MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012583	TTG	2	6	338765	338770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119501
5502	NC_012583	ACCAGA	15	90	338802	338891	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227119501
5503	NC_012583	AG	3	6	338957	338962	50 %	0 %	50 %	0 %	227119501
5504	NC_012583	GAA	2	6	338970	338975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119501
5505	NC_012583	ATG	2	6	339579	339584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119502
5506	NC_012583	CAA	2	6	339594	339599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119502
5507	NC_012583	GGT	2	6	339764	339769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119502
5508	NC_012583	TGG	2	6	339781	339786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119502
5509	NC_012583	TCA	2	6	339803	339808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119502
5510	NC_012583	TGA	2	6	339937	339942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119502
5511	NC_012583	TGA	2	6	339957	339962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119502
5512	NC_012583	A	6	6	340013	340018	100 %	0 %	0 %	0 %	227119502
5513	NC_012583	CAAA	2	8	340032	340039	75 %	0 %	0 %	25 %	227119502
5514	NC_012583	A	6	6	340042	340047	100 %	0 %	0 %	0 %	227119502
5515	NC_012583	TGAC	2	8	340070	340077	25 %	25 %	25 %	25 %	227119503
5516	NC_012583	ATC	2	6	340083	340088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119503
5517	NC_012583	TTTC	2	8	340123	340130	0 %	75 %	0 %	25 %	227119503
5518	NC_012583	T	6	6	340143	340148	0 %	100 %	0 %	0 %	227119503
5519	NC_012583	GTA	2	6	340156	340161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119503
5520	NC_012583	TAAAAA	2	12	340217	340228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	227119503
5521	NC_012583	TAT	2	6	340303	340308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119503
5522	NC_012583	AAG	2	6	340430	340435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119503
5523	NC_012583	AGG	2	6	340454	340459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119503
5524	NC_012583	TAA	2	6	340536	340541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119503
5525	NC_012583	CCT	2	6	340639	340644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119503
5526	NC_012583	GTT	2	6	340645	340650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119503
5527	NC_012583	CAA	2	6	340716	340721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119503
5528	NC_012583	A	7	7	340745	340751	100 %	0 %	0 %	0 %	227119504
5529	NC_012583	ATT	2	6	340853	340858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119504
5530	NC_012583	CTAT	2	8	340923	340930	25 %	50 %	0 %	25 %	227119504
5531	NC_012583	ATA	2	6	340959	340964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119504
5532	NC_012583	AC	3	6	340998	341003	50 %	0 %	0 %	50 %	227119504
5533	NC_012583	GCTA	2	8	341030	341037	25 %	25 %	25 %	25 %	227119504
5534	NC_012583	GAA	2	6	341045	341050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119504
5535	NC_012583	TAT	2	6	341366	341371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119505
5536	NC_012583	GC	3	6	341487	341492	0 %	0 %	50 %	50 %	227119505
5537	NC_012583	ATC	2	6	341535	341540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119505
5538	NC_012583	GC	3	6	341587	341592	0 %	0 %	50 %	50 %	227119505
5539	NC_012583	CTTG	2	8	341594	341601	0 %	50 %	25 %	25 %	227119505
5540	NC_012583	TAC	2	6	341670	341675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119505
5541	NC_012583	TC	5	10	341694	341703	0 %	50 %	0 %	50 %	227119505
5542	NC_012583	AAG	2	6	341704	341709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119505
5543	NC_012583	AAAG	2	8	341771	341778	75 %	0 %	25 %	0 %	227119505
5544	NC_012583	GC	3	6	341793	341798	0 %	0 %	50 %	50 %	227119505
5545	NC_012583	TGA	2	6	341843	341848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119505
5546	NC_012583	TGA	2	6	341861	341866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119505
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5548	NC_012583	CA	3	6	341926	341931	50 %	0 %	0 %	50 %	227119505
5549	NC_012583	TGC	2	6	342004	342009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119505
5550	NC_012583	GAA	2	6	342072	342077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119505
5551	NC_012583	GCA	2	6	342131	342136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119505
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5553	NC_012583	AAG	2	6	342235	342240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119505
5554	NC_012583	TGA	2	6	342253	342258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119505
5555	NC_012583	TCA	2	6	342324	342329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119505
5556	NC_012583	TGCGTG	2	12	342484	342495	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	227119505
5557	NC_012583	TCT	2	6	342520	342525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119505
5558	NC_012583	CAA	2	6	342543	342548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119505
5559	NC_012583	GTG	2	6	342612	342617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119505
5560	NC_012583	CGTG	2	8	342789	342796	0 %	25 %	50 %	25 %	227119505
5561	NC_012583	TGA	2	6	342886	342891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119505
5562	NC_012583	GAA	2	6	342942	342947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119505
5563	NC_012583	TTC	2	6	342957	342962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119505
5564	NC_012583	TTGG	2	8	342968	342975	0 %	50 %	50 %	0 %	227119505
5565	NC_012583	TGT	3	9	342989	342997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119505
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5567	NC_012583	GTAC	2	8	343185	343192	25 %	25 %	25 %	25 %	227119505
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5569	NC_012583	TAAATT	2	12	343214	343225	50 %	50 %	0 %	0 %	227119505
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5587	NC_012583	TAC	2	6	344253	344258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119508
5588	NC_012583	TTA	2	6	344299	344304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119508
5589	NC_012583	TCA	2	6	344419	344424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119508
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5600	NC_012583	CTTTT	2	10	344955	344964	0 %	80 %	0 %	20 %	227119509
5601	NC_012583	CCG	2	6	344986	344991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119509
5602	NC_012583	T	7	7	344995	345001	0 %	100 %	0 %	0 %	227119509
5603	NC_012583	C	6	6	345097	345102	0 %	0 %	0 %	100 %	227119509
5604	NC_012583	ATCTC	2	10	345250	345259	20 %	40 %	0 %	40 %	227119509
5605	NC_012583	TGAG	2	8	345356	345363	25 %	25 %	50 %	0 %	227119509
5606	NC_012583	TTC	2	6	345426	345431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119509
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5609	NC_012583	ATG	2	6	345842	345847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119510
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