MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vulcanisaeta distributa DSM 14429 chromosome

Total Repeats: 43673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014537	TAT	2	6	7	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594150
2	NC_014537	ATTA	2	8	25	32	50 %	50 %	0 %	0 %	307594150
3	NC_014537	TTC	2	6	86	91	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307594150
4	NC_014537	TCT	2	6	178	183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307594150
5	NC_014537	ATT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594150
6	NC_014537	GTT	2	6	314	319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594150
7	NC_014537	TAA	2	6	342	347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594150
8	NC_014537	ATTA	2	8	370	377	50 %	50 %	0 %	0 %	307594150
9	NC_014537	GAG	2	6	385	390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307594150
10	NC_014537	AT	3	6	407	412	50 %	50 %	0 %	0 %	307594150
11	NC_014537	TTA	2	6	435	440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594150
12	NC_014537	ATAC	2	8	625	632	50 %	25 %	0 %	25 %	307594151
13	NC_014537	GAA	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307594151
14	NC_014537	AGC	2	6	666	671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307594151
15	NC_014537	GTG	2	6	788	793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307594151
16	NC_014537	TGA	2	6	982	987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594151
17	NC_014537	AAT	2	6	1004	1009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594151
18	NC_014537	GAG	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307594151
19	NC_014537	CTT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307594151
20	NC_014537	AGG	2	6	1224	1229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307594151
21	NC_014537	ATG	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594151
22	NC_014537	GAT	2	6	1267	1272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594151
23	NC_014537	TGA	2	6	1291	1296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594151
24	NC_014537	TGA	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594151
25	NC_014537	GAA	2	6	1513	1518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307594151
26	NC_014537	CATA	2	8	1530	1537	50 %	25 %	0 %	25 %	307594151
27	NC_014537	AC	3	6	1603	1608	50 %	0 %	0 %	50 %	307594151
28	NC_014537	TTG	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594151
29	NC_014537	AGG	2	6	1734	1739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307594151
30	NC_014537	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307594151
31	NC_014537	AGA	2	6	1791	1796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307594152
32	NC_014537	TCA	2	6	1804	1809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594152
33	NC_014537	TTAGGG	2	12	1814	1825	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307594152
34	NC_014537	AGG	2	6	1850	1855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307594152
35	NC_014537	GAG	2	6	1945	1950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307594152
36	NC_014537	TAGGAT	2	12	1962	1973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594152
37	NC_014537	GCAT	2	8	2037	2044	25 %	25 %	25 %	25 %	307594152
38	NC_014537	CCCT	2	8	2142	2149	0 %	25 %	0 %	75 %	307594153
39	NC_014537	CCT	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594153
40	NC_014537	TCC	2	6	2196	2201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594153
41	NC_014537	AC	3	6	2289	2294	50 %	0 %	0 %	50 %	307594153
42	NC_014537	CGC	2	6	2366	2371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307594153
43	NC_014537	AAC	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307594153
44	NC_014537	CCA	2	6	2424	2429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307594153
45	NC_014537	TAA	2	6	2485	2490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594153
46	NC_014537	ACG	2	6	2607	2612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307594153
47	NC_014537	AAG	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307594153
48	NC_014537	TTA	2	6	2722	2727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594153
49	NC_014537	ATT	2	6	2831	2836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594153
50	NC_014537	AAT	2	6	2847	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594153
51	NC_014537	CCT	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594153
52	NC_014537	AGG	2	6	3027	3032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307594154
53	NC_014537	CCTC	2	8	3049	3056	0 %	25 %	0 %	75 %	307594154
54	NC_014537	TCA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594154
55	NC_014537	TTG	2	6	3199	3204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594154
56	NC_014537	CTA	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594154
57	NC_014537	ACA	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307594154
58	NC_014537	CCTT	2	8	3244	3251	0 %	50 %	0 %	50 %	307594154
59	NC_014537	TAA	2	6	3268	3273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594154
60	NC_014537	TGTAT	2	10	3357	3366	20 %	60 %	20 %	0 %	307594154
61	NC_014537	GAA	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307594154
62	NC_014537	CTC	2	6	3812	3817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594154
63	NC_014537	GCC	2	6	3852	3857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307594154
64	NC_014537	TTA	2	6	3991	3996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594155
65	NC_014537	GTATT	2	10	4011	4020	20 %	60 %	20 %	0 %	307594155
66	NC_014537	GTT	2	6	4106	4111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594155
67	NC_014537	GAT	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594155
68	NC_014537	AATT	2	8	4179	4186	50 %	50 %	0 %	0 %	307594155
69	NC_014537	GCCT	2	8	4238	4245	0 %	25 %	25 %	50 %	307594155
70	NC_014537	GCA	2	6	4288	4293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307594155
71	NC_014537	GCG	2	6	4377	4382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307594155
72	NC_014537	GTTG	2	8	4388	4395	0 %	50 %	50 %	0 %	307594155
73	NC_014537	GCA	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307594155
74	NC_014537	CTT	2	6	4489	4494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307594155
75	NC_014537	TCA	2	6	4544	4549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594155
76	NC_014537	AATT	2	8	4677	4684	50 %	50 %	0 %	0 %	307594155
77	NC_014537	CAT	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594155
78	NC_014537	TAA	2	6	4839	4844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594155
79	NC_014537	TCA	2	6	4848	4853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594155
80	NC_014537	TA	3	6	4898	4903	50 %	50 %	0 %	0 %	307594155
81	NC_014537	AGT	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594155
82	NC_014537	GTT	2	6	5005	5010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594155
83	NC_014537	ATA	2	6	5024	5029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594155
84	NC_014537	ATGA	2	8	5104	5111	50 %	25 %	25 %	0 %	307594156
85	NC_014537	AAC	2	6	5122	5127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307594156
86	NC_014537	GTT	2	6	5186	5191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594156
87	NC_014537	TAA	2	6	5245	5250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594156
88	NC_014537	GTA	2	6	5294	5299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594156
89	NC_014537	ATT	2	6	5385	5390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594156
90	NC_014537	TAC	2	6	5401	5406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594156
91	NC_014537	GCG	2	6	5459	5464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307594156
92	NC_014537	ATT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594156
93	NC_014537	ATC	2	6	5637	5642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594156
94	NC_014537	CAT	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594156
95	NC_014537	GAG	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307594156
96	NC_014537	ATT	2	6	5850	5855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594156
97	NC_014537	CAA	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307594156
98	NC_014537	TCC	2	6	5929	5934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594156
99	NC_014537	ATT	2	6	5986	5991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594156
100	NC_014537	TC	3	6	6053	6058	0 %	50 %	0 %	50 %	307594156
101	NC_014537	AGTG	2	8	6094	6101	25 %	25 %	50 %	0 %	307594156
102	NC_014537	GTT	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594156
103	NC_014537	GTT	2	6	6146	6151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594156
104	NC_014537	ATGA	2	8	6206	6213	50 %	25 %	25 %	0 %	307594157
105	NC_014537	TCT	2	6	6249	6254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307594157
106	NC_014537	AC	3	6	6308	6313	50 %	0 %	0 %	50 %	307594157
107	NC_014537	TCT	3	9	6354	6362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307594157
108	NC_014537	TCT	2	6	6369	6374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307594157
109	NC_014537	TCC	2	6	6395	6400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594157
110	NC_014537	TCC	2	6	6497	6502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594157
111	NC_014537	ATT	2	6	6518	6523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594157
112	NC_014537	CAA	2	6	6544	6549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307594157
113	NC_014537	CTC	2	6	6562	6567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594157
114	NC_014537	TTA	2	6	6623	6628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594157
115	NC_014537	CTC	2	6	6853	6858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594157
116	NC_014537	ACT	2	6	6958	6963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594157
117	NC_014537	CAA	2	6	7043	7048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307594158
118	NC_014537	GATA	2	8	7070	7077	50 %	25 %	25 %	0 %	307594158
119	NC_014537	CT	3	6	7112	7117	0 %	50 %	0 %	50 %	307594158
120	NC_014537	CCT	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594158
121	NC_014537	TGC	2	6	7240	7245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307594158
122	NC_014537	GGC	2	6	7374	7379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307594158
123	NC_014537	CCT	2	6	7545	7550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594158
124	NC_014537	AGC	2	6	7553	7558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307594158
125	NC_014537	CTC	2	6	7681	7686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594159
126	NC_014537	ATC	2	6	7736	7741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594159
127	NC_014537	CTA	2	6	7751	7756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594159
128	NC_014537	ATT	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594159
129	NC_014537	AAT	2	6	7925	7930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594160
130	NC_014537	T	6	6	7952	7957	0 %	100 %	0 %	0 %	307594160
131	NC_014537	CAT	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594160
132	NC_014537	AAT	2	6	8070	8075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594160
133	NC_014537	TAACT	2	10	8123	8132	40 %	40 %	0 %	20 %	307594160
134	NC_014537	AGCCCT	2	12	8153	8164	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307594160
135	NC_014537	CTGA	2	8	8230	8237	25 %	25 %	25 %	25 %	307594160
136	NC_014537	TA	3	6	8296	8301	50 %	50 %	0 %	0 %	307594160
137	NC_014537	GTA	2	6	8303	8308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594160
138	NC_014537	TAA	2	6	8321	8326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594160
139	NC_014537	ATA	2	6	8397	8402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594160
140	NC_014537	ACCC	2	8	8413	8420	25 %	0 %	0 %	75 %	307594160
141	NC_014537	TTA	2	6	8481	8486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594160
142	NC_014537	TCA	2	6	8606	8611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594161
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144	NC_014537	TAT	2	6	8680	8685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594161
145	NC_014537	TAC	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594161
146	NC_014537	AGT	2	6	8829	8834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594161
147	NC_014537	TTAAC	2	10	8859	8868	40 %	40 %	0 %	20 %	307594161
148	NC_014537	GTT	2	6	8894	8899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594161
149	NC_014537	TAG	2	6	8917	8922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594161
150	NC_014537	ATG	2	6	8945	8950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594161
151	NC_014537	ATT	2	6	8951	8956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594161
152	NC_014537	GAA	2	6	9022	9027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307594161
153	NC_014537	AATT	2	8	9060	9067	50 %	50 %	0 %	0 %	307594161
154	NC_014537	AAT	2	6	9094	9099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594161
155	NC_014537	AGT	2	6	9101	9106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594161
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158	NC_014537	TAG	2	6	9353	9358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594162
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167	NC_014537	CGTTA	2	10	9573	9582	20 %	40 %	20 %	20 %	307594162
168	NC_014537	CCT	2	6	9587	9592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594162
169	NC_014537	TTG	2	6	9743	9748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594163
170	NC_014537	TGA	2	6	9750	9755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594163
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173	NC_014537	GTT	2	6	10305	10310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594163
174	NC_014537	TA	3	6	10351	10356	50 %	50 %	0 %	0 %	307594163
175	NC_014537	TGA	2	6	10497	10502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594163
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177	NC_014537	GTGTTG	2	12	10526	10537	0 %	50 %	50 %	0 %	307594163
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221	NC_014537	AACT	2	8	12699	12706	50 %	25 %	0 %	25 %	307594165
222	NC_014537	TGTC	2	8	12714	12721	0 %	50 %	25 %	25 %	307594165
223	NC_014537	TC	3	6	12720	12725	0 %	50 %	0 %	50 %	307594165
224	NC_014537	ATC	2	6	12744	12749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307594165
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244	NC_014537	CCT	2	6	14135	14140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594166
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247	NC_014537	TAT	2	6	14310	14315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594166
248	NC_014537	TGA	3	9	14392	14400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594166
249	NC_014537	GT	3	6	14416	14421	0 %	50 %	50 %	0 %	307594166
250	NC_014537	AGCC	2	8	14524	14531	25 %	0 %	25 %	50 %	307594166
251	NC_014537	AAT	2	6	14556	14561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594166
252	NC_014537	CCT	2	6	14703	14708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594166
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254	NC_014537	TAT	2	6	14760	14765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594166
255	NC_014537	CCT	3	9	15018	15026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594167
256	NC_014537	CTT	2	6	15040	15045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307594167
257	NC_014537	CTC	2	6	15046	15051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594167
258	NC_014537	CCT	3	9	15057	15065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594167
259	NC_014537	CTT	2	6	15079	15084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307594167
260	NC_014537	CTC	2	6	15085	15090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594167
261	NC_014537	CCT	2	6	15099	15104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307594167
262	NC_014537	CTG	2	6	15115	15120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307594167
263	NC_014537	GCT	2	6	15123	15128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307594167
264	NC_014537	GTAT	2	8	15210	15217	25 %	50 %	25 %	0 %	307594167
265	NC_014537	TTA	2	6	15411	15416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307594167
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384	NC_014537	TAA	2	6	22080	22085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307594177
385	NC_014537	TGT	2	6	22125	22130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307594177
386	NC_014537	TA	3	6	22177	22182	50 %	50 %	0 %	0 %	307594177
387	NC_014537	AC	3	6	22205	22210	50 %	0 %	0 %	50 %	307594177
388	NC_014537	GTATGA	2	12	22221	22232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307594177
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