MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 16955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012667	TGTC	2	8	613360	613367	0 %	50 %	25 %	25 %	229605590
10002	NC_012667	CCAA	2	8	613400	613407	50 %	0 %	0 %	50 %	229605590
10003	NC_012667	TTCAC	2	10	613413	613422	20 %	40 %	0 %	40 %	229605590
10004	NC_012667	AC	3	6	613501	613506	50 %	0 %	0 %	50 %	229605590
10005	NC_012667	CAG	3	9	613520	613528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605590
10006	NC_012667	GTG	2	6	613558	613563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605590
10007	NC_012667	ACG	2	6	613595	613600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605590
10008	NC_012667	C	6	6	613710	613715	0 %	0 %	0 %	100 %	229605590
10009	NC_012667	CAC	2	6	613718	613723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605590
10010	NC_012667	ATC	2	6	613742	613747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605590
10011	NC_012667	CCA	2	6	613768	613773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605590
10012	NC_012667	TCA	2	6	613821	613826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605590
10013	NC_012667	TCA	2	6	613857	613862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605590
10014	NC_012667	CAG	2	6	613865	613870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605590
10015	NC_012667	TGAT	2	8	613977	613984	25 %	50 %	25 %	0 %	229605590
10016	NC_012667	AGATTG	2	12	613995	614006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605590
10017	NC_012667	CTT	2	6	614020	614025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605590
10018	NC_012667	CG	3	6	614027	614032	0 %	0 %	50 %	50 %	229605590
10019	NC_012667	ATACCC	2	12	614175	614186	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	229605590
10020	NC_012667	GA	3	6	614225	614230	50 %	0 %	50 %	0 %	229605590
10021	NC_012667	GC	3	6	614346	614351	0 %	0 %	50 %	50 %	229605590
10022	NC_012667	TCT	2	6	614364	614369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605590
10023	NC_012667	ATG	2	6	614381	614386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605590
10024	NC_012667	T	6	6	614471	614476	0 %	100 %	0 %	0 %	229605590
10025	NC_012667	ACAGA	2	10	614545	614554	60 %	0 %	20 %	20 %	229605590
10026	NC_012667	CGAT	2	8	614587	614594	25 %	25 %	25 %	25 %	229605590
10027	NC_012667	TGT	2	6	614599	614604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605590
10028	NC_012667	GC	3	6	614709	614714	0 %	0 %	50 %	50 %	229605590
10029	NC_012667	CTG	2	6	614807	614812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605590
10030	NC_012667	TGC	2	6	615107	615112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605591
10031	NC_012667	CCA	3	9	615129	615137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605591
10032	NC_012667	T	6	6	615151	615156	0 %	100 %	0 %	0 %	229605591
10033	NC_012667	GCA	2	6	615165	615170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605591
10034	NC_012667	T	7	7	615256	615262	0 %	100 %	0 %	0 %	229605591
10035	NC_012667	ATC	2	6	615295	615300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605591
10036	NC_012667	TG	3	6	615322	615327	0 %	50 %	50 %	0 %	229605591
10037	NC_012667	CGA	2	6	615363	615368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605591
10038	NC_012667	CAG	2	6	615427	615432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605591
10039	NC_012667	GGC	2	6	615529	615534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605591
10040	NC_012667	CAAAA	2	10	615550	615559	80 %	0 %	0 %	20 %	229605591
10041	NC_012667	CAA	2	6	615649	615654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605591
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10045	NC_012667	TGC	2	6	615837	615842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605591
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10047	NC_012667	CAT	2	6	616104	616109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605591
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10050	NC_012667	CTG	2	6	616285	616290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605591
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10052	NC_012667	CAA	2	6	616396	616401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605591
10053	NC_012667	AC	3	6	616508	616513	50 %	0 %	0 %	50 %	229605591
10054	NC_012667	GC	3	6	616565	616570	0 %	0 %	50 %	50 %	229605591
10055	NC_012667	CAG	2	6	616801	616806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605591
10056	NC_012667	CTG	2	6	616816	616821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605591
10057	NC_012667	GGGATC	2	12	616844	616855	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	229605591
10058	NC_012667	TAA	2	6	617058	617063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605592
10059	NC_012667	CTG	2	6	617161	617166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605592
10060	NC_012667	CATT	2	8	617178	617185	25 %	50 %	0 %	25 %	229605592
10061	NC_012667	TGT	2	6	617186	617191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605592
10062	NC_012667	ATC	2	6	617236	617241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605592
10063	NC_012667	AGTA	2	8	617372	617379	50 %	25 %	25 %	0 %	229605592
10064	NC_012667	AATA	2	8	617395	617402	75 %	25 %	0 %	0 %	229605592
10065	NC_012667	ACAA	2	8	617428	617435	75 %	0 %	0 %	25 %	229605592
10066	NC_012667	AGAT	2	8	617531	617538	50 %	25 %	25 %	0 %	229605592
10067	NC_012667	ATC	2	6	617638	617643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605592
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10070	NC_012667	CAAG	2	8	617724	617731	50 %	0 %	25 %	25 %	229605592
10071	NC_012667	GCG	2	6	617815	617820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605592
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10074	NC_012667	TGCT	2	8	617950	617957	0 %	50 %	25 %	25 %	229605592
10075	NC_012667	A	6	6	617971	617976	100 %	0 %	0 %	0 %	229605592
10076	NC_012667	TTG	2	6	617981	617986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605592
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10078	NC_012667	CGA	2	6	618103	618108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605592
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10087	NC_012667	GGCG	2	8	618722	618729	0 %	0 %	75 %	25 %	229605593
10088	NC_012667	CTG	2	6	618889	618894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605593
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10092	NC_012667	CATC	2	8	618950	618957	25 %	25 %	0 %	50 %	229605593
10093	NC_012667	TC	3	6	619029	619034	0 %	50 %	0 %	50 %	229605594
10094	NC_012667	TGA	2	6	619094	619099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605594
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10100	NC_012667	CGGT	2	8	619331	619338	0 %	25 %	50 %	25 %	229605594
10101	NC_012667	GGT	2	6	619378	619383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605594
10102	NC_012667	AGC	2	6	619385	619390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605594
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10104	NC_012667	TGAT	2	8	619487	619494	25 %	50 %	25 %	0 %	229605594
10105	NC_012667	TGAAC	2	10	619503	619512	40 %	20 %	20 %	20 %	229605594
10106	NC_012667	CACTA	2	10	619524	619533	40 %	20 %	0 %	40 %	229605594
10107	NC_012667	CGA	2	6	619576	619581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605594
10108	NC_012667	T	6	6	619582	619587	0 %	100 %	0 %	0 %	229605594
10109	NC_012667	GGA	2	6	619605	619610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605594
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10118	NC_012667	CGCA	2	8	620457	620464	25 %	0 %	25 %	50 %	229605595
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10120	NC_012667	GGT	2	6	620555	620560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605595
10121	NC_012667	GCT	2	6	620594	620599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605595
10122	NC_012667	TTG	2	6	620619	620624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605595
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10127	NC_012667	CTG	2	6	620823	620828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605595
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10478	NC_012667	TGA	2	6	643666	643671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605617
10479	NC_012667	CGT	2	6	643697	643702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605617
10480	NC_012667	GCT	2	6	643748	643753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605617
10481	NC_012667	GCG	2	6	643875	643880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605617
10482	NC_012667	CG	3	6	643944	643949	0 %	0 %	50 %	50 %	229605617
10483	NC_012667	CTG	2	6	643983	643988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605617
10484	NC_012667	A	6	6	644208	644213	100 %	0 %	0 %	0 %	229605617
10485	NC_012667	TCA	2	6	644287	644292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605618
10486	NC_012667	GCTG	2	8	644328	644335	0 %	25 %	50 %	25 %	229605618
10487	NC_012667	CAA	2	6	644500	644505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605618
10488	NC_012667	TGT	2	6	644855	644860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605618
10489	NC_012667	AGCGAG	2	12	644888	644899	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	229605618
10490	NC_012667	T	6	6	644972	644977	0 %	100 %	0 %	0 %	229605618
10491	NC_012667	TG	3	6	644984	644989	0 %	50 %	50 %	0 %	229605618
10492	NC_012667	TTG	2	6	645035	645040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605618
10493	NC_012667	ATGA	2	8	645046	645053	50 %	25 %	25 %	0 %	229605618
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10495	NC_012667	TGC	2	6	645309	645314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605619
10496	NC_012667	TTTTG	2	10	645339	645348	0 %	80 %	20 %	0 %	229605619
10497	NC_012667	AG	3	6	645357	645362	50 %	0 %	50 %	0 %	229605619
10498	NC_012667	CGTT	2	8	645385	645392	0 %	50 %	25 %	25 %	229605619
10499	NC_012667	AGC	2	6	645426	645431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605619
10500	NC_012667	GCC	2	6	645474	645479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605619

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