MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 16955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012667	ATC	2	6	92176	92181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605146
1502	NC_012667	AGC	2	6	92225	92230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605146
1503	NC_012667	AAG	2	6	92231	92236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605146
1504	NC_012667	TAT	2	6	92277	92282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605146
1505	NC_012667	GCTC	2	8	92343	92350	0 %	25 %	25 %	50 %	229605146
1506	NC_012667	GCG	2	6	92357	92362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605146
1507	NC_012667	GGT	2	6	92371	92376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605146
1508	NC_012667	A	6	6	92397	92402	100 %	0 %	0 %	0 %	229605146
1509	NC_012667	TGA	2	6	92406	92411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605146
1510	NC_012667	GA	4	8	92410	92417	50 %	0 %	50 %	0 %	229605146
1511	NC_012667	ATCA	2	8	92737	92744	50 %	25 %	0 %	25 %	229605147
1512	NC_012667	TCG	2	6	92833	92838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605147
1513	NC_012667	AAGCG	2	10	92859	92868	40 %	0 %	40 %	20 %	229605147
1514	NC_012667	CAC	2	6	92931	92936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605147
1515	NC_012667	CAC	2	6	93660	93665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605148
1516	NC_012667	TATT	2	8	93734	93741	25 %	75 %	0 %	0 %	229605148
1517	NC_012667	GTG	2	6	93803	93808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605148
1518	NC_012667	CCA	2	6	93894	93899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605148
1519	NC_012667	GTG	2	6	93905	93910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605148
1520	NC_012667	ACT	2	6	93995	94000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605148
1521	NC_012667	CTG	2	6	94035	94040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605148
1522	NC_012667	AT	3	6	94164	94169	50 %	50 %	0 %	0 %	229605148
1523	NC_012667	GCCA	2	8	94202	94209	25 %	0 %	25 %	50 %	229605148
1524	NC_012667	GGC	2	6	94426	94431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605148
1525	NC_012667	CTT	2	6	94455	94460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605148
1526	NC_012667	TG	4	8	94487	94494	0 %	50 %	50 %	0 %	229605148
1527	NC_012667	AAG	2	6	94499	94504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605148
1528	NC_012667	CAA	2	6	94654	94659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605148
1529	NC_012667	GGC	2	6	94663	94668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605148
1530	NC_012667	TGC	2	6	94671	94676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605148
1531	NC_012667	CTG	2	6	94696	94701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605148
1532	NC_012667	CAG	2	6	94712	94717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605148
1533	NC_012667	TAC	2	6	94793	94798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605148
1534	NC_012667	CG	3	6	94867	94872	0 %	0 %	50 %	50 %	229605148
1535	NC_012667	TCA	2	6	94898	94903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605148
1536	NC_012667	TTAC	2	8	94958	94965	25 %	50 %	0 %	25 %	229605148
1537	NC_012667	AAC	2	6	95123	95128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605149
1538	NC_012667	ATT	2	6	95152	95157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605149
1539	NC_012667	CT	3	6	95219	95224	0 %	50 %	0 %	50 %	229605149
1540	NC_012667	AAC	2	6	95368	95373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605149
1541	NC_012667	CGG	2	6	95391	95396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605149
1542	NC_012667	TGT	2	6	95402	95407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605149
1543	NC_012667	CATC	2	8	95612	95619	25 %	25 %	0 %	50 %	229605149
1544	NC_012667	GTG	2	6	95642	95647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605149
1545	NC_012667	TGC	2	6	95672	95677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605149
1546	NC_012667	ATC	2	6	95702	95707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605149
1547	NC_012667	GGT	2	6	95904	95909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605149
1548	NC_012667	ATTT	2	8	96011	96018	25 %	75 %	0 %	0 %	229605149
1549	NC_012667	TC	3	6	96084	96089	0 %	50 %	0 %	50 %	229605149
1550	NC_012667	GCC	2	6	96139	96144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605149
1551	NC_012667	TAT	2	6	96159	96164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605149
1552	NC_012667	ATG	2	6	96289	96294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605149
1553	NC_012667	A	6	6	96529	96534	100 %	0 %	0 %	0 %	229605150
1554	NC_012667	CAC	2	6	96745	96750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605150
1555	NC_012667	TTCCTT	2	12	96767	96778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605150
1556	NC_012667	ATT	2	6	96814	96819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605150
1557	NC_012667	CAT	2	6	96835	96840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605150
1558	NC_012667	AAG	2	6	96857	96862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605150
1559	NC_012667	CTG	2	6	96913	96918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605150
1560	NC_012667	AGCCA	2	10	96957	96966	40 %	0 %	20 %	40 %	229605150
1561	NC_012667	CAC	2	6	97005	97010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605150
1562	NC_012667	AGC	2	6	97016	97021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605150
1563	NC_012667	CTG	2	6	97101	97106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605150
1564	NC_012667	AGC	3	9	97157	97165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605150
1565	NC_012667	GAA	2	6	97174	97179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605150
1566	NC_012667	TGAT	2	8	97223	97230	25 %	50 %	25 %	0 %	229605150
1567	NC_012667	AGTA	2	8	97463	97470	50 %	25 %	25 %	0 %	229605150
1568	NC_012667	TGA	2	6	97540	97545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605151
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1570	NC_012667	GCCT	2	8	97669	97676	0 %	25 %	25 %	50 %	229605151
1571	NC_012667	TGA	2	6	97700	97705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605151
1572	NC_012667	TGGAT	2	10	99255	99264	20 %	40 %	40 %	0 %	229605152
1573	NC_012667	CAG	2	6	99285	99290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605152
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1575	NC_012667	TGC	2	6	99552	99557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605152
1576	NC_012667	T	6	6	99560	99565	0 %	100 %	0 %	0 %	229605152
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1578	NC_012667	GT	3	6	99691	99696	0 %	50 %	50 %	0 %	229605152
1579	NC_012667	GAC	2	6	99751	99756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605152
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1581	NC_012667	TCGC	2	8	99873	99880	0 %	25 %	25 %	50 %	229605152
1582	NC_012667	GCA	2	6	100003	100008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605152
1583	NC_012667	CGG	2	6	100018	100023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605152
1584	NC_012667	GTC	2	6	100097	100102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605152
1585	NC_012667	CGAAC	2	10	100139	100148	40 %	0 %	20 %	40 %	229605152
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1591	NC_012667	TGG	2	6	100445	100450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605152
1592	NC_012667	ATCT	2	8	100496	100503	25 %	50 %	0 %	25 %	229605152
1593	NC_012667	ATC	2	6	100508	100513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605152
1594	NC_012667	TGC	2	6	100533	100538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605152
1595	NC_012667	AGG	2	6	100545	100550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605152
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1598	NC_012667	TCC	2	6	100658	100663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605153
1599	NC_012667	AGT	2	6	100666	100671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605153
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1605	NC_012667	ATT	2	6	101172	101177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605154
1606	NC_012667	CG	3	6	101231	101236	0 %	0 %	50 %	50 %	229605154
1607	NC_012667	CTGG	2	8	101262	101269	0 %	25 %	50 %	25 %	229605154
1608	NC_012667	CTT	2	6	101338	101343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605154
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1612	NC_012667	TTG	2	6	101629	101634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605154
1613	NC_012667	TGC	2	6	101677	101682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605154
1614	NC_012667	GCG	2	6	101745	101750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605154
1615	NC_012667	A	7	7	101799	101805	100 %	0 %	0 %	0 %	229605154
1616	NC_012667	TTCT	2	8	101806	101813	0 %	75 %	0 %	25 %	229605154
1617	NC_012667	T	6	6	101890	101895	0 %	100 %	0 %	0 %	229605154
1618	NC_012667	TGG	2	6	101939	101944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605154
1619	NC_012667	CGG	2	6	101987	101992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605154
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1621	NC_012667	CGC	2	6	102035	102040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605154
1622	NC_012667	CTC	2	6	102061	102066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605154
1623	NC_012667	TCA	2	6	102094	102099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605154
1624	NC_012667	GCT	2	6	102111	102116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605154
1625	NC_012667	TTGG	2	8	102147	102154	0 %	50 %	50 %	0 %	229605154
1626	NC_012667	CTG	2	6	102214	102219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605154
1627	NC_012667	ACA	2	6	102224	102229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605154
1628	NC_012667	ATT	2	6	102356	102361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605154
1629	NC_012667	TGC	2	6	102447	102452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605155
1630	NC_012667	ACT	2	6	102462	102467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605155
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1633	NC_012667	ACTT	2	8	102545	102552	25 %	50 %	0 %	25 %	229605155
1634	NC_012667	CAC	2	6	102571	102576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605155
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1637	NC_012667	GTG	2	6	102981	102986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605156
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1641	NC_012667	AGT	2	6	103470	103475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605157
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1644	NC_012667	GC	3	6	103687	103692	0 %	0 %	50 %	50 %	229605158
1645	NC_012667	CTG	2	6	103701	103706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605158
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1653	NC_012667	CAC	2	6	104263	104268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605158
1654	NC_012667	T	6	6	104314	104319	0 %	100 %	0 %	0 %	229605158
1655	NC_012667	CAA	2	6	104347	104352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605158
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1658	NC_012667	ACC	2	6	104420	104425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605158
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1667	NC_012667	T	6	6	105063	105068	0 %	100 %	0 %	0 %	229605159
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1749	NC_012667	AGC	2	6	110681	110686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605162
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1989	NC_012667	CCA	3	9	124619	124627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605173
1990	NC_012667	GCG	2	6	124654	124659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605173
1991	NC_012667	AT	3	6	124663	124668	50 %	50 %	0 %	0 %	229605173
1992	NC_012667	TCA	2	6	124684	124689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605173
1993	NC_012667	CCA	2	6	124703	124708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605173
1994	NC_012667	TTC	2	6	124794	124799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605173
1995	NC_012667	GAT	2	6	124806	124811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605173
1996	NC_012667	ATGG	2	8	124813	124820	25 %	25 %	50 %	0 %	229605173
1997	NC_012667	TGC	2	6	124835	124840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605173
1998	NC_012667	GCT	2	6	124853	124858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605173
1999	NC_012667	CAC	2	6	124868	124873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605173
2000	NC_012667	CAA	2	6	124920	124925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605173

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