MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012668	CAAAT	2	10	28518	28527	60 %	20 %	0 %	20 %	229606154
502	NC_012668	CCG	2	6	28577	28582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606154
503	NC_012668	TAA	2	6	28620	28625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606154
504	NC_012668	GTAG	2	8	28694	28701	25 %	25 %	50 %	0 %	229606155
505	NC_012668	GGCTTG	2	12	28758	28769	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	229606155
506	NC_012668	GCG	2	6	28776	28781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606155
507	NC_012668	CATCT	2	10	28794	28803	20 %	40 %	0 %	40 %	229606155
508	NC_012668	GCC	2	6	28881	28886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606155
509	NC_012668	CA	3	6	28961	28966	50 %	0 %	0 %	50 %	229606155
510	NC_012668	CGC	2	6	28982	28987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606155
511	NC_012668	AC	3	6	29033	29038	50 %	0 %	0 %	50 %	229606155
512	NC_012668	CAA	2	6	29143	29148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606155
513	NC_012668	CCAT	2	8	29161	29168	25 %	25 %	0 %	50 %	229606155
514	NC_012668	CGAG	2	8	29264	29271	25 %	0 %	50 %	25 %	229606155
515	NC_012668	AT	3	6	29281	29286	50 %	50 %	0 %	0 %	229606155
516	NC_012668	TTCA	2	8	29466	29473	25 %	50 %	0 %	25 %	229606155
517	NC_012668	GCA	2	6	29513	29518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606155
518	NC_012668	GC	3	6	29525	29530	0 %	0 %	50 %	50 %	229606155
519	NC_012668	A	6	6	29632	29637	100 %	0 %	0 %	0 %	229606155
520	NC_012668	CCAA	2	8	29682	29689	50 %	0 %	0 %	50 %	229606155
521	NC_012668	GTA	2	6	29694	29699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606155
522	NC_012668	CTT	2	6	29753	29758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606155
523	NC_012668	AAT	2	6	29820	29825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606155
524	NC_012668	ACG	2	6	29844	29849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606155
525	NC_012668	CGA	2	6	29892	29897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606155
526	NC_012668	GA	3	6	29950	29955	50 %	0 %	50 %	0 %	229606155
527	NC_012668	CAG	2	6	30018	30023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606155
528	NC_012668	TGA	2	6	30050	30055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606155
529	NC_012668	GTTT	2	8	30212	30219	0 %	75 %	25 %	0 %	229606155
530	NC_012668	GAT	2	6	30372	30377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606156
531	NC_012668	CAC	2	6	30441	30446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606156
532	NC_012668	AAT	2	6	30447	30452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606156
533	NC_012668	GCC	2	6	30481	30486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606156
534	NC_012668	TGC	2	6	30535	30540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
535	NC_012668	TTG	2	6	30624	30629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606156
536	NC_012668	ATG	2	6	30687	30692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606156
537	NC_012668	GAT	2	6	30939	30944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606156
538	NC_012668	GCG	2	6	30950	30955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606156
539	NC_012668	ACT	2	6	31003	31008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606156
540	NC_012668	CTG	2	6	31062	31067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
541	NC_012668	TCAAGG	2	12	31157	31168	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	229606156
542	NC_012668	CAAA	2	8	31205	31212	75 %	0 %	0 %	25 %	229606156
543	NC_012668	C	6	6	31217	31222	0 %	0 %	0 %	100 %	229606156
544	NC_012668	ATA	2	6	31223	31228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606156
545	NC_012668	TGC	2	6	31297	31302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
546	NC_012668	AGC	2	6	31342	31347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606156
547	NC_012668	TTC	2	6	31384	31389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606156
548	NC_012668	CTT	2	6	31499	31504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606156
549	NC_012668	GCA	2	6	31505	31510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606156
550	NC_012668	CTT	2	6	31535	31540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606156
551	NC_012668	GCGA	2	8	31703	31710	25 %	0 %	50 %	25 %	229606156
552	NC_012668	GCT	2	6	31742	31747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
553	NC_012668	T	6	6	31757	31762	0 %	100 %	0 %	0 %	229606156
554	NC_012668	CACTA	2	10	31836	31845	40 %	20 %	0 %	40 %	229606156
555	NC_012668	A	6	6	31956	31961	100 %	0 %	0 %	0 %	229606156
556	NC_012668	GCC	2	6	31972	31977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606156
557	NC_012668	CT	3	6	32002	32007	0 %	50 %	0 %	50 %	229606156
558	NC_012668	GAT	2	6	32040	32045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606156
559	NC_012668	CTG	2	6	32073	32078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
560	NC_012668	TGT	2	6	32252	32257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606156
561	NC_012668	AGC	2	6	32338	32343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606156
562	NC_012668	GCT	2	6	32348	32353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
563	NC_012668	TAA	2	6	32372	32377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606156
564	NC_012668	GCTG	2	8	32398	32405	0 %	25 %	50 %	25 %	229606156
565	NC_012668	GTTT	2	8	32473	32480	0 %	75 %	25 %	0 %	229606156
566	NC_012668	ATT	2	6	32514	32519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606156
567	NC_012668	T	6	6	32642	32647	0 %	100 %	0 %	0 %	229606156
568	NC_012668	GC	3	6	32686	32691	0 %	0 %	50 %	50 %	229606156
569	NC_012668	T	6	6	32783	32788	0 %	100 %	0 %	0 %	229606156
570	NC_012668	ATTG	2	8	32792	32799	25 %	50 %	25 %	0 %	229606156
571	NC_012668	TGG	2	6	32837	32842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606156
572	NC_012668	GAGC	2	8	32850	32857	25 %	0 %	50 %	25 %	229606156
573	NC_012668	TGC	2	6	32884	32889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
574	NC_012668	CAT	2	6	32919	32924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606156
575	NC_012668	AGA	2	6	33135	33140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606156
576	NC_012668	ACT	2	6	33165	33170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606156
577	NC_012668	TAA	2	6	33180	33185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606156
578	NC_012668	AAC	2	6	33202	33207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606156
579	NC_012668	TCA	2	6	33218	33223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606156
580	NC_012668	AAAC	2	8	33234	33241	75 %	0 %	0 %	25 %	229606157
581	NC_012668	GCA	2	6	33253	33258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606157
582	NC_012668	ATC	2	6	33292	33297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606157
583	NC_012668	AAT	2	6	33357	33362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606157
584	NC_012668	CAAC	2	8	33366	33373	50 %	0 %	0 %	50 %	229606157
585	NC_012668	GAGC	2	8	33542	33549	25 %	0 %	50 %	25 %	229606157
586	NC_012668	CAA	2	6	33561	33566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606157
587	NC_012668	CGC	2	6	33567	33572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606157
588	NC_012668	GCC	2	6	33579	33584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606157
589	NC_012668	TAA	2	6	33588	33593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606157
590	NC_012668	GCG	2	6	33632	33637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606157
591	NC_012668	AG	3	6	33647	33652	50 %	0 %	50 %	0 %	229606157
592	NC_012668	AGA	2	6	33666	33671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606157
593	NC_012668	CCA	2	6	33678	33683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606157
594	NC_012668	AAG	2	6	33701	33706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606158
595	NC_012668	GT	3	6	33720	33725	0 %	50 %	50 %	0 %	229606158
596	NC_012668	GCG	2	6	33753	33758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606158
597	NC_012668	GCT	2	6	33832	33837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606158
598	NC_012668	CGG	2	6	33907	33912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606158
599	NC_012668	CGC	2	6	33971	33976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606158
600	NC_012668	C	6	6	33981	33986	0 %	0 %	0 %	100 %	229606158
601	NC_012668	GATC	2	8	33991	33998	25 %	25 %	25 %	25 %	229606158
602	NC_012668	GA	3	6	34024	34029	50 %	0 %	50 %	0 %	229606158
603	NC_012668	GCG	2	6	34122	34127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606158
604	NC_012668	AC	3	6	34180	34185	50 %	0 %	0 %	50 %	229606158
605	NC_012668	CTT	2	6	34192	34197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606158
606	NC_012668	GCG	2	6	34224	34229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606158
607	NC_012668	CA	3	6	34307	34312	50 %	0 %	0 %	50 %	229606158
608	NC_012668	ACTG	2	8	34318	34325	25 %	25 %	25 %	25 %	229606158
609	NC_012668	ACC	3	9	34328	34336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606158
610	NC_012668	GGC	2	6	34384	34389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606158
611	NC_012668	TGC	2	6	34466	34471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606158
612	NC_012668	CCCG	2	8	34485	34492	0 %	0 %	25 %	75 %	229606158
613	NC_012668	GTTT	2	8	34624	34631	0 %	75 %	25 %	0 %	229606158
614	NC_012668	AC	3	6	34779	34784	50 %	0 %	0 %	50 %	229606159
615	NC_012668	GCAT	2	8	34832	34839	25 %	25 %	25 %	25 %	229606159
616	NC_012668	AAG	2	6	34844	34849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606159
617	NC_012668	GAC	2	6	34882	34887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606159
618	NC_012668	GCA	2	6	34919	34924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606159
619	NC_012668	CACCC	2	10	34981	34990	20 %	0 %	0 %	80 %	229606159
620	NC_012668	AGC	2	6	35008	35013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606159
621	NC_012668	CCA	2	6	35148	35153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606159
622	NC_012668	AGC	2	6	35234	35239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606159
623	NC_012668	CGT	2	6	35317	35322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606159
624	NC_012668	GGT	2	6	35339	35344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606159
625	NC_012668	AAT	2	6	35347	35352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606159
626	NC_012668	CTGG	2	8	35416	35423	0 %	25 %	50 %	25 %	229606159
627	NC_012668	CCA	2	6	35453	35458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606159
628	NC_012668	CGA	2	6	35470	35475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606159
629	NC_012668	GTA	2	6	35680	35685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606159
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759	NC_012668	TCA	2	6	44321	44326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606166
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873	NC_012668	TCAAT	2	10	51185	51194	40 %	40 %	0 %	20 %	229606174
874	NC_012668	GCA	2	6	51245	51250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606174
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