MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_012583	GGC	2	6	307253	307258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119472
5003	NC_012583	GCT	2	6	307358	307363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119472
5004	NC_012583	GCC	2	6	307385	307390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119472
5005	NC_012583	GGC	2	6	307436	307441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119472
5006	NC_012583	CAAG	2	8	307445	307452	50 %	0 %	25 %	25 %	227119472
5007	NC_012583	ATG	2	6	307465	307470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119472
5008	NC_012583	AGCT	2	8	307491	307498	25 %	25 %	25 %	25 %	227119472
5009	NC_012583	GCG	2	6	307671	307676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119473
5010	NC_012583	TCC	2	6	307687	307692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119473
5011	NC_012583	GC	3	6	307710	307715	0 %	0 %	50 %	50 %	227119473
5012	NC_012583	TTG	2	6	307756	307761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119473
5013	NC_012583	CCAG	2	8	307779	307786	25 %	0 %	25 %	50 %	227119473
5014	NC_012583	TTG	2	6	307840	307845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119473
5015	NC_012583	GCT	2	6	307857	307862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119473
5016	NC_012583	GGC	2	6	307874	307879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119473
5017	NC_012583	TG	3	6	308106	308111	0 %	50 %	50 %	0 %	227119474
5018	NC_012583	TCC	2	6	308125	308130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119474
5019	NC_012583	GC	3	6	308148	308153	0 %	0 %	50 %	50 %	227119474
5020	NC_012583	TTG	2	6	308194	308199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119474
5021	NC_012583	CCAG	2	8	308217	308224	25 %	0 %	25 %	50 %	227119474
5022	NC_012583	TTG	2	6	308278	308283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119474
5023	NC_012583	GCT	2	6	308295	308300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119474
5024	NC_012583	CG	3	6	308306	308311	0 %	0 %	50 %	50 %	227119474
5025	NC_012583	CACG	2	8	308382	308389	25 %	0 %	25 %	50 %	227119474
5026	NC_012583	GTG	2	6	308428	308433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119474
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5028	NC_012583	ATA	2	6	308578	308583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119474
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5030	NC_012583	TGC	2	6	308769	308774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119474
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5032	NC_012583	GCT	2	6	309249	309254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119474
5033	NC_012583	T	6	6	309340	309345	0 %	100 %	0 %	0 %	227119474
5034	NC_012583	T	7	7	309373	309379	0 %	100 %	0 %	0 %	227119474
5035	NC_012583	CCA	2	6	309459	309464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119474
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5037	NC_012583	T	6	6	309522	309527	0 %	100 %	0 %	0 %	227119474
5038	NC_012583	CGC	2	6	309577	309582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119474
5039	NC_012583	TGC	2	6	309710	309715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119474
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5041	NC_012583	TGA	2	6	309762	309767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119474
5042	NC_012583	CTG	2	6	309778	309783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119474
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5044	NC_012583	TGT	2	6	310097	310102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119474
5045	NC_012583	CTTG	2	8	310155	310162	0 %	50 %	25 %	25 %	227119474
5046	NC_012583	GAT	2	6	310165	310170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119474
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5048	NC_012583	GC	3	6	310236	310241	0 %	0 %	50 %	50 %	227119474
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5051	NC_012583	TGGG	2	8	310480	310487	0 %	25 %	75 %	0 %	227119475
5052	NC_012583	GCA	2	6	310522	310527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119475
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5054	NC_012583	CAG	2	6	310661	310666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119475
5055	NC_012583	GCT	2	6	310675	310680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119475
5056	NC_012583	GA	3	6	310719	310724	50 %	0 %	50 %	0 %	227119475
5057	NC_012583	CTG	2	6	310768	310773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119475
5058	NC_012583	GGCT	2	8	310818	310825	0 %	25 %	50 %	25 %	227119475
5059	NC_012583	GT	3	6	311011	311016	0 %	50 %	50 %	0 %	227119475
5060	NC_012583	GTG	2	6	311085	311090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119475
5061	NC_012583	TGGG	2	8	311103	311110	0 %	25 %	75 %	0 %	227119475
5062	NC_012583	GGC	2	6	311115	311120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119475
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5069	NC_012583	GCAT	2	8	311767	311774	25 %	25 %	25 %	25 %	227119476
5070	NC_012583	GAC	2	6	311882	311887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119477
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5089	NC_012583	GCT	2	6	312702	312707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119477
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5101	NC_012583	CAGG	2	8	313214	313221	25 %	0 %	50 %	25 %	227119477
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5106	NC_012583	TGC	2	6	314061	314066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119478
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5117	NC_012583	CAT	2	6	314498	314503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119479
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5122	NC_012583	AC	3	6	314855	314860	50 %	0 %	0 %	50 %	227119480
5123	NC_012583	GCG	2	6	314869	314874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119480
5124	NC_012583	ACA	2	6	314877	314882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119480
5125	NC_012583	TGG	2	6	314954	314959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119480
5126	NC_012583	CATC	2	8	314975	314982	25 %	25 %	0 %	50 %	227119480
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5148	NC_012583	TAAG	2	8	316612	316619	50 %	25 %	25 %	0 %	227119482
5149	NC_012583	GA	3	6	316639	316644	50 %	0 %	50 %	0 %	227119482
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5154	NC_012583	GTA	2	6	316915	316920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119482
5155	NC_012583	GA	3	6	316935	316940	50 %	0 %	50 %	0 %	227119482
5156	NC_012583	TCA	2	6	317184	317189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119483
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5165	NC_012583	A	6	6	317652	317657	100 %	0 %	0 %	0 %	227119484
5166	NC_012583	TAA	2	6	317745	317750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119484
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5172	NC_012583	ATCA	2	8	318033	318040	50 %	25 %	0 %	25 %	227119484
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5216	NC_012583	TGA	2	6	320536	320541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
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5222	NC_012583	ATCA	2	8	320825	320832	50 %	25 %	0 %	25 %	227119486
5223	NC_012583	TGC	2	6	320847	320852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119486
5224	NC_012583	TCG	2	6	320902	320907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119486
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5227	NC_012583	AGC	2	6	321023	321028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
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5229	NC_012583	GGT	2	6	321100	321105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119486
5230	NC_012583	TGAG	2	8	321123	321130	25 %	25 %	50 %	0 %	227119486
5231	NC_012583	GC	3	6	321134	321139	0 %	0 %	50 %	50 %	227119486
5232	NC_012583	AATCA	2	10	321162	321171	60 %	20 %	0 %	20 %	227119486
5233	NC_012583	GCA	2	6	321199	321204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
5234	NC_012583	AAT	2	6	321221	321226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119486
5235	NC_012583	CTT	2	6	321243	321248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119486
5236	NC_012583	CAAA	2	8	321303	321310	75 %	0 %	0 %	25 %	227119486
5237	NC_012583	CTG	2	6	321359	321364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119486
5238	NC_012583	GCG	2	6	321386	321391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119486
5239	NC_012583	GGT	2	6	321421	321426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119486
5240	NC_012583	GTGC	2	8	321437	321444	0 %	25 %	50 %	25 %	227119486
5241	NC_012583	CAC	2	6	321469	321474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119486
5242	NC_012583	CGT	2	6	321520	321525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119486
5243	NC_012583	AGC	2	6	321546	321551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
5244	NC_012583	ACG	2	6	321560	321565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
5245	NC_012583	ATG	2	6	321602	321607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
5246	NC_012583	TGA	2	6	321628	321633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
5247	NC_012583	CA	3	6	321640	321645	50 %	0 %	0 %	50 %	227119486
5248	NC_012583	GCG	3	9	321650	321658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119486
5249	NC_012583	AGC	2	6	321663	321668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
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5251	NC_012583	TAG	2	6	321804	321809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
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5253	NC_012583	T	7	7	321938	321944	0 %	100 %	0 %	0 %	227119487
5254	NC_012583	TCGT	2	8	321973	321980	0 %	50 %	25 %	25 %	227119487
5255	NC_012583	ATC	3	9	322029	322037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119487
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5259	NC_012583	GAT	2	6	322216	322221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119487
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5261	NC_012583	TGG	2	6	322281	322286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119487
5262	NC_012583	G	6	6	322349	322354	0 %	0 %	100 %	0 %	227119487
5263	NC_012583	ACT	2	6	322467	322472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119487
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5266	NC_012583	GCT	2	6	322587	322592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119487
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5333	NC_012583	TCT	2	6	328137	328142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119494
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5352	NC_012583	GAC	2	6	329215	329220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119494
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5358	NC_012583	GCGCG	2	10	329526	329535	0 %	0 %	60 %	40 %	227119494
5359	NC_012583	CAG	2	6	329594	329599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119494
5360	NC_012583	TGC	2	6	329646	329651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119494
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5486	NC_012583	ACG	2	6	337489	337494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119500
5487	NC_012583	TAA	2	6	337821	337826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119501
5488	NC_012583	AGA	2	6	337842	337847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119501
5489	NC_012583	CAT	2	6	337990	337995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119501
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