MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012668	ACAGC	2	10	614841	614850	40 %	0 %	20 %	40 %	229606661
10002	NC_012668	GGTAAG	2	12	614875	614886	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	229606661
10003	NC_012668	AGA	2	6	614916	614921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606661
10004	NC_012668	AGA	2	6	614940	614945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606661
10005	NC_012668	TTGA	2	8	614986	614993	25 %	50 %	25 %	0 %	229606661
10006	NC_012668	CGAAAT	2	12	615024	615035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	229606661
10007	NC_012668	TGA	2	6	615077	615082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606661
10008	NC_012668	CGA	2	6	615084	615089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606661
10009	NC_012668	TGC	2	6	615092	615097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606661
10010	NC_012668	AGC	2	6	615194	615199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606661
10011	NC_012668	TTTG	2	8	615210	615217	0 %	75 %	25 %	0 %	229606661
10012	NC_012668	A	6	6	615242	615247	100 %	0 %	0 %	0 %	229606661
10013	NC_012668	GAA	2	6	615274	615279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606661
10014	NC_012668	GAT	2	6	615381	615386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606661
10015	NC_012668	ATC	2	6	615419	615424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606661
10016	NC_012668	TC	3	6	615447	615452	0 %	50 %	0 %	50 %	229606661
10017	NC_012668	GAA	2	6	615493	615498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606661
10018	NC_012668	TTG	2	6	615521	615526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606661
10019	NC_012668	ACT	2	6	615557	615562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606661
10020	NC_012668	CAT	2	6	615579	615584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606661
10021	NC_012668	GCG	2	6	615646	615651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606661
10022	NC_012668	CAG	3	9	615653	615661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606661
10023	NC_012668	AGC	2	6	615698	615703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606661
10024	NC_012668	TGC	2	6	615867	615872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606661
10025	NC_012668	GTC	2	6	615902	615907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606661
10026	NC_012668	CAT	2	6	616005	616010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606661
10027	NC_012668	A	6	6	616012	616017	100 %	0 %	0 %	0 %	229606661
10028	NC_012668	TGT	2	6	616022	616027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606661
10029	NC_012668	TGG	2	6	616028	616033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606661
10030	NC_012668	AAAGT	2	10	616136	616145	60 %	20 %	20 %	0 %	229606661
10031	NC_012668	ACA	2	6	616146	616151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606661
10032	NC_012668	GCT	2	6	617003	617008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606662
10033	NC_012668	CTT	3	9	617012	617020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606662
10034	NC_012668	GC	3	6	617068	617073	0 %	0 %	50 %	50 %	229606662
10035	NC_012668	CCA	2	6	617128	617133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606662
10036	NC_012668	GAT	2	6	617247	617252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606662
10037	NC_012668	CGA	2	6	617408	617413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606662
10038	NC_012668	TGGT	2	8	617494	617501	0 %	50 %	50 %	0 %	229606662
10039	NC_012668	GAA	2	6	617796	617801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606663
10040	NC_012668	GCT	2	6	617831	617836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606663
10041	NC_012668	GTA	2	6	617852	617857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606663
10042	NC_012668	TGC	2	6	617889	617894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606663
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10044	NC_012668	GCG	2	6	618005	618010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606663
10045	NC_012668	TGA	2	6	618035	618040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606663
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10048	NC_012668	GTTCC	2	10	618297	618306	0 %	40 %	20 %	40 %	229606663
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10050	NC_012668	GATATC	2	12	618370	618381	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229606663
10051	NC_012668	GGA	2	6	618600	618605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606664
10052	NC_012668	GCAT	2	8	618611	618618	25 %	25 %	25 %	25 %	229606664
10053	NC_012668	AGC	2	6	618668	618673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606664
10054	NC_012668	CAG	2	6	618691	618696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606664
10055	NC_012668	TGA	2	6	618783	618788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606664
10056	NC_012668	GA	3	6	618832	618837	50 %	0 %	50 %	0 %	229606664
10057	NC_012668	TC	3	6	618892	618897	0 %	50 %	0 %	50 %	229606664
10058	NC_012668	AGA	2	6	618903	618908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606664
10059	NC_012668	ATC	2	6	618944	618949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606664
10060	NC_012668	GCA	2	6	619035	619040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606664
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10062	NC_012668	TGA	2	6	619079	619084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606664
10063	NC_012668	T	6	6	619153	619158	0 %	100 %	0 %	0 %	229606664
10064	NC_012668	ATG	2	6	619220	619225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606664
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10066	NC_012668	GTAC	2	8	619311	619318	25 %	25 %	25 %	25 %	229606665
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10069	NC_012668	GCC	2	6	619390	619395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606665
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10101	NC_012668	CAA	2	6	621129	621134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606667
10102	NC_012668	CGCAG	2	10	621197	621206	20 %	0 %	40 %	40 %	229606667
10103	NC_012668	AAG	2	6	621217	621222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606667
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10118	NC_012668	ATT	2	6	622107	622112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606668
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10120	NC_012668	GCA	2	6	622136	622141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606668
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10122	NC_012668	CT	3	6	622222	622227	0 %	50 %	0 %	50 %	229606668
10123	NC_012668	TGC	2	6	622411	622416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606668
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10230	NC_012668	GGT	2	6	627910	627915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606673
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10237	NC_012668	CGT	2	6	628463	628468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606673
10238	NC_012668	GCA	2	6	628512	628517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606673
10239	NC_012668	GGT	2	6	628588	628593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606673
10240	NC_012668	TTC	2	6	628625	628630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606673
10241	NC_012668	TGA	2	6	628669	628674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606673
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10244	NC_012668	CCGTA	2	10	628859	628868	20 %	20 %	20 %	40 %	229606673
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10252	NC_012668	TCA	2	6	629268	629273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606674
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10358	NC_012668	GGCAG	2	10	635551	635560	20 %	0 %	60 %	20 %	229606681
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