MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 16955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012667	ATC	2	6	332076	332081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605337
5502	NC_012667	GCA	2	6	332147	332152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605337
5503	NC_012667	TTGA	2	8	332184	332191	25 %	50 %	25 %	0 %	229605337
5504	NC_012667	AGA	2	6	332192	332197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605337
5505	NC_012667	CAC	2	6	332200	332205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605337
5506	NC_012667	CG	3	6	332232	332237	0 %	0 %	50 %	50 %	229605337
5507	NC_012667	ATG	2	6	332308	332313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605337
5508	NC_012667	CG	4	8	332340	332347	0 %	0 %	50 %	50 %	229605337
5509	NC_012667	AAG	2	6	332377	332382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605337
5510	NC_012667	CGC	2	6	332447	332452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605337
5511	NC_012667	GT	3	6	332479	332484	0 %	50 %	50 %	0 %	229605337
5512	NC_012667	TG	4	8	332485	332492	0 %	50 %	50 %	0 %	229605337
5513	NC_012667	AGA	2	6	332543	332548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605337
5514	NC_012667	TGC	2	6	332560	332565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605337
5515	NC_012667	ATG	2	6	332782	332787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605338
5516	NC_012667	CAT	2	6	332796	332801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605338
5517	NC_012667	TATCT	2	10	332841	332850	20 %	60 %	0 %	20 %	229605338
5518	NC_012667	A	6	6	332917	332922	100 %	0 %	0 %	0 %	229605338
5519	NC_012667	CGG	2	6	332925	332930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605338
5520	NC_012667	GGT	2	6	332935	332940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605338
5521	NC_012667	TGG	2	6	333138	333143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605338
5522	NC_012667	GC	3	6	333145	333150	0 %	0 %	50 %	50 %	229605338
5523	NC_012667	CAT	3	9	333186	333194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605338
5524	NC_012667	CAT	2	6	333213	333218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605338
5525	NC_012667	CG	3	6	333250	333255	0 %	0 %	50 %	50 %	229605338
5526	NC_012667	TTC	2	6	333280	333285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605338
5527	NC_012667	CGG	2	6	333294	333299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605338
5528	NC_012667	GGC	2	6	333403	333408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605338
5529	NC_012667	CAT	2	6	333432	333437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605338
5530	NC_012667	TGGC	2	8	333588	333595	0 %	25 %	50 %	25 %	229605338
5531	NC_012667	TTC	2	6	333640	333645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605338
5532	NC_012667	TGA	2	6	333731	333736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605338
5533	NC_012667	CTCA	2	8	333747	333754	25 %	25 %	0 %	50 %	229605338
5534	NC_012667	CAT	2	6	333798	333803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605338
5535	NC_012667	CT	3	6	333814	333819	0 %	50 %	0 %	50 %	229605338
5536	NC_012667	AGC	2	6	333845	333850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605338
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5538	NC_012667	GCA	2	6	334075	334080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605339
5539	NC_012667	TCTG	2	8	334112	334119	0 %	50 %	25 %	25 %	229605339
5540	NC_012667	GTG	2	6	334582	334587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605340
5541	NC_012667	TGC	3	9	334588	334596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605340
5542	NC_012667	GAT	2	6	334599	334604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605340
5543	NC_012667	TAC	2	6	334652	334657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605340
5544	NC_012667	TGA	2	6	334672	334677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605340
5545	NC_012667	CTGA	2	8	334710	334717	25 %	25 %	25 %	25 %	229605340
5546	NC_012667	TGG	2	6	334750	334755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605340
5547	NC_012667	CAA	3	9	334757	334765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605340
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5551	NC_012667	CGT	2	6	334950	334955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605340
5552	NC_012667	TTGAT	2	10	334975	334984	20 %	60 %	20 %	0 %	229605340
5553	NC_012667	CAGC	2	8	335001	335008	25 %	0 %	25 %	50 %	229605340
5554	NC_012667	TG	3	6	335017	335022	0 %	50 %	50 %	0 %	229605340
5555	NC_012667	GCA	2	6	335041	335046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605340
5556	NC_012667	ATC	2	6	335064	335069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605340
5557	NC_012667	ACC	2	6	335223	335228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605341
5558	NC_012667	CTT	2	6	335232	335237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605341
5559	NC_012667	T	6	6	335307	335312	0 %	100 %	0 %	0 %	229605341
5560	NC_012667	T	6	6	335422	335427	0 %	100 %	0 %	0 %	229605341
5561	NC_012667	CAT	2	6	335431	335436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605341
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5564	NC_012667	CG	3	6	335649	335654	0 %	0 %	50 %	50 %	229605341
5565	NC_012667	CAC	2	6	335677	335682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605341
5566	NC_012667	TCA	2	6	335718	335723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605341
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5568	NC_012667	TCGG	2	8	335786	335793	0 %	25 %	50 %	25 %	229605341
5569	NC_012667	GAGC	2	8	335798	335805	25 %	0 %	50 %	25 %	229605341
5570	NC_012667	GGA	2	6	335808	335813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605341
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5572	NC_012667	TGG	2	6	336092	336097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605342
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5579	NC_012667	AATCA	2	10	336418	336427	60 %	20 %	0 %	20 %	229605342
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5582	NC_012667	CG	3	6	336552	336557	0 %	0 %	50 %	50 %	229605342
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5589	NC_012667	TG	3	6	337127	337132	0 %	50 %	50 %	0 %	229605343
5590	NC_012667	CTG	2	6	337210	337215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605343
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5604	NC_012667	GTGG	2	8	338165	338172	0 %	25 %	75 %	0 %	229605344
5605	NC_012667	GCC	2	6	338181	338186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605344
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5607	NC_012667	A	7	7	338250	338256	100 %	0 %	0 %	0 %	229605344
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5622	NC_012667	AC	3	6	339244	339249	50 %	0 %	0 %	50 %	229605344
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5739	NC_012667	GC	3	6	346717	346722	0 %	0 %	50 %	50 %	229605352
5740	NC_012667	A	6	6	346769	346774	100 %	0 %	0 %	0 %	229605352
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5988	NC_012667	GCC	2	6	360331	360336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605366
5989	NC_012667	TTA	2	6	360343	360348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605366
5990	NC_012667	AGCTG	2	10	360384	360393	20 %	20 %	40 %	20 %	229605366
5991	NC_012667	A	6	6	360420	360425	100 %	0 %	0 %	0 %	229605366
5992	NC_012667	GC	3	6	360541	360546	0 %	0 %	50 %	50 %	229605366
5993	NC_012667	GCA	2	6	360621	360626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605366
5994	NC_012667	TGCTC	2	10	360636	360645	0 %	40 %	20 %	40 %	229605366
5995	NC_012667	TGC	2	6	360753	360758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605366
5996	NC_012667	CTG	3	9	360803	360811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605366
5997	NC_012667	GC	3	6	360838	360843	0 %	0 %	50 %	50 %	229605366
5998	NC_012667	A	6	6	360863	360868	100 %	0 %	0 %	0 %	229605366
5999	NC_012667	GCT	2	6	360990	360995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605366
6000	NC_012667	TGAA	2	8	361028	361035	50 %	25 %	25 %	0 %	229605366

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