MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012583	CTG	2	6	830682	830687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13002	NC_012583	CT	3	6	830764	830769	0 %	50 %	0 %	50 %	227120046
13003	NC_012583	GATT	2	8	830831	830838	25 %	50 %	25 %	0 %	227120046
13004	NC_012583	CTGC	2	8	830974	830981	0 %	25 %	25 %	50 %	227120046
13005	NC_012583	TCA	2	6	831029	831034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13006	NC_012583	CAT	2	6	831035	831040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13007	NC_012583	GT	3	6	831043	831048	0 %	50 %	50 %	0 %	227120046
13008	NC_012583	CAGT	2	8	831083	831090	25 %	25 %	25 %	25 %	227120046
13009	NC_012583	TCA	2	6	831106	831111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13010	NC_012583	ATCA	2	8	831168	831175	50 %	25 %	0 %	25 %	227120046
13011	NC_012583	GC	3	6	831182	831187	0 %	0 %	50 %	50 %	227120046
13012	NC_012583	GCA	2	6	831322	831327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13013	NC_012583	GCT	2	6	831393	831398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13014	NC_012583	GAT	2	6	831411	831416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120046
13015	NC_012583	CGC	2	6	831422	831427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120046
13016	NC_012583	TCT	2	6	831523	831528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120046
13017	NC_012583	CCG	2	6	831575	831580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120046
13018	NC_012583	GTTG	2	8	831689	831696	0 %	50 %	50 %	0 %	227120046
13019	NC_012583	GCT	2	6	831728	831733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13020	NC_012583	CGC	2	6	831758	831763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120046
13021	NC_012583	CAT	2	6	831977	831982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13022	NC_012583	TG	3	6	832017	832022	0 %	50 %	50 %	0 %	227120046
13023	NC_012583	CGC	3	9	832169	832177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120046
13024	NC_012583	CAC	2	6	832188	832193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
13025	NC_012583	TCGG	2	8	832225	832232	0 %	25 %	50 %	25 %	227120046
13026	NC_012583	CAT	2	6	832271	832276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13027	NC_012583	CCA	2	6	832385	832390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
13028	NC_012583	GCT	3	9	832440	832448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13029	NC_012583	TCA	2	6	832474	832479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13030	NC_012583	TGAG	2	8	832603	832610	25 %	25 %	50 %	0 %	227120046
13031	NC_012583	CTT	2	6	832700	832705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120046
13032	NC_012583	GCCAA	2	10	832735	832744	40 %	0 %	20 %	40 %	227120046
13033	NC_012583	TCGG	2	8	832816	832823	0 %	25 %	50 %	25 %	227120046
13034	NC_012583	CTG	3	9	832909	832917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13035	NC_012583	GA	3	6	832934	832939	50 %	0 %	50 %	0 %	227120046
13036	NC_012583	TCA	2	6	832972	832977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13037	NC_012583	GTC	2	6	832993	832998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13038	NC_012583	CG	3	6	833036	833041	0 %	0 %	50 %	50 %	227120046
13039	NC_012583	CAA	2	6	833120	833125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120046
13040	NC_012583	CCA	2	6	833140	833145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
13041	NC_012583	CAG	2	6	833156	833161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13042	NC_012583	TCGC	2	8	833167	833174	0 %	25 %	25 %	50 %	227120046
13043	NC_012583	TCG	2	6	833194	833199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13044	NC_012583	TCT	2	6	833272	833277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120046
13045	NC_012583	ATC	2	6	833292	833297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13046	NC_012583	TTA	2	6	833335	833340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120046
13047	NC_012583	TCACT	2	10	833399	833408	20 %	40 %	0 %	40 %	227120046
13048	NC_012583	GTT	2	6	833469	833474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120046
13049	NC_012583	TTA	2	6	833485	833490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120046
13050	NC_012583	TGT	2	6	833492	833497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120046
13051	NC_012583	GTT	2	6	833565	833570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120046
13052	NC_012583	CAG	2	6	833586	833591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13053	NC_012583	ACC	2	6	833629	833634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
13054	NC_012583	CTGC	2	8	833665	833672	0 %	25 %	25 %	50 %	227120046
13055	NC_012583	CAT	2	6	833732	833737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13056	NC_012583	AATC	2	8	833747	833754	50 %	25 %	0 %	25 %	227120046
13057	NC_012583	CGC	2	6	834000	834005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120046
13058	NC_012583	ATT	2	6	834090	834095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120046
13059	NC_012583	CAT	2	6	834317	834322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13060	NC_012583	GAT	2	6	834367	834372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120046
13061	NC_012583	ATG	2	6	834583	834588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120046
13062	NC_012583	TCAC	2	8	834616	834623	25 %	25 %	0 %	50 %	227120046
13063	NC_012583	CAT	2	6	834650	834655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13064	NC_012583	TGC	2	6	834740	834745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13065	NC_012583	ATA	2	6	834888	834893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120046
13066	NC_012583	ACGA	2	8	834987	834994	50 %	0 %	25 %	25 %	227120046
13067	NC_012583	TCACT	2	10	835040	835049	20 %	40 %	0 %	40 %	227120046
13068	NC_012583	ATCA	2	8	835167	835174	50 %	25 %	0 %	25 %	227120046
13069	NC_012583	TGG	2	6	835223	835228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120046
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13071	NC_012583	AGTA	2	8	835328	835335	50 %	25 %	25 %	0 %	227120046
13072	NC_012583	TTGG	2	8	835351	835358	0 %	50 %	50 %	0 %	227120046
13073	NC_012583	TGT	2	6	835445	835450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120046
13074	NC_012583	CAT	2	6	835502	835507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13075	NC_012583	CTG	2	6	835519	835524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13076	NC_012583	CACT	2	8	835619	835626	25 %	25 %	0 %	50 %	227120046
13077	NC_012583	AGT	2	6	835655	835660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120046
13078	NC_012583	TTG	2	6	835716	835721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120046
13079	NC_012583	GGCA	2	8	835731	835738	25 %	0 %	50 %	25 %	227120046
13080	NC_012583	ATA	2	6	835800	835805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120046
13081	NC_012583	CAT	2	6	835871	835876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
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13083	NC_012583	CTG	2	6	836013	836018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13084	NC_012583	CCGTT	2	10	836165	836174	0 %	40 %	20 %	40 %	227120046
13085	NC_012583	CCA	2	6	836225	836230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
13086	NC_012583	CGA	2	6	836403	836408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13087	NC_012583	CAT	2	6	836459	836464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13088	NC_012583	CGA	2	6	836465	836470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13089	NC_012583	GAT	2	6	836561	836566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120046
13090	NC_012583	TAAAG	2	10	836580	836589	60 %	20 %	20 %	0 %	227120046
13091	NC_012583	CAC	2	6	836628	836633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
13092	NC_012583	ACT	2	6	836670	836675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13093	NC_012583	GC	3	6	836693	836698	0 %	0 %	50 %	50 %	227120046
13094	NC_012583	GGT	2	6	836790	836795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120046
13095	NC_012583	GGT	2	6	836814	836819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120046
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13097	NC_012583	ATC	2	6	836853	836858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13098	NC_012583	TGGT	2	8	836895	836902	0 %	50 %	50 %	0 %	227120046
13099	NC_012583	GCA	2	6	836921	836926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13100	NC_012583	GCC	2	6	837016	837021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120046
13101	NC_012583	CAT	2	6	837113	837118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13102	NC_012583	CGCCA	2	10	837141	837150	20 %	0 %	20 %	60 %	227120046
13103	NC_012583	GCT	2	6	837180	837185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13104	NC_012583	GTAC	2	8	837296	837303	25 %	25 %	25 %	25 %	227120046
13105	NC_012583	GTC	2	6	837333	837338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13106	NC_012583	CAT	2	6	837545	837550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
13107	NC_012583	CGCCA	2	10	837573	837582	20 %	0 %	20 %	60 %	227120046
13108	NC_012583	GCT	2	6	837612	837617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13109	NC_012583	TCACTG	2	12	837773	837784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227120046
13110	NC_012583	TGCT	2	8	837794	837801	0 %	50 %	25 %	25 %	227120046
13111	NC_012583	CAA	2	6	837843	837848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120046
13112	NC_012583	AGC	2	6	837916	837921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120046
13113	NC_012583	ACC	2	6	838008	838013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
13114	NC_012583	ACACC	2	10	838061	838070	40 %	0 %	0 %	60 %	227120046
13115	NC_012583	GTA	2	6	838087	838092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120046
13116	NC_012583	CCA	2	6	838106	838111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
13117	NC_012583	CCA	2	6	838120	838125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
13118	NC_012583	GTTT	2	8	838147	838154	0 %	75 %	25 %	0 %	227120046
13119	NC_012583	GCT	2	6	838166	838171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
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13229	NC_012583	GATC	2	8	843910	843917	25 %	25 %	25 %	25 %	227120050
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13270	NC_012583	TCT	2	6	846198	846203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120053
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13348	NC_012583	CTCA	2	8	851116	851123	25 %	25 %	0 %	50 %	227120059
13349	NC_012583	TCAACC	2	12	851130	851141	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	227120059
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13478	NC_012583	TCAA	2	8	858091	858098	50 %	25 %	0 %	25 %	227120063
13479	NC_012583	A	7	7	858136	858142	100 %	0 %	0 %	0 %	227120063
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