MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012583	GACA	2	8	244852	244859	50 %	0 %	25 %	25 %	227119416
4002	NC_012583	TGGA	2	8	244886	244893	25 %	25 %	50 %	0 %	227119416
4003	NC_012583	CGA	2	6	244930	244935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119416
4004	NC_012583	AAG	2	6	245028	245033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119416
4005	NC_012583	GA	3	6	245073	245078	50 %	0 %	50 %	0 %	227119416
4006	NC_012583	AAC	2	6	245134	245139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119417
4007	NC_012583	CAG	2	6	245159	245164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119417
4008	NC_012583	CGG	2	6	245180	245185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119417
4009	NC_012583	CAA	2	6	245197	245202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119417
4010	NC_012583	GCA	2	6	245207	245212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119417
4011	NC_012583	TGC	2	6	245220	245225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119417
4012	NC_012583	AACC	2	8	245238	245245	50 %	0 %	0 %	50 %	227119417
4013	NC_012583	TCAA	2	8	245333	245340	50 %	25 %	0 %	25 %	227119417
4014	NC_012583	CCA	2	6	245423	245428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119417
4015	NC_012583	GCT	2	6	245437	245442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119417
4016	NC_012583	CA	3	6	245511	245516	50 %	0 %	0 %	50 %	227119417
4017	NC_012583	GTG	2	6	245577	245582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119417
4018	NC_012583	AGCA	2	8	245611	245618	50 %	0 %	25 %	25 %	227119417
4019	NC_012583	ACT	2	6	245705	245710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119417
4020	NC_012583	CGC	2	6	245712	245717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119417
4021	NC_012583	GC	3	6	245802	245807	0 %	0 %	50 %	50 %	227119417
4022	NC_012583	GCC	2	6	245923	245928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119417
4023	NC_012583	GT	3	6	245960	245965	0 %	50 %	50 %	0 %	227119417
4024	NC_012583	CAG	2	6	245970	245975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119417
4025	NC_012583	T	6	6	245989	245994	0 %	100 %	0 %	0 %	227119417
4026	NC_012583	GAG	2	6	245995	246000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119417
4027	NC_012583	TTA	2	6	246001	246006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119417
4028	NC_012583	CG	3	6	246059	246064	0 %	0 %	50 %	50 %	227119418
4029	NC_012583	GGCAT	2	10	246090	246099	20 %	20 %	40 %	20 %	227119418
4030	NC_012583	AGC	2	6	246204	246209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119418
4031	NC_012583	CCG	2	6	246307	246312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119418
4032	NC_012583	GCA	2	6	246416	246421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119418
4033	NC_012583	ACA	2	6	246440	246445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119418
4034	NC_012583	GCA	2	6	246452	246457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119418
4035	NC_012583	TCA	2	6	246498	246503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119419
4036	NC_012583	GAA	2	6	246509	246514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119419
4037	NC_012583	GGC	2	6	246557	246562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119419
4038	NC_012583	GAC	3	9	246580	246588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119419
4039	NC_012583	CCG	2	6	246593	246598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119419
4040	NC_012583	T	6	6	246653	246658	0 %	100 %	0 %	0 %	227119419
4041	NC_012583	AGCC	2	8	246681	246688	25 %	0 %	25 %	50 %	227119419
4042	NC_012583	CAA	2	6	246768	246773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119419
4043	NC_012583	CAT	2	6	246790	246795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119419
4044	NC_012583	A	7	7	246800	246806	100 %	0 %	0 %	0 %	227119419
4045	NC_012583	AAG	2	6	246845	246850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119419
4046	NC_012583	ACA	2	6	246993	246998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119419
4047	NC_012583	CAAAG	2	10	247029	247038	60 %	0 %	20 %	20 %	227119419
4048	NC_012583	AGCC	2	8	247164	247171	25 %	0 %	25 %	50 %	227119419
4049	NC_012583	TGC	2	6	247194	247199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119419
4050	NC_012583	CGC	2	6	247207	247212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119419
4051	NC_012583	TAG	2	6	247437	247442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119419
4052	NC_012583	CCA	2	6	247515	247520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119419
4053	NC_012583	GCA	3	9	247540	247548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119419
4054	NC_012583	GAA	2	6	247553	247558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119419
4055	NC_012583	CAAG	2	8	247630	247637	50 %	0 %	25 %	25 %	227119419
4056	NC_012583	GCAC	2	8	247642	247649	25 %	0 %	25 %	50 %	227119419
4057	NC_012583	CAT	2	6	247711	247716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119419
4058	NC_012583	ACA	2	6	247767	247772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119419
4059	NC_012583	CGC	2	6	247855	247860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119419
4060	NC_012583	CTG	2	6	247925	247930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119419
4061	NC_012583	AC	3	6	247965	247970	50 %	0 %	0 %	50 %	227119419
4062	NC_012583	CGG	2	6	247987	247992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119419
4063	NC_012583	GCA	2	6	248018	248023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119419
4064	NC_012583	GCTCA	2	10	248066	248075	20 %	20 %	20 %	40 %	227119419
4065	NC_012583	TC	3	6	249483	249488	0 %	50 %	0 %	50 %	227119420
4066	NC_012583	AAT	2	6	249499	249504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119420
4067	NC_012583	TCTT	2	8	249509	249516	0 %	75 %	0 %	25 %	227119420
4068	NC_012583	A	8	8	249693	249700	100 %	0 %	0 %	0 %	227119420
4069	NC_012583	AAG	2	6	249723	249728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119420
4070	NC_012583	CGG	2	6	249757	249762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119420
4071	NC_012583	TCC	2	6	249763	249768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119420
4072	NC_012583	T	6	6	249871	249876	0 %	100 %	0 %	0 %	227119420
4073	NC_012583	ATG	2	6	249930	249935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119420
4074	NC_012583	AATTC	2	10	250181	250190	40 %	40 %	0 %	20 %	227119420
4075	NC_012583	ATG	2	6	250254	250259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119420
4076	NC_012583	CAT	2	6	250283	250288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119420
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4078	NC_012583	TGA	2	6	250330	250335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119420
4079	NC_012583	CTG	2	6	250383	250388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119420
4080	NC_012583	AAT	2	6	250397	250402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119420
4081	NC_012583	GCA	2	6	250442	250447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119420
4082	NC_012583	GAA	2	6	250733	250738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119421
4083	NC_012583	TGGT	2	8	250761	250768	0 %	50 %	50 %	0 %	227119421
4084	NC_012583	GA	3	6	250827	250832	50 %	0 %	50 %	0 %	227119421
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4087	NC_012583	A	6	6	251271	251276	100 %	0 %	0 %	0 %	227119421
4088	NC_012583	AGTA	2	8	251311	251318	50 %	25 %	25 %	0 %	227119421
4089	NC_012583	TGA	3	9	251356	251364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119421
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4091	NC_012583	GAA	2	6	251384	251389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119421
4092	NC_012583	TGA	2	6	251395	251400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119421
4093	NC_012583	ATG	2	6	251406	251411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119421
4094	NC_012583	CAA	2	6	251460	251465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119421
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4097	NC_012583	ACT	2	6	251711	251716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119421
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4101	NC_012583	TCT	2	6	251990	251995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119421
4102	NC_012583	GA	3	6	252038	252043	50 %	0 %	50 %	0 %	227119421
4103	NC_012583	ATG	2	6	252120	252125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119421
4104	NC_012583	CTT	2	6	252127	252132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119421
4105	NC_012583	TTC	2	6	252187	252192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119421
4106	NC_012583	A	6	6	252278	252283	100 %	0 %	0 %	0 %	227119421
4107	NC_012583	ATT	2	6	252310	252315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119421
4108	NC_012583	GTT	2	6	252319	252324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119421
4109	NC_012583	ATG	2	6	252341	252346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119421
4110	NC_012583	TGA	2	6	252349	252354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119421
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4112	NC_012583	A	7	7	252398	252404	100 %	0 %	0 %	0 %	227119421
4113	NC_012583	TGA	2	6	252427	252432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119421
4114	NC_012583	A	6	6	252432	252437	100 %	0 %	0 %	0 %	227119421
4115	NC_012583	ATT	2	6	252486	252491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119421
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4117	NC_012583	GAAAAT	2	12	252602	252613	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227119421
4118	NC_012583	TAA	2	6	252625	252630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119421
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4120	NC_012583	T	6	6	252706	252711	0 %	100 %	0 %	0 %	227119422
4121	NC_012583	AAT	2	6	252717	252722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119422
4122	NC_012583	TAA	2	6	252782	252787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119422
4123	NC_012583	TGA	2	6	252851	252856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119422
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4489	NC_012583	TAT	2	6	277575	277580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119440
4490	NC_012583	TAC	2	6	277641	277646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119440
4491	NC_012583	ATG	2	6	277735	277740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119440
4492	NC_012583	TGA	2	6	277784	277789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119440
4493	NC_012583	A	7	7	277923	277929	100 %	0 %	0 %	0 %	227119441
4494	NC_012583	CG	3	6	278059	278064	0 %	0 %	50 %	50 %	227119441
4495	NC_012583	TC	3	6	278081	278086	0 %	50 %	0 %	50 %	227119441
4496	NC_012583	CAG	2	6	278118	278123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119441
4497	NC_012583	GCG	2	6	278202	278207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119441
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4500	NC_012583	CTG	2	6	278308	278313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119441

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