MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_012668	CCG	2	6	825519	825524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606854
13503	NC_012668	ATG	2	6	825572	825577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606854
13504	NC_012668	CCA	2	6	825659	825664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606854
13505	NC_012668	CA	3	6	825680	825685	50 %	0 %	0 %	50 %	229606854
13506	NC_012668	CAA	2	6	825736	825741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606854
13507	NC_012668	ACA	2	6	825770	825775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606854
13508	NC_012668	GGCAAA	2	12	825829	825840	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	229606854
13509	NC_012668	CTG	3	9	825896	825904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606854
13510	NC_012668	TCCA	2	8	825908	825915	25 %	25 %	0 %	50 %	229606854
13511	NC_012668	TAA	2	6	825943	825948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606854
13512	NC_012668	CA	3	6	826205	826210	50 %	0 %	0 %	50 %	229606855
13513	NC_012668	CGT	2	6	826371	826376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606855
13514	NC_012668	GAAG	2	8	826509	826516	50 %	0 %	50 %	0 %	229606855
13515	NC_012668	AAG	2	6	826525	826530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606855
13516	NC_012668	CAC	2	6	826548	826553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606855
13517	NC_012668	AAG	2	6	826624	826629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606855
13518	NC_012668	TCT	2	6	826681	826686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606855
13519	NC_012668	TCA	2	6	826730	826735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606855
13520	NC_012668	ACCG	2	8	826803	826810	25 %	0 %	25 %	50 %	229606855
13521	NC_012668	ATG	2	6	826830	826835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606855
13522	NC_012668	AGC	2	6	826939	826944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606855
13523	NC_012668	GAA	2	6	826974	826979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606855
13524	NC_012668	CAAG	2	8	826982	826989	50 %	0 %	25 %	25 %	229606855
13525	NC_012668	CGAT	2	8	827023	827030	25 %	25 %	25 %	25 %	229606855
13526	NC_012668	GAT	2	6	827052	827057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606855
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13528	NC_012668	TGGC	2	8	827087	827094	0 %	25 %	50 %	25 %	229606855
13529	NC_012668	TACG	2	8	827127	827134	25 %	25 %	25 %	25 %	229606855
13530	NC_012668	AAG	2	6	827155	827160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606855
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13533	NC_012668	TGT	2	6	827561	827566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606855
13534	NC_012668	GCCTCT	2	12	827619	827630	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	229606855
13535	NC_012668	GCG	2	6	827652	827657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606855
13536	NC_012668	CCA	2	6	827676	827681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606855
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13539	NC_012668	ACCG	2	8	827759	827766	25 %	0 %	25 %	50 %	229606855
13540	NC_012668	TGC	2	6	827830	827835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606855
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13542	NC_012668	TTGGC	2	10	827881	827890	0 %	40 %	40 %	20 %	229606855
13543	NC_012668	CGT	2	6	827925	827930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606855
13544	NC_012668	TGC	2	6	827944	827949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606855
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13547	NC_012668	TGA	2	6	828086	828091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606855
13548	NC_012668	CG	3	6	828097	828102	0 %	0 %	50 %	50 %	229606855
13549	NC_012668	GAA	2	6	828150	828155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606855
13550	NC_012668	CGT	2	6	828164	828169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606855
13551	NC_012668	CTT	2	6	828191	828196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606855
13552	NC_012668	ACT	2	6	828256	828261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606855
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13554	NC_012668	GTAAAA	2	12	828333	828344	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	229606855
13555	NC_012668	TGA	2	6	828362	828367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606855
13556	NC_012668	A	6	6	828471	828476	100 %	0 %	0 %	0 %	229606855
13557	NC_012668	A	6	6	828600	828605	100 %	0 %	0 %	0 %	229606855
13558	NC_012668	TAC	2	6	828710	828715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606856
13559	NC_012668	CG	3	6	828726	828731	0 %	0 %	50 %	50 %	229606856
13560	NC_012668	GTC	2	6	828758	828763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606856
13561	NC_012668	CTG	2	6	828775	828780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606856
13562	NC_012668	ATC	2	6	828866	828871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606856
13563	NC_012668	GATT	2	8	828875	828882	25 %	50 %	25 %	0 %	229606856
13564	NC_012668	TGT	2	6	828956	828961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606856
13565	NC_012668	GGC	2	6	829032	829037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606856
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13568	NC_012668	GC	3	6	829152	829157	0 %	0 %	50 %	50 %	229606856
13569	NC_012668	CGT	2	6	829276	829281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606856
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13572	NC_012668	CGTATC	2	12	829893	829904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229606857
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13574	NC_012668	TGC	2	6	830156	830161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606857
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13579	NC_012668	A	7	7	830681	830687	100 %	0 %	0 %	0 %	229606858
13580	NC_012668	ACT	2	6	830898	830903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606859
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13587	NC_012668	GTT	2	6	831207	831212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606859
13588	NC_012668	AGCTA	2	10	831254	831263	40 %	20 %	20 %	20 %	229606859
13589	NC_012668	CGTG	2	8	831353	831360	0 %	25 %	50 %	25 %	229606859
13590	NC_012668	CTG	3	9	831415	831423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606859
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13593	NC_012668	CTG	2	6	831519	831524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606860
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13600	NC_012668	TGAA	2	8	831711	831718	50 %	25 %	25 %	0 %	229606860
13601	NC_012668	GGC	2	6	831740	831745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606860
13602	NC_012668	GTC	3	9	831805	831813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606861
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13976	NC_012668	TCA	2	6	853731	853736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606895
13977	NC_012668	TTGA	2	8	853814	853821	25 %	50 %	25 %	0 %	229606895
13978	NC_012668	CG	3	6	853822	853827	0 %	0 %	50 %	50 %	229606895
13979	NC_012668	CGT	2	6	853850	853855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606895
13980	NC_012668	ACTT	2	8	853872	853879	25 %	50 %	0 %	25 %	229606895
13981	NC_012668	ATT	2	6	853926	853931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606895
13982	NC_012668	GA	3	6	853992	853997	50 %	0 %	50 %	0 %	229606895
13983	NC_012668	ATC	2	6	854009	854014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606895
13984	NC_012668	A	6	6	854049	854054	100 %	0 %	0 %	0 %	229606895
13985	NC_012668	GTG	2	6	854216	854221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606895
13986	NC_012668	TGA	2	6	854344	854349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606895
13987	NC_012668	GTG	2	6	854364	854369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606895
13988	NC_012668	TTG	2	6	854414	854419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606895
13989	NC_012668	TGTGG	2	10	854425	854434	0 %	40 %	60 %	0 %	229606895
13990	NC_012668	TCA	2	6	854521	854526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606895
13991	NC_012668	GGT	2	6	854651	854656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606895
13992	NC_012668	TCA	2	6	854658	854663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606895
13993	NC_012668	GATT	2	8	854809	854816	25 %	50 %	25 %	0 %	229606895
13994	NC_012668	GTGA	2	8	854836	854843	25 %	25 %	50 %	0 %	229606895
13995	NC_012668	GGAT	2	8	854844	854851	25 %	25 %	50 %	0 %	229606896
13996	NC_012668	AAGC	2	8	854856	854863	50 %	0 %	25 %	25 %	229606896
13997	NC_012668	TGTGG	2	10	854903	854912	0 %	40 %	60 %	0 %	229606896
13998	NC_012668	CAG	2	6	854955	854960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606896
13999	NC_012668	GCG	2	6	855039	855044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606896
14000	NC_012668	CTG	2	6	855063	855068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606896

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