MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012583	GTTT	2	8	859076	859083	0 %	75 %	25 %	0 %	227120064
13502	NC_012583	CAT	2	6	859272	859277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120065
13503	NC_012583	GTT	2	6	859301	859306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120065
13504	NC_012583	AC	3	6	859331	859336	50 %	0 %	0 %	50 %	227120065
13505	NC_012583	TGA	2	6	859359	859364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120065
13506	NC_012583	GGC	2	6	859402	859407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120065
13507	NC_012583	TCA	2	6	859433	859438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120065
13508	NC_012583	CCA	2	6	859917	859922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120066
13509	NC_012583	GCA	2	6	859923	859928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120066
13510	NC_012583	TCT	2	6	860047	860052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120067
13511	NC_012583	TTC	2	6	860068	860073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120067
13512	NC_012583	GCA	2	6	860080	860085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120067
13513	NC_012583	CCG	2	6	860113	860118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120067
13514	NC_012583	A	8	8	860147	860154	100 %	0 %	0 %	0 %	227120067
13515	NC_012583	AAG	2	6	860160	860165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120067
13516	NC_012583	CT	3	6	860172	860177	0 %	50 %	0 %	50 %	227120067
13517	NC_012583	GATC	2	8	860195	860202	25 %	25 %	25 %	25 %	227120067
13518	NC_012583	ATT	2	6	860217	860222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120067
13519	NC_012583	AAT	2	6	860229	860234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120067
13520	NC_012583	CCATCA	2	12	860326	860337	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	227120067
13521	NC_012583	CCGCG	2	10	860438	860447	0 %	0 %	40 %	60 %	227120067
13522	NC_012583	CAC	2	6	860460	860465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120067
13523	NC_012583	GGC	2	6	860472	860477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120067
13524	NC_012583	TGG	2	6	860593	860598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120067
13525	NC_012583	A	6	6	860616	860621	100 %	0 %	0 %	0 %	227120067
13526	NC_012583	TTG	2	6	860628	860633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120067
13527	NC_012583	TTGTC	2	10	860780	860789	0 %	60 %	20 %	20 %	227120067
13528	NC_012583	CA	3	6	860795	860800	50 %	0 %	0 %	50 %	227120067
13529	NC_012583	TCG	2	6	860824	860829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120067
13530	NC_012583	T	6	6	861221	861226	0 %	100 %	0 %	0 %	227120068
13531	NC_012583	GAA	2	6	861230	861235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120068
13532	NC_012583	A	6	6	861298	861303	100 %	0 %	0 %	0 %	227120068
13533	NC_012583	TCGAT	2	10	861309	861318	20 %	40 %	20 %	20 %	227120068
13534	NC_012583	GAA	2	6	861433	861438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120068
13535	NC_012583	ACG	2	6	861511	861516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120068
13536	NC_012583	CCT	2	6	861660	861665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227120068
13537	NC_012583	A	6	6	861706	861711	100 %	0 %	0 %	0 %	227120068
13538	NC_012583	CGG	2	6	861871	861876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120068
13539	NC_012583	TCT	2	6	861936	861941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120068
13540	NC_012583	AAAC	2	8	862006	862013	75 %	0 %	0 %	25 %	227120068
13541	NC_012583	AGC	2	6	862015	862020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120068
13542	NC_012583	GAT	2	6	862065	862070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120068
13543	NC_012583	AGC	2	6	862257	862262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120068
13544	NC_012583	CAC	2	6	862314	862319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120068
13545	NC_012583	A	7	7	862322	862328	100 %	0 %	0 %	0 %	227120068
13546	NC_012583	A	6	6	862353	862358	100 %	0 %	0 %	0 %	227120068
13547	NC_012583	CAG	2	6	862523	862528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120068
13548	NC_012583	CAT	2	6	862545	862550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120068
13549	NC_012583	TGA	2	6	862577	862582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120068
13550	NC_012583	TGAT	2	8	862788	862795	25 %	50 %	25 %	0 %	227120069
13551	NC_012583	GTT	2	6	862796	862801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120069
13552	NC_012583	GAC	2	6	862987	862992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120069
13553	NC_012583	TCG	2	6	863088	863093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120069
13554	NC_012583	T	6	6	863096	863101	0 %	100 %	0 %	0 %	227120069
13555	NC_012583	TTC	2	6	863126	863131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120069
13556	NC_012583	TGGT	2	8	863134	863141	0 %	50 %	50 %	0 %	227120069
13557	NC_012583	TCA	2	6	863169	863174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120069
13558	NC_012583	TAG	2	6	863181	863186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120069
13559	NC_012583	TTA	2	6	863398	863403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120069
13560	NC_012583	GC	3	6	863432	863437	0 %	0 %	50 %	50 %	227120069
13561	NC_012583	CGC	2	6	863452	863457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120069
13562	NC_012583	AAAGT	2	10	863534	863543	60 %	20 %	20 %	0 %	227120069
13563	NC_012583	CAG	2	6	863583	863588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120069
13564	NC_012583	AGAA	2	8	863616	863623	75 %	0 %	25 %	0 %	227120069
13565	NC_012583	CGTT	2	8	863678	863685	0 %	50 %	25 %	25 %	227120069
13566	NC_012583	TGA	2	6	863686	863691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120069
13567	NC_012583	CTA	2	6	863729	863734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120069
13568	NC_012583	TGG	2	6	863751	863756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120069
13569	NC_012583	ACT	2	6	863764	863769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120069
13570	NC_012583	AGCA	2	8	863904	863911	50 %	0 %	25 %	25 %	227120069
13571	NC_012583	GAT	2	6	863915	863920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120069
13572	NC_012583	TG	3	6	863932	863937	0 %	50 %	50 %	0 %	227120069
13573	NC_012583	CAT	2	6	863959	863964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120069
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13576	NC_012583	GTC	2	6	864126	864131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120069
13577	NC_012583	TCGC	2	8	864206	864213	0 %	25 %	25 %	50 %	227120069
13578	NC_012583	CAT	2	6	864214	864219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120069
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13591	NC_012583	GAAT	2	8	865050	865057	50 %	25 %	25 %	0 %	227120070
13592	NC_012583	GTC	2	6	865115	865120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120070
13593	NC_012583	CAA	2	6	865124	865129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120070
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13599	NC_012583	AT	3	6	865483	865488	50 %	50 %	0 %	0 %	227120070
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13602	NC_012583	GAA	2	6	866340	866345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120071
13603	NC_012583	A	8	8	866365	866372	100 %	0 %	0 %	0 %	227120071
13604	NC_012583	A	6	6	866374	866379	100 %	0 %	0 %	0 %	227120071
13605	NC_012583	TGTC	2	8	866450	866457	0 %	50 %	25 %	25 %	227120071
13606	NC_012583	A	6	6	866480	866485	100 %	0 %	0 %	0 %	227120071
13607	NC_012583	T	6	6	866521	866526	0 %	100 %	0 %	0 %	227120071
13608	NC_012583	T	6	6	866765	866770	0 %	100 %	0 %	0 %	227120072
13609	NC_012583	TCT	2	6	866786	866791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120072
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13615	NC_012583	CAT	2	6	867145	867150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120072
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13618	NC_012583	TGC	2	6	867275	867280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120072
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13981	NC_012583	TGGG	2	8	891796	891803	0 %	25 %	75 %	0 %	227120095
13982	NC_012583	AAGATG	2	12	892007	892018	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227120095
13983	NC_012583	GTTG	2	8	892026	892033	0 %	50 %	50 %	0 %	227120095
13984	NC_012583	AGA	2	6	892034	892039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120095
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13994	NC_012583	CTG	2	6	892600	892605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120095
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