MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_012668	ACT	2	6	1158051	1158056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607149
19002	NC_012668	GC	3	6	1158058	1158063	0 %	0 %	50 %	50 %	229607149
19003	NC_012668	CAT	2	6	1158091	1158096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607149
19004	NC_012668	CGA	2	6	1158138	1158143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607149
19005	NC_012668	GA	3	6	1158142	1158147	50 %	0 %	50 %	0 %	229607149
19006	NC_012668	CAT	2	6	1158218	1158223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607149
19007	NC_012668	AGC	2	6	1158355	1158360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607149
19008	NC_012668	ATCA	2	8	1158368	1158375	50 %	25 %	0 %	25 %	229607149
19009	NC_012668	CTC	2	6	1158475	1158480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229607150
19010	NC_012668	AAC	2	6	1158545	1158550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607150
19011	NC_012668	CCA	2	6	1158608	1158613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607150
19012	NC_012668	TTC	2	6	1158646	1158651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607150
19013	NC_012668	CA	4	8	1158699	1158706	50 %	0 %	0 %	50 %	229607150
19014	NC_012668	TCCT	2	8	1158763	1158770	0 %	50 %	0 %	50 %	229607150
19015	NC_012668	GCAA	2	8	1158798	1158805	50 %	0 %	25 %	25 %	229607150
19016	NC_012668	T	6	6	1158894	1158899	0 %	100 %	0 %	0 %	229607150
19017	NC_012668	AGT	2	6	1159165	1159170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607151
19018	NC_012668	CCA	2	6	1159172	1159177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607151
19019	NC_012668	T	6	6	1159284	1159289	0 %	100 %	0 %	0 %	229607151
19020	NC_012668	CATA	2	8	1159355	1159362	50 %	25 %	0 %	25 %	229607151
19021	NC_012668	CCAG	2	8	1159404	1159411	25 %	0 %	25 %	50 %	229607151
19022	NC_012668	TGG	2	6	1159480	1159485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607151
19023	NC_012668	AGCAC	2	10	1159514	1159523	40 %	0 %	20 %	40 %	229607151
19024	NC_012668	TTG	2	6	1159531	1159536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607151
19025	NC_012668	TGAG	2	8	1159562	1159569	25 %	25 %	50 %	0 %	229607151
19026	NC_012668	ACA	2	6	1159576	1159581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607151
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19028	NC_012668	CAA	2	6	1159637	1159642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607151
19029	NC_012668	GTT	2	6	1159646	1159651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607151
19030	NC_012668	CACTT	2	10	1159668	1159677	20 %	40 %	0 %	40 %	229607151
19031	NC_012668	GC	3	6	1159902	1159907	0 %	0 %	50 %	50 %	229607151
19032	NC_012668	GGC	2	6	1159988	1159993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607151
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19035	NC_012668	CTT	2	6	1160129	1160134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607151
19036	NC_012668	CTT	2	6	1160162	1160167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607151
19037	NC_012668	CAG	2	6	1160178	1160183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607151
19038	NC_012668	AAG	2	6	1160234	1160239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607151
19039	NC_012668	GGATC	2	10	1160312	1160321	20 %	20 %	40 %	20 %	229607151
19040	NC_012668	T	7	7	1160350	1160356	0 %	100 %	0 %	0 %	229607151
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19043	NC_012668	CGA	2	6	1160455	1160460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607151
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19050	NC_012668	GCA	2	6	1162013	1162018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607153
19051	NC_012668	CTT	2	6	1162024	1162029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607153
19052	NC_012668	TGA	2	6	1162071	1162076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607153
19053	NC_012668	GGC	2	6	1162130	1162135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607153
19054	NC_012668	CTG	2	6	1162188	1162193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607153
19055	NC_012668	TTGT	2	8	1162232	1162239	0 %	75 %	25 %	0 %	229607153
19056	NC_012668	CTG	2	6	1162254	1162259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607153
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19066	NC_012668	CTGA	2	8	1162592	1162599	25 %	25 %	25 %	25 %	229607153
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19097	NC_012668	GC	3	6	1164268	1164273	0 %	0 %	50 %	50 %	229607155
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19105	NC_012668	A	6	6	1164898	1164903	100 %	0 %	0 %	0 %	229607156
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19112	NC_012668	CTG	2	6	1165513	1165518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607157
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19117	NC_012668	CCG	2	6	1165820	1165825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607157
19118	NC_012668	ACC	2	6	1165867	1165872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607157
19119	NC_012668	TGA	2	6	1165875	1165880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607157
19120	NC_012668	TGG	2	6	1165899	1165904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607157
19121	NC_012668	GGC	2	6	1165927	1165932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607157
19122	NC_012668	CCA	2	6	1165937	1165942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607157
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19124	NC_012668	TCG	2	6	1165965	1165970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607157
19125	NC_012668	TCA	2	6	1165985	1165990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607157
19126	NC_012668	TGA	2	6	1166034	1166039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607157
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19129	NC_012668	GCA	2	6	1166171	1166176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607157
19130	NC_012668	GTG	2	6	1166194	1166199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607157
19131	NC_012668	GTG	2	6	1166222	1166227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607157
19132	NC_012668	GTG	2	6	1166230	1166235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607157
19133	NC_012668	GC	3	6	1166266	1166271	0 %	0 %	50 %	50 %	229607157
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19139	NC_012668	TGC	2	6	1166617	1166622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607158
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19153	NC_012668	TTCTG	2	10	1167780	1167789	0 %	60 %	20 %	20 %	229607159
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19227	NC_012668	CGT	2	6	1171916	1171921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607164
19228	NC_012668	GAA	3	9	1172024	1172032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607164
19229	NC_012668	TGC	2	6	1172056	1172061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607164
19230	NC_012668	CTG	2	6	1172093	1172098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607164
19231	NC_012668	ATG	2	6	1172177	1172182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607164
19232	NC_012668	CGT	2	6	1172222	1172227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607164
19233	NC_012668	GTG	2	6	1172246	1172251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607164
19234	NC_012668	TGC	2	6	1172284	1172289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607164
19235	NC_012668	CCGCA	2	10	1172331	1172340	20 %	0 %	20 %	60 %	229607164
19236	NC_012668	CGTA	2	8	1172341	1172348	25 %	25 %	25 %	25 %	229607164
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19464	NC_012668	CAT	2	6	1186327	1186332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607178
19465	NC_012668	CAA	2	6	1186447	1186452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607178
19466	NC_012668	AGA	2	6	1186555	1186560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607178
19467	NC_012668	TAC	2	6	1186565	1186570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607178
19468	NC_012668	GGT	2	6	1186603	1186608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607178
19469	NC_012668	TGG	2	6	1186757	1186762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607178
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19472	NC_012668	TACT	2	8	1186825	1186832	25 %	50 %	0 %	25 %	229607178
19473	NC_012668	CA	3	6	1186870	1186875	50 %	0 %	0 %	50 %	229607178
19474	NC_012668	TC	3	6	1186884	1186889	0 %	50 %	0 %	50 %	229607178
19475	NC_012668	AAG	2	6	1186895	1186900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607178
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19480	NC_012668	AGC	2	6	1187139	1187144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607178
19481	NC_012668	TGG	2	6	1187154	1187159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607178
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19484	NC_012668	CTCAA	2	10	1187273	1187282	40 %	20 %	0 %	40 %	229607178
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19486	NC_012668	CTT	2	6	1187488	1187493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607178
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19489	NC_012668	TGA	2	6	1187701	1187706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607178
19490	NC_012668	CAA	2	6	1187743	1187748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607178
19491	NC_012668	TGC	2	6	1187791	1187796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607178
19492	NC_012668	TTG	2	6	1187828	1187833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607178
19493	NC_012668	TAA	2	6	1187869	1187874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229607178
19494	NC_012668	CGG	2	6	1187898	1187903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607178
19495	NC_012668	ACC	2	6	1187907	1187912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607178
19496	NC_012668	CTG	2	6	1188023	1188028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607178
19497	NC_012668	GCGG	2	8	1188110	1188117	0 %	0 %	75 %	25 %	229607178
19498	NC_012668	ACT	2	6	1188177	1188182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607178
19499	NC_012668	GAT	2	6	1188215	1188220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607178
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