MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_012668	GC	3	6	1127426	1127431	0 %	0 %	50 %	50 %	229607116
18502	NC_012668	GTG	2	6	1127484	1127489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607116
18503	NC_012668	CTG	2	6	1127504	1127509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607116
18504	NC_012668	GCTT	2	8	1127544	1127551	0 %	50 %	25 %	25 %	229607116
18505	NC_012668	CAA	2	6	1127582	1127587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607116
18506	NC_012668	AAG	2	6	1127733	1127738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607116
18507	NC_012668	GGC	2	6	1127754	1127759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607116
18508	NC_012668	GAT	2	6	1127837	1127842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607116
18509	NC_012668	GCA	2	6	1127880	1127885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607116
18510	NC_012668	GCCGA	2	10	1127899	1127908	20 %	0 %	40 %	40 %	229607116
18511	NC_012668	CATA	2	8	1127941	1127948	50 %	25 %	0 %	25 %	229607116
18512	NC_012668	CCG	2	6	1127990	1127995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607116
18513	NC_012668	AGTT	2	8	1128021	1128028	25 %	50 %	25 %	0 %	229607116
18514	NC_012668	A	6	6	1128050	1128055	100 %	0 %	0 %	0 %	229607116
18515	NC_012668	TGC	2	6	1128213	1128218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607117
18516	NC_012668	GCA	2	6	1128601	1128606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607118
18517	NC_012668	GCG	2	6	1128620	1128625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607118
18518	NC_012668	GT	3	6	1128704	1128709	0 %	50 %	50 %	0 %	229607118
18519	NC_012668	GCTTG	2	10	1128751	1128760	0 %	40 %	40 %	20 %	229607118
18520	NC_012668	TGCT	2	8	1128762	1128769	0 %	50 %	25 %	25 %	229607118
18521	NC_012668	TTC	2	6	1128848	1128853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607118
18522	NC_012668	AGC	2	6	1128874	1128879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607118
18523	NC_012668	GAT	2	6	1128902	1128907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607118
18524	NC_012668	GCG	2	6	1128947	1128952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607118
18525	NC_012668	AATCA	2	10	1128983	1128992	60 %	20 %	0 %	20 %	229607118
18526	NC_012668	CCG	2	6	1128999	1129004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607118
18527	NC_012668	ATC	2	6	1129007	1129012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607118
18528	NC_012668	TCT	2	6	1129104	1129109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607118
18529	NC_012668	CG	3	6	1129142	1129147	0 %	0 %	50 %	50 %	229607118
18530	NC_012668	GCG	2	6	1129161	1129166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607118
18531	NC_012668	A	6	6	1129170	1129175	100 %	0 %	0 %	0 %	229607118
18532	NC_012668	TCA	2	6	1129197	1129202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607118
18533	NC_012668	AGC	2	6	1129416	1129421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607118
18534	NC_012668	GA	3	6	1129525	1129530	50 %	0 %	50 %	0 %	229607118
18535	NC_012668	TGA	2	6	1129531	1129536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607118
18536	NC_012668	GTTGA	2	10	1129553	1129562	20 %	40 %	40 %	0 %	229607118
18537	NC_012668	TTG	2	6	1129581	1129586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607118
18538	NC_012668	TGT	2	6	1129617	1129622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607118
18539	NC_012668	CGG	2	6	1129630	1129635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607118
18540	NC_012668	TCA	2	6	1129662	1129667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607118
18541	NC_012668	T	7	7	1129707	1129713	0 %	100 %	0 %	0 %	229607118
18542	NC_012668	TGAT	2	8	1129722	1129729	25 %	50 %	25 %	0 %	229607118
18543	NC_012668	GCA	2	6	1129777	1129782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607118
18544	NC_012668	TGA	2	6	1129795	1129800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607118
18545	NC_012668	TCC	2	6	1129832	1129837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229607118
18546	NC_012668	AAT	2	6	1129963	1129968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229607118
18547	NC_012668	AAAT	2	8	1130063	1130070	75 %	25 %	0 %	0 %	229607119
18548	NC_012668	GCAGT	2	10	1130138	1130147	20 %	20 %	40 %	20 %	229607119
18549	NC_012668	CCT	2	6	1130272	1130277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229607120
18550	NC_012668	GTC	2	6	1130308	1130313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607120
18551	NC_012668	A	6	6	1130389	1130394	100 %	0 %	0 %	0 %	229607120
18552	NC_012668	CAC	2	6	1130438	1130443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607120
18553	NC_012668	CTCGA	2	10	1130464	1130473	20 %	20 %	20 %	40 %	229607120
18554	NC_012668	A	6	6	1130585	1130590	100 %	0 %	0 %	0 %	229607120
18555	NC_012668	TCT	2	6	1130685	1130690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607121
18556	NC_012668	TC	3	6	1130692	1130697	0 %	50 %	0 %	50 %	229607121
18557	NC_012668	CTG	2	6	1130710	1130715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607121
18558	NC_012668	CAA	3	9	1130758	1130766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607122
18559	NC_012668	CA	3	6	1130774	1130779	50 %	0 %	0 %	50 %	229607122
18560	NC_012668	AGC	2	6	1130967	1130972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607122
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18563	NC_012668	GATC	2	8	1131180	1131187	25 %	25 %	25 %	25 %	229607122
18564	NC_012668	TCA	2	6	1131191	1131196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607122
18565	NC_012668	TTGA	2	8	1131304	1131311	25 %	50 %	25 %	0 %	229607122
18566	NC_012668	CTTC	2	8	1131413	1131420	0 %	50 %	0 %	50 %	229607122
18567	NC_012668	CTG	2	6	1131550	1131555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607122
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18572	NC_012668	TGG	2	6	1131925	1131930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607123
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18583	NC_012668	TCA	2	6	1132209	1132214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607123
18584	NC_012668	CTTCT	2	10	1132293	1132302	0 %	60 %	0 %	40 %	229607123
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18589	NC_012668	GATT	2	8	1132486	1132493	25 %	50 %	25 %	0 %	229607123
18590	NC_012668	GC	3	6	1132646	1132651	0 %	0 %	50 %	50 %	229607123
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18600	NC_012668	GCTTG	2	10	1133045	1133054	0 %	40 %	40 %	20 %	229607124
18601	NC_012668	CGA	2	6	1133104	1133109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607124
18602	NC_012668	ATGG	2	8	1133223	1133230	25 %	25 %	50 %	0 %	229607125
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18604	NC_012668	GAAA	2	8	1133274	1133281	75 %	0 %	25 %	0 %	229607125
18605	NC_012668	CATC	2	8	1133309	1133316	25 %	25 %	0 %	50 %	229607125
18606	NC_012668	ATG	2	6	1133331	1133336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607125
18607	NC_012668	TTG	2	6	1133358	1133363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607125
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18615	NC_012668	GC	3	6	1133774	1133779	0 %	0 %	50 %	50 %	229607125
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18966	NC_012668	TGG	2	6	1156116	1156121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607147
18967	NC_012668	GTG	2	6	1156190	1156195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607147
18968	NC_012668	GTTTG	2	10	1156219	1156228	0 %	60 %	40 %	0 %	229607147
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18970	NC_012668	TGG	2	6	1156288	1156293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607147
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