MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012583	CCAG	2	8	957385	957392	25 %	0 %	25 %	50 %	227120168
15002	NC_012583	AAC	2	6	957625	957630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120168
15003	NC_012583	AATAA	2	10	957667	957676	80 %	20 %	0 %	0 %	227120168
15004	NC_012583	CCA	2	6	957707	957712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120168
15005	NC_012583	AAAC	2	8	957779	957786	75 %	0 %	0 %	25 %	227120168
15006	NC_012583	ATC	2	6	957787	957792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120168
15007	NC_012583	CAT	2	6	957807	957812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120168
15008	NC_012583	GTT	2	6	957884	957889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120168
15009	NC_012583	ATG	2	6	958153	958158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120168
15010	NC_012583	GATTT	2	10	958170	958179	20 %	60 %	20 %	0 %	227120168
15011	NC_012583	CTGTCG	2	12	958328	958339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120168
15012	NC_012583	A	6	6	958386	958391	100 %	0 %	0 %	0 %	227120168
15013	NC_012583	GC	3	6	958398	958403	0 %	0 %	50 %	50 %	227120168
15014	NC_012583	ACCC	2	8	958449	958456	25 %	0 %	0 %	75 %	227120168
15015	NC_012583	ACT	2	6	958479	958484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120168
15016	NC_012583	TCCCT	2	10	958519	958528	0 %	40 %	0 %	60 %	227120168
15017	NC_012583	TTG	2	6	958541	958546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120168
15018	NC_012583	A	6	6	958593	958598	100 %	0 %	0 %	0 %	227120169
15019	NC_012583	AAAT	2	8	958639	958646	75 %	25 %	0 %	0 %	227120169
15020	NC_012583	TTAA	2	8	958658	958665	50 %	50 %	0 %	0 %	227120169
15021	NC_012583	ACAG	2	8	958677	958684	50 %	0 %	25 %	25 %	227120169
15022	NC_012583	GAA	2	6	958696	958701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120169
15023	NC_012583	A	6	6	958706	958711	100 %	0 %	0 %	0 %	227120169
15024	NC_012583	TAT	2	6	958725	958730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120169
15025	NC_012583	GAA	2	6	958813	958818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120170
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15027	NC_012583	CTGA	2	8	958879	958886	25 %	25 %	25 %	25 %	227120170
15028	NC_012583	TGC	2	6	958961	958966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120170
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15030	NC_012583	TTG	2	6	959112	959117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120170
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15032	NC_012583	TGCG	2	8	959168	959175	0 %	25 %	50 %	25 %	227120170
15033	NC_012583	CGC	2	6	959251	959256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120170
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15039	NC_012583	TTCA	2	8	959509	959516	25 %	50 %	0 %	25 %	227120170
15040	NC_012583	TCA	2	6	959577	959582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120170
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15043	NC_012583	TG	3	6	959657	959662	0 %	50 %	50 %	0 %	227120170
15044	NC_012583	GGT	2	6	959665	959670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120170
15045	NC_012583	AG	3	6	959728	959733	50 %	0 %	50 %	0 %	227120170
15046	NC_012583	AGC	2	6	959801	959806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120170
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15053	NC_012583	ATCGT	2	10	960242	960251	20 %	40 %	20 %	20 %	227120170
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15055	NC_012583	TAAA	2	8	960372	960379	75 %	25 %	0 %	0 %	227120170
15056	NC_012583	CAT	2	6	960769	960774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120171
15057	NC_012583	GC	3	6	960882	960887	0 %	0 %	50 %	50 %	227120171
15058	NC_012583	AC	3	6	960956	960961	50 %	0 %	0 %	50 %	227120171
15059	NC_012583	AAG	2	6	960966	960971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120171
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15062	NC_012583	CCACC	2	10	961120	961129	20 %	0 %	0 %	80 %	227120171
15063	NC_012583	GTGCG	2	10	961171	961180	0 %	20 %	60 %	20 %	227120171
15064	NC_012583	ATC	2	6	961212	961217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120171
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15085	NC_012583	AG	3	6	962076	962081	50 %	0 %	50 %	0 %	227120171
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15093	NC_012583	TCA	2	6	962433	962438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120171
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15103	NC_012583	ATCG	2	8	962969	962976	25 %	25 %	25 %	25 %	227120171
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15106	NC_012583	T	6	6	963294	963299	0 %	100 %	0 %	0 %	227120172
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15113	NC_012583	TCAA	2	8	963521	963528	50 %	25 %	0 %	25 %	227120172
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15122	NC_012583	ACC	2	6	963824	963829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120173
15123	NC_012583	ATG	2	6	963831	963836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120173
15124	NC_012583	CTG	2	6	963950	963955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120173
15125	NC_012583	CG	3	6	963964	963969	0 %	0 %	50 %	50 %	227120173
15126	NC_012583	ATCC	2	8	963971	963978	25 %	25 %	0 %	50 %	227120173
15127	NC_012583	CAT	2	6	963988	963993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120173
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15138	NC_012583	ATC	2	6	964928	964933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120173
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15142	NC_012583	CCTT	2	8	965108	965115	0 %	50 %	0 %	50 %	227120173
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15152	NC_012583	CCA	2	6	965768	965773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120174
15153	NC_012583	TTTG	2	8	965825	965832	0 %	75 %	25 %	0 %	227120174
15154	NC_012583	TCAT	2	8	965866	965873	25 %	50 %	0 %	25 %	227120174
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15239	NC_012583	GCCTT	2	10	970720	970729	0 %	40 %	20 %	40 %	227120178
15240	NC_012583	CTCA	2	8	970778	970785	25 %	25 %	0 %	50 %	227120178
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15362	NC_012583	TGC	2	6	978448	978453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120182
15363	NC_012583	CCA	2	6	978454	978459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120182
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15366	NC_012583	GGCT	2	8	978529	978536	0 %	25 %	50 %	25 %	227120182
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15381	NC_012583	TC	3	6	979326	979331	0 %	50 %	0 %	50 %	227120182
15382	NC_012583	AACC	2	8	979580	979587	50 %	0 %	0 %	50 %	227120183
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15468	NC_012583	CAC	2	6	984777	984782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120186
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15470	NC_012583	CAC	2	6	984837	984842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120186
15471	NC_012583	CTT	2	6	984935	984940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120186
15472	NC_012583	TGC	2	6	984941	984946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120186
15473	NC_012583	GCA	2	6	984953	984958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120186
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15475	NC_012583	GA	3	6	985033	985038	50 %	0 %	50 %	0 %	227120186
15476	NC_012583	TGC	2	6	985046	985051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120186
15477	NC_012583	AACTC	2	10	985121	985130	40 %	20 %	0 %	40 %	227120186
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15479	NC_012583	ACG	3	9	985420	985428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120187
15480	NC_012583	ACC	2	6	985434	985439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120187
15481	NC_012583	AAAG	2	8	985479	985486	75 %	0 %	25 %	0 %	227120187
15482	NC_012583	CAT	2	6	985514	985519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120187
15483	NC_012583	GCAGC	2	10	985586	985595	20 %	0 %	40 %	40 %	227120187
15484	NC_012583	A	6	6	985612	985617	100 %	0 %	0 %	0 %	227120187
15485	NC_012583	CAA	2	6	985674	985679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120187
15486	NC_012583	A	7	7	985691	985697	100 %	0 %	0 %	0 %	227120187
15487	NC_012583	CGC	2	6	985738	985743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120187
15488	NC_012583	TGCAAG	2	12	985753	985764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227120187
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15490	NC_012583	TGA	2	6	985826	985831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120187
15491	NC_012583	GC	3	6	985867	985872	0 %	0 %	50 %	50 %	227120187
15492	NC_012583	TTG	2	6	985941	985946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120187
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15500	NC_012583	GAT	2	6	986172	986177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120188

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