MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012668	GCA	2	6	210213	210218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606315
3502	NC_012668	TCA	2	6	210272	210277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606315
3503	NC_012668	TTG	2	6	210322	210327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606315
3504	NC_012668	GCCT	2	8	210410	210417	0 %	25 %	25 %	50 %	229606315
3505	NC_012668	TTC	2	6	210421	210426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606315
3506	NC_012668	CGC	2	6	210562	210567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606315
3507	NC_012668	GTGCG	2	10	210592	210601	0 %	20 %	60 %	20 %	229606315
3508	NC_012668	ATAC	2	8	210670	210677	50 %	25 %	0 %	25 %	229606315
3509	NC_012668	TCA	2	6	210889	210894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606316
3510	NC_012668	ACC	2	6	210896	210901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606316
3511	NC_012668	CAC	2	6	210905	210910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606316
3512	NC_012668	CT	3	6	210947	210952	0 %	50 %	0 %	50 %	229606316
3513	NC_012668	TGC	2	6	211014	211019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606316
3514	NC_012668	GCG	2	6	211078	211083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606316
3515	NC_012668	AGA	2	6	211105	211110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606316
3516	NC_012668	GCGTAA	2	12	211114	211125	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	229606316
3517	NC_012668	GTT	2	6	211223	211228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606316
3518	NC_012668	CAC	2	6	211319	211324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606316
3519	NC_012668	ACC	2	6	211334	211339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606316
3520	NC_012668	GGA	2	6	211445	211450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606316
3521	NC_012668	CTG	2	6	211475	211480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606316
3522	NC_012668	GC	3	6	211596	211601	0 %	0 %	50 %	50 %	229606316
3523	NC_012668	TCGT	2	8	211704	211711	0 %	50 %	25 %	25 %	229606316
3524	NC_012668	TTCCG	2	10	211721	211730	0 %	40 %	20 %	40 %	229606316
3525	NC_012668	GAA	2	6	211767	211772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606316
3526	NC_012668	TAC	2	6	211789	211794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606316
3527	NC_012668	GAG	2	6	211806	211811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606316
3528	NC_012668	CTA	2	6	211812	211817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606316
3529	NC_012668	CGT	2	6	211859	211864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606316
3530	NC_012668	AACG	2	8	211875	211882	50 %	0 %	25 %	25 %	229606316
3531	NC_012668	ACC	2	6	211971	211976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606316
3532	NC_012668	CACG	2	8	211993	212000	25 %	0 %	25 %	50 %	229606316
3533	NC_012668	A	6	6	212108	212113	100 %	0 %	0 %	0 %	229606316
3534	NC_012668	GAC	2	6	212239	212244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606316
3535	NC_012668	CCA	2	6	212317	212322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606316
3536	NC_012668	CAC	2	6	212330	212335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606316
3537	NC_012668	GGAT	2	8	212447	212454	25 %	25 %	50 %	0 %	229606317
3538	NC_012668	CAC	2	6	212476	212481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606317
3539	NC_012668	AGC	2	6	212520	212525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606317
3540	NC_012668	ACC	2	6	212687	212692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606317
3541	NC_012668	CTC	2	6	212699	212704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606318
3542	NC_012668	AAT	2	6	212782	212787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606318
3543	NC_012668	GC	3	6	212904	212909	0 %	0 %	50 %	50 %	229606318
3544	NC_012668	GCC	2	6	213027	213032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606318
3545	NC_012668	AGC	2	6	213033	213038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606318
3546	NC_012668	TTTGCA	2	12	213169	213180	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229606318
3547	NC_012668	TCAA	2	8	213213	213220	50 %	25 %	0 %	25 %	229606318
3548	NC_012668	CAT	2	6	213233	213238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606318
3549	NC_012668	TC	3	6	213277	213282	0 %	50 %	0 %	50 %	229606318
3550	NC_012668	CGAG	2	8	213479	213486	25 %	0 %	50 %	25 %	229606319
3551	NC_012668	TGCT	2	8	213625	213632	0 %	50 %	25 %	25 %	229606319
3552	NC_012668	CGC	2	6	213667	213672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606319
3553	NC_012668	GAAG	2	8	213686	213693	50 %	0 %	50 %	0 %	229606319
3554	NC_012668	CTG	2	6	213706	213711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606319
3555	NC_012668	GATT	2	8	213740	213747	25 %	50 %	25 %	0 %	229606319
3556	NC_012668	TGT	2	6	213749	213754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606319
3557	NC_012668	TGC	2	6	213755	213760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606319
3558	NC_012668	CTG	2	6	213769	213774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606319
3559	NC_012668	ACCC	2	8	213796	213803	25 %	0 %	0 %	75 %	229606319
3560	NC_012668	GC	3	6	213931	213936	0 %	0 %	50 %	50 %	229606319
3561	NC_012668	GTT	2	6	213948	213953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606319
3562	NC_012668	CAC	2	6	213954	213959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606319
3563	NC_012668	AC	3	6	214051	214056	50 %	0 %	0 %	50 %	229606319
3564	NC_012668	TGT	2	6	214064	214069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606319
3565	NC_012668	GCC	2	6	214075	214080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606319
3566	NC_012668	AATC	2	8	214101	214108	50 %	25 %	0 %	25 %	229606319
3567	NC_012668	TGC	2	6	214251	214256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606319
3568	NC_012668	GCA	2	6	214260	214265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606319
3569	NC_012668	CCA	2	6	214290	214295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606319
3570	NC_012668	CCG	2	6	214341	214346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606319
3571	NC_012668	AAGGC	2	10	214482	214491	40 %	0 %	40 %	20 %	229606319
3572	NC_012668	CAT	2	6	214578	214583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606319
3573	NC_012668	TTG	2	6	214630	214635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606319
3574	NC_012668	GGA	2	6	214649	214654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606319
3575	NC_012668	ATC	2	6	214666	214671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606319
3576	NC_012668	CAC	2	6	214699	214704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606319
3577	NC_012668	TTC	2	6	214763	214768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606319
3578	NC_012668	AG	3	6	214825	214830	50 %	0 %	50 %	0 %	229606320
3579	NC_012668	G	6	6	214835	214840	0 %	0 %	100 %	0 %	229606320
3580	NC_012668	TGG	2	6	214855	214860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606320
3581	NC_012668	AGG	2	6	214864	214869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606320
3582	NC_012668	CTC	2	6	214882	214887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606320
3583	NC_012668	CAC	2	6	214908	214913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606320
3584	NC_012668	AGT	2	6	214948	214953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606320
3585	NC_012668	CGAA	2	8	215012	215019	50 %	0 %	25 %	25 %	229606320
3586	NC_012668	GTGC	2	8	215104	215111	0 %	25 %	50 %	25 %	229606320
3587	NC_012668	CAC	2	6	215137	215142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606320
3588	NC_012668	ATG	2	6	215174	215179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606320
3589	NC_012668	AG	3	6	215230	215235	50 %	0 %	50 %	0 %	229606320
3590	NC_012668	AAC	2	6	215311	215316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606320
3591	NC_012668	A	6	6	215360	215365	100 %	0 %	0 %	0 %	229606320
3592	NC_012668	TTG	2	6	215458	215463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606320
3593	NC_012668	TCA	2	6	215696	215701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606320
3594	NC_012668	CGC	2	6	215714	215719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606320
3595	NC_012668	CTT	2	6	215724	215729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606320
3596	NC_012668	TCT	2	6	215762	215767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606320
3597	NC_012668	TCAA	2	8	215795	215802	50 %	25 %	0 %	25 %	229606320
3598	NC_012668	TAC	2	6	215838	215843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606320
3599	NC_012668	TGA	2	6	215846	215851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606320
3600	NC_012668	TAG	2	6	215879	215884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606320
3601	NC_012668	CT	3	6	215975	215980	0 %	50 %	0 %	50 %	229606320
3602	NC_012668	GCA	2	6	216009	216014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606320
3603	NC_012668	CGC	2	6	216021	216026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606320
3604	NC_012668	ACA	2	6	216072	216077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606320
3605	NC_012668	TCAA	2	8	216173	216180	50 %	25 %	0 %	25 %	229606320
3606	NC_012668	ATC	2	6	216260	216265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606320
3607	NC_012668	TAG	2	6	216295	216300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606320
3608	NC_012668	GGT	2	6	216361	216366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606320
3609	NC_012668	TGG	2	6	216495	216500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606320
3610	NC_012668	ATG	2	6	216551	216556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606320
3611	NC_012668	GCG	2	6	216602	216607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606320
3612	NC_012668	CCA	2	6	216701	216706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606320
3613	NC_012668	GTC	2	6	216931	216936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606321
3614	NC_012668	CGG	2	6	216949	216954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606321
3615	NC_012668	TTG	2	6	216994	216999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606321
3616	NC_012668	TGC	2	6	217010	217015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606321
3617	NC_012668	GTT	2	6	217023	217028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606321
3618	NC_012668	TGC	2	6	217049	217054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606321
3619	NC_012668	GCC	2	6	217069	217074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606321
3620	NC_012668	T	6	6	217296	217301	0 %	100 %	0 %	0 %	229606321
3621	NC_012668	GCC	2	6	217369	217374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606321
3622	NC_012668	TCA	2	6	217739	217744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606322
3623	NC_012668	GCAC	2	8	217762	217769	25 %	0 %	25 %	50 %	229606322
3624	NC_012668	ATTT	2	8	217771	217778	25 %	75 %	0 %	0 %	229606322
3625	NC_012668	GCC	2	6	217819	217824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606322
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3868	NC_012668	CAAT	2	8	232521	232528	50 %	25 %	0 %	25 %	229606329
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3987	NC_012668	CTC	2	6	244773	244778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606337
3988	NC_012668	AAG	2	6	244823	244828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606338
3989	NC_012668	A	7	7	244850	244856	100 %	0 %	0 %	0 %	229606338
3990	NC_012668	A	6	6	244890	244895	100 %	0 %	0 %	0 %	229606338
3991	NC_012668	T	6	6	244924	244929	0 %	100 %	0 %	0 %	229606339
3992	NC_012668	AC	3	6	244930	244935	50 %	0 %	0 %	50 %	229606339
3993	NC_012668	CAT	2	6	245126	245131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606339
3994	NC_012668	CTG	2	6	245183	245188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606339
3995	NC_012668	CAGC	2	8	245197	245204	25 %	0 %	25 %	50 %	229606339
3996	NC_012668	ATC	2	6	245235	245240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606339
3997	NC_012668	CTT	2	6	245272	245277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606339
3998	NC_012668	GTG	2	6	245359	245364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606339
3999	NC_012668	TTTC	2	8	245377	245384	0 %	75 %	0 %	25 %	229606339
4000	NC_012668	ATC	2	6	245495	245500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606339

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