679396	679401	0 %	0 %	50 %	50 %	360035036
11483	NC_016445	ACA	3	9	679440	679448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035036
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11485	NC_016445	TG	3	6	679512	679517	0 %	50 %	50 %	0 %	360035036
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11491	NC_016445	TACGG	2	10	679748	679757	20 %	20 %	40 %	20 %	360035036
11492	NC_016445	TGA	2	6	679894	679899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035036
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