MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 162068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014931	GC	3	6	518832	518837	0 %	0 %	50 %	50 %	319791172
13002	NC_014931	CGAC	2	8	518850	518857	25 %	0 %	25 %	50 %	319791172
13003	NC_014931	CGA	2	6	518863	518868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791172
13004	NC_014931	TGA	2	6	518880	518885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791172
13005	NC_014931	AGA	2	6	518886	518891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791172
13006	NC_014931	CACGTA	2	12	518899	518910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319791172
13007	NC_014931	ACC	2	6	518988	518993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791172
13008	NC_014931	CG	3	6	519004	519009	0 %	0 %	50 %	50 %	319791172
13009	NC_014931	GC	3	6	519013	519018	0 %	0 %	50 %	50 %	319791172
13010	NC_014931	GGC	2	6	519028	519033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791172
13011	NC_014931	TGC	2	6	519069	519074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791172
13012	NC_014931	TGA	2	6	519090	519095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791172
13013	NC_014931	GCG	2	6	519099	519104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791172
13014	NC_014931	GC	3	6	519124	519129	0 %	0 %	50 %	50 %	319791172
13015	NC_014931	CTT	2	6	519187	519192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791172
13016	NC_014931	CCT	2	6	519193	519198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319791172
13017	NC_014931	AAC	2	6	519254	519259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791172
13018	NC_014931	TAC	2	6	519272	519277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791172
13019	NC_014931	GC	3	6	519293	519298	0 %	0 %	50 %	50 %	319791172
13020	NC_014931	GCG	2	6	519324	519329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791172
13021	NC_014931	CGC	2	6	519331	519336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791172
13022	NC_014931	CGC	2	6	519360	519365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791172
13023	NC_014931	TGC	2	6	519393	519398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791172
13024	NC_014931	CCG	2	6	519426	519431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791172
13025	NC_014931	ACG	2	6	519453	519458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791172
13026	NC_014931	ACG	2	6	519504	519509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791172
13027	NC_014931	TGG	2	6	519522	519527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791172
13028	NC_014931	ACG	2	6	519528	519533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791172
13029	NC_014931	CGC	2	6	519565	519570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791172
13030	NC_014931	TGC	2	6	519582	519587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791172
13031	NC_014931	GAA	2	6	519648	519653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791173
13032	NC_014931	ATC	2	6	519691	519696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791173
13033	NC_014931	GCG	2	6	519785	519790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791173
13034	NC_014931	CGC	2	6	519842	519847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791173
13035	NC_014931	GCC	2	6	519865	519870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791173
13036	NC_014931	CGC	2	6	519878	519883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791173
13037	NC_014931	GCC	2	6	519886	519891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791173
13038	NC_014931	CCGGT	2	10	519893	519902	0 %	20 %	40 %	40 %	319791173
13039	NC_014931	CCA	2	6	519926	519931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791173
13040	NC_014931	CAC	2	6	519933	519938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791173
13041	NC_014931	CGC	2	6	519956	519961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791173
13042	NC_014931	CACCG	2	10	519969	519978	20 %	0 %	20 %	60 %	319791173
13043	NC_014931	GTG	2	6	519985	519990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791173
13044	NC_014931	GCCG	2	8	520023	520030	0 %	0 %	50 %	50 %	319791173
13045	NC_014931	CG	3	6	520084	520089	0 %	0 %	50 %	50 %	319791173
13046	NC_014931	GCA	2	6	520103	520108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791173
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13050	NC_014931	CAC	2	6	520212	520217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791173
13051	NC_014931	CGA	2	6	520218	520223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791173
13052	NC_014931	GC	3	6	520236	520241	0 %	0 %	50 %	50 %	319791173
13053	NC_014931	GC	3	6	520314	520319	0 %	0 %	50 %	50 %	319791173
13054	NC_014931	CAA	2	6	520329	520334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791173
13055	NC_014931	GGC	3	9	520372	520380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791173
13056	NC_014931	GACC	2	8	520412	520419	25 %	0 %	25 %	50 %	319791173
13057	NC_014931	CGT	2	6	520580	520585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791174
13058	NC_014931	GCC	2	6	520598	520603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791174
13059	NC_014931	GCT	2	6	520615	520620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791174
13060	NC_014931	GCC	2	6	520628	520633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791174
13061	NC_014931	GC	3	6	520652	520657	0 %	0 %	50 %	50 %	319791174
13062	NC_014931	CCGG	2	8	520715	520722	0 %	0 %	50 %	50 %	319791174
13063	NC_014931	GGT	2	6	520732	520737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791174
13064	NC_014931	TTC	2	6	520742	520747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791174
13065	NC_014931	CCG	2	6	520828	520833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791174
13066	NC_014931	ACG	2	6	520857	520862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791174
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13068	NC_014931	TAC	2	6	520883	520888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791174
13069	NC_014931	CGA	2	6	520912	520917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791174
13070	NC_014931	AGC	2	6	520950	520955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791174
13071	NC_014931	CAT	2	6	520981	520986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791174
13072	NC_014931	GC	3	6	521068	521073	0 %	0 %	50 %	50 %	319791174
13073	NC_014931	TGGC	2	8	521100	521107	0 %	25 %	50 %	25 %	319791174
13074	NC_014931	TGGCCG	2	12	521118	521129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319791174
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13076	NC_014931	TGC	2	6	521175	521180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791174
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13081	NC_014931	TCGT	2	8	521450	521457	0 %	50 %	25 %	25 %	319791175
13082	NC_014931	GCC	2	6	521465	521470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791175
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13084	NC_014931	GGCC	2	8	521493	521500	0 %	0 %	50 %	50 %	319791175
13085	NC_014931	CCG	2	6	521525	521530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791175
13086	NC_014931	GCA	2	6	521534	521539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791175
13087	NC_014931	ACG	2	6	521573	521578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791175
13088	NC_014931	ATC	3	9	521632	521640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791175
13089	NC_014931	GC	4	8	521645	521652	0 %	0 %	50 %	50 %	319791175
13090	NC_014931	GC	3	6	521715	521720	0 %	0 %	50 %	50 %	319791175
13091	NC_014931	TAC	2	6	521722	521727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791175
13092	NC_014931	CGA	2	6	521748	521753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791175
13093	NC_014931	CCA	2	6	521825	521830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791175
13094	NC_014931	GCT	2	6	521838	521843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791175
13095	NC_014931	ACG	2	6	521858	521863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791175
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13100	NC_014931	ACC	2	6	522094	522099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791175
13101	NC_014931	CCG	2	6	522139	522144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791176
13102	NC_014931	CGT	2	6	522221	522226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
13103	NC_014931	GTC	2	6	522261	522266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
13104	NC_014931	TCG	2	6	522316	522321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
13105	NC_014931	GC	3	6	522329	522334	0 %	0 %	50 %	50 %	319791176
13106	NC_014931	CCG	2	6	522389	522394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791176
13107	NC_014931	CG	4	8	522393	522400	0 %	0 %	50 %	50 %	319791176
13108	NC_014931	GC	3	6	522467	522472	0 %	0 %	50 %	50 %	319791176
13109	NC_014931	CGA	2	6	522497	522502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791176
13110	NC_014931	GGT	2	6	522512	522517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791176
13111	NC_014931	GAA	2	6	522527	522532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791176
13112	NC_014931	GAG	2	6	522540	522545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319791176
13113	NC_014931	CTG	2	6	522558	522563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
13114	NC_014931	GCG	2	6	522616	522621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791176
13115	NC_014931	CGC	3	9	522624	522632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791176
13116	NC_014931	GC	5	10	522642	522651	0 %	0 %	50 %	50 %	319791176
13117	NC_014931	CTG	2	6	522675	522680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
13118	NC_014931	ATC	2	6	522732	522737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791176
13119	NC_014931	TCA	2	6	522769	522774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791176
13120	NC_014931	CGTG	2	8	522785	522792	0 %	25 %	50 %	25 %	319791176
13121	NC_014931	TCA	3	9	522820	522828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791176
13122	NC_014931	TCG	2	6	522868	522873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
13123	NC_014931	AGGG	2	8	522923	522930	25 %	0 %	75 %	0 %	319791176
13124	NC_014931	GCA	2	6	522971	522976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
13125	NC_014931	GCA	2	6	522998	523003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
13126	NC_014931	GCT	2	6	523013	523018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791177
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13131	NC_014931	CG	3	6	523147	523152	0 %	0 %	50 %	50 %	319791177
13132	NC_014931	ACG	2	6	523153	523158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
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