MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012668	TG	3	6	178	183	0 %	50 %	50 %	0 %	229606123
2	NC_012668	CTG	2	6	205	210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606123
3	NC_012668	TG	4	8	363	370	0 %	50 %	50 %	0 %	229606123
4	NC_012668	CGC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606123
5	NC_012668	TGG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606123
6	NC_012668	AAG	2	6	479	484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606123
7	NC_012668	AT	3	6	705	710	50 %	50 %	0 %	0 %	229606123
8	NC_012668	TTC	2	6	798	803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606124
9	NC_012668	CGC	2	6	836	841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606124
10	NC_012668	CGT	3	9	919	927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606124
11	NC_012668	AGA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606124
12	NC_012668	GAA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606124
13	NC_012668	TTG	2	6	1095	1100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606124
14	NC_012668	CT	3	6	1112	1117	0 %	50 %	0 %	50 %	229606124
15	NC_012668	GCTT	2	8	1208	1215	0 %	50 %	25 %	25 %	229606124
16	NC_012668	AGA	2	6	1261	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606124
17	NC_012668	TAA	2	6	1339	1344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606124
18	NC_012668	GC	3	6	1385	1390	0 %	0 %	50 %	50 %	229606124
19	NC_012668	GTG	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606124
20	NC_012668	GAT	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606124
21	NC_012668	ATCA	2	8	1441	1448	50 %	25 %	0 %	25 %	229606124
22	NC_012668	TGCG	2	8	1470	1477	0 %	25 %	50 %	25 %	229606124
23	NC_012668	GCAC	2	8	1514	1521	25 %	0 %	25 %	50 %	229606124
24	NC_012668	CAG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606124
25	NC_012668	AAGC	2	8	1547	1554	50 %	0 %	25 %	25 %	229606124
26	NC_012668	TGAT	2	8	1593	1600	25 %	50 %	25 %	0 %	229606124
27	NC_012668	GAA	3	9	1643	1651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606124
28	NC_012668	CCTTTG	2	12	1731	1742	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	229606125
29	NC_012668	AAT	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606125
30	NC_012668	CA	3	6	1760	1765	50 %	0 %	0 %	50 %	229606125
31	NC_012668	CCA	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606125
32	NC_012668	GCA	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606125
33	NC_012668	CCA	2	6	1932	1937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606125
34	NC_012668	GCG	2	6	1948	1953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606125
35	NC_012668	ATC	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606125
36	NC_012668	AATC	2	8	2012	2019	50 %	25 %	0 %	25 %	229606125
37	NC_012668	ACC	2	6	2034	2039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606125
38	NC_012668	AAT	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606125
39	NC_012668	ACAA	2	8	2094	2101	75 %	0 %	0 %	25 %	229606125
40	NC_012668	CAA	2	6	2132	2137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606125
41	NC_012668	CG	3	6	2142	2147	0 %	0 %	50 %	50 %	229606125
42	NC_012668	CGC	2	6	2149	2154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606125
43	NC_012668	AAAG	2	8	2237	2244	75 %	0 %	25 %	0 %	229606125
44	NC_012668	CAT	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606125
45	NC_012668	GAT	2	6	2366	2371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606125
46	NC_012668	TTG	2	6	2552	2557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606126
47	NC_012668	T	6	6	2622	2627	0 %	100 %	0 %	0 %	229606126
48	NC_012668	CCA	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606126
49	NC_012668	CTG	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606126
50	NC_012668	TGG	2	6	2757	2762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606126
51	NC_012668	CGC	2	6	2778	2783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606126
52	NC_012668	ATG	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606126
53	NC_012668	CTT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606126
54	NC_012668	AGTG	2	8	2832	2839	25 %	25 %	50 %	0 %	229606126
55	NC_012668	TCA	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606126
56	NC_012668	CAG	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606126
57	NC_012668	ATC	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606126
58	NC_012668	GCC	2	6	2995	3000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606126
59	NC_012668	AG	3	6	3001	3006	50 %	0 %	50 %	0 %	229606126
60	NC_012668	CG	3	6	3064	3069	0 %	0 %	50 %	50 %	229606126
61	NC_012668	TGC	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606126
62	NC_012668	GATGA	2	10	3257	3266	40 %	20 %	40 %	0 %	229606126
63	NC_012668	TGG	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606126
64	NC_012668	CAG	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606126
65	NC_012668	T	6	6	3325	3330	0 %	100 %	0 %	0 %	229606126
66	NC_012668	GTT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606126
67	NC_012668	T	6	6	3905	3910	0 %	100 %	0 %	0 %	229606127
68	NC_012668	GCCAA	2	10	3976	3985	40 %	0 %	20 %	40 %	229606127
69	NC_012668	ATCA	2	8	3993	4000	50 %	25 %	0 %	25 %	229606127
70	NC_012668	ATC	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606127
71	NC_012668	CTG	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606127
72	NC_012668	ATC	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606127
73	NC_012668	CAG	2	6	4137	4142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606127
74	NC_012668	CAT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606127
75	NC_012668	AC	3	6	4256	4261	50 %	0 %	0 %	50 %	229606127
76	NC_012668	ATG	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606127
77	NC_012668	CCA	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606127
78	NC_012668	ACC	2	6	4456	4461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606127
79	NC_012668	TGG	2	6	4538	4543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606127
80	NC_012668	AAT	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606127
81	NC_012668	GA	3	6	4638	4643	50 %	0 %	50 %	0 %	229606127
82	NC_012668	ATCA	2	8	4704	4711	50 %	25 %	0 %	25 %	229606127
83	NC_012668	GAC	2	6	4746	4751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606127
84	NC_012668	ATC	2	6	4794	4799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606127
85	NC_012668	ACG	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606127
86	NC_012668	CTTG	2	8	4862	4869	0 %	50 %	25 %	25 %	229606127
87	NC_012668	A	8	8	4885	4892	100 %	0 %	0 %	0 %	229606127
88	NC_012668	CCA	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606127
89	NC_012668	GTG	2	6	5012	5017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606127
90	NC_012668	CAT	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606127
91	NC_012668	CGC	2	6	5166	5171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606127
92	NC_012668	CCA	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606127
93	NC_012668	GGA	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606127
94	NC_012668	GGC	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606127
95	NC_012668	A	6	6	5283	5288	100 %	0 %	0 %	0 %	229606127
96	NC_012668	ACGCTA	2	12	5348	5359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229606127
97	NC_012668	ATG	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606127
98	NC_012668	GGT	2	6	5379	5384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606127
99	NC_012668	CCA	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606127
100	NC_012668	AAC	2	6	5602	5607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606128
101	NC_012668	AAC	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606128
102	NC_012668	T	6	6	5696	5701	0 %	100 %	0 %	0 %	229606128
103	NC_012668	ATT	2	6	5765	5770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606128
104	NC_012668	TGC	2	6	5848	5853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606128
105	NC_012668	CAT	2	6	5864	5869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606128
106	NC_012668	TG	3	6	5870	5875	0 %	50 %	50 %	0 %	229606128
107	NC_012668	GTG	2	6	5890	5895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606128
108	NC_012668	GCG	2	6	5904	5909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606128
109	NC_012668	TGC	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606128
110	NC_012668	TAC	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606128
111	NC_012668	TGCC	2	8	5998	6005	0 %	25 %	25 %	50 %	229606128
112	NC_012668	GCAGT	2	10	6181	6190	20 %	20 %	40 %	20 %	229606128
113	NC_012668	AGA	2	6	6217	6222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606128
114	NC_012668	ATC	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606128
115	NC_012668	CAC	2	6	6347	6352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606129
116	NC_012668	AGGT	2	8	6365	6372	25 %	25 %	50 %	0 %	229606129
117	NC_012668	ACCGAC	2	12	6398	6409	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	229606129
118	NC_012668	ACG	2	6	6464	6469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606129
119	NC_012668	ATA	2	6	6564	6569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606129
120	NC_012668	CCA	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606129
121	NC_012668	TCA	2	6	6603	6608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606129
122	NC_012668	TGA	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606129
123	NC_012668	GCA	2	6	6742	6747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606129
124	NC_012668	CCAA	2	8	6750	6757	50 %	0 %	0 %	50 %	229606129
125	NC_012668	ACT	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606129
126	NC_012668	TG	3	6	6854	6859	0 %	50 %	50 %	0 %	229606129
127	NC_012668	TCAA	2	8	7126	7133	50 %	25 %	0 %	25 %	229606130
128	NC_012668	GTG	2	6	7270	7275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606130
129	NC_012668	ACT	2	6	7327	7332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606130
130	NC_012668	CTT	2	6	7394	7399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606130
131	NC_012668	AACC	2	8	7433	7440	50 %	0 %	0 %	50 %	229606130
132	NC_012668	GAGTG	2	10	7509	7518	20 %	20 %	60 %	0 %	229606130
133	NC_012668	TGTT	2	8	7546	7553	0 %	75 %	25 %	0 %	229606130
134	NC_012668	CCA	2	6	7555	7560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606130
135	NC_012668	CTG	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606130
136	NC_012668	TG	3	6	7621	7626	0 %	50 %	50 %	0 %	229606130
137	NC_012668	TCT	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606130
138	NC_012668	TCT	2	6	7681	7686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606130
139	NC_012668	AAG	2	6	7711	7716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606130
140	NC_012668	ATT	2	6	7985	7990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606131
141	NC_012668	GCA	2	6	8059	8064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606131
142	NC_012668	T	6	6	8067	8072	0 %	100 %	0 %	0 %	229606131
143	NC_012668	TGC	2	6	8128	8133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606131
144	NC_012668	ATC	2	6	8190	8195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606131
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148	NC_012668	A	6	6	8419	8424	100 %	0 %	0 %	0 %	229606131
149	NC_012668	GAC	2	6	8522	8527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606131
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151	NC_012668	CTG	2	6	8637	8642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606131
152	NC_012668	GCAAA	2	10	8657	8666	60 %	0 %	20 %	20 %	229606131
153	NC_012668	TAA	2	6	8694	8699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606131
154	NC_012668	TG	3	6	8767	8772	0 %	50 %	50 %	0 %	229606131
155	NC_012668	TAT	2	6	8840	8845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606131
156	NC_012668	CATCA	2	10	8861	8870	40 %	20 %	0 %	40 %	229606132
157	NC_012668	ACC	2	6	8926	8931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606132
158	NC_012668	ACTC	2	8	8957	8964	25 %	25 %	0 %	50 %	229606132
159	NC_012668	GCCA	2	8	9081	9088	25 %	0 %	25 %	50 %	229606132
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162	NC_012668	CTG	2	6	9225	9230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606132
163	NC_012668	TTA	2	6	9240	9245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606132
164	NC_012668	AAG	2	6	9265	9270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606132
165	NC_012668	GCA	2	6	9323	9328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606132
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167	NC_012668	AAG	2	6	9430	9435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606132
168	NC_012668	ACT	2	6	9469	9474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606132
169	NC_012668	TGGC	2	8	9527	9534	0 %	25 %	50 %	25 %	229606132
170	NC_012668	TGGC	2	8	9603	9610	0 %	25 %	50 %	25 %	229606132
171	NC_012668	GCA	2	6	9620	9625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606132
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176	NC_012668	TGT	2	6	9881	9886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606132
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239	NC_012668	TCAG	2	8	12823	12830	25 %	25 %	25 %	25 %	229606137
240	NC_012668	GAAT	2	8	12840	12847	50 %	25 %	25 %	0 %	229606137
241	NC_012668	TTA	2	6	13036	13041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606137
242	NC_012668	ACT	2	6	13075	13080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606137
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244	NC_012668	ATC	2	6	13120	13125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606137
245	NC_012668	ATG	2	6	13201	13206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606137
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247	NC_012668	TCA	2	6	13300	13305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606137
248	NC_012668	CAACT	2	10	13308	13317	40 %	20 %	0 %	40 %	229606137
249	NC_012668	TCA	2	6	13394	13399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606137
250	NC_012668	TTG	2	6	13408	13413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606137
251	NC_012668	CGACAA	2	12	13562	13573	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	229606138
252	NC_012668	CCA	2	6	13602	13607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606138
253	NC_012668	CGA	2	6	13757	13762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606138
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255	NC_012668	GCC	2	6	14209	14214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606138
256	NC_012668	GCA	2	6	14228	14233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606138
257	NC_012668	CAAA	2	8	14237	14244	75 %	0 %	0 %	25 %	229606138
258	NC_012668	T	6	6	14256	14261	0 %	100 %	0 %	0 %	229606138
259	NC_012668	TTG	2	6	14278	14283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606139
260	NC_012668	AGA	2	6	14314	14319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606139
261	NC_012668	GT	3	6	14371	14376	0 %	50 %	50 %	0 %	229606139
262	NC_012668	GC	3	6	14395	14400	0 %	0 %	50 %	50 %	229606139
263	NC_012668	GAAC	2	8	14478	14485	50 %	0 %	25 %	25 %	229606139
264	NC_012668	ACA	2	6	14520	14525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606139
265	NC_012668	AGC	2	6	14553	14558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606139
266	NC_012668	CGCA	2	8	14570	14577	25 %	0 %	25 %	50 %	229606139
267	NC_012668	GCT	2	6	14643	14648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606139
268	NC_012668	GGC	2	6	14658	14663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606139
269	NC_012668	TCC	2	6	14675	14680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606139
270	NC_012668	GAA	2	6	14693	14698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606139
271	NC_012668	AAGAAT	2	12	14715	14726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	229606139
272	NC_012668	ATCGA	2	10	14775	14784	40 %	20 %	20 %	20 %	229606139
273	NC_012668	CTT	2	6	14795	14800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606139
274	NC_012668	GTA	2	6	14804	14809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606139
275	NC_012668	GCA	2	6	14920	14925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606139
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277	NC_012668	CAC	2	6	15010	15015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606139
278	NC_012668	ATC	2	6	15032	15037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606139
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280	NC_012668	GTTG	2	8	15382	15389	0 %	50 %	50 %	0 %	229606139
281	NC_012668	AAAGTT	2	12	15428	15439	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	229606139
282	NC_012668	TCA	2	6	15542	15547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606140
283	NC_012668	GCG	2	6	15585	15590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606140
284	NC_012668	GTG	2	6	15606	15611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606140
285	NC_012668	AGA	2	6	15669	15674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606140
286	NC_012668	TGT	2	6	15815	15820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606140
287	NC_012668	ACG	2	6	15889	15894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606140
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290	NC_012668	ACC	2	6	16051	16056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606140
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294	NC_012668	ACC	3	9	16627	16635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606141
295	NC_012668	AAC	2	6	16696	16701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606141
296	NC_012668	AAG	2	6	16707	16712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606141
297	NC_012668	GAC	2	6	16716	16721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606141
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299	NC_012668	TAA	2	6	16776	16781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606141
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373	NC_012668	A	7	7	21798	21804	100 %	0 %	0 %	0 %	229606146
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385	NC_012668	TCT	2	6	22535	22540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606148
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389	NC_012668	AATC	2	8	22744	22751	50 %	25 %	0 %	25 %	229606148
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