MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 16955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012667	ATG	3	9	245323	245331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605270
4002	NC_012667	AC	3	6	245372	245377	50 %	0 %	0 %	50 %	229605270
4003	NC_012667	CAC	2	6	245400	245405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605270
4004	NC_012667	AGA	2	6	245653	245658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605271
4005	NC_012667	AGC	2	6	245707	245712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605271
4006	NC_012667	TGG	2	6	245749	245754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605271
4007	NC_012667	CCA	2	6	245819	245824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605271
4008	NC_012667	CA	3	6	245823	245828	50 %	0 %	0 %	50 %	229605271
4009	NC_012667	CATT	2	8	245836	245843	25 %	50 %	0 %	25 %	229605271
4010	NC_012667	GC	3	6	245906	245911	0 %	0 %	50 %	50 %	229605271
4011	NC_012667	CAC	2	6	245929	245934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605271
4012	NC_012667	CGC	2	6	245961	245966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605271
4013	NC_012667	TAAA	2	8	245987	245994	75 %	25 %	0 %	0 %	229605271
4014	NC_012667	ACG	2	6	246012	246017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605271
4015	NC_012667	TGT	2	6	246026	246031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605271
4016	NC_012667	ATT	2	6	246218	246223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605272
4017	NC_012667	TCT	2	6	246256	246261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605272
4018	NC_012667	A	6	6	246275	246280	100 %	0 %	0 %	0 %	229605272
4019	NC_012667	CCA	2	6	246328	246333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605272
4020	NC_012667	TCTTT	2	10	246334	246343	0 %	80 %	0 %	20 %	229605272
4021	NC_012667	CAAT	2	8	246358	246365	50 %	25 %	0 %	25 %	229605272
4022	NC_012667	GGTGG	2	10	246398	246407	0 %	20 %	80 %	0 %	229605272
4023	NC_012667	CAG	2	6	246428	246433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605272
4024	NC_012667	CCGC	2	8	246441	246448	0 %	0 %	25 %	75 %	229605272
4025	NC_012667	ACG	2	6	246471	246476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605272
4026	NC_012667	AACA	2	8	246486	246493	75 %	0 %	0 %	25 %	229605272
4027	NC_012667	CCCA	2	8	246504	246511	25 %	0 %	0 %	75 %	229605272
4028	NC_012667	CTT	2	6	246553	246558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605272
4029	NC_012667	TAA	2	6	246567	246572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605272
4030	NC_012667	GGT	2	6	246604	246609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605272
4031	NC_012667	GCA	2	6	246630	246635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605272
4032	NC_012667	A	8	8	246701	246708	100 %	0 %	0 %	0 %	229605272
4033	NC_012667	CAG	2	6	246733	246738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605272
4034	NC_012667	TCT	2	6	246770	246775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605272
4035	NC_012667	CT	3	6	246774	246779	0 %	50 %	0 %	50 %	229605272
4036	NC_012667	ATAA	2	8	246803	246810	75 %	25 %	0 %	0 %	229605272
4037	NC_012667	CTG	2	6	246816	246821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605272
4038	NC_012667	CG	3	6	246941	246946	0 %	0 %	50 %	50 %	229605273
4039	NC_012667	TGT	2	6	247089	247094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605273
4040	NC_012667	TGA	2	6	247099	247104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605273
4041	NC_012667	ATA	2	6	247136	247141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605273
4042	NC_012667	ATCC	2	8	247241	247248	25 %	25 %	0 %	50 %	229605273
4043	NC_012667	GCT	2	6	247254	247259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605273
4044	NC_012667	CT	3	6	247350	247355	0 %	50 %	0 %	50 %	229605273
4045	NC_012667	CCA	2	6	247500	247505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605273
4046	NC_012667	A	6	6	247540	247545	100 %	0 %	0 %	0 %	229605273
4047	NC_012667	CTG	2	6	247611	247616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605273
4048	NC_012667	CCA	2	6	247678	247683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605273
4049	NC_012667	CGAT	2	8	247687	247694	25 %	25 %	25 %	25 %	229605273
4050	NC_012667	AAC	2	6	247770	247775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605273
4051	NC_012667	GC	3	6	248032	248037	0 %	0 %	50 %	50 %	229605273
4052	NC_012667	CTG	2	6	248057	248062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605273
4053	NC_012667	CAT	2	6	248099	248104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605273
4054	NC_012667	ACT	2	6	248114	248119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605273
4055	NC_012667	CAT	2	6	248209	248214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605273
4056	NC_012667	GCA	2	6	248287	248292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605273
4057	NC_012667	CCA	2	6	248317	248322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605273
4058	NC_012667	CAA	2	6	248342	248347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605273
4059	NC_012667	CCT	2	6	248358	248363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605273
4060	NC_012667	CT	3	6	248412	248417	0 %	50 %	0 %	50 %	229605273
4061	NC_012667	CCA	2	6	248557	248562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605273
4062	NC_012667	AG	3	6	248582	248587	50 %	0 %	50 %	0 %	229605273
4063	NC_012667	GTT	2	6	248615	248620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605273
4064	NC_012667	T	7	7	248699	248705	0 %	100 %	0 %	0 %	229605273
4065	NC_012667	TCA	2	6	248724	248729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605273
4066	NC_012667	ACC	2	6	248745	248750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605273
4067	NC_012667	GTT	2	6	248872	248877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605273
4068	NC_012667	CCA	2	6	248917	248922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605273
4069	NC_012667	TCA	2	6	248952	248957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605273
4070	NC_012667	TGT	2	6	248965	248970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605273
4071	NC_012667	T	6	6	248972	248977	0 %	100 %	0 %	0 %	229605273
4072	NC_012667	TGG	2	6	249001	249006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605273
4073	NC_012667	TGC	3	9	249054	249062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605273
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4075	NC_012667	CGGAT	2	10	249180	249189	20 %	20 %	40 %	20 %	229605273
4076	NC_012667	TTTCTT	2	12	249211	249222	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	229605273
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4078	NC_012667	GTA	2	6	249321	249326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605273
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4080	NC_012667	CTG	2	6	249420	249425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605273
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4082	NC_012667	CTT	2	6	249475	249480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605273
4083	NC_012667	GCT	2	6	249653	249658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605273
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4085	NC_012667	AG	3	6	249719	249724	50 %	0 %	50 %	0 %	229605273
4086	NC_012667	GTTT	2	8	249790	249797	0 %	75 %	25 %	0 %	229605273
4087	NC_012667	TCA	3	9	249801	249809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605273
4088	NC_012667	CAAT	2	8	249813	249820	50 %	25 %	0 %	25 %	229605273
4089	NC_012667	TCA	2	6	249873	249878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605273
4090	NC_012667	AGCC	2	8	249888	249895	25 %	0 %	25 %	50 %	229605273
4091	NC_012667	GCT	2	6	249925	249930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605273
4092	NC_012667	ATC	2	6	249995	250000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605273
4093	NC_012667	CAT	2	6	250081	250086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605273
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4095	NC_012667	TGA	2	6	250141	250146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605274
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4098	NC_012667	CTG	2	6	250324	250329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605274
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4100	NC_012667	CTG	2	6	250402	250407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605274
4101	NC_012667	ACG	2	6	250684	250689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605274
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4103	NC_012667	A	6	6	250729	250734	100 %	0 %	0 %	0 %	229605274
4104	NC_012667	GCT	2	6	250821	250826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605274
4105	NC_012667	TTG	2	6	250998	251003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605274
4106	NC_012667	CA	3	6	251030	251035	50 %	0 %	0 %	50 %	229605275
4107	NC_012667	CA	4	8	251039	251046	50 %	0 %	0 %	50 %	229605275
4108	NC_012667	CTG	2	6	251103	251108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605275
4109	NC_012667	GCG	2	6	251141	251146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605275
4110	NC_012667	CTGC	2	8	251206	251213	0 %	25 %	25 %	50 %	229605275
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4117	NC_012667	CCG	2	6	251407	251412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605275
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4120	NC_012667	GTG	2	6	251539	251544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605275
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4122	NC_012667	GCA	2	6	251663	251668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605275
4123	NC_012667	GGTTTT	2	12	251670	251681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605275
4124	NC_012667	GGC	2	6	251701	251706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605275
4125	NC_012667	AAGA	2	8	251764	251771	75 %	0 %	25 %	0 %	229605275
4126	NC_012667	ACTG	2	8	251816	251823	25 %	25 %	25 %	25 %	229605275
4127	NC_012667	CCCG	2	8	251909	251916	0 %	0 %	25 %	75 %	229605275
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4364	NC_012667	AGAGA	2	10	266153	266162	60 %	0 %	40 %	0 %	229605282
4365	NC_012667	AAC	2	6	266219	266224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605282
4366	NC_012667	AAT	2	6	266228	266233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605282
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4368	NC_012667	GCTC	2	8	266300	266307	0 %	25 %	25 %	50 %	229605282
4369	NC_012667	GAA	2	6	266324	266329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605282
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4373	NC_012667	CA	3	6	266552	266557	50 %	0 %	0 %	50 %	229605282
4374	NC_012667	TAC	2	6	266629	266634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605282
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4377	NC_012667	AGAGC	2	10	266734	266743	40 %	0 %	40 %	20 %	229605282
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4383	NC_012667	GC	3	6	267215	267220	0 %	0 %	50 %	50 %	229605283
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4491	NC_012667	TTC	2	6	274491	274496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605289
4492	NC_012667	ACA	2	6	274585	274590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605289
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