MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 16955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012667	C	6	6	30212	30217	0 %	0 %	0 %	100 %	229605093
502	NC_012667	CGC	2	6	30248	30253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605093
503	NC_012667	TGC	2	6	30330	30335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605093
504	NC_012667	GA	3	6	30369	30374	50 %	0 %	50 %	0 %	229605093
505	NC_012667	CG	3	6	30391	30396	0 %	0 %	50 %	50 %	229605093
506	NC_012667	T	7	7	30526	30532	0 %	100 %	0 %	0 %	229605093
507	NC_012667	TCA	2	6	30666	30671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605094
508	NC_012667	CAT	2	6	30715	30720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605094
509	NC_012667	AGT	2	6	30808	30813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605094
510	NC_012667	ATA	2	6	30875	30880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605094
511	NC_012667	GGT	2	6	30905	30910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605094
512	NC_012667	GCC	2	6	30915	30920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605094
513	NC_012667	AG	3	6	30959	30964	50 %	0 %	50 %	0 %	229605094
514	NC_012667	ATCA	2	8	30968	30975	50 %	25 %	0 %	25 %	229605094
515	NC_012667	CCA	2	6	30979	30984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605094
516	NC_012667	CTCA	2	8	31013	31020	25 %	25 %	0 %	50 %	229605094
517	NC_012667	CAC	2	6	31039	31044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605094
518	NC_012667	TGG	2	6	31138	31143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605094
519	NC_012667	CCA	2	6	31146	31151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605094
520	NC_012667	T	6	6	31175	31180	0 %	100 %	0 %	0 %	229605094
521	NC_012667	ATCC	2	8	31322	31329	25 %	25 %	0 %	50 %	229605094
522	NC_012667	TTG	2	6	31397	31402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605094
523	NC_012667	GAA	2	6	31440	31445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605094
524	NC_012667	GA	3	6	31452	31457	50 %	0 %	50 %	0 %	229605094
525	NC_012667	CCA	2	6	31848	31853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605095
526	NC_012667	AG	3	6	31870	31875	50 %	0 %	50 %	0 %	229605095
527	NC_012667	GTC	2	6	31931	31936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605095
528	NC_012667	GTTG	2	8	31938	31945	0 %	50 %	50 %	0 %	229605095
529	NC_012667	CCA	2	6	31974	31979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605095
530	NC_012667	GA	3	6	32059	32064	50 %	0 %	50 %	0 %	229605095
531	NC_012667	ACC	2	6	32090	32095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605095
532	NC_012667	GCGA	2	8	32106	32113	25 %	0 %	50 %	25 %	229605095
533	NC_012667	CCA	2	6	32229	32234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605095
534	NC_012667	TGA	2	6	32368	32373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605095
535	NC_012667	T	6	6	32443	32448	0 %	100 %	0 %	0 %	229605095
536	NC_012667	GCTT	2	8	32471	32478	0 %	50 %	25 %	25 %	229605095
537	NC_012667	GC	4	8	32604	32611	0 %	0 %	50 %	50 %	229605095
538	NC_012667	AC	3	6	32616	32621	50 %	0 %	0 %	50 %	229605095
539	NC_012667	TCG	2	6	32631	32636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605095
540	NC_012667	CTT	2	6	32661	32666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605095
541	NC_012667	CA	3	6	32718	32723	50 %	0 %	0 %	50 %	229605095
542	NC_012667	CGC	3	9	32770	32778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605095
543	NC_012667	AGTGA	2	10	32837	32846	40 %	20 %	40 %	0 %	229605095
544	NC_012667	TGAA	2	8	32847	32854	50 %	25 %	25 %	0 %	229605095
545	NC_012667	CTG	2	6	32865	32870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605095
546	NC_012667	TGC	2	6	32930	32935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605095
547	NC_012667	TGC	2	6	32942	32947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605095
548	NC_012667	GCA	2	6	33060	33065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605095
549	NC_012667	CAT	2	6	33262	33267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605095
550	NC_012667	ACA	2	6	33405	33410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605095
551	NC_012667	TCAAA	2	10	33781	33790	60 %	20 %	0 %	20 %	229605096
552	NC_012667	ACCA	2	8	33804	33811	50 %	0 %	0 %	50 %	229605096
553	NC_012667	CCA	2	6	33946	33951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605096
554	NC_012667	CTG	2	6	33953	33958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605096
555	NC_012667	ACC	2	6	34031	34036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605096
556	NC_012667	CCA	2	6	34041	34046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605096
557	NC_012667	GCA	2	6	34083	34088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605096
558	NC_012667	GAT	2	6	34108	34113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605096
559	NC_012667	GCT	2	6	34126	34131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605096
560	NC_012667	TG	3	6	34146	34151	0 %	50 %	50 %	0 %	229605096
561	NC_012667	TGC	2	6	34231	34236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605096
562	NC_012667	GTTT	2	8	34260	34267	0 %	75 %	25 %	0 %	229605096
563	NC_012667	CGC	2	6	34285	34290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605096
564	NC_012667	GCC	2	6	34479	34484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605096
565	NC_012667	GTT	2	6	34517	34522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605096
566	NC_012667	GGC	2	6	34549	34554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605096
567	NC_012667	CGA	2	6	34611	34616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605096
568	NC_012667	TGA	2	6	34647	34652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605096
569	NC_012667	TAG	2	6	34665	34670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605096
570	NC_012667	GAT	2	6	34718	34723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605096
571	NC_012667	GGTA	2	8	34828	34835	25 %	25 %	50 %	0 %	229605096
572	NC_012667	CTG	2	6	34876	34881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605096
573	NC_012667	TTG	2	6	34889	34894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605096
574	NC_012667	TTC	2	6	34926	34931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605096
575	NC_012667	TG	3	6	34956	34961	0 %	50 %	50 %	0 %	229605096
576	NC_012667	CCACC	2	10	35038	35047	20 %	0 %	0 %	80 %	229605096
577	NC_012667	CGT	2	6	35216	35221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605096
578	NC_012667	TCA	2	6	35286	35291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605096
579	NC_012667	GAC	2	6	35410	35415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605096
580	NC_012667	GTT	2	6	35444	35449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605096
581	NC_012667	TGCCGG	2	12	35531	35542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	229605096
582	NC_012667	GC	3	6	35558	35563	0 %	0 %	50 %	50 %	229605096
583	NC_012667	TAA	2	6	35564	35569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605096
584	NC_012667	CAG	2	6	35636	35641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605096
585	NC_012667	TGA	2	6	35659	35664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605096
586	NC_012667	ACCC	2	8	35684	35691	25 %	0 %	0 %	75 %	229605096
587	NC_012667	CTGA	2	8	35747	35754	25 %	25 %	25 %	25 %	229605096
588	NC_012667	CAGCT	2	10	35798	35807	20 %	20 %	20 %	40 %	229605096
589	NC_012667	CAG	2	6	35842	35847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605096
590	NC_012667	TAA	2	6	35887	35892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605096
591	NC_012667	CCG	2	6	35896	35901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605096
592	NC_012667	CAC	2	6	35905	35910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605096
593	NC_012667	A	7	7	36974	36980	100 %	0 %	0 %	0 %	229605097
594	NC_012667	CT	3	6	36983	36988	0 %	50 %	0 %	50 %	229605097
595	NC_012667	TAGC	2	8	37005	37012	25 %	25 %	25 %	25 %	229605097
596	NC_012667	GCC	2	6	37025	37030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605097
597	NC_012667	CG	3	6	37070	37075	0 %	0 %	50 %	50 %	229605097
598	NC_012667	CAA	2	6	37082	37087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605097
599	NC_012667	AAAC	2	8	37097	37104	75 %	0 %	0 %	25 %	229605097
600	NC_012667	GTT	2	6	37119	37124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605097
601	NC_012667	ATG	2	6	37146	37151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605097
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603	NC_012667	A	7	7	37236	37242	100 %	0 %	0 %	0 %	229605097
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606	NC_012667	A	6	6	37804	37809	100 %	0 %	0 %	0 %	229605097
607	NC_012667	TGA	2	6	37818	37823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605097
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609	NC_012667	GCA	2	6	37890	37895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605097
610	NC_012667	ATC	2	6	37898	37903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605097
611	NC_012667	AGCA	2	8	37926	37933	50 %	0 %	25 %	25 %	229605097
612	NC_012667	TAC	2	6	37937	37942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605097
613	NC_012667	ACT	2	6	38000	38005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605097
614	NC_012667	GCC	2	6	38069	38074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605097
615	NC_012667	CT	3	6	38096	38101	0 %	50 %	0 %	50 %	229605097
616	NC_012667	CAAG	2	8	38113	38120	50 %	0 %	25 %	25 %	229605097
617	NC_012667	CAC	2	6	38158	38163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605097
618	NC_012667	TCA	2	6	38170	38175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605097
619	NC_012667	GCAGA	2	10	38183	38192	40 %	0 %	40 %	20 %	229605097
620	NC_012667	ACA	2	6	38343	38348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605098
621	NC_012667	ACTC	2	8	38366	38373	25 %	25 %	0 %	50 %	229605098
622	NC_012667	TTTC	2	8	38458	38465	0 %	75 %	0 %	25 %	229605098
623	NC_012667	TTC	2	6	38499	38504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605098
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627	NC_012667	TGG	2	6	38607	38612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605098
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