MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012583	AGC	2	6	278314	278319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119441
4502	NC_012583	GCA	2	6	278516	278521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119441
4503	NC_012583	TGG	2	6	278545	278550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119441
4504	NC_012583	GAT	2	6	278583	278588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119441
4505	NC_012583	CAG	2	6	278607	278612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119441
4506	NC_012583	TAT	2	6	278622	278627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119441
4507	NC_012583	AGC	2	6	278674	278679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119441
4508	NC_012583	CAG	2	6	278691	278696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119441
4509	NC_012583	AGC	2	6	278704	278709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119441
4510	NC_012583	GGC	2	6	278728	278733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119441
4511	NC_012583	TGATGG	2	12	278864	278875	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227119442
4512	NC_012583	CATC	2	8	278894	278901	25 %	25 %	0 %	50 %	227119442
4513	NC_012583	CAT	2	6	278915	278920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119442
4514	NC_012583	GT	3	6	279095	279100	0 %	50 %	50 %	0 %	227119442
4515	NC_012583	TGA	2	6	279118	279123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119442
4516	NC_012583	TATCGC	2	12	279125	279136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227119442
4517	NC_012583	CTGC	2	8	279172	279179	0 %	25 %	25 %	50 %	227119442
4518	NC_012583	ACT	2	6	279270	279275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119442
4519	NC_012583	AG	3	6	279294	279299	50 %	0 %	50 %	0 %	227119442
4520	NC_012583	GTG	2	6	279346	279351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119442
4521	NC_012583	AAC	2	6	279366	279371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119442
4522	NC_012583	GCG	2	6	279548	279553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119442
4523	NC_012583	GACCA	2	10	279622	279631	40 %	0 %	20 %	40 %	227119442
4524	NC_012583	AGCC	2	8	279661	279668	25 %	0 %	25 %	50 %	227119442
4525	NC_012583	GCA	2	6	279812	279817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119442
4526	NC_012583	AG	3	6	280020	280025	50 %	0 %	50 %	0 %	227119442
4527	NC_012583	ATC	2	6	280095	280100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119442
4528	NC_012583	TCG	2	6	280103	280108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119442
4529	NC_012583	CG	3	6	280147	280152	0 %	0 %	50 %	50 %	227119442
4530	NC_012583	TGGCT	2	10	280199	280208	0 %	40 %	40 %	20 %	227119442
4531	NC_012583	CTG	2	6	280211	280216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119442
4532	NC_012583	ATC	2	6	280251	280256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119442
4533	NC_012583	CG	3	6	280382	280387	0 %	0 %	50 %	50 %	227119442
4534	NC_012583	GCT	2	6	280415	280420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119442
4535	NC_012583	GCCC	2	8	280509	280516	0 %	0 %	25 %	75 %	227119442
4536	NC_012583	CA	3	6	280622	280627	50 %	0 %	0 %	50 %	227119442
4537	NC_012583	AC	3	6	280775	280780	50 %	0 %	0 %	50 %	227119442
4538	NC_012583	CTT	2	6	280790	280795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119442
4539	NC_012583	ATC	2	6	280816	280821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119442
4540	NC_012583	TTACCG	2	12	280855	280866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227119442
4541	NC_012583	CG	3	6	280919	280924	0 %	0 %	50 %	50 %	227119442
4542	NC_012583	TTG	2	6	280972	280977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119442
4543	NC_012583	TAA	2	6	280999	281004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119442
4544	NC_012583	T	6	6	281011	281016	0 %	100 %	0 %	0 %	227119442
4545	NC_012583	CTG	2	6	281033	281038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119442
4546	NC_012583	ATC	2	6	281214	281219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119442
4547	NC_012583	GCT	2	6	281351	281356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119442
4548	NC_012583	TCC	2	6	281410	281415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119442
4549	NC_012583	AATT	2	8	281493	281500	50 %	50 %	0 %	0 %	227119442
4550	NC_012583	CAC	2	6	281511	281516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119442
4551	NC_012583	CTG	2	6	281551	281556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119442
4552	NC_012583	A	6	6	281557	281562	100 %	0 %	0 %	0 %	227119442
4553	NC_012583	GGC	2	6	281571	281576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119442
4554	NC_012583	T	7	7	281588	281594	0 %	100 %	0 %	0 %	227119442
4555	NC_012583	TTA	3	9	281782	281790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119443
4556	NC_012583	TGC	2	6	281827	281832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119443
4557	NC_012583	TCAA	2	8	281866	281873	50 %	25 %	0 %	25 %	227119443
4558	NC_012583	ACTA	2	8	281877	281884	50 %	25 %	0 %	25 %	227119443
4559	NC_012583	TCA	2	6	281890	281895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119443
4560	NC_012583	ATA	2	6	281915	281920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119443
4561	NC_012583	GCTG	2	8	282563	282570	0 %	25 %	50 %	25 %	227119444
4562	NC_012583	GCA	2	6	282710	282715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119444
4563	NC_012583	CGTT	2	8	282810	282817	0 %	50 %	25 %	25 %	227119444
4564	NC_012583	ACG	2	6	282973	282978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119444
4565	NC_012583	CGT	2	6	283089	283094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119444
4566	NC_012583	TC	3	6	283119	283124	0 %	50 %	0 %	50 %	227119444
4567	NC_012583	CCG	2	6	283171	283176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119444
4568	NC_012583	ATC	2	6	283207	283212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119444
4569	NC_012583	GTCA	2	8	283295	283302	25 %	25 %	25 %	25 %	227119444
4570	NC_012583	TCAC	2	8	283470	283477	25 %	25 %	0 %	50 %	227119445
4571	NC_012583	GCC	2	6	283480	283485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119445
4572	NC_012583	CT	3	6	283652	283657	0 %	50 %	0 %	50 %	227119446
4573	NC_012583	GGAA	2	8	283709	283716	50 %	0 %	50 %	0 %	227119446
4574	NC_012583	ATT	2	6	283752	283757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119446
4575	NC_012583	TGC	2	6	283767	283772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119446
4576	NC_012583	ACC	2	6	283813	283818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119446
4577	NC_012583	GTT	2	6	283974	283979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119446
4578	NC_012583	TGATTG	2	12	284021	284032	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227119446
4579	NC_012583	ACG	2	6	284054	284059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119446
4580	NC_012583	TGC	2	6	284091	284096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119446
4581	NC_012583	CAG	2	6	284131	284136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119446
4582	NC_012583	CAT	2	6	284217	284222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119446
4583	NC_012583	CAAC	2	8	284229	284236	50 %	0 %	0 %	50 %	227119446
4584	NC_012583	GGC	2	6	284272	284277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119446
4585	NC_012583	GAC	2	6	284283	284288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119446
4586	NC_012583	AG	3	6	284361	284366	50 %	0 %	50 %	0 %	227119446
4587	NC_012583	TGATC	2	10	284376	284385	20 %	40 %	20 %	20 %	227119446
4588	NC_012583	TGG	2	6	284426	284431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119446
4589	NC_012583	GTG	2	6	284446	284451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119446
4590	NC_012583	CCA	2	6	284504	284509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119446
4591	NC_012583	GTT	2	6	284708	284713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119447
4592	NC_012583	TGTT	2	8	284730	284737	0 %	75 %	25 %	0 %	227119447
4593	NC_012583	TGA	2	6	284776	284781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119447
4594	NC_012583	CTG	2	6	284798	284803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119447
4595	NC_012583	ATT	2	6	284821	284826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119447
4596	NC_012583	GCA	2	6	284875	284880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119447
4597	NC_012583	TTCA	2	8	285035	285042	25 %	50 %	0 %	25 %	227119447
4598	NC_012583	CAT	2	6	285085	285090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119447
4599	NC_012583	ATG	2	6	285138	285143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119447
4600	NC_012583	CGC	2	6	285253	285258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119447
4601	NC_012583	ATC	2	6	285329	285334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119447
4602	NC_012583	CAT	2	6	285352	285357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119447
4603	NC_012583	GTT	2	6	285493	285498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119447
4604	NC_012583	TCA	2	6	285519	285524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119447
4605	NC_012583	ATC	2	6	285554	285559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119447
4606	NC_012583	GGT	2	6	285569	285574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119447
4607	NC_012583	CTG	3	9	285633	285641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119448
4608	NC_012583	CTG	2	6	285654	285659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119448
4609	NC_012583	GCG	2	6	285663	285668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119448
4610	NC_012583	T	6	6	285710	285715	0 %	100 %	0 %	0 %	227119448
4611	NC_012583	CGT	2	6	285720	285725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119448
4612	NC_012583	ATTGCG	2	12	285759	285770	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227119448
4613	NC_012583	GTC	2	6	285773	285778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119448
4614	NC_012583	TAT	2	6	285824	285829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119448
4615	NC_012583	GTG	2	6	285870	285875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119448
4616	NC_012583	GGC	2	6	285935	285940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119448
4617	NC_012583	GCT	2	6	285959	285964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119448
4618	NC_012583	T	6	6	286039	286044	0 %	100 %	0 %	0 %	227119448
4619	NC_012583	CTTT	2	8	286057	286064	0 %	75 %	0 %	25 %	227119448
4620	NC_012583	TAA	2	6	286124	286129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119448
4621	NC_012583	CTG	2	6	286164	286169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119448
4622	NC_012583	TGC	2	6	286183	286188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119448
4623	NC_012583	AGATAA	2	12	286226	286237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227119448
4624	NC_012583	GC	3	6	286294	286299	0 %	0 %	50 %	50 %	227119448
4625	NC_012583	GATTTC	2	12	286304	286315	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227119448
4626	NC_012583	T	6	6	286341	286346	0 %	100 %	0 %	0 %	227119448
4627	NC_012583	GCT	2	6	286349	286354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119448
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4640	NC_012583	GTG	2	6	286974	286979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119449
4641	NC_012583	CGA	2	6	287041	287046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119449
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4645	NC_012583	GTGAT	2	10	287226	287235	20 %	40 %	40 %	0 %	227119449
4646	NC_012583	GA	3	6	287410	287415	50 %	0 %	50 %	0 %	227119450
4647	NC_012583	T	6	6	287426	287431	0 %	100 %	0 %	0 %	227119450
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4653	NC_012583	ATC	2	6	288080	288085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119450
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4720	NC_012583	TTAC	2	8	292012	292019	25 %	50 %	0 %	25 %	227119454
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4732	NC_012583	TGA	2	6	292612	292617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119455
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4735	NC_012583	AGTG	2	8	292928	292935	25 %	25 %	50 %	0 %	227119456
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4737	NC_012583	TTG	2	6	293028	293033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119456
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4739	NC_012583	AG	3	6	293045	293050	50 %	0 %	50 %	0 %	227119456
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4864	NC_012583	TCA	2	6	299710	299715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119464
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4866	NC_012583	GC	3	6	299877	299882	0 %	0 %	50 %	50 %	227119464
4867	NC_012583	GGGCA	2	10	299886	299895	20 %	0 %	60 %	20 %	227119464
4868	NC_012583	GCT	2	6	299927	299932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119464
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4883	NC_012583	GAA	2	6	300859	300864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119465
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4984	NC_012583	CATT	2	8	306272	306279	25 %	50 %	0 %	25 %	227119469
4985	NC_012583	T	6	6	306313	306318	0 %	100 %	0 %	0 %	227119469
4986	NC_012583	GCG	3	9	306326	306334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119469
4987	NC_012583	TGC	2	6	306340	306345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119469
4988	NC_012583	GCT	2	6	306406	306411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119469
4989	NC_012583	TGC	2	6	306421	306426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119469
4990	NC_012583	AAC	2	6	306445	306450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119469
4991	NC_012583	GAT	2	6	306455	306460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119469
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4993	NC_012583	GT	3	6	306666	306671	0 %	50 %	50 %	0 %	227119470
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4997	NC_012583	CAC	2	6	306824	306829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119472
4998	NC_012583	CTG	2	6	306876	306881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119472
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