MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 16955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012667	GGCT	2	8	214530	214537	0 %	25 %	50 %	25 %	229605246
3502	NC_012667	GAA	2	6	214568	214573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605246
3503	NC_012667	AAT	2	6	214607	214612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605246
3504	NC_012667	CTG	2	6	214661	214666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605246
3505	NC_012667	CAG	2	6	214699	214704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605246
3506	NC_012667	CTT	2	6	214742	214747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605246
3507	NC_012667	CAA	2	6	214763	214768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605246
3508	NC_012667	AGA	2	6	214780	214785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605246
3509	NC_012667	GGC	2	6	214801	214806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605246
3510	NC_012667	A	6	6	214820	214825	100 %	0 %	0 %	0 %	229605246
3511	NC_012667	TGA	2	6	214842	214847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605246
3512	NC_012667	TGC	2	6	214848	214853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605246
3513	NC_012667	AGC	2	6	214911	214916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605246
3514	NC_012667	GC	3	6	214919	214924	0 %	0 %	50 %	50 %	229605246
3515	NC_012667	TC	3	6	214975	214980	0 %	50 %	0 %	50 %	229605246
3516	NC_012667	TGG	2	6	215003	215008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605246
3517	NC_012667	A	6	6	215039	215044	100 %	0 %	0 %	0 %	229605246
3518	NC_012667	GTC	2	6	215060	215065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605246
3519	NC_012667	TG	3	6	215095	215100	0 %	50 %	50 %	0 %	229605246
3520	NC_012667	TCAC	2	8	215113	215120	25 %	25 %	0 %	50 %	229605246
3521	NC_012667	CAG	2	6	215152	215157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605246
3522	NC_012667	TGC	2	6	215194	215199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605246
3523	NC_012667	TGC	2	6	215286	215291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605246
3524	NC_012667	AAG	2	6	215383	215388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605247
3525	NC_012667	ACC	2	6	215463	215468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605247
3526	NC_012667	CAT	2	6	215492	215497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605247
3527	NC_012667	CCG	2	6	215510	215515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605247
3528	NC_012667	GC	3	6	215552	215557	0 %	0 %	50 %	50 %	229605247
3529	NC_012667	TGAG	2	8	215620	215627	25 %	25 %	50 %	0 %	229605247
3530	NC_012667	GCATG	2	10	215699	215708	20 %	20 %	40 %	20 %	229605247
3531	NC_012667	TGA	2	6	215711	215716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605247
3532	NC_012667	CTA	2	6	215786	215791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605247
3533	NC_012667	A	6	6	215794	215799	100 %	0 %	0 %	0 %	229605247
3534	NC_012667	TGA	2	6	215921	215926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605247
3535	NC_012667	CTG	2	6	215952	215957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605247
3536	NC_012667	CAAGC	2	10	215979	215988	40 %	0 %	20 %	40 %	229605247
3537	NC_012667	CAA	2	6	215997	216002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605247
3538	NC_012667	GAT	2	6	216020	216025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605247
3539	NC_012667	CT	3	6	216111	216116	0 %	50 %	0 %	50 %	229605247
3540	NC_012667	CCA	2	6	216139	216144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605247
3541	NC_012667	TGC	2	6	216145	216150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605247
3542	NC_012667	CATT	2	8	216179	216186	25 %	50 %	0 %	25 %	229605247
3543	NC_012667	GT	3	6	216228	216233	0 %	50 %	50 %	0 %	229605247
3544	NC_012667	AAAG	2	8	216272	216279	75 %	0 %	25 %	0 %	229605247
3545	NC_012667	TGA	2	6	216301	216306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605247
3546	NC_012667	CGC	2	6	216345	216350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605247
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3549	NC_012667	CCG	2	6	216494	216499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605247
3550	NC_012667	TTGG	2	8	216500	216507	0 %	50 %	50 %	0 %	229605247
3551	NC_012667	CTG	3	9	216525	216533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605247
3552	NC_012667	ATG	2	6	216589	216594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605247
3553	NC_012667	GTG	2	6	216667	216672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605247
3554	NC_012667	CCT	2	6	216673	216678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605247
3555	NC_012667	ATGC	2	8	216744	216751	25 %	25 %	25 %	25 %	229605247
3556	NC_012667	ACGT	2	8	216863	216870	25 %	25 %	25 %	25 %	229605247
3557	NC_012667	GT	4	8	216924	216931	0 %	50 %	50 %	0 %	229605247
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3559	NC_012667	TCG	2	6	217110	217115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605248
3560	NC_012667	ATT	2	6	217136	217141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605248
3561	NC_012667	CATT	2	8	217201	217208	25 %	50 %	0 %	25 %	229605248
3562	NC_012667	TGAT	2	8	217353	217360	25 %	50 %	25 %	0 %	229605248
3563	NC_012667	CTT	2	6	217401	217406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605248
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3565	NC_012667	AAT	2	6	217458	217463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605248
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3567	NC_012667	TG	3	6	217496	217501	0 %	50 %	50 %	0 %	229605249
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3569	NC_012667	TGA	2	6	217598	217603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605249
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3573	NC_012667	AAACC	2	10	217699	217708	60 %	0 %	0 %	40 %	229605249
3574	NC_012667	TGTTC	2	10	217728	217737	0 %	60 %	20 %	20 %	229605249
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3581	NC_012667	AGGTA	2	10	218313	218322	40 %	20 %	40 %	0 %	229605249
3582	NC_012667	GTG	2	6	218381	218386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605249
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3584	NC_012667	CTACCT	2	12	218571	218582	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	229605249
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3588	NC_012667	AATC	2	8	218958	218965	50 %	25 %	0 %	25 %	229605250
3589	NC_012667	TTG	2	6	218973	218978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605250
3590	NC_012667	CTT	2	6	219041	219046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605250
3591	NC_012667	GCA	2	6	219310	219315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605250
3592	NC_012667	AGC	2	6	219403	219408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605250
3593	NC_012667	TCC	2	6	219460	219465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605250
3594	NC_012667	TTTC	2	8	219545	219552	0 %	75 %	0 %	25 %	229605250
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3597	NC_012667	ATC	2	6	219660	219665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605250
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3601	NC_012667	GATT	2	8	220103	220110	25 %	50 %	25 %	0 %	229605250
3602	NC_012667	GAT	2	6	220146	220151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605250
3603	NC_012667	ATA	2	6	220186	220191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605250
3604	NC_012667	TGAG	2	8	220193	220200	25 %	25 %	50 %	0 %	229605250
3605	NC_012667	GCT	2	6	220223	220228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605250
3606	NC_012667	CCA	2	6	220244	220249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605250
3607	NC_012667	CTG	2	6	220259	220264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605250
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3609	NC_012667	CAT	2	6	220382	220387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605250
3610	NC_012667	CAC	2	6	220392	220397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605250
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3612	NC_012667	CGT	2	6	220767	220772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605250
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3618	NC_012667	TGCT	2	8	221112	221119	0 %	50 %	25 %	25 %	229605250
3619	NC_012667	TGG	2	6	221212	221217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605250
3620	NC_012667	GCT	2	6	221252	221257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605250
3621	NC_012667	CAGA	2	8	221285	221292	50 %	0 %	25 %	25 %	229605250
3622	NC_012667	CA	3	6	221320	221325	50 %	0 %	0 %	50 %	229605250
3623	NC_012667	GTG	2	6	221350	221355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605250
3624	NC_012667	TCA	2	6	221440	221445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605250
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3626	NC_012667	ATC	2	6	221601	221606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605250
3627	NC_012667	GAGAA	2	10	221618	221627	60 %	0 %	40 %	0 %	229605250
3628	NC_012667	GCT	2	6	221633	221638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605250
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3631	NC_012667	CGAT	2	8	221762	221769	25 %	25 %	25 %	25 %	229605250
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3639	NC_012667	CAT	2	6	222534	222539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605251
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3647	NC_012667	CG	3	6	222969	222974	0 %	0 %	50 %	50 %	229605252
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3651	NC_012667	TGA	2	6	223142	223147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605252
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