MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012583	CAG	2	6	151163	151168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119314
2502	NC_012583	CAT	2	6	151190	151195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119314
2503	NC_012583	GCC	2	6	151454	151459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119315
2504	NC_012583	CAC	2	6	151513	151518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119315
2505	NC_012583	CTG	2	6	151546	151551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119315
2506	NC_012583	CGG	2	6	151558	151563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119315
2507	NC_012583	TTC	2	6	151566	151571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119315
2508	NC_012583	AGC	2	6	151643	151648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119315
2509	NC_012583	CTG	2	6	151729	151734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119315
2510	NC_012583	GCG	2	6	151739	151744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119315
2511	NC_012583	CA	3	6	151774	151779	50 %	0 %	0 %	50 %	227119315
2512	NC_012583	GCCC	2	8	151796	151803	0 %	0 %	25 %	75 %	227119315
2513	NC_012583	AAG	2	6	151825	151830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119315
2514	NC_012583	CTT	2	6	151855	151860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119315
2515	NC_012583	GCAATC	2	12	151920	151931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227119315
2516	NC_012583	TGT	2	6	151945	151950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119315
2517	NC_012583	AGA	2	6	151966	151971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119315
2518	NC_012583	ATC	2	6	152012	152017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119315
2519	NC_012583	GGT	2	6	152046	152051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119315
2520	NC_012583	GAG	2	6	152065	152070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119315
2521	NC_012583	AAAG	2	8	152114	152121	75 %	0 %	25 %	0 %	227119315
2522	NC_012583	ATC	2	6	152147	152152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119315
2523	NC_012583	ACC	3	9	152195	152203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119315
2524	NC_012583	CAC	2	6	152239	152244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119315
2525	NC_012583	ACC	2	6	152257	152262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119315
2526	NC_012583	CAG	2	6	152324	152329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119315
2527	NC_012583	TGC	2	6	152347	152352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119315
2528	NC_012583	AGAC	2	8	152468	152475	50 %	0 %	25 %	25 %	227119315
2529	NC_012583	TAG	2	6	152580	152585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119315
2530	NC_012583	CAA	2	6	152596	152601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119315
2531	NC_012583	CTA	2	6	152739	152744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119315
2532	NC_012583	TTA	2	6	152848	152853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119316
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2534	NC_012583	ATT	2	6	152876	152881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119316
2535	NC_012583	TTG	2	6	152915	152920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119316
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2537	NC_012583	TTG	2	6	153302	153307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119317
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2539	NC_012583	ATTG	2	8	153385	153392	25 %	50 %	25 %	0 %	227119317
2540	NC_012583	TGGT	2	8	153404	153411	0 %	50 %	50 %	0 %	227119317
2541	NC_012583	AAT	2	6	153463	153468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119317
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2543	NC_012583	GGC	2	6	153977	153982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119318
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2545	NC_012583	GGC	2	6	154091	154096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119318
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2547	NC_012583	GGT	2	6	154187	154192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119318
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2550	NC_012583	TTTA	2	8	154351	154358	25 %	75 %	0 %	0 %	227119318
2551	NC_012583	TTGG	2	8	154410	154417	0 %	50 %	50 %	0 %	227119318
2552	NC_012583	GCGAT	2	10	154492	154501	20 %	20 %	40 %	20 %	227119318
2553	NC_012583	GGT	2	6	154533	154538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119318
2554	NC_012583	GGC	2	6	154572	154577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119318
2555	NC_012583	CCA	2	6	154587	154592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119318
2556	NC_012583	CCGA	2	8	154605	154612	25 %	0 %	25 %	50 %	227119318
2557	NC_012583	TAC	2	6	154638	154643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119318
2558	NC_012583	TTGCC	2	10	154729	154738	0 %	40 %	20 %	40 %	227119318
2559	NC_012583	CAA	2	6	154748	154753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119318
2560	NC_012583	CCAA	2	8	154876	154883	50 %	0 %	0 %	50 %	227119318
2561	NC_012583	GTG	2	6	155036	155041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119318
2562	NC_012583	GT	3	6	155080	155085	0 %	50 %	50 %	0 %	227119318
2563	NC_012583	ATT	2	6	155256	155261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119319
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2567	NC_012583	GTT	2	6	155531	155536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119319
2568	NC_012583	TCGAAC	2	12	155571	155582	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227119319
2569	NC_012583	GC	3	6	155598	155603	0 %	0 %	50 %	50 %	227119319
2570	NC_012583	GATG	2	8	155606	155613	25 %	25 %	50 %	0 %	227119319
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2573	NC_012583	TTG	2	6	155895	155900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119319
2574	NC_012583	TCT	2	6	155926	155931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119319
2575	NC_012583	ATCA	2	8	155997	156004	50 %	25 %	0 %	25 %	227119319
2576	NC_012583	GGC	2	6	156020	156025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119319
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2578	NC_012583	CAG	3	9	156147	156155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119319
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2580	NC_012583	TTG	2	6	156310	156315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119319
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2582	NC_012583	AGC	2	6	156418	156423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119319
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2587	NC_012583	GA	3	6	156667	156672	50 %	0 %	50 %	0 %	227119319
2588	NC_012583	AAT	2	6	156674	156679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119319
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2591	NC_012583	GCA	2	6	156799	156804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119319
2592	NC_012583	TGC	2	6	156821	156826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119319
2593	NC_012583	GCT	2	6	156860	156865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119319
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2599	NC_012583	TCA	2	6	157070	157075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119319
2600	NC_012583	GCGCT	2	10	157152	157161	0 %	20 %	40 %	40 %	227119319
2601	NC_012583	CAG	2	6	157215	157220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119319
2602	NC_012583	ATTG	2	8	157572	157579	25 %	50 %	25 %	0 %	227119320
2603	NC_012583	GAC	3	9	157582	157590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119320
2604	NC_012583	GCG	2	6	157672	157677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119320
2605	NC_012583	AGC	2	6	157682	157687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119320
2606	NC_012583	CGC	2	6	157695	157700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119320
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2608	NC_012583	TGG	2	6	157748	157753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119320
2609	NC_012583	GTCA	2	8	157906	157913	25 %	25 %	25 %	25 %	227119320
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2613	NC_012583	CGGTG	2	10	158220	158229	0 %	20 %	60 %	20 %	227119320
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2989	NC_012583	CAG	2	6	186015	186020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
2990	NC_012583	CAG	2	6	186027	186032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
2991	NC_012583	AT	3	6	186037	186042	50 %	50 %	0 %	0 %	227119345
2992	NC_012583	CGA	2	6	186059	186064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
2993	NC_012583	CTG	2	6	186066	186071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119345
2994	NC_012583	GGCT	2	8	186088	186095	0 %	25 %	50 %	25 %	227119345
2995	NC_012583	TTC	2	6	186117	186122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119345
2996	NC_012583	TGCC	2	8	186146	186153	0 %	25 %	25 %	50 %	227119345
2997	NC_012583	CCA	2	6	186189	186194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119345
2998	NC_012583	CCTG	2	8	186226	186233	0 %	25 %	25 %	50 %	227119345
2999	NC_012583	CTTG	2	8	186248	186255	0 %	50 %	25 %	25 %	227119345
3000	NC_012583	CT	3	6	186322	186327	0 %	50 %	0 %	50 %	227119345

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