MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_016445	AAT	2	6	593193	593198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034948
10003	NC_016445	AAC	2	6	593203	593208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034949
10004	NC_016445	TGA	2	6	593229	593234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034949
10005	NC_016445	GCA	2	6	593235	593240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034949
10006	NC_016445	TGGC	2	8	593248	593255	0 %	25 %	50 %	25 %	360034949
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10008	NC_016445	AGA	2	6	593304	593309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034949
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10010	NC_016445	CAG	2	6	593482	593487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034949
10011	NC_016445	GGT	2	6	593542	593547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034949
10012	NC_016445	TGG	2	6	593646	593651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034949
10013	NC_016445	CTGC	2	8	593683	593690	0 %	25 %	25 %	50 %	360034949
10014	NC_016445	A	6	6	593737	593742	100 %	0 %	0 %	0 %	360034949
10015	NC_016445	TCT	2	6	593799	593804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034949
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10017	NC_016445	GC	3	6	593826	593831	0 %	0 %	50 %	50 %	360034949
10018	NC_016445	GCA	2	6	593919	593924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034949
10019	NC_016445	ATGC	2	8	593995	594002	25 %	25 %	25 %	25 %	360034949
10020	NC_016445	TGA	2	6	594041	594046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034949
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10022	NC_016445	GGC	2	6	594135	594140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034949
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10029	NC_016445	TGG	2	6	594578	594583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034949
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10032	NC_016445	TTG	2	6	594665	594670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034949
10033	NC_016445	ATGA	2	8	594718	594725	50 %	25 %	25 %	0 %	360034949
10034	NC_016445	TGC	2	6	594771	594776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034949
10035	NC_016445	CTTG	2	8	594813	594820	0 %	50 %	25 %	25 %	360034949
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10040	NC_016445	TTG	2	6	595066	595071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034949
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10043	NC_016445	GTG	2	6	595219	595224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034949
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10051	NC_016445	GC	3	6	595550	595555	0 %	0 %	50 %	50 %	360034950
10052	NC_016445	GCC	2	6	595623	595628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034950
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10089	NC_016445	ATT	2	6	597947	597952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034952
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10101	NC_016445	GC	3	6	598827	598832	0 %	0 %	50 %	50 %	360034954
10102	NC_016445	CAA	2	6	598972	598977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034954
10103	NC_016445	A	6	6	599181	599186	100 %	0 %	0 %	0 %	360034955
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10110	NC_016445	GTTT	2	8	599851	599858	0 %	75 %	25 %	0 %	360034956
10111	NC_016445	CG	3	6	599995	600000	0 %	0 %	50 %	50 %	360034956
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10117	NC_016445	TGCC	2	8	600577	600584	0 %	25 %	25 %	50 %	360034956
10118	NC_016445	TAC	2	6	600663	600668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034956
10119	NC_016445	TGC	2	6	600739	600744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034956
10120	NC_016445	ATG	2	6	600747	600752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034956
10121	NC_016445	CAA	2	6	600820	600825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034956
10122	NC_016445	GGC	2	6	600848	600853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034956
10123	NC_016445	ATG	2	6	600939	600944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034956
10124	NC_016445	GCA	2	6	600945	600950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034956
10125	NC_016445	TGT	2	6	601025	601030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034956
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10128	NC_016445	ACAAA	2	10	601115	601124	80 %	0 %	0 %	20 %	360034956
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10130	NC_016445	AG	3	6	601192	601197	50 %	0 %	50 %	0 %	360034956
10131	NC_016445	ATG	2	6	601228	601233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034956
10132	NC_016445	A	6	6	601329	601334	100 %	0 %	0 %	0 %	360034956
10133	NC_016445	A	6	6	601348	601353	100 %	0 %	0 %	0 %	360034956
10134	NC_016445	TTGA	2	8	601374	601381	25 %	50 %	25 %	0 %	360034956
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10137	NC_016445	CAG	2	6	601653	601658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034956
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10139	NC_016445	CAA	2	6	601876	601881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034957
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10143	NC_016445	ATG	2	6	602066	602071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034957
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10146	NC_016445	CTGC	2	8	602222	602229	0 %	25 %	25 %	50 %	360034958
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10148	NC_016445	GGT	2	6	602292	602297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034958
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10150	NC_016445	CAG	2	6	602443	602448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034958
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10156	NC_016445	GGC	2	6	602997	603002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034959
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10184	NC_016445	GC	3	6	604916	604921	0 %	0 %	50 %	50 %	360034962
10185	NC_016445	AAG	2	6	604934	604939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034962
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10201	NC_016445	GAA	2	6	605474	605479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034962
10202	NC_016445	GAT	2	6	605612	605617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034962
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10204	NC_016445	CTG	2	6	605654	605659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034962
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10219	NC_016445	GTAA	2	8	606504	606511	50 %	25 %	25 %	0 %	360034963
10220	NC_016445	T	7	7	606626	606632	0 %	100 %	0 %	0 %	360034963
10221	NC_016445	CG	3	6	606634	606639	0 %	0 %	50 %	50 %	360034963
10222	NC_016445	CAAG	2	8	606674	606681	50 %	0 %	25 %	25 %	360034963
10223	NC_016445	AAT	2	6	606729	606734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034963
10224	NC_016445	GA	3	6	606804	606809	50 %	0 %	50 %	0 %	360034963
10225	NC_016445	GGTGG	2	10	606813	606822	0 %	20 %	80 %	0 %	360034963
10226	NC_016445	AGAT	2	8	606838	606845	50 %	25 %	25 %	0 %	360034963
10227	NC_016445	CGG	2	6	606893	606898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034963
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10229	NC_016445	A	7	7	607204	607210	100 %	0 %	0 %	0 %	360034964
10230	NC_016445	GAA	2	6	607213	607218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034964
10231	NC_016445	CGAG	2	8	607233	607240	25 %	0 %	50 %	25 %	360034964
10232	NC_016445	CT	3	6	607270	607275	0 %	50 %	0 %	50 %	360034964
10233	NC_016445	GAC	2	6	607296	607301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034964
10234	NC_016445	ATG	2	6	607402	607407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034964
10235	NC_016445	A	6	6	607450	607455	100 %	0 %	0 %	0 %	360034964
10236	NC_016445	CTT	2	6	607574	607579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034965
10237	NC_016445	CAC	2	6	607622	607627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034965
10238	NC_016445	CATC	2	8	607685	607692	25 %	25 %	0 %	50 %	360034965
10239	NC_016445	ACGG	2	8	607697	607704	25 %	0 %	50 %	25 %	360034965
10240	NC_016445	TCA	2	6	607751	607756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034965
10241	NC_016445	GATG	2	8	607826	607833	25 %	25 %	50 %	0 %	360034965
10242	NC_016445	TGA	2	6	607913	607918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034965
10243	NC_016445	CAC	2	6	607949	607954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034965
10244	NC_016445	TTCGGA	2	12	608007	608018	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	360034965
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10246	NC_016445	A	6	6	608105	608110	100 %	0 %	0 %	0 %	360034965
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10250	NC_016445	ATGA	2	8	608625	608632	50 %	25 %	25 %	0 %	360034966
10251	NC_016445	CAA	2	6	608636	608641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034966
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10257	NC_016445	AAT	2	6	609117	609122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034967
10258	NC_016445	TGA	2	6	609175	609180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034967
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10265	NC_016445	TCAG	2	8	609614	609621	25 %	25 %	25 %	25 %	360034968
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10309	NC_016445	CATA	2	8	611690	611697	50 %	25 %	0 %	25 %	360034969
10310	NC_016445	TGG	2	6	611800	611805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034969
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10334	NC_016445	TGC	2	6	613404	613409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034972
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10343	NC_016445	ACC	2	6	613915	613920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034972
10344	NC_016445	CAT	2	6	614019	614024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034972
10345	NC_016445	ACG	2	6	614044	614049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034972
10346	NC_016445	ATCA	2	8	614059	614066	50 %	25 %	0 %	25 %	360034972
10347	NC_016445	GATT	2	8	614136	614143	25 %	50 %	25 %	0 %	360034972
10348	NC_016445	CAA	2	6	614162	614167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034972
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10351	NC_016445	A	6	6	614301	614306	100 %	0 %	0 %	0 %	360034973
10352	NC_016445	AGC	2	6	614469	614474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034973
10353	NC_016445	GAT	2	6	614543	614548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034973
10354	NC_016445	GC	3	6	614550	614555	0 %	0 %	50 %	50 %	360034973
10355	NC_016445	GCA	2	6	614581	614586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034973
10356	NC_016445	TGCAT	2	10	614637	614646	20 %	40 %	20 %	20 %	360034973
10357	NC_016445	CTG	3	9	614684	614692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034973
10358	NC_016445	CAT	2	6	614716	614721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034973
10359	NC_016445	AAGTGC	2	12	614763	614774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	360034973
10360	NC_016445	TGT	2	6	614849	614854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034974
10361	NC_016445	ACT	2	6	614900	614905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034974
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10373	NC_016445	CTAT	2	8	615557	615564	25 %	50 %	0 %	25 %	360034974
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10477	NC_016445	TGAAC	2	10	621443	621452	40 %	20 %	20 %	20 %	360034978
10478	NC_016445	TGG	2	6	621476	621481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034978
10479	NC_016445	A	6	6	621547	621552	100 %	0 %	0 %	0 %	360034978
10480	NC_016445	TGC	2	6	621595	621600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034978
10481	NC_016445	GC	3	6	621599	621604	0 %	0 %	50 %	50 %	360034978
10482	NC_016445	TGAA	2	8	621643	621650	50 %	25 %	25 %	0 %	360034978
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