MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_012668	GCAG	2	8	519395	519402	25 %	0 %	50 %	25 %	229606572
8502	NC_012668	TGC	2	6	519471	519476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606572
8503	NC_012668	AAGTG	2	10	519571	519580	40 %	20 %	40 %	0 %	229606572
8504	NC_012668	CTCA	2	8	519590	519597	25 %	25 %	0 %	50 %	229606572
8505	NC_012668	CCAA	2	8	519642	519649	50 %	0 %	0 %	50 %	229606572
8506	NC_012668	CTA	2	6	519658	519663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606572
8507	NC_012668	CAC	2	6	519694	519699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606572
8508	NC_012668	AGCTC	2	10	519745	519754	20 %	20 %	20 %	40 %	229606572
8509	NC_012668	TGC	2	6	519846	519851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606572
8510	NC_012668	GTG	2	6	520038	520043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606572
8511	NC_012668	AAG	3	9	520098	520106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606572
8512	NC_012668	CTGCG	2	10	520193	520202	0 %	20 %	40 %	40 %	229606572
8513	NC_012668	TGG	2	6	520245	520250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606572
8514	NC_012668	GAT	2	6	520259	520264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606572
8515	NC_012668	CAG	2	6	520385	520390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606573
8516	NC_012668	CGGA	2	8	520491	520498	25 %	0 %	50 %	25 %	229606573
8517	NC_012668	TAA	2	6	520590	520595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606573
8518	NC_012668	GGC	2	6	520627	520632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606573
8519	NC_012668	CTG	2	6	520705	520710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606573
8520	NC_012668	T	6	6	520773	520778	0 %	100 %	0 %	0 %	229606573
8521	NC_012668	AGCA	2	8	520807	520814	50 %	0 %	25 %	25 %	229606573
8522	NC_012668	GC	3	6	520835	520840	0 %	0 %	50 %	50 %	229606573
8523	NC_012668	TCAA	2	8	520922	520929	50 %	25 %	0 %	25 %	229606573
8524	NC_012668	TAT	2	6	520993	520998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606573
8525	NC_012668	A	7	7	521039	521045	100 %	0 %	0 %	0 %	229606573
8526	NC_012668	CAG	2	6	521059	521064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606573
8527	NC_012668	TGT	2	6	521138	521143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606573
8528	NC_012668	GT	3	6	521167	521172	0 %	50 %	50 %	0 %	229606573
8529	NC_012668	GCA	2	6	521193	521198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606573
8530	NC_012668	GAT	2	6	521239	521244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606573
8531	NC_012668	TGA	2	6	521522	521527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606574
8532	NC_012668	CAC	2	6	521541	521546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606574
8533	NC_012668	GGT	2	6	521558	521563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606574
8534	NC_012668	TGA	2	6	521576	521581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606574
8535	NC_012668	GTCA	2	8	521639	521646	25 %	25 %	25 %	25 %	229606574
8536	NC_012668	CCGA	2	8	521667	521674	25 %	0 %	25 %	50 %	229606574
8537	NC_012668	TCA	2	6	521710	521715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606574
8538	NC_012668	CGG	2	6	521732	521737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606574
8539	NC_012668	GAC	2	6	521745	521750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606574
8540	NC_012668	GGT	2	6	521769	521774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606574
8541	NC_012668	GT	3	6	521788	521793	0 %	50 %	50 %	0 %	229606574
8542	NC_012668	GGT	2	6	521795	521800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606574
8543	NC_012668	TGC	2	6	521821	521826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606574
8544	NC_012668	GTG	2	6	521839	521844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606574
8545	NC_012668	CAT	2	6	521868	521873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606574
8546	NC_012668	TAC	2	6	521924	521929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606574
8547	NC_012668	GAA	2	6	522057	522062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606574
8548	NC_012668	A	6	6	522066	522071	100 %	0 %	0 %	0 %	229606574
8549	NC_012668	AAC	2	6	522246	522251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606574
8550	NC_012668	TGG	2	6	522266	522271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606574
8551	NC_012668	GTG	2	6	522292	522297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606574
8552	NC_012668	AAC	2	6	522315	522320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606574
8553	NC_012668	AAG	2	6	522331	522336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606574
8554	NC_012668	GAA	2	6	522344	522349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606574
8555	NC_012668	TGA	2	6	522371	522376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606574
8556	NC_012668	CCAAA	2	10	522437	522446	60 %	0 %	0 %	40 %	229606574
8557	NC_012668	TTC	2	6	522458	522463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606574
8558	NC_012668	ATGA	2	8	522492	522499	50 %	25 %	25 %	0 %	229606574
8559	NC_012668	AAGCG	2	10	522530	522539	40 %	0 %	40 %	20 %	229606574
8560	NC_012668	ATT	2	6	522558	522563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606574
8561	NC_012668	GCG	2	6	522567	522572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606574
8562	NC_012668	GCG	2	6	522585	522590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606574
8563	NC_012668	GC	3	6	522622	522627	0 %	0 %	50 %	50 %	229606574
8564	NC_012668	GCGG	2	8	522717	522724	0 %	0 %	75 %	25 %	229606574
8565	NC_012668	CCGTAA	2	12	522740	522751	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229606574
8566	NC_012668	TGT	2	6	522817	522822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606574
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8568	NC_012668	TCA	2	6	522844	522849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606574
8569	NC_012668	TGA	2	6	522875	522880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606574
8570	NC_012668	CAT	4	12	522911	522922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606574
8571	NC_012668	CTG	2	6	522960	522965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606574
8572	NC_012668	TTGA	2	8	522996	523003	25 %	50 %	25 %	0 %	229606574
8573	NC_012668	CCA	2	6	523029	523034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606574
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8580	NC_012668	AAG	2	6	523354	523359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606574
8581	NC_012668	GCTGA	2	10	523398	523407	20 %	20 %	40 %	20 %	229606574
8582	NC_012668	TACT	2	8	523458	523465	25 %	50 %	0 %	25 %	229606574
8583	NC_012668	TTGA	2	8	523533	523540	25 %	50 %	25 %	0 %	229606574
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8587	NC_012668	CGC	2	6	523626	523631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606574
8588	NC_012668	GTCT	2	8	523633	523640	0 %	50 %	25 %	25 %	229606574
8589	NC_012668	CGT	2	6	523713	523718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606574
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8592	NC_012668	CGT	2	6	523797	523802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606574
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8594	NC_012668	TGC	2	6	524363	524368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606575
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8600	NC_012668	AG	3	6	524781	524786	50 %	0 %	50 %	0 %	229606576
8601	NC_012668	TTAA	2	8	524820	524827	50 %	50 %	0 %	0 %	229606576
8602	NC_012668	ATG	2	6	525162	525167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606577
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8606	NC_012668	AG	3	6	525338	525343	50 %	0 %	50 %	0 %	229606577
8607	NC_012668	CTG	2	6	525444	525449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606577
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8612	NC_012668	TCA	2	6	525841	525846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606578
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8616	NC_012668	CGCAG	2	10	526109	526118	20 %	0 %	40 %	40 %	229606578
8617	NC_012668	GGTTG	2	10	526305	526314	0 %	40 %	60 %	0 %	229606578
8618	NC_012668	AC	3	6	526325	526330	50 %	0 %	0 %	50 %	229606578
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