MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_012583	CCG	2	6	1045041	1045046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120250
16503	NC_012583	ACC	2	6	1045049	1045054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120250
16504	NC_012583	TGC	2	6	1045070	1045075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120250
16505	NC_012583	GAGTT	2	10	1045130	1045139	20 %	40 %	40 %	0 %	227120250
16506	NC_012583	TCA	2	6	1045223	1045228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120250
16507	NC_012583	ATTCC	2	10	1045316	1045325	20 %	40 %	0 %	40 %	227120250
16508	NC_012583	CCA	2	6	1045326	1045331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120250
16509	NC_012583	TCG	2	6	1045397	1045402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120250
16510	NC_012583	CTGC	2	8	1045434	1045441	0 %	25 %	25 %	50 %	227120250
16511	NC_012583	GT	3	6	1045485	1045490	0 %	50 %	50 %	0 %	227120250
16512	NC_012583	CAT	2	6	1045528	1045533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120250
16513	NC_012583	TGAT	2	8	1045619	1045626	25 %	50 %	25 %	0 %	227120250
16514	NC_012583	CAG	2	6	1045684	1045689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120250
16515	NC_012583	TTTC	2	8	1045761	1045768	0 %	75 %	0 %	25 %	227120250
16516	NC_012583	TAC	2	6	1045842	1045847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120250
16517	NC_012583	ATGA	2	8	1045868	1045875	50 %	25 %	25 %	0 %	227120250
16518	NC_012583	GCC	3	9	1045877	1045885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120250
16519	NC_012583	ATA	2	6	1045921	1045926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120250
16520	NC_012583	ATT	2	6	1045930	1045935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120250
16521	NC_012583	CT	3	6	1045976	1045981	0 %	50 %	0 %	50 %	227120250
16522	NC_012583	CAT	2	6	1046070	1046075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120250
16523	NC_012583	CAT	2	6	1046133	1046138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120250
16524	NC_012583	CGT	2	6	1046277	1046282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120250
16525	NC_012583	GTG	2	6	1046312	1046317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120250
16526	NC_012583	GAA	2	6	1046342	1046347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120250
16527	NC_012583	T	7	7	1046478	1046484	0 %	100 %	0 %	0 %	227120250
16528	NC_012583	GCTC	2	8	1046516	1046523	0 %	25 %	25 %	50 %	227120250
16529	NC_012583	GGC	2	6	1046548	1046553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120250
16530	NC_012583	ACCC	2	8	1046560	1046567	25 %	0 %	0 %	75 %	227120250
16531	NC_012583	A	6	6	1046589	1046594	100 %	0 %	0 %	0 %	227120250
16532	NC_012583	TTG	2	6	1046624	1046629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120250
16533	NC_012583	TGT	2	6	1047043	1047048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120251
16534	NC_012583	GCT	2	6	1047092	1047097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120251
16535	NC_012583	CAT	2	6	1047125	1047130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120251
16536	NC_012583	CGC	2	6	1047143	1047148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120251
16537	NC_012583	GT	3	6	1047199	1047204	0 %	50 %	50 %	0 %	227120251
16538	NC_012583	AGC	2	6	1047208	1047213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120251
16539	NC_012583	GGC	2	6	1047261	1047266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120251
16540	NC_012583	CACG	2	8	1047275	1047282	25 %	0 %	25 %	50 %	227120251
16541	NC_012583	AGC	2	6	1047324	1047329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120251
16542	NC_012583	CATT	2	8	1047466	1047473	25 %	50 %	0 %	25 %	227120251
16543	NC_012583	CTT	2	6	1047476	1047481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120251
16544	NC_012583	AGC	2	6	1047499	1047504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120251
16545	NC_012583	CAG	2	6	1047525	1047530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120251
16546	NC_012583	CGC	2	6	1047582	1047587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120251
16547	NC_012583	CA	3	6	1047608	1047613	50 %	0 %	0 %	50 %	227120251
16548	NC_012583	GC	3	6	1047654	1047659	0 %	0 %	50 %	50 %	227120251
16549	NC_012583	GAT	2	6	1048167	1048172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120252
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16551	NC_012583	CG	3	6	1048183	1048188	0 %	0 %	50 %	50 %	227120252
16552	NC_012583	GGGC	2	8	1048211	1048218	0 %	0 %	75 %	25 %	227120252
16553	NC_012583	AGT	2	6	1048299	1048304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120252
16554	NC_012583	TTGAT	2	10	1048312	1048321	20 %	60 %	20 %	0 %	227120252
16555	NC_012583	GAA	2	6	1048323	1048328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120252
16556	NC_012583	AGA	2	6	1048361	1048366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120252
16557	NC_012583	CGCT	2	8	1048411	1048418	0 %	25 %	25 %	50 %	227120252
16558	NC_012583	TG	3	6	1048438	1048443	0 %	50 %	50 %	0 %	227120252
16559	NC_012583	CCA	2	6	1048643	1048648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120252
16560	NC_012583	CAT	2	6	1048796	1048801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120252
16561	NC_012583	GCTC	2	8	1048935	1048942	0 %	25 %	25 %	50 %	227120253
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16563	NC_012583	TGG	2	6	1048979	1048984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120253
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16566	NC_012583	ATT	2	6	1049092	1049097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120253
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16571	NC_012583	GACC	2	8	1049369	1049376	25 %	0 %	25 %	50 %	227120253
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16573	NC_012583	AAG	2	6	1049503	1049508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120253
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16589	NC_012583	AGC	2	6	1050143	1050148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120254
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16601	NC_012583	GCC	2	6	1051429	1051434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120255
16602	NC_012583	GAT	2	6	1051510	1051515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120255
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16607	NC_012583	T	6	6	1051807	1051812	0 %	100 %	0 %	0 %	227120255
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16614	NC_012583	AC	3	6	1052245	1052250	50 %	0 %	0 %	50 %	227120256
16615	NC_012583	GCG	2	6	1052277	1052282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120256
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16734	NC_012583	CGA	2	6	1058372	1058377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120262
16735	NC_012583	TTG	2	6	1058380	1058385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120262
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16964	NC_012583	CTC	2	6	1072410	1072415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227120273
16965	NC_012583	CAAGTG	2	12	1072417	1072428	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227120273
16966	NC_012583	CGA	2	6	1072515	1072520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120273
16967	NC_012583	CGCGAG	2	12	1072543	1072554	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	227120273
16968	NC_012583	GAAGA	2	10	1072633	1072642	60 %	0 %	40 %	0 %	227120273
16969	NC_012583	GCTT	2	8	1072677	1072684	0 %	50 %	25 %	25 %	227120273
16970	NC_012583	TCCC	2	8	1072685	1072692	0 %	25 %	0 %	75 %	227120273
16971	NC_012583	AGCC	2	8	1072705	1072712	25 %	0 %	25 %	50 %	227120273
16972	NC_012583	TC	4	8	1072782	1072789	0 %	50 %	0 %	50 %	227120273
16973	NC_012583	TTGA	2	8	1072816	1072823	25 %	50 %	25 %	0 %	227120273
16974	NC_012583	ATC	2	6	1072837	1072842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120273
16975	NC_012583	A	6	6	1072870	1072875	100 %	0 %	0 %	0 %	227120273
16976	NC_012583	CTG	2	6	1072930	1072935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120273
16977	NC_012583	AGC	2	6	1073066	1073071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120273
16978	NC_012583	TC	3	6	1073107	1073112	0 %	50 %	0 %	50 %	227120273
16979	NC_012583	CGG	2	6	1073120	1073125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120273
16980	NC_012583	CAT	2	6	1073235	1073240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120273
16981	NC_012583	TGG	2	6	1073364	1073369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120273
16982	NC_012583	ATT	2	6	1073521	1073526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120273
16983	NC_012583	CTG	2	6	1073554	1073559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120273
16984	NC_012583	GCCC	2	8	1073601	1073608	0 %	0 %	25 %	75 %	227120273
16985	NC_012583	CCT	2	6	1073647	1073652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227120274
16986	NC_012583	GCTC	2	8	1073765	1073772	0 %	25 %	25 %	50 %	227120274
16987	NC_012583	AGAGCA	2	12	1073780	1073791	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	227120274
16988	NC_012583	AAG	2	6	1073797	1073802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120274
16989	NC_012583	T	6	6	1073811	1073816	0 %	100 %	0 %	0 %	227120274
16990	NC_012583	ACT	2	6	1073863	1073868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120274
16991	NC_012583	ACTCC	2	10	1074034	1074043	20 %	20 %	0 %	60 %	227120274
16992	NC_012583	ATA	2	6	1074067	1074072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120274
16993	NC_012583	TAAA	2	8	1074241	1074248	75 %	25 %	0 %	0 %	227120274
16994	NC_012583	ATG	2	6	1074262	1074267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120274
16995	NC_012583	ACAA	2	8	1074288	1074295	75 %	0 %	0 %	25 %	227120275
16996	NC_012583	GAT	2	6	1074307	1074312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120275
16997	NC_012583	TGT	2	6	1074327	1074332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120275
16998	NC_012583	AAC	4	12	1074381	1074392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120275
16999	NC_012583	CAA	2	6	1074403	1074408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120275
17000	NC_012583	GAA	2	6	1074451	1074456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120275

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