MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012583	TAAG	2	8	1014979	1014986	50 %	25 %	25 %	0 %	227120222
16002	NC_012583	TAA	2	6	1015039	1015044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120222
16003	NC_012583	CAT	2	6	1015059	1015064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120222
16004	NC_012583	AGC	2	6	1015114	1015119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120222
16005	NC_012583	CAT	2	6	1015212	1015217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120222
16006	NC_012583	GAA	2	6	1015334	1015339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120222
16007	NC_012583	TAT	2	6	1015344	1015349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120222
16008	NC_012583	AG	3	6	1015372	1015377	50 %	0 %	50 %	0 %	227120222
16009	NC_012583	ACC	3	9	1015408	1015416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120222
16010	NC_012583	GTA	2	6	1015471	1015476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120222
16011	NC_012583	CTT	2	6	1015500	1015505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120222
16012	NC_012583	TTC	2	6	1015642	1015647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120222
16013	NC_012583	TAG	2	6	1015664	1015669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120222
16014	NC_012583	GAC	2	6	1015689	1015694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120222
16015	NC_012583	GCA	2	6	1015820	1015825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120222
16016	NC_012583	ACTT	2	8	1015831	1015838	25 %	50 %	0 %	25 %	227120222
16017	NC_012583	T	6	6	1015837	1015842	0 %	100 %	0 %	0 %	227120222
16018	NC_012583	AAAATG	2	12	1016274	1016285	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227120223
16019	NC_012583	CT	3	6	1016380	1016385	0 %	50 %	0 %	50 %	227120223
16020	NC_012583	ATG	2	6	1016503	1016508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120223
16021	NC_012583	GAGAT	2	10	1016665	1016674	40 %	20 %	40 %	0 %	227120223
16022	NC_012583	ATT	2	6	1016872	1016877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120223
16023	NC_012583	ACC	2	6	1016952	1016957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120223
16024	NC_012583	ACT	2	6	1017070	1017075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120223
16025	NC_012583	TC	3	6	1017131	1017136	0 %	50 %	0 %	50 %	227120223
16026	NC_012583	TTTCG	2	10	1017207	1017216	0 %	60 %	20 %	20 %	227120223
16027	NC_012583	GCC	2	6	1017222	1017227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120223
16028	NC_012583	GTG	2	6	1017241	1017246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120223
16029	NC_012583	AAG	2	6	1017259	1017264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120223
16030	NC_012583	TGC	2	6	1017298	1017303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120223
16031	NC_012583	TTGG	2	8	1017373	1017380	0 %	50 %	50 %	0 %	227120223
16032	NC_012583	TGGCG	2	10	1017423	1017432	0 %	20 %	60 %	20 %	227120223
16033	NC_012583	AAACAC	2	12	1017573	1017584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120223
16034	NC_012583	CG	3	6	1017678	1017683	0 %	0 %	50 %	50 %	227120223
16035	NC_012583	CTG	2	6	1017720	1017725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120223
16036	NC_012583	CA	3	6	1017742	1017747	50 %	0 %	0 %	50 %	227120223
16037	NC_012583	CCG	2	6	1017754	1017759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120223
16038	NC_012583	CA	3	6	1017769	1017774	50 %	0 %	0 %	50 %	227120223
16039	NC_012583	CAA	2	6	1017785	1017790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120223
16040	NC_012583	AAC	2	6	1017837	1017842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120223
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16043	NC_012583	TGT	2	6	1018057	1018062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120223
16044	NC_012583	GC	3	6	1018089	1018094	0 %	0 %	50 %	50 %	227120223
16045	NC_012583	GCA	2	6	1018115	1018120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120223
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16048	NC_012583	GAAA	2	8	1018405	1018412	75 %	0 %	25 %	0 %	227120224
16049	NC_012583	GTT	2	6	1018441	1018446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120224
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16053	NC_012583	TTC	2	6	1019100	1019105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120225
16054	NC_012583	A	7	7	1019124	1019130	100 %	0 %	0 %	0 %	227120225
16055	NC_012583	TGG	2	6	1019174	1019179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120225
16056	NC_012583	CTGA	2	8	1019226	1019233	25 %	25 %	25 %	25 %	227120225
16057	NC_012583	TACCT	2	10	1019237	1019246	20 %	40 %	0 %	40 %	227120225
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16060	NC_012583	CAA	2	6	1019373	1019378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120225
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16063	NC_012583	GAT	2	6	1019516	1019521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120225
16064	NC_012583	GCA	2	6	1019528	1019533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120225
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16067	NC_012583	CT	3	6	1019604	1019609	0 %	50 %	0 %	50 %	227120225
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16082	NC_012583	CGA	2	6	1020329	1020334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120225
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16115	NC_012583	ATC	2	6	1022799	1022804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120227
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16235	NC_012583	ACGTT	2	10	1029381	1029390	20 %	40 %	20 %	20 %	227120234
16236	NC_012583	CG	3	6	1029443	1029448	0 %	0 %	50 %	50 %	227120234
16237	NC_012583	CCA	2	6	1029513	1029518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120234
16238	NC_012583	GTGTTT	2	12	1029522	1029533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120234
16239	NC_012583	TCT	2	6	1029535	1029540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120234
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16241	NC_012583	CA	3	6	1029600	1029605	50 %	0 %	0 %	50 %	227120234
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16243	NC_012583	CT	3	6	1029693	1029698	0 %	50 %	0 %	50 %	227120234
16244	NC_012583	GCTTG	2	10	1029773	1029782	0 %	40 %	40 %	20 %	227120234
16245	NC_012583	GCTG	2	8	1029845	1029852	0 %	25 %	50 %	25 %	227120234
16246	NC_012583	TCA	2	6	1029868	1029873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120234
16247	NC_012583	ATC	2	6	1029885	1029890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120234
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16253	NC_012583	CCG	2	6	1030618	1030623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120235
16254	NC_012583	GC	3	6	1030658	1030663	0 %	0 %	50 %	50 %	227120235
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16265	NC_012583	GCGG	2	8	1031011	1031018	0 %	0 %	75 %	25 %	227120235
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16341	NC_012583	A	7	7	1034989	1034995	100 %	0 %	0 %	0 %	227120239
16342	NC_012583	ACTC	2	8	1035041	1035048	25 %	25 %	0 %	50 %	227120239
16343	NC_012583	CACC	2	8	1035072	1035079	25 %	0 %	0 %	75 %	227120239
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16349	NC_012583	ACCT	2	8	1035433	1035440	25 %	25 %	0 %	50 %	227120239
16350	NC_012583	GCG	2	6	1035551	1035556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120239
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16352	NC_012583	ACC	2	6	1035616	1035621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120239
16353	NC_012583	CCA	2	6	1035668	1035673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120239
16354	NC_012583	CCA	2	6	1035704	1035709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120239
16355	NC_012583	TCA	2	6	1035952	1035957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120240
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16469	NC_012583	GCC	2	6	1043047	1043052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120248
16470	NC_012583	TGAG	2	8	1043094	1043101	25 %	25 %	50 %	0 %	227120248
16471	NC_012583	CT	3	6	1043102	1043107	0 %	50 %	0 %	50 %	227120248
16472	NC_012583	ACGA	2	8	1043167	1043174	50 %	0 %	25 %	25 %	227120248
16473	NC_012583	T	6	6	1043262	1043267	0 %	100 %	0 %	0 %	227120248
16474	NC_012583	TAGT	2	8	1043369	1043376	25 %	50 %	25 %	0 %	227120249
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16477	NC_012583	TGC	2	6	1043537	1043542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120249
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16481	NC_012583	TGC	2	6	1043711	1043716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120249
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16492	NC_012583	ACC	2	6	1044596	1044601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120250
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16494	NC_012583	GAC	2	6	1044628	1044633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120250
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16497	NC_012583	TTG	2	6	1044895	1044900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120250
16498	NC_012583	CG	3	6	1044918	1044923	0 %	0 %	50 %	50 %	227120250
16499	NC_012583	CCG	2	6	1044947	1044952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120250
16500	NC_012583	GCT	2	6	1044986	1044991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120250

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