MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012668	GC	3	6	370487	370492	0 %	0 %	50 %	50 %	229606450
6002	NC_012668	TGC	2	6	370523	370528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606450
6003	NC_012668	CAA	2	6	370591	370596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606450
6004	NC_012668	ACC	3	9	370631	370639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606450
6005	NC_012668	CTGCA	2	10	370732	370741	20 %	20 %	20 %	40 %	229606450
6006	NC_012668	GCA	2	6	370767	370772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606450
6007	NC_012668	TCAG	2	8	370784	370791	25 %	25 %	25 %	25 %	229606450
6008	NC_012668	CCG	2	6	370866	370871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606450
6009	NC_012668	GCC	2	6	370874	370879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606450
6010	NC_012668	GCT	2	6	370893	370898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606450
6011	NC_012668	CGC	2	6	370906	370911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606450
6012	NC_012668	CAAT	2	8	371033	371040	50 %	25 %	0 %	25 %	229606450
6013	NC_012668	CAG	2	6	371041	371046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606450
6014	NC_012668	TGA	2	6	371105	371110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606450
6015	NC_012668	TGT	2	6	371121	371126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606450
6016	NC_012668	AGT	2	6	371374	371379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606452
6017	NC_012668	T	6	6	371379	371384	0 %	100 %	0 %	0 %	229606452
6018	NC_012668	ATC	2	6	371400	371405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606452
6019	NC_012668	TTG	2	6	371528	371533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606452
6020	NC_012668	CAAG	2	8	371540	371547	50 %	0 %	25 %	25 %	229606452
6021	NC_012668	TCA	2	6	371604	371609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606452
6022	NC_012668	AGA	2	6	371648	371653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606452
6023	NC_012668	ACCA	2	8	371657	371664	50 %	0 %	0 %	50 %	229606452
6024	NC_012668	T	6	6	371688	371693	0 %	100 %	0 %	0 %	229606452
6025	NC_012668	CA	3	6	371793	371798	50 %	0 %	0 %	50 %	229606452
6026	NC_012668	AAC	2	6	371820	371825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606452
6027	NC_012668	AAAAT	2	10	371841	371850	80 %	20 %	0 %	0 %	229606452
6028	NC_012668	GAT	2	6	371884	371889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606453
6029	NC_012668	GC	3	6	371913	371918	0 %	0 %	50 %	50 %	229606453
6030	NC_012668	AGTGT	2	10	371951	371960	20 %	40 %	40 %	0 %	229606453
6031	NC_012668	T	6	6	371960	371965	0 %	100 %	0 %	0 %	229606453
6032	NC_012668	TAA	2	6	372069	372074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606453
6033	NC_012668	AAG	2	6	372111	372116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606453
6034	NC_012668	CGT	2	6	372131	372136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606453
6035	NC_012668	A	7	7	372151	372157	100 %	0 %	0 %	0 %	229606453
6036	NC_012668	CAA	2	6	372184	372189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606453
6037	NC_012668	TCA	2	6	372284	372289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606453
6038	NC_012668	CTG	2	6	372365	372370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606453
6039	NC_012668	TAA	2	6	372378	372383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606453
6040	NC_012668	TGT	2	6	372385	372390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606453
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6043	NC_012668	TGCT	2	8	372531	372538	0 %	50 %	25 %	25 %	229606453
6044	NC_012668	GCG	2	6	372625	372630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606453
6045	NC_012668	CT	3	6	372662	372667	0 %	50 %	0 %	50 %	229606453
6046	NC_012668	GTT	2	6	372719	372724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606453
6047	NC_012668	TCA	2	6	373039	373044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606454
6048	NC_012668	ATG	2	6	373068	373073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606454
6049	NC_012668	TGC	2	6	373099	373104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606454
6050	NC_012668	ATG	2	6	373163	373168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606454
6051	NC_012668	CT	3	6	373185	373190	0 %	50 %	0 %	50 %	229606454
6052	NC_012668	GTAT	2	8	373209	373216	25 %	50 %	25 %	0 %	229606454
6053	NC_012668	ATG	2	6	373235	373240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606454
6054	NC_012668	CTGC	2	8	373241	373248	0 %	25 %	25 %	50 %	229606454
6055	NC_012668	TGTC	2	8	373266	373273	0 %	50 %	25 %	25 %	229606454
6056	NC_012668	TTTC	2	8	373309	373316	0 %	75 %	0 %	25 %	229606454
6057	NC_012668	TTTA	2	8	373343	373350	25 %	75 %	0 %	0 %	229606454
6058	NC_012668	ATT	2	6	373413	373418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606454
6059	NC_012668	TGA	2	6	373498	373503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606454
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6061	NC_012668	TCT	2	6	373518	373523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606454
6062	NC_012668	GAT	3	9	373526	373534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606454
6063	NC_012668	TAG	2	6	373579	373584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606454
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6065	NC_012668	CT	3	6	373682	373687	0 %	50 %	0 %	50 %	229606454
6066	NC_012668	TGC	2	6	373732	373737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606454
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6068	NC_012668	GCA	2	6	374021	374026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606454
6069	NC_012668	A	6	6	374057	374062	100 %	0 %	0 %	0 %	229606454
6070	NC_012668	TCA	2	6	374074	374079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606454
6071	NC_012668	TGC	2	6	374098	374103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606454
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6073	NC_012668	A	6	6	374209	374214	100 %	0 %	0 %	0 %	229606454
6074	NC_012668	AGCA	2	8	374266	374273	50 %	0 %	25 %	25 %	229606454
6075	NC_012668	TAC	2	6	374292	374297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606454
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6081	NC_012668	GAA	2	6	374735	374740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606454
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6086	NC_012668	A	7	7	375050	375056	100 %	0 %	0 %	0 %	229606455
6087	NC_012668	CCATTA	2	12	375137	375148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606455
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6093	NC_012668	AAT	2	6	375362	375367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606455
6094	NC_012668	TGA	2	6	375380	375385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606455
6095	NC_012668	TATCC	2	10	375393	375402	20 %	40 %	0 %	40 %	229606455
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6099	NC_012668	TTG	2	6	375460	375465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606455
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6105	NC_012668	GTT	2	6	375804	375809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606455
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6109	NC_012668	TCA	2	6	376157	376162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606456
6110	NC_012668	ATA	2	6	376213	376218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606456
6111	NC_012668	TAG	2	6	376311	376316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606456
6112	NC_012668	AT	3	6	376320	376325	50 %	50 %	0 %	0 %	229606456
6113	NC_012668	ACT	2	6	376330	376335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606456
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6117	NC_012668	ATG	2	6	376480	376485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606456
6118	NC_012668	ATT	2	6	376501	376506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606456
6119	NC_012668	AGC	2	6	376588	376593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606456
6120	NC_012668	GTG	2	6	376637	376642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606456
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6122	NC_012668	TCTA	2	8	379253	379260	25 %	50 %	0 %	25 %	229606457
6123	NC_012668	CCCAT	2	10	379271	379280	20 %	20 %	0 %	60 %	229606457
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6491	NC_012668	ATGC	2	8	399065	399072	25 %	25 %	25 %	25 %	229606473
6492	NC_012668	GTG	2	6	399181	399186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606473
6493	NC_012668	CAA	3	9	399249	399257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606473
6494	NC_012668	TCTT	2	8	399274	399281	0 %	75 %	0 %	25 %	229606473
6495	NC_012668	TGA	2	6	399368	399373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606473
6496	NC_012668	CA	3	6	399450	399455	50 %	0 %	0 %	50 %	229606473
6497	NC_012668	T	6	6	399469	399474	0 %	100 %	0 %	0 %	229606473
6498	NC_012668	CT	3	6	399502	399507	0 %	50 %	0 %	50 %	229606473
6499	NC_012668	TGA	2	6	399526	399531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606473
6500	NC_012668	ACA	2	6	399582	399587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606473

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