MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012668	TGC	2	6	181505	181510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606293
3002	NC_012668	TTC	2	6	181568	181573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606293
3003	NC_012668	TAATCA	2	12	181590	181601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	229606293
3004	NC_012668	GCA	2	6	181695	181700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606293
3005	NC_012668	T	6	6	181868	181873	0 %	100 %	0 %	0 %	229606293
3006	NC_012668	TGA	2	6	182013	182018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606293
3007	NC_012668	AGC	2	6	182198	182203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606293
3008	NC_012668	CT	3	6	182260	182265	0 %	50 %	0 %	50 %	229606293
3009	NC_012668	T	6	6	182275	182280	0 %	100 %	0 %	0 %	229606293
3010	NC_012668	CTT	2	6	182321	182326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606293
3011	NC_012668	CAA	2	6	182431	182436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606293
3012	NC_012668	AGAA	2	8	182526	182533	75 %	0 %	25 %	0 %	229606293
3013	NC_012668	GCTG	2	8	182565	182572	0 %	25 %	50 %	25 %	229606293
3014	NC_012668	CAC	2	6	182578	182583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606293
3015	NC_012668	TGG	2	6	182598	182603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606293
3016	NC_012668	AAT	2	6	182638	182643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606293
3017	NC_012668	TAT	2	6	182668	182673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606293
3018	NC_012668	AAC	2	6	182742	182747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606293
3019	NC_012668	TA	3	6	182751	182756	50 %	50 %	0 %	0 %	229606293
3020	NC_012668	CT	3	6	182771	182776	0 %	50 %	0 %	50 %	229606293
3021	NC_012668	T	10	10	182805	182814	0 %	100 %	0 %	0 %	229606293
3022	NC_012668	A	6	6	182848	182853	100 %	0 %	0 %	0 %	229606293
3023	NC_012668	TA	3	6	182861	182866	50 %	50 %	0 %	0 %	229606293
3024	NC_012668	CAC	2	6	182878	182883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606293
3025	NC_012668	T	6	6	183012	183017	0 %	100 %	0 %	0 %	229606294
3026	NC_012668	AC	3	6	183057	183062	50 %	0 %	0 %	50 %	229606294
3027	NC_012668	TCC	2	6	183080	183085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606294
3028	NC_012668	GCT	2	6	183105	183110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606294
3029	NC_012668	T	7	7	183201	183207	0 %	100 %	0 %	0 %	229606294
3030	NC_012668	CAA	2	6	183208	183213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606294
3031	NC_012668	ACT	2	6	183257	183262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606294
3032	NC_012668	TTC	2	6	183328	183333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606294
3033	NC_012668	A	6	6	183343	183348	100 %	0 %	0 %	0 %	229606294
3034	NC_012668	TAA	2	6	183366	183371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606294
3035	NC_012668	TTC	2	6	183380	183385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606294
3036	NC_012668	TCA	2	6	183389	183394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606294
3037	NC_012668	CAT	2	6	183420	183425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606294
3038	NC_012668	TC	4	8	183434	183441	0 %	50 %	0 %	50 %	229606294
3039	NC_012668	CT	4	8	183452	183459	0 %	50 %	0 %	50 %	229606294
3040	NC_012668	TAT	3	9	183552	183560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606294
3041	NC_012668	GCC	2	6	183562	183567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606294
3042	NC_012668	AG	3	6	183584	183589	50 %	0 %	50 %	0 %	229606294
3043	NC_012668	CACCAA	2	12	183600	183611	50 %	0 %	0 %	50 %	229606294
3044	NC_012668	CTC	2	6	183673	183678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606294
3045	NC_012668	GAA	2	6	183699	183704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606294
3046	NC_012668	CTC	2	6	183724	183729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606294
3047	NC_012668	CCA	2	6	183863	183868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606294
3048	NC_012668	ATCA	2	8	183964	183971	50 %	25 %	0 %	25 %	229606294
3049	NC_012668	TCAAAT	2	12	183980	183991	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	229606294
3050	NC_012668	TTA	2	6	183998	184003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606294
3051	NC_012668	GGT	2	6	184023	184028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606294
3052	NC_012668	ATCA	2	8	184039	184046	50 %	25 %	0 %	25 %	229606294
3053	NC_012668	AGT	2	6	184069	184074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606294
3054	NC_012668	AGT	2	6	184099	184104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606294
3055	NC_012668	GTG	2	6	184130	184135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606294
3056	NC_012668	T	6	6	184145	184150	0 %	100 %	0 %	0 %	229606294
3057	NC_012668	TCT	2	6	184295	184300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606294
3058	NC_012668	TCT	2	6	184473	184478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606294
3059	NC_012668	TTTG	2	8	184498	184505	0 %	75 %	25 %	0 %	229606294
3060	NC_012668	GTATTG	2	12	184510	184521	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	229606294
3061	NC_012668	ATC	2	6	184534	184539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606294
3062	NC_012668	AAGTG	2	10	184563	184572	40 %	20 %	40 %	0 %	229606294
3063	NC_012668	ATA	2	6	184601	184606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606294
3064	NC_012668	TCA	2	6	184761	184766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606295
3065	NC_012668	TCA	2	6	184788	184793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606295
3066	NC_012668	ATG	2	6	184836	184841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606295
3067	NC_012668	TCA	2	6	184881	184886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606295
3068	NC_012668	TGG	2	6	184915	184920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606295
3069	NC_012668	AGCAG	2	10	184927	184936	40 %	0 %	40 %	20 %	229606295
3070	NC_012668	TTA	2	6	184938	184943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606295
3071	NC_012668	CATCTT	2	12	184945	184956	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	229606295
3072	NC_012668	TTC	2	6	184961	184966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606295
3073	NC_012668	TCT	2	6	185031	185036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606295
3074	NC_012668	AAT	2	6	185102	185107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606295
3075	NC_012668	TTC	2	6	185141	185146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606295
3076	NC_012668	AGAT	2	8	185150	185157	50 %	25 %	25 %	0 %	229606295
3077	NC_012668	ATC	2	6	185159	185164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606295
3078	NC_012668	ATG	2	6	185175	185180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606295
3079	NC_012668	TGA	2	6	186016	186021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606296
3080	NC_012668	GCG	2	6	186038	186043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606296
3081	NC_012668	CTG	2	6	186101	186106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606296
3082	NC_012668	TGA	2	6	186232	186237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606296
3083	NC_012668	TCA	2	6	186238	186243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606296
3084	NC_012668	CAC	2	6	186247	186252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606296
3085	NC_012668	GGGC	2	8	186262	186269	0 %	0 %	75 %	25 %	229606296
3086	NC_012668	GCCA	2	8	186321	186328	25 %	0 %	25 %	50 %	229606296
3087	NC_012668	CCT	2	6	186378	186383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606296
3088	NC_012668	ATG	2	6	186416	186421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606296
3089	NC_012668	ACCA	2	8	186443	186450	50 %	0 %	0 %	50 %	229606296
3090	NC_012668	GC	3	6	186454	186459	0 %	0 %	50 %	50 %	229606296
3091	NC_012668	TGA	2	6	186517	186522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606296
3092	NC_012668	GTG	2	6	186552	186557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606296
3093	NC_012668	CAC	2	6	186612	186617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606296
3094	NC_012668	TGCA	2	8	186704	186711	25 %	25 %	25 %	25 %	229606296
3095	NC_012668	TGA	2	6	186723	186728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606296
3096	NC_012668	AGCA	2	8	186864	186871	50 %	0 %	25 %	25 %	229606296
3097	NC_012668	ATT	2	6	186882	186887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606296
3098	NC_012668	ATC	2	6	186893	186898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606296
3099	NC_012668	AAT	2	6	186950	186955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606296
3100	NC_012668	CGG	2	6	187078	187083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606296
3101	NC_012668	CCCA	2	8	187231	187238	25 %	0 %	0 %	75 %	229606297
3102	NC_012668	TGGC	2	8	187264	187271	0 %	25 %	50 %	25 %	229606297
3103	NC_012668	CA	3	6	187305	187310	50 %	0 %	0 %	50 %	229606297
3104	NC_012668	CTG	2	6	187357	187362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606297
3105	NC_012668	TCAA	2	8	187427	187434	50 %	25 %	0 %	25 %	229606297
3106	NC_012668	CCA	2	6	187490	187495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606297
3107	NC_012668	T	6	6	187516	187521	0 %	100 %	0 %	0 %	229606297
3108	NC_012668	GAT	2	6	187531	187536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606297
3109	NC_012668	GT	3	6	187545	187550	0 %	50 %	50 %	0 %	229606297
3110	NC_012668	TCA	3	9	187727	187735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606297
3111	NC_012668	GA	3	6	187741	187746	50 %	0 %	50 %	0 %	229606297
3112	NC_012668	T	6	6	187804	187809	0 %	100 %	0 %	0 %	229606297
3113	NC_012668	CGA	2	6	187831	187836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606297
3114	NC_012668	GCA	2	6	187884	187889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606297
3115	NC_012668	AC	3	6	187890	187895	50 %	0 %	0 %	50 %	229606297
3116	NC_012668	GAAA	2	8	187990	187997	75 %	0 %	25 %	0 %	229606297
3117	NC_012668	T	6	6	188004	188009	0 %	100 %	0 %	0 %	229606297
3118	NC_012668	CTT	3	9	188016	188024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606297
3119	NC_012668	CCA	3	9	188051	188059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606297
3120	NC_012668	AC	3	6	188100	188105	50 %	0 %	0 %	50 %	229606297
3121	NC_012668	GCC	2	6	188159	188164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606297
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3123	NC_012668	GACT	2	8	188193	188200	25 %	25 %	25 %	25 %	229606297
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3369	NC_012668	CCA	2	6	203340	203345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606307
3370	NC_012668	GCCC	2	8	203397	203404	0 %	0 %	25 %	75 %	229606307
3371	NC_012668	GGT	2	6	203468	203473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606307
3372	NC_012668	GAT	2	6	203510	203515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606307
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3374	NC_012668	CTG	2	6	203620	203625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606308
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3476	NC_012668	TTG	2	6	208826	208831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606314
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3482	NC_012668	AGCG	2	8	209033	209040	25 %	0 %	50 %	25 %	229606314
3483	NC_012668	ATA	2	6	209123	209128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606314
3484	NC_012668	GCC	2	6	209133	209138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606314
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3488	NC_012668	ATC	2	6	209295	209300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606314
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3491	NC_012668	TG	3	6	209589	209594	0 %	50 %	50 %	0 %	229606314
3492	NC_012668	GAC	2	6	209640	209645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606314
3493	NC_012668	ACCA	2	8	209677	209684	50 %	0 %	0 %	50 %	229606314
3494	NC_012668	GTGA	2	8	209782	209789	25 %	25 %	50 %	0 %	229606314
3495	NC_012668	TTCA	2	8	209816	209823	25 %	50 %	0 %	25 %	229606314
3496	NC_012668	GAT	2	6	209913	209918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606315
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3498	NC_012668	TGAT	2	8	209978	209985	25 %	50 %	25 %	0 %	229606315
3499	NC_012668	T	6	6	210022	210027	0 %	100 %	0 %	0 %	229606315
3500	NC_012668	TGC	2	6	210164	210169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606315

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