MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_012583	GAT	2	6	643152	643157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119866
10003	NC_012583	GTCG	2	8	643281	643288	0 %	25 %	50 %	25 %	227119866
10004	NC_012583	CTGCG	2	10	643451	643460	0 %	20 %	40 %	40 %	227119866
10005	NC_012583	TGC	2	6	643465	643470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119866
10006	NC_012583	TGGT	2	8	643617	643624	0 %	50 %	50 %	0 %	227119866
10007	NC_012583	TCA	2	6	643688	643693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119866
10008	NC_012583	TGC	2	6	643695	643700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119866
10009	NC_012583	CG	3	6	643717	643722	0 %	0 %	50 %	50 %	227119866
10010	NC_012583	CCG	2	6	643765	643770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119866
10011	NC_012583	TGA	2	6	643787	643792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119866
10012	NC_012583	TCT	2	6	643846	643851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119866
10013	NC_012583	CAG	2	6	643904	643909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119866
10014	NC_012583	ACC	2	6	643911	643916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119866
10015	NC_012583	GCA	2	6	643928	643933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119866
10016	NC_012583	CGATG	2	10	643974	643983	20 %	20 %	40 %	20 %	227119866
10017	NC_012583	CAG	2	6	644075	644080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119866
10018	NC_012583	GCG	2	6	644107	644112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119866
10019	NC_012583	CTT	2	6	644132	644137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119866
10020	NC_012583	CCCAA	2	10	644207	644216	40 %	0 %	0 %	60 %	227119866
10021	NC_012583	CG	3	6	644224	644229	0 %	0 %	50 %	50 %	227119866
10022	NC_012583	TTTG	2	8	644283	644290	0 %	75 %	25 %	0 %	227119866
10023	NC_012583	GAT	2	6	644304	644309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119866
10024	NC_012583	GTC	2	6	644445	644450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119866
10025	NC_012583	GCCAAG	2	12	644517	644528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119866
10026	NC_012583	AAC	2	6	644573	644578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119866
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10028	NC_012583	TTG	2	6	644629	644634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119866
10029	NC_012583	GCC	2	6	644641	644646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119866
10030	NC_012583	AGC	2	6	644821	644826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119866
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10032	NC_012583	AGG	2	6	645062	645067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119866
10033	NC_012583	CAA	2	6	645084	645089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119866
10034	NC_012583	ATC	2	6	645154	645159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119867
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10036	NC_012583	TAC	2	6	645426	645431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119867
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10039	NC_012583	CTT	2	6	645518	645523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119867
10040	NC_012583	ATG	2	6	645541	645546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119867
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10042	NC_012583	CACG	2	8	645589	645596	25 %	0 %	25 %	50 %	227119867
10043	NC_012583	CAG	2	6	645615	645620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119867
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10047	NC_012583	AAGA	2	8	645782	645789	75 %	0 %	25 %	0 %	227119867
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10052	NC_012583	GC	3	6	646597	646602	0 %	0 %	50 %	50 %	227119868
10053	NC_012583	CTG	2	6	646708	646713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119869
10054	NC_012583	TTA	2	6	646731	646736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119869
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10056	NC_012583	CAAG	2	8	646809	646816	50 %	0 %	25 %	25 %	227119869
10057	NC_012583	TGA	2	6	646821	646826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119869
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10060	NC_012583	TTGA	2	8	646888	646895	25 %	50 %	25 %	0 %	227119869
10061	NC_012583	GCGCC	2	10	646908	646917	0 %	0 %	40 %	60 %	227119869
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10064	NC_012583	CAA	2	6	646957	646962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119869
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10120	NC_012583	TCG	2	6	650584	650589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119873
10121	NC_012583	ATC	2	6	650656	650661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119873
10122	NC_012583	GC	3	6	650682	650687	0 %	0 %	50 %	50 %	227119873
10123	NC_012583	CAC	2	6	650700	650705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119873
10124	NC_012583	TCA	2	6	650722	650727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119873
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10126	NC_012583	GGC	2	6	650875	650880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119873
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10235	NC_012583	GAC	2	6	658165	658170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119883
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10482	NC_012583	ATTG	2	8	671614	671621	25 %	50 %	25 %	0 %	227119896
10483	NC_012583	AGA	3	9	671773	671781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119896
10484	NC_012583	TGG	2	6	671950	671955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119896
10485	NC_012583	CAG	2	6	672193	672198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119897
10486	NC_012583	CG	3	6	672223	672228	0 %	0 %	50 %	50 %	227119897
10487	NC_012583	CTC	2	6	672256	672261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119897
10488	NC_012583	ATT	2	6	672281	672286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119897
10489	NC_012583	GGT	2	6	672295	672300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119897
10490	NC_012583	AAG	2	6	672350	672355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119897
10491	NC_012583	AAG	2	6	672431	672436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119897
10492	NC_012583	TTATTG	2	12	672459	672470	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	227119897
10493	NC_012583	ACCT	2	8	672628	672635	25 %	25 %	0 %	50 %	227119897
10494	NC_012583	CGT	2	6	672858	672863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119898
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10497	NC_012583	CGG	2	6	673112	673117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119898
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10499	NC_012583	ATG	2	6	673262	673267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119898
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