MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 16955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_012667	ATG	2	6	1057244	1057249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606041
16503	NC_012667	GCATA	2	10	1057316	1057325	40 %	20 %	20 %	20 %	229606041
16504	NC_012667	TTA	2	6	1057413	1057418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606041
16505	NC_012667	GTC	2	6	1057743	1057748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606042
16506	NC_012667	TCA	2	6	1057815	1057820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606042
16507	NC_012667	ATG	2	6	1057862	1057867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606042
16508	NC_012667	ATGG	2	8	1057918	1057925	25 %	25 %	50 %	0 %	229606042
16509	NC_012667	TCG	2	6	1058015	1058020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606042
16510	NC_012667	TG	3	6	1058025	1058030	0 %	50 %	50 %	0 %	229606042
16511	NC_012667	TTC	2	6	1058062	1058067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606042
16512	NC_012667	AGT	2	6	1058119	1058124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606042
16513	NC_012667	TGAG	2	8	1058135	1058142	25 %	25 %	50 %	0 %	229606042
16514	NC_012667	GTTG	2	8	1058229	1058236	0 %	50 %	50 %	0 %	229606042
16515	NC_012667	TCG	2	6	1058271	1058276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606042
16516	NC_012667	TCA	2	6	1058298	1058303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606042
16517	NC_012667	CGC	2	6	1058307	1058312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606042
16518	NC_012667	ATTG	2	8	1058325	1058332	25 %	50 %	25 %	0 %	229606042
16519	NC_012667	AC	3	6	1058343	1058348	50 %	0 %	0 %	50 %	229606042
16520	NC_012667	TGC	2	6	1058363	1058368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606042
16521	NC_012667	ATG	2	6	1058390	1058395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606042
16522	NC_012667	CTG	2	6	1058503	1058508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606042
16523	NC_012667	GCG	2	6	1058548	1058553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606042
16524	NC_012667	TGA	2	6	1058696	1058701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606042
16525	NC_012667	AAT	2	6	1058778	1058783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606043
16526	NC_012667	TTC	2	6	1058874	1058879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606043
16527	NC_012667	TTC	2	6	1058914	1058919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606043
16528	NC_012667	TGC	2	6	1058937	1058942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606043
16529	NC_012667	G	6	6	1058996	1059001	0 %	0 %	100 %	0 %	229606043
16530	NC_012667	CAT	2	6	1059004	1059009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606043
16531	NC_012667	T	6	6	1059048	1059053	0 %	100 %	0 %	0 %	229606043
16532	NC_012667	CTT	2	6	1059094	1059099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606043
16533	NC_012667	T	6	6	1059160	1059165	0 %	100 %	0 %	0 %	229606043
16534	NC_012667	AGCC	2	8	1059166	1059173	25 %	0 %	25 %	50 %	229606043
16535	NC_012667	ATC	2	6	1059247	1059252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606043
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16538	NC_012667	CAA	2	6	1059361	1059366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606043
16539	NC_012667	CTTG	2	8	1059393	1059400	0 %	50 %	25 %	25 %	229606043
16540	NC_012667	TCA	2	6	1059408	1059413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606043
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16542	NC_012667	TGT	2	6	1059564	1059569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606043
16543	NC_012667	AAT	2	6	1059591	1059596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606043
16544	NC_012667	ATT	2	6	1059617	1059622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606043
16545	NC_012667	AACT	2	8	1059673	1059680	50 %	25 %	0 %	25 %	229606043
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16548	NC_012667	GCA	2	6	1060432	1060437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606044
16549	NC_012667	GCG	2	6	1060476	1060481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606044
16550	NC_012667	TTG	2	6	1060560	1060565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606044
16551	NC_012667	CG	3	6	1060701	1060706	0 %	0 %	50 %	50 %	229606044
16552	NC_012667	GCG	2	6	1060715	1060720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606044
16553	NC_012667	GCTT	2	8	1060745	1060752	0 %	50 %	25 %	25 %	229606044
16554	NC_012667	CG	3	6	1060822	1060827	0 %	0 %	50 %	50 %	229606044
16555	NC_012667	TCCAC	2	10	1060840	1060849	20 %	20 %	0 %	60 %	229606044
16556	NC_012667	TTC	2	6	1060850	1060855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606044
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16559	NC_012667	GAGCA	2	10	1061060	1061069	40 %	0 %	40 %	20 %	229606044
16560	NC_012667	GCAG	2	8	1061100	1061107	25 %	0 %	50 %	25 %	229606044
16561	NC_012667	CGC	2	6	1061144	1061149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606044
16562	NC_012667	CAC	3	9	1061153	1061161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606044
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16570	NC_012667	T	6	6	1061381	1061386	0 %	100 %	0 %	0 %	229606044
16571	NC_012667	GTC	2	6	1061475	1061480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606044
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16601	NC_012667	GTC	2	6	1063469	1063474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606046
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16603	NC_012667	CG	3	6	1063506	1063511	0 %	0 %	50 %	50 %	229606046
16604	NC_012667	GCTG	2	8	1063690	1063697	0 %	25 %	50 %	25 %	229606046
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16612	NC_012667	CA	3	6	1064655	1064660	50 %	0 %	0 %	50 %	229606048
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16614	NC_012667	TGCC	2	8	1064765	1064772	0 %	25 %	25 %	50 %	229606048
16615	NC_012667	TAC	2	6	1064893	1064898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606048
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