MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_012668	GA	3	6	1100311	1100316	50 %	0 %	50 %	0 %	229607098
18002	NC_012668	GAT	2	6	1100344	1100349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607098
18003	NC_012668	TTC	2	6	1100419	1100424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607098
18004	NC_012668	GTT	2	6	1100445	1100450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607098
18005	NC_012668	TCA	2	6	1100540	1100545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607098
18006	NC_012668	GTGG	2	8	1100548	1100555	0 %	25 %	75 %	0 %	229607098
18007	NC_012668	TAT	2	6	1100685	1100690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229607098
18008	NC_012668	CGA	2	6	1100703	1100708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607098
18009	NC_012668	CTGC	2	8	1100756	1100763	0 %	25 %	25 %	50 %	229607098
18010	NC_012668	CAT	2	6	1100800	1100805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607098
18011	NC_012668	T	6	6	1100837	1100842	0 %	100 %	0 %	0 %	229607098
18012	NC_012668	GTAA	2	8	1100929	1100936	50 %	25 %	25 %	0 %	229607098
18013	NC_012668	CAA	2	6	1100940	1100945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607098
18014	NC_012668	TAA	2	6	1100955	1100960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229607098
18015	NC_012668	GCA	2	6	1101003	1101008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607098
18016	NC_012668	GTG	2	6	1101021	1101026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607098
18017	NC_012668	AGG	2	6	1101037	1101042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229607098
18018	NC_012668	CTT	2	6	1101340	1101345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607099
18019	NC_012668	CA	3	6	1101365	1101370	50 %	0 %	0 %	50 %	229607099
18020	NC_012668	T	6	6	1101400	1101405	0 %	100 %	0 %	0 %	229607099
18021	NC_012668	TTGT	2	8	1101440	1101447	0 %	75 %	25 %	0 %	229607099
18022	NC_012668	AGA	2	6	1101717	1101722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607099
18023	NC_012668	TCA	2	6	1101789	1101794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607099
18024	NC_012668	GAT	2	6	1101827	1101832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607099
18025	NC_012668	CG	3	6	1101834	1101839	0 %	0 %	50 %	50 %	229607099
18026	NC_012668	CAC	2	6	1101946	1101951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607099
18027	NC_012668	AGAT	2	8	1101952	1101959	50 %	25 %	25 %	0 %	229607099
18028	NC_012668	AAT	2	6	1102012	1102017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229607099
18029	NC_012668	A	6	6	1102034	1102039	100 %	0 %	0 %	0 %	229607099
18030	NC_012668	CGA	2	6	1102048	1102053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607099
18031	NC_012668	GT	3	6	1102056	1102061	0 %	50 %	50 %	0 %	229607099
18032	NC_012668	AAT	2	6	1102160	1102165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229607099
18033	NC_012668	TGT	2	6	1102191	1102196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607099
18034	NC_012668	TGAC	2	8	1102242	1102249	25 %	25 %	25 %	25 %	229607099
18035	NC_012668	TCTT	2	8	1102281	1102288	0 %	75 %	0 %	25 %	229607099
18036	NC_012668	CCA	2	6	1102606	1102611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607100
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18038	NC_012668	GGC	2	6	1102718	1102723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607100
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18040	NC_012668	A	6	6	1102827	1102832	100 %	0 %	0 %	0 %	229607100
18041	NC_012668	TGC	2	6	1102946	1102951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607100
18042	NC_012668	GCA	2	6	1103005	1103010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607100
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18045	NC_012668	GAA	2	6	1103057	1103062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607100
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18050	NC_012668	TGA	2	6	1103242	1103247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607100
18051	NC_012668	CCA	2	6	1103347	1103352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607100
18052	NC_012668	GCT	2	6	1103417	1103422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607100
18053	NC_012668	AGC	3	9	1103433	1103441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607100
18054	NC_012668	ATG	2	6	1103442	1103447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607100
18055	NC_012668	GCCA	2	8	1103489	1103496	25 %	0 %	25 %	50 %	229607100
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18058	NC_012668	AGGA	2	8	1103549	1103556	50 %	0 %	50 %	0 %	229607100
18059	NC_012668	CAA	2	6	1103614	1103619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607100
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18066	NC_012668	GAT	2	6	1104312	1104317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607101
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18070	NC_012668	TGC	2	6	1104643	1104648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607101
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18101	NC_012668	CG	3	6	1106101	1106106	0 %	0 %	50 %	50 %	229607101
18102	NC_012668	ACC	2	6	1106158	1106163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607101
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18117	NC_012668	TGG	2	6	1107004	1107009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607101
18118	NC_012668	GCA	2	6	1107041	1107046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607101
18119	NC_012668	TGGGCG	2	12	1107049	1107060	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	229607101
18120	NC_012668	GAT	2	6	1107063	1107068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607101
18121	NC_012668	CTCA	2	8	1107102	1107109	25 %	25 %	0 %	50 %	229607101
18122	NC_012668	TATCAG	2	12	1107117	1107128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229607101
18123	NC_012668	CT	3	6	1107182	1107187	0 %	50 %	0 %	50 %	229607102
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18125	NC_012668	TGG	2	6	1107217	1107222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607102
18126	NC_012668	ATC	2	6	1107231	1107236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607102
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18130	NC_012668	GCT	3	9	1107548	1107556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607102
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18133	NC_012668	TGA	2	6	1107624	1107629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607102
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18136	NC_012668	TGA	2	6	1107847	1107852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607102
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18229	NC_012668	TG	3	6	1112941	1112946	0 %	50 %	50 %	0 %	229607108
18230	NC_012668	CTG	2	6	1112947	1112952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607108
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18232	NC_012668	TTC	2	6	1113025	1113030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607108
18233	NC_012668	ATC	2	6	1113115	1113120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607108
18234	NC_012668	TG	3	6	1113148	1113153	0 %	50 %	50 %	0 %	229607108
18235	NC_012668	CTTGG	2	10	1113276	1113285	0 %	40 %	40 %	20 %	229607109
18236	NC_012668	TCA	2	6	1113293	1113298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607109
18237	NC_012668	TGA	2	6	1113312	1113317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607109
18238	NC_012668	CTG	2	6	1113377	1113382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607109
18239	NC_012668	TGC	2	6	1113383	1113388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607109
18240	NC_012668	CTTT	2	8	1113404	1113411	0 %	75 %	0 %	25 %	229607109
18241	NC_012668	TGG	2	6	1113505	1113510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607109
18242	NC_012668	TGT	2	6	1113524	1113529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607109
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18245	NC_012668	GGT	2	6	1113741	1113746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607109
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18251	NC_012668	GGGC	2	8	1113909	1113916	0 %	0 %	75 %	25 %	229607109
18252	NC_012668	TTC	2	6	1114027	1114032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607109
18253	NC_012668	TGC	2	6	1114155	1114160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607109
18254	NC_012668	TGC	3	9	1114184	1114192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607109
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18264	NC_012668	CAGT	2	8	1114671	1114678	25 %	25 %	25 %	25 %	229607110
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18341	NC_012668	CGCAG	2	10	1118938	1118947	20 %	0 %	40 %	40 %	229607114
18342	NC_012668	AAG	2	6	1118959	1118964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607114
18343	NC_012668	GCT	2	6	1118999	1119004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607114
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18345	NC_012668	A	6	6	1119082	1119087	100 %	0 %	0 %	0 %	229607114
18346	NC_012668	GTG	2	6	1119159	1119164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607114
18347	NC_012668	GCA	2	6	1119307	1119312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607114
18348	NC_012668	GCC	2	6	1119353	1119358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607114
18349	NC_012668	TGCG	2	8	1119376	1119383	0 %	25 %	50 %	25 %	229607114
18350	NC_012668	CGC	2	6	1119541	1119546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607114
18351	NC_012668	TCT	2	6	1119653	1119658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607114
18352	NC_012668	GCT	2	6	1119713	1119718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607114
18353	NC_012668	CAG	2	6	1119779	1119784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607114
18354	NC_012668	GAT	2	6	1119813	1119818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607114
18355	NC_012668	TGC	2	6	1119865	1119870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607114
18356	NC_012668	CGAC	2	8	1119872	1119879	25 %	0 %	25 %	50 %	229607114
18357	NC_012668	CG	3	6	1119916	1119921	0 %	0 %	50 %	50 %	229607114
18358	NC_012668	CTT	2	6	1120061	1120066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607114
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18360	NC_012668	GAA	2	6	1120194	1120199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607114
18361	NC_012668	GGC	2	6	1120341	1120346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607114
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18366	NC_012668	ATGA	2	8	1120752	1120759	50 %	25 %	25 %	0 %	229607114
18367	NC_012668	TGG	2	6	1120783	1120788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607114
18368	NC_012668	TTG	2	6	1120872	1120877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607114
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18374	NC_012668	CG	3	6	1121132	1121137	0 %	0 %	50 %	50 %	229607114
18375	NC_012668	TTC	2	6	1121262	1121267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229607114
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18380	NC_012668	TGG	2	6	1121371	1121376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607114
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18384	NC_012668	GCA	2	6	1121504	1121509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607114
18385	NC_012668	A	6	6	1121527	1121532	100 %	0 %	0 %	0 %	229607114
18386	NC_012668	ACCA	2	8	1121548	1121555	50 %	0 %	0 %	50 %	229607114
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18400	NC_012668	TGA	2	6	1122406	1122411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607115
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18405	NC_012668	CTG	2	6	1122720	1122725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607115
18406	NC_012668	TTG	2	6	1122759	1122764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607115
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18420	NC_012668	TCA	2	6	1123406	1123411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607115
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18432	NC_012668	TGA	2	6	1123823	1123828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607115
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18435	NC_012668	ATT	2	6	1123957	1123962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229607115
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18440	NC_012668	TGC	2	6	1124206	1124211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607115
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18447	NC_012668	G	6	6	1124576	1124581	0 %	0 %	100 %	0 %	229607115
18448	NC_012668	TGA	2	6	1124585	1124590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607115
18449	NC_012668	GCG	2	6	1124615	1124620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607115
18450	NC_012668	TGA	2	6	1124689	1124694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607115
18451	NC_012668	CCA	2	6	1124740	1124745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607115
18452	NC_012668	AGA	2	6	1124807	1124812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607115
18453	NC_012668	CTG	2	6	1124937	1124942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607115
18454	NC_012668	AAG	2	6	1124953	1124958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607115
18455	NC_012668	GCA	2	6	1124975	1124980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607115
18456	NC_012668	GCT	2	6	1124984	1124989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607115
18457	NC_012668	CGAG	2	8	1125074	1125081	25 %	0 %	50 %	25 %	229607115
18458	NC_012668	CGC	2	6	1125117	1125122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607115
18459	NC_012668	CTTG	2	8	1125197	1125204	0 %	50 %	25 %	25 %	229607115
18460	NC_012668	GCG	2	6	1125249	1125254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607115
18461	NC_012668	CA	3	6	1125355	1125360	50 %	0 %	0 %	50 %	229607115
18462	NC_012668	ATC	2	6	1125378	1125383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607115
18463	NC_012668	GTTG	2	8	1125440	1125447	0 %	50 %	50 %	0 %	229607115
18464	NC_012668	ACA	2	6	1125491	1125496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607115
18465	NC_012668	GCC	2	6	1125504	1125509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607115
18466	NC_012668	CTGGA	2	10	1125696	1125705	20 %	20 %	40 %	20 %	229607115
18467	NC_012668	GCG	2	6	1125732	1125737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607115
18468	NC_012668	ATC	2	6	1125739	1125744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607115
18469	NC_012668	AGC	2	6	1125856	1125861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607115
18470	NC_012668	CGG	2	6	1125866	1125871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607115
18471	NC_012668	GATG	2	8	1125896	1125903	25 %	25 %	50 %	0 %	229607115
18472	NC_012668	CCAAG	2	10	1125931	1125940	40 %	0 %	20 %	40 %	229607115
18473	NC_012668	TGGA	2	8	1125961	1125968	25 %	25 %	50 %	0 %	229607115
18474	NC_012668	ATG	2	6	1126031	1126036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607115
18475	NC_012668	CTG	2	6	1126064	1126069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607116
18476	NC_012668	GC	3	6	1126077	1126082	0 %	0 %	50 %	50 %	229607116
18477	NC_012668	GCAA	2	8	1126119	1126126	50 %	0 %	25 %	25 %	229607116
18478	NC_012668	GCG	2	6	1126181	1126186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607116
18479	NC_012668	TCTG	2	8	1126215	1126222	0 %	50 %	25 %	25 %	229607116
18480	NC_012668	TG	3	6	1126227	1126232	0 %	50 %	50 %	0 %	229607116
18481	NC_012668	GCG	2	6	1126259	1126264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607116
18482	NC_012668	GCA	2	6	1126294	1126299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607116
18483	NC_012668	TGG	2	6	1126353	1126358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607116
18484	NC_012668	GCA	2	6	1126360	1126365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607116
18485	NC_012668	GGC	2	6	1126441	1126446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607116
18486	NC_012668	CTG	2	6	1126485	1126490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607116
18487	NC_012668	ACA	2	6	1126561	1126566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607116
18488	NC_012668	CTG	2	6	1126598	1126603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607116
18489	NC_012668	TGT	2	6	1126618	1126623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229607116
18490	NC_012668	AGC	2	6	1126704	1126709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607116
18491	NC_012668	GGC	2	6	1126747	1126752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607116
18492	NC_012668	CCG	2	6	1126768	1126773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607116
18493	NC_012668	ACC	2	6	1126811	1126816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607116
18494	NC_012668	GGC	2	6	1126834	1126839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607116
18495	NC_012668	CGC	2	6	1126972	1126977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607116
18496	NC_012668	TCA	2	6	1127047	1127052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607116
18497	NC_012668	TGG	3	9	1127082	1127090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607116
18498	NC_012668	GC	3	6	1127262	1127267	0 %	0 %	50 %	50 %	229607116
18499	NC_012668	TATG	2	8	1127343	1127350	25 %	50 %	25 %	0 %	229607116
18500	NC_012668	A	6	6	1127355	1127360	100 %	0 %	0 %	0 %	229607116

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