MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012583	CAT	2	6	215814	215819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119375
3502	NC_012583	CCA	2	6	215823	215828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119375
3503	NC_012583	ATT	2	6	215885	215890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119375
3504	NC_012583	GTT	2	6	215971	215976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119375
3505	NC_012583	GAAC	2	8	215988	215995	50 %	0 %	25 %	25 %	227119375
3506	NC_012583	AAAC	2	8	216063	216070	75 %	0 %	0 %	25 %	227119375
3507	NC_012583	CAT	2	6	216100	216105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119375
3508	NC_012583	TGT	2	6	216156	216161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119375
3509	NC_012583	TTC	2	6	216200	216205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119375
3510	NC_012583	ATC	2	6	216206	216211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119375
3511	NC_012583	AGAA	2	8	216224	216231	75 %	0 %	25 %	0 %	227119375
3512	NC_012583	TGA	2	6	216246	216251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119375
3513	NC_012583	TTA	2	6	216303	216308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119375
3514	NC_012583	GTC	2	6	216338	216343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119375
3515	NC_012583	A	6	6	216360	216365	100 %	0 %	0 %	0 %	227119375
3516	NC_012583	TTC	2	6	216464	216469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119375
3517	NC_012583	AAC	2	6	216470	216475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119375
3518	NC_012583	TC	3	6	216504	216509	0 %	50 %	0 %	50 %	227119375
3519	NC_012583	CTT	2	6	216530	216535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119375
3520	NC_012583	TTA	2	6	216651	216656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119375
3521	NC_012583	TCA	2	6	216696	216701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119375
3522	NC_012583	CAA	2	6	216706	216711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119375
3523	NC_012583	AATC	2	8	216748	216755	50 %	25 %	0 %	25 %	227119376
3524	NC_012583	ATCAAT	2	12	216888	216899	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227119376
3525	NC_012583	AGT	2	6	216902	216907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119376
3526	NC_012583	CCA	2	6	216938	216943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119376
3527	NC_012583	TGC	2	6	216977	216982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119376
3528	NC_012583	AAG	2	6	217041	217046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119376
3529	NC_012583	CTT	2	6	217107	217112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119376
3530	NC_012583	GGTG	2	8	217118	217125	0 %	25 %	75 %	0 %	227119376
3531	NC_012583	GAG	2	6	217133	217138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119376
3532	NC_012583	TCA	2	6	217165	217170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119376
3533	NC_012583	ATC	3	9	217657	217665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119377
3534	NC_012583	CAAAAC	2	12	217671	217682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119377
3535	NC_012583	GAAA	2	8	217683	217690	75 %	0 %	25 %	0 %	227119377
3536	NC_012583	TGC	2	6	218056	218061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119378
3537	NC_012583	CAT	2	6	218087	218092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119378
3538	NC_012583	GCG	2	6	218113	218118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119378
3539	NC_012583	GAA	2	6	218148	218153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119378
3540	NC_012583	CAT	2	6	218159	218164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119378
3541	NC_012583	CT	3	6	218202	218207	0 %	50 %	0 %	50 %	227119378
3542	NC_012583	ATGCA	2	10	218212	218221	40 %	20 %	20 %	20 %	227119378
3543	NC_012583	GCC	2	6	218283	218288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119378
3544	NC_012583	ACA	2	6	218465	218470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119379
3545	NC_012583	CAC	2	6	218521	218526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119379
3546	NC_012583	CGC	2	6	218576	218581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119379
3547	NC_012583	AGC	2	6	218616	218621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119379
3548	NC_012583	CAA	2	6	218630	218635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119379
3549	NC_012583	TGC	2	6	218682	218687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119379
3550	NC_012583	GAA	2	6	218973	218978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119380
3551	NC_012583	GGC	2	6	219149	219154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119380
3552	NC_012583	TGT	2	6	219226	219231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119380
3553	NC_012583	TGAT	2	8	219328	219335	25 %	50 %	25 %	0 %	227119380
3554	NC_012583	CTC	2	6	219375	219380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119380
3555	NC_012583	ATC	2	6	219408	219413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119380
3556	NC_012583	GTT	2	6	219596	219601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119381
3557	NC_012583	GTG	3	9	219688	219696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119381
3558	NC_012583	AACCA	2	10	219716	219725	60 %	0 %	0 %	40 %	227119381
3559	NC_012583	AGC	2	6	219748	219753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119381
3560	NC_012583	CT	3	6	219766	219771	0 %	50 %	0 %	50 %	227119381
3561	NC_012583	A	6	6	219800	219805	100 %	0 %	0 %	0 %	227119381
3562	NC_012583	TGG	2	6	219827	219832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119381
3563	NC_012583	GCCA	2	8	219840	219847	25 %	0 %	25 %	50 %	227119381
3564	NC_012583	CAT	2	6	219858	219863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119381
3565	NC_012583	CGC	2	6	220135	220140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119382
3566	NC_012583	TGG	2	6	220159	220164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119382
3567	NC_012583	AAG	2	6	220188	220193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119382
3568	NC_012583	TGA	2	6	220228	220233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119382
3569	NC_012583	ACC	2	6	220328	220333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119382
3570	NC_012583	CAAC	2	8	220358	220365	50 %	0 %	0 %	50 %	227119383
3571	NC_012583	CAG	2	6	220400	220405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119383
3572	NC_012583	CTG	2	6	220420	220425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119383
3573	NC_012583	A	6	6	220493	220498	100 %	0 %	0 %	0 %	227119383
3574	NC_012583	GCCA	2	8	220510	220517	25 %	0 %	25 %	50 %	227119383
3575	NC_012583	ATC	2	6	220585	220590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119383
3576	NC_012583	TCAC	2	8	220606	220613	25 %	25 %	0 %	50 %	227119383
3577	NC_012583	A	7	7	220911	220917	100 %	0 %	0 %	0 %	227119383
3578	NC_012583	AGC	2	6	220941	220946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119383
3579	NC_012583	AG	3	6	221003	221008	50 %	0 %	50 %	0 %	227119384
3580	NC_012583	CAAG	2	8	221045	221052	50 %	0 %	25 %	25 %	227119384
3581	NC_012583	AGG	2	6	221062	221067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119384
3582	NC_012583	TGAT	2	8	221118	221125	25 %	50 %	25 %	0 %	227119385
3583	NC_012583	TTG	2	6	221265	221270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119385
3584	NC_012583	TTA	2	6	221402	221407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119385
3585	NC_012583	CAG	2	6	221409	221414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119385
3586	NC_012583	GTT	2	6	221417	221422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119385
3587	NC_012583	AG	3	6	221432	221437	50 %	0 %	50 %	0 %	227119385
3588	NC_012583	A	6	6	221456	221461	100 %	0 %	0 %	0 %	227119385
3589	NC_012583	TAG	2	6	221476	221481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119385
3590	NC_012583	AC	3	6	221514	221519	50 %	0 %	0 %	50 %	227119385
3591	NC_012583	ACT	2	6	221551	221556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119385
3592	NC_012583	A	7	7	221573	221579	100 %	0 %	0 %	0 %	227119385
3593	NC_012583	CGC	2	6	221591	221596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119385
3594	NC_012583	GGT	2	6	221615	221620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119385
3595	NC_012583	AACC	2	8	221669	221676	50 %	0 %	0 %	50 %	227119386
3596	NC_012583	CGA	2	6	221778	221783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119386
3597	NC_012583	T	6	6	221848	221853	0 %	100 %	0 %	0 %	227119386
3598	NC_012583	GCC	2	6	221862	221867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119386
3599	NC_012583	GCG	2	6	221929	221934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119386
3600	NC_012583	A	6	6	221951	221956	100 %	0 %	0 %	0 %	227119386
3601	NC_012583	TGC	2	6	221987	221992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119386
3602	NC_012583	ACAA	2	8	221999	222006	75 %	0 %	0 %	25 %	227119386
3603	NC_012583	AC	3	6	222014	222019	50 %	0 %	0 %	50 %	227119386
3604	NC_012583	GAA	2	6	222040	222045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119386
3605	NC_012583	CAC	2	6	222074	222079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119386
3606	NC_012583	AAACC	2	10	222086	222095	60 %	0 %	0 %	40 %	227119386
3607	NC_012583	TGCT	2	8	222155	222162	0 %	50 %	25 %	25 %	227119386
3608	NC_012583	GAA	2	6	222262	222267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119386
3609	NC_012583	GTT	2	6	222283	222288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119386
3610	NC_012583	ACC	2	6	222365	222370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119386
3611	NC_012583	CAT	2	6	222387	222392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119386
3612	NC_012583	GTG	2	6	222411	222416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119386
3613	NC_012583	TCGCCA	2	12	222461	222472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227119386
3614	NC_012583	AAC	2	6	222487	222492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119386
3615	NC_012583	TG	3	6	222517	222522	0 %	50 %	50 %	0 %	227119386
3616	NC_012583	AGC	2	6	222536	222541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119386
3617	NC_012583	AAC	2	6	222542	222547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119386
3618	NC_012583	GAA	2	6	222586	222591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119386
3619	NC_012583	GAA	2	6	222595	222600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119386
3620	NC_012583	CGC	2	6	222652	222657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119386
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3622	NC_012583	A	6	6	222766	222771	100 %	0 %	0 %	0 %	227119386
3623	NC_012583	GGC	2	6	222772	222777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119386
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3859	NC_012583	A	7	7	236479	236485	100 %	0 %	0 %	0 %	227119403
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3986	NC_012583	ATA	2	6	243856	243861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119415
3987	NC_012583	TTG	2	6	243874	243879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119415
3988	NC_012583	GAT	4	12	243975	243986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119415
3989	NC_012583	GCC	2	6	244057	244062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119415
3990	NC_012583	GGC	2	6	244100	244105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119415
3991	NC_012583	CGC	3	9	244195	244203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119415
3992	NC_012583	ACA	2	6	244255	244260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119415
3993	NC_012583	CGG	2	6	244315	244320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119415
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3995	NC_012583	GCCA	2	8	244394	244401	25 %	0 %	25 %	50 %	227119415
3996	NC_012583	GGAA	2	8	244406	244413	50 %	0 %	50 %	0 %	227119415
3997	NC_012583	TCA	2	6	244507	244512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119415
3998	NC_012583	TGG	2	6	244544	244549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119415
3999	NC_012583	TAC	2	6	244617	244622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119416
4000	NC_012583	GCC	2	6	244712	244717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119416

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