MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012583	TGGT	2	8	120328	120335	0 %	50 %	50 %	0 %	227119290
2002	NC_012583	CTT	2	6	120391	120396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119290
2003	NC_012583	TCGTCA	2	12	120428	120439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227119290
2004	NC_012583	AG	3	6	120467	120472	50 %	0 %	50 %	0 %	227119290
2005	NC_012583	G	6	6	120478	120483	0 %	0 %	100 %	0 %	227119290
2006	NC_012583	TGA	2	6	120518	120523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119290
2007	NC_012583	TCAA	2	8	120555	120562	50 %	25 %	0 %	25 %	227119290
2008	NC_012583	TGC	2	6	120583	120588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119290
2009	NC_012583	TGGGG	2	10	120599	120608	0 %	20 %	80 %	0 %	227119290
2010	NC_012583	TG	3	6	120615	120620	0 %	50 %	50 %	0 %	227119290
2011	NC_012583	CGAC	2	8	120622	120629	25 %	0 %	25 %	50 %	227119290
2012	NC_012583	TG	3	6	120774	120779	0 %	50 %	50 %	0 %	227119290
2013	NC_012583	GGTAC	2	10	120975	120984	20 %	20 %	40 %	20 %	227119290
2014	NC_012583	CA	3	6	121076	121081	50 %	0 %	0 %	50 %	227119290
2015	NC_012583	GTGAT	2	10	121284	121293	20 %	40 %	40 %	0 %	227119291
2016	NC_012583	GAT	2	6	121313	121318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119291
2017	NC_012583	T	6	6	121340	121345	0 %	100 %	0 %	0 %	227119291
2018	NC_012583	G	6	6	121412	121417	0 %	0 %	100 %	0 %	227119291
2019	NC_012583	AGC	2	6	121422	121427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119291
2020	NC_012583	T	6	6	121438	121443	0 %	100 %	0 %	0 %	227119291
2021	NC_012583	GATT	2	8	121452	121459	25 %	50 %	25 %	0 %	227119291
2022	NC_012583	TAC	2	6	121493	121498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119291
2023	NC_012583	TGG	2	6	121551	121556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119291
2024	NC_012583	ATT	2	6	121667	121672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119291
2025	NC_012583	ATTG	2	8	121811	121818	25 %	50 %	25 %	0 %	227119291
2026	NC_012583	TAT	2	6	121831	121836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119291
2027	NC_012583	T	6	6	121873	121878	0 %	100 %	0 %	0 %	227119291
2028	NC_012583	TGG	2	6	121914	121919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119291
2029	NC_012583	GATG	2	8	121963	121970	25 %	25 %	50 %	0 %	227119291
2030	NC_012583	TGA	2	6	122267	122272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119292
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2033	NC_012583	GAA	2	6	122437	122442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119292
2034	NC_012583	ACCA	2	8	122535	122542	50 %	0 %	0 %	50 %	227119292
2035	NC_012583	GCG	2	6	122581	122586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119292
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2039	NC_012583	TGC	2	6	122672	122677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119292
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2041	NC_012583	CA	3	6	122959	122964	50 %	0 %	0 %	50 %	227119292
2042	NC_012583	TGA	2	6	123033	123038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119292
2043	NC_012583	TG	3	6	123097	123102	0 %	50 %	50 %	0 %	227119292
2044	NC_012583	CAA	2	6	123124	123129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119292
2045	NC_012583	GTGA	2	8	123130	123137	25 %	25 %	50 %	0 %	227119292
2046	NC_012583	CGT	2	6	123249	123254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119292
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2051	NC_012583	CA	3	6	123420	123425	50 %	0 %	0 %	50 %	227119292
2052	NC_012583	CTA	2	6	123465	123470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119292
2053	NC_012583	GTT	2	6	123510	123515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119292
2054	NC_012583	TCG	2	6	123633	123638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119293
2055	NC_012583	GTC	2	6	123779	123784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119293
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2060	NC_012583	TGT	2	6	125438	125443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119294
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2062	NC_012583	A	6	6	125456	125461	100 %	0 %	0 %	0 %	227119294
2063	NC_012583	ACT	2	6	125477	125482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119294
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2066	NC_012583	TTTA	2	8	125863	125870	25 %	75 %	0 %	0 %	227119294
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2071	NC_012583	CCGA	2	8	126007	126014	25 %	0 %	25 %	50 %	227119294
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2083	NC_012583	A	6	6	126632	126637	100 %	0 %	0 %	0 %	227119295
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2092	NC_012583	CCCA	2	8	126938	126945	25 %	0 %	0 %	75 %	227119295
2093	NC_012583	TGAT	2	8	127038	127045	25 %	50 %	25 %	0 %	227119295
2094	NC_012583	AAG	2	6	127119	127124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119295
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2099	NC_012583	CA	3	6	127332	127337	50 %	0 %	0 %	50 %	227119295
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2102	NC_012583	AGCG	2	8	127574	127581	25 %	0 %	50 %	25 %	227119295
2103	NC_012583	GCA	3	9	127648	127656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119295
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2107	NC_012583	GCTGA	2	10	127691	127700	20 %	20 %	40 %	20 %	227119295
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2116	NC_012583	GGT	2	6	128248	128253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119295
2117	NC_012583	TGA	2	6	128260	128265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119295
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2121	NC_012583	CTTT	2	8	128466	128473	0 %	75 %	0 %	25 %	227119295
2122	NC_012583	CTGCT	2	10	128478	128487	0 %	40 %	20 %	40 %	227119295
2123	NC_012583	TACC	2	8	128510	128517	25 %	25 %	0 %	50 %	227119295
2124	NC_012583	AAG	2	6	128526	128531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119295
2125	NC_012583	GTG	2	6	128603	128608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119295
2126	NC_012583	AG	3	6	128614	128619	50 %	0 %	50 %	0 %	227119295
2127	NC_012583	TGC	2	6	128700	128705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119295
2128	NC_012583	GCT	2	6	128722	128727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119295
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2130	NC_012583	TGGC	2	8	128821	128828	0 %	25 %	50 %	25 %	227119296
2131	NC_012583	TGG	2	6	128843	128848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119296
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2136	NC_012583	CAATC	2	10	129079	129088	40 %	20 %	0 %	40 %	227119296
2137	NC_012583	T	6	6	129254	129259	0 %	100 %	0 %	0 %	227119296
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2146	NC_012583	CTG	2	6	129820	129825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119296
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2151	NC_012583	GC	3	6	130073	130078	0 %	0 %	50 %	50 %	227119296
2152	NC_012583	ACCCT	2	10	130132	130141	20 %	20 %	0 %	60 %	227119296
2153	NC_012583	GCTG	2	8	130215	130222	0 %	25 %	50 %	25 %	227119296
2154	NC_012583	GTCA	2	8	130264	130271	25 %	25 %	25 %	25 %	227119296
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2231	NC_012583	TCG	2	6	137647	137652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119301
2232	NC_012583	CTG	2	6	137761	137766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119301
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2235	NC_012583	CAG	2	6	137949	137954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119301
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2239	NC_012583	AC	3	6	138143	138148	50 %	0 %	0 %	50 %	227119301
2240	NC_012583	AGCCA	2	10	138188	138197	40 %	0 %	20 %	40 %	227119301
2241	NC_012583	ACC	2	6	138264	138269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119301
2242	NC_012583	CAG	2	6	138363	138368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119301
2243	NC_012583	TGCTT	2	10	138464	138473	0 %	60 %	20 %	20 %	227119301
2244	NC_012583	AAG	2	6	138610	138615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119301
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2246	NC_012583	A	6	6	138823	138828	100 %	0 %	0 %	0 %	227119301
2247	NC_012583	GTA	2	6	138877	138882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119301
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2277	NC_012583	TCA	2	6	140190	140195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119301
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2353	NC_012583	T	6	6	143802	143807	0 %	100 %	0 %	0 %	227119307
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2357	NC_012583	GCTG	2	8	144000	144007	0 %	25 %	50 %	25 %	227119307
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2362	NC_012583	TTCCGG	2	12	144200	144211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119307
2363	NC_012583	GGC	2	6	144292	144297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119307
2364	NC_012583	CAT	2	6	144390	144395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119307
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2366	NC_012583	CAT	2	6	144507	144512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119307
2367	NC_012583	TCA	2	6	144533	144538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119307
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2482	NC_012583	TGCT	2	8	150296	150303	0 %	50 %	25 %	25 %	227119314
2483	NC_012583	TCA	2	6	150304	150309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119314
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2487	NC_012583	CAAC	2	8	150349	150356	50 %	0 %	0 %	50 %	227119314
2488	NC_012583	GCC	2	6	150407	150412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119314
2489	NC_012583	AGTCAT	2	12	150427	150438	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227119314
2490	NC_012583	CAG	2	6	150494	150499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119314
2491	NC_012583	AGC	2	6	150534	150539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119314
2492	NC_012583	TCA	2	6	150540	150545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119314
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2494	NC_012583	GTC	2	6	150593	150598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119314
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2500	NC_012583	ATGT	2	8	151063	151070	25 %	50 %	25 %	0 %	227119314

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