MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

< Previous12...24252627282930313233343536Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_012583	TGC	2	6	1104243	1104248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120300
17502	NC_012583	GC	3	6	1104256	1104261	0 %	0 %	50 %	50 %	227120300
17503	NC_012583	TCTGC	2	10	1104265	1104274	0 %	40 %	20 %	40 %	227120300
17504	NC_012583	TTC	2	6	1104302	1104307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120300
17505	NC_012583	CAAA	2	8	1104311	1104318	75 %	0 %	0 %	25 %	227120300
17506	NC_012583	T	6	6	1104358	1104363	0 %	100 %	0 %	0 %	227120300
17507	NC_012583	A	6	6	1104530	1104535	100 %	0 %	0 %	0 %	227120300
17508	NC_012583	TG	3	6	1104559	1104564	0 %	50 %	50 %	0 %	227120300
17509	NC_012583	AAT	2	6	1104688	1104693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120300
17510	NC_012583	CT	3	6	1104705	1104710	0 %	50 %	0 %	50 %	227120300
17511	NC_012583	CAA	2	6	1104727	1104732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120300
17512	NC_012583	TGC	3	9	1104762	1104770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120300
17513	NC_012583	ACT	2	6	1104799	1104804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120301
17514	NC_012583	GCTT	2	8	1104808	1104815	0 %	50 %	25 %	25 %	227120301
17515	NC_012583	ATTG	2	8	1104830	1104837	25 %	50 %	25 %	0 %	227120301
17516	NC_012583	ACG	2	6	1104972	1104977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120301
17517	NC_012583	CAC	2	6	1105015	1105020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120301
17518	NC_012583	CTG	2	6	1105041	1105046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120301
17519	NC_012583	AAG	2	6	1105088	1105093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120301
17520	NC_012583	TCAA	2	8	1105108	1105115	50 %	25 %	0 %	25 %	227120301
17521	NC_012583	AAG	2	6	1105152	1105157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120301
17522	NC_012583	CAGA	2	8	1105225	1105232	50 %	0 %	25 %	25 %	227120301
17523	NC_012583	TCA	2	6	1105315	1105320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120301
17524	NC_012583	GCC	2	6	1105692	1105697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120302
17525	NC_012583	CAA	2	6	1105727	1105732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120302
17526	NC_012583	CT	3	6	1105743	1105748	0 %	50 %	0 %	50 %	227120302
17527	NC_012583	CG	3	6	1105818	1105823	0 %	0 %	50 %	50 %	227120302
17528	NC_012583	GAT	2	6	1105892	1105897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120302
17529	NC_012583	CTG	2	6	1105955	1105960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120302
17530	NC_012583	CCAA	2	8	1105972	1105979	50 %	0 %	0 %	50 %	227120302
17531	NC_012583	AG	4	8	1106005	1106012	50 %	0 %	50 %	0 %	227120302
17532	NC_012583	AAC	2	6	1106014	1106019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120302
17533	NC_012583	TAGC	2	8	1106068	1106075	25 %	25 %	25 %	25 %	227120302
17534	NC_012583	CAA	2	6	1106084	1106089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120302
17535	NC_012583	TCAC	2	8	1106094	1106101	25 %	25 %	0 %	50 %	227120302
17536	NC_012583	TGG	2	6	1106110	1106115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120302
17537	NC_012583	TAA	2	6	1106118	1106123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120302
17538	NC_012583	TGC	2	6	1106133	1106138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120302
17539	NC_012583	CAA	2	6	1106153	1106158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120302
17540	NC_012583	CAA	2	6	1106217	1106222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120302
17541	NC_012583	GC	3	6	1106228	1106233	0 %	0 %	50 %	50 %	227120302
17542	NC_012583	CGC	2	6	1106292	1106297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120302
17543	NC_012583	TCG	2	6	1106320	1106325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120302
17544	NC_012583	CGA	2	6	1106389	1106394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120302
17545	NC_012583	CA	3	6	1106504	1106509	50 %	0 %	0 %	50 %	227120302
17546	NC_012583	CTGA	2	8	1106516	1106523	25 %	25 %	25 %	25 %	227120302
17547	NC_012583	TC	3	6	1106544	1106549	0 %	50 %	0 %	50 %	227120302
17548	NC_012583	AGA	2	6	1106586	1106591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120302
17549	NC_012583	CGC	2	6	1106627	1106632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120302
17550	NC_012583	GCT	2	6	1106644	1106649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120302
17551	NC_012583	CAAC	2	8	1106687	1106694	50 %	0 %	0 %	50 %	227120302
17552	NC_012583	GAA	2	6	1106748	1106753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120302
17553	NC_012583	GCAGC	2	10	1106803	1106812	20 %	0 %	40 %	40 %	227120302
17554	NC_012583	TCG	2	6	1106817	1106822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120302
17555	NC_012583	CAC	2	6	1106990	1106995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120302
17556	NC_012583	GCC	2	6	1107030	1107035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120302
17557	NC_012583	ATG	2	6	1107117	1107122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120302
17558	NC_012583	TTCG	2	8	1107165	1107172	0 %	50 %	25 %	25 %	227120302
17559	NC_012583	CCGAAT	2	12	1107178	1107189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227120302
17560	NC_012583	CAAG	2	8	1107223	1107230	50 %	0 %	25 %	25 %	227120302
17561	NC_012583	GC	3	6	1107240	1107245	0 %	0 %	50 %	50 %	227120302
17562	NC_012583	ACC	2	6	1107291	1107296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120302
17563	NC_012583	CCG	2	6	1107306	1107311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120302
17564	NC_012583	CCA	2	6	1107313	1107318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120302
17565	NC_012583	GTT	2	6	1107472	1107477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120302
17566	NC_012583	TGC	2	6	1107513	1107518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120302
17567	NC_012583	CAC	2	6	1107529	1107534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120302
17568	NC_012583	CTTG	2	8	1107562	1107569	0 %	50 %	25 %	25 %	227120302
17569	NC_012583	GCT	2	6	1107574	1107579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120302
17570	NC_012583	AATA	2	8	1107588	1107595	75 %	25 %	0 %	0 %	227120302
17571	NC_012583	ATG	2	6	1107632	1107637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120302
17572	NC_012583	AAG	2	6	1107691	1107696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120302
17573	NC_012583	AAC	2	6	1107961	1107966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120303
17574	NC_012583	AAG	2	6	1107967	1107972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120303
17575	NC_012583	AAT	2	6	1108002	1108007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120303
17576	NC_012583	CAAACT	2	12	1108022	1108033	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227120303
17577	NC_012583	TAC	2	6	1108230	1108235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120303
17578	NC_012583	TGG	2	6	1108414	1108419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120303
17579	NC_012583	GAA	2	6	1108424	1108429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120303
17580	NC_012583	AGA	2	6	1108562	1108567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120303
17581	NC_012583	TGGA	2	8	1108581	1108588	25 %	25 %	50 %	0 %	227120303
17582	NC_012583	GCA	2	6	1108609	1108614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120303
17583	NC_012583	TTA	2	6	1108639	1108644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120303
17584	NC_012583	ACCA	2	8	1108654	1108661	50 %	0 %	0 %	50 %	227120303
17585	NC_012583	CCA	2	6	1108705	1108710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120303
17586	NC_012583	GCT	2	6	1108724	1108729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120303
17587	NC_012583	A	7	7	1108782	1108788	100 %	0 %	0 %	0 %	227120303
17588	NC_012583	TCA	3	9	1108971	1108979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120304
17589	NC_012583	TTC	2	6	1108983	1108988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120304
17590	NC_012583	ATT	2	6	1109003	1109008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120304
17591	NC_012583	TGA	2	6	1109038	1109043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120304
17592	NC_012583	AGG	2	6	1109072	1109077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227120304
17593	NC_012583	CTT	2	6	1109116	1109121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120304
17594	NC_012583	CTTGAG	2	12	1109140	1109151	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227120304
17595	NC_012583	TGC	2	6	1109154	1109159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120304
17596	NC_012583	TAA	2	6	1109192	1109197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120304
17597	NC_012583	TAG	2	6	1109251	1109256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120304
17598	NC_012583	GGC	2	6	1109257	1109262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120304
17599	NC_012583	ACA	2	6	1109271	1109276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120304
17600	NC_012583	GCG	2	6	1109310	1109315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120304
17601	NC_012583	CAC	2	6	1109326	1109331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120304
17602	NC_012583	CAC	2	6	1109389	1109394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120304
17603	NC_012583	GCTTG	2	10	1109401	1109410	0 %	40 %	40 %	20 %	227120304
17604	NC_012583	CGA	2	6	1109547	1109552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120304
17605	NC_012583	T	6	6	1109707	1109712	0 %	100 %	0 %	0 %	227120304
17606	NC_012583	TCA	2	6	1109721	1109726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120304
17607	NC_012583	ATC	2	6	1109784	1109789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120304
17608	NC_012583	TGTGCT	2	12	1109790	1109801	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227120304
17609	NC_012583	CGT	2	6	1109828	1109833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120304
17610	NC_012583	GTTCA	2	10	1109870	1109879	20 %	40 %	20 %	20 %	227120304
17611	NC_012583	TTAC	2	8	1109900	1109907	25 %	50 %	0 %	25 %	227120305
17612	NC_012583	TGAA	2	8	1109931	1109938	50 %	25 %	25 %	0 %	227120305
17613	NC_012583	GCTCTA	2	12	1109945	1109956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227120305
17614	NC_012583	T	6	6	1109963	1109968	0 %	100 %	0 %	0 %	227120305
17615	NC_012583	T	7	7	1109996	1110002	0 %	100 %	0 %	0 %	227120305
17616	NC_012583	TCAAA	2	10	1110026	1110035	60 %	20 %	0 %	20 %	227120305
17617	NC_012583	TGG	2	6	1110086	1110091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120305
17618	NC_012583	CAT	2	6	1110093	1110098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120305
17619	NC_012583	CAA	2	6	1110111	1110116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120305
17620	NC_012583	CTT	2	6	1110147	1110152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120305
17621	NC_012583	GAA	2	6	1110246	1110251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120305
17622	NC_012583	CAGTC	2	10	1110268	1110277	20 %	20 %	20 %	40 %	227120305
17623	NC_012583	CGC	2	6	1110282	1110287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120305
17624	NC_012583	ATCA	2	8	1110357	1110364	50 %	25 %	0 %	25 %	227120305
17625	NC_012583	TGA	2	6	1110365	1110370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120305
17626	NC_012583	TGAT	2	8	1110432	1110439	25 %	50 %	25 %	0 %	227120305
17627	NC_012583	GA	3	6	1110445	1110450	50 %	0 %	50 %	0 %	227120305
17628	NC_012583	TCAA	2	8	1110682	1110689	50 %	25 %	0 %	25 %	227120305
17629	NC_012583	ACC	2	6	1110765	1110770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120305
17630	NC_012583	TGA	2	6	1110788	1110793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120305
17631	NC_012583	ATT	2	6	1110810	1110815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120305
17632	NC_012583	T	8	8	1110814	1110821	0 %	100 %	0 %	0 %	227120305
17633	NC_012583	CATC	2	8	1110851	1110858	25 %	25 %	0 %	50 %	227120305
17634	NC_012583	AG	3	6	1110877	1110882	50 %	0 %	50 %	0 %	227120305
17635	NC_012583	AGT	2	6	1110887	1110892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120305
17636	NC_012583	CTT	2	6	1110926	1110931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120305
17637	NC_012583	TCA	2	6	1110949	1110954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120305
17638	NC_012583	GGA	2	6	1111006	1111011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227120305
17639	NC_012583	TCA	2	6	1111018	1111023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120305
17640	NC_012583	CTC	2	6	1111029	1111034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227120305
17641	NC_012583	TTG	2	6	1111065	1111070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120305

< Previous12...24252627282930313233343536Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.