MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 50518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012582	CTT	2	6	611	616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116371
2	NC_012582	TCA	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116371
3	NC_012582	CCA	2	6	710	715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116371
4	NC_012582	CAAGC	2	10	869	878	40 %	0 %	20 %	40 %	227116371
5	NC_012582	AT	3	6	912	917	50 %	50 %	0 %	0 %	227116371
6	NC_012582	GAA	2	6	964	969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116371
7	NC_012582	TCC	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116372
8	NC_012582	TGG	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116372
9	NC_012582	TGCTTT	2	12	1056	1067	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227116372
10	NC_012582	GC	3	6	1109	1114	0 %	0 %	50 %	50 %	227116372
11	NC_012582	AATC	2	8	1129	1136	50 %	25 %	0 %	25 %	227116372
12	NC_012582	TCT	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116372
13	NC_012582	TTC	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116372
14	NC_012582	TTC	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116372
15	NC_012582	TTG	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116372
16	NC_012582	TGGC	2	8	1387	1394	0 %	25 %	50 %	25 %	227116372
17	NC_012582	GC	3	6	1482	1487	0 %	0 %	50 %	50 %	227116372
18	NC_012582	AGAT	2	8	1641	1648	50 %	25 %	25 %	0 %	227116372
19	NC_012582	ACC	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116372
20	NC_012582	GCA	2	6	2191	2196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116373
21	NC_012582	CCCAA	2	10	2210	2219	40 %	0 %	0 %	60 %	227116373
22	NC_012582	TTG	2	6	2225	2230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116373
23	NC_012582	ATC	2	6	2235	2240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116373
24	NC_012582	CAA	2	6	2245	2250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116373
25	NC_012582	TGA	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116373
26	NC_012582	TTG	2	6	2303	2308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116373
27	NC_012582	CAAC	2	8	2317	2324	50 %	0 %	0 %	50 %	227116373
28	NC_012582	CAA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116373
29	NC_012582	ATT	2	6	2521	2526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116373
30	NC_012582	ATC	2	6	2539	2544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116373
31	NC_012582	ATG	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116373
32	NC_012582	TGG	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116373
33	NC_012582	CGATAA	2	12	2739	2750	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227116373
34	NC_012582	GGCA	2	8	2787	2794	25 %	0 %	50 %	25 %	227116373
35	NC_012582	GGGA	2	8	2955	2962	25 %	0 %	75 %	0 %	227116373
36	NC_012582	CGG	2	6	3014	3019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116373
37	NC_012582	TGC	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116373
38	NC_012582	ATA	2	6	3038	3043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116373
39	NC_012582	AAT	2	6	3106	3111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116373
40	NC_012582	ACG	2	6	3202	3207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116373
41	NC_012582	CT	3	6	3283	3288	0 %	50 %	0 %	50 %	227116373
42	NC_012582	AATCA	2	10	3292	3301	60 %	20 %	0 %	20 %	227116373
43	NC_012582	GCT	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116373
44	NC_012582	GCT	2	6	3366	3371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116373
45	NC_012582	GCAA	2	8	3488	3495	50 %	0 %	25 %	25 %	227116373
46	NC_012582	A	6	6	3505	3510	100 %	0 %	0 %	0 %	227116373
47	NC_012582	GTC	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116373
48	NC_012582	AAT	2	6	3646	3651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116373
49	NC_012582	CAC	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116373
50	NC_012582	TGG	2	6	3734	3739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116373
51	NC_012582	CTA	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116373
52	NC_012582	ATA	2	6	3847	3852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116374
53	NC_012582	CG	3	6	3853	3858	0 %	0 %	50 %	50 %	227116374
54	NC_012582	CAG	3	9	3861	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
55	NC_012582	TAA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116374
56	NC_012582	GTC	2	6	3929	3934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116374
57	NC_012582	TAG	2	6	3947	3952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116374
58	NC_012582	GA	3	6	3970	3975	50 %	0 %	50 %	0 %	227116374
59	NC_012582	ACG	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
60	NC_012582	ATC	2	6	4141	4146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116374
61	NC_012582	TGC	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116374
62	NC_012582	AACTC	2	10	4208	4217	40 %	20 %	0 %	40 %	227116374
63	NC_012582	TTC	2	6	4253	4258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116374
64	NC_012582	GTT	2	6	4259	4264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
65	NC_012582	CTG	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116374
66	NC_012582	TGT	2	6	4494	4499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
67	NC_012582	ATC	2	6	4528	4533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116374
68	NC_012582	TTG	2	6	4561	4566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
69	NC_012582	CAG	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
70	NC_012582	GCA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
71	NC_012582	TGC	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116374
72	NC_012582	CAC	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116374
73	NC_012582	CA	3	6	4679	4684	50 %	0 %	0 %	50 %	227116374
74	NC_012582	GTT	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
75	NC_012582	AAAG	2	8	4853	4860	75 %	0 %	25 %	0 %	227116374
76	NC_012582	TGT	2	6	4902	4907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
77	NC_012582	CAAA	2	8	4944	4951	75 %	0 %	0 %	25 %	227116374
78	NC_012582	TCA	2	6	4961	4966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116374
79	NC_012582	CAA	2	6	4984	4989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116374
80	NC_012582	CAT	2	6	5022	5027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116374
81	NC_012582	CT	3	6	5066	5071	0 %	50 %	0 %	50 %	227116374
82	NC_012582	TTG	3	9	5179	5187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
83	NC_012582	ATG	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116374
84	NC_012582	ACC	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116374
85	NC_012582	GCA	2	6	5324	5329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
86	NC_012582	TCCA	2	8	5344	5351	25 %	25 %	0 %	50 %	227116374
87	NC_012582	CCA	2	6	5414	5419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116374
88	NC_012582	AAC	2	6	5453	5458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116374
89	NC_012582	CAA	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116374
90	NC_012582	AGC	2	6	5618	5623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
91	NC_012582	A	6	6	8061	8066	100 %	0 %	0 %	0 %	227116375
92	NC_012582	TGC	2	6	8088	8093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116375
93	NC_012582	TCAT	2	8	8128	8135	25 %	50 %	0 %	25 %	227116375
94	NC_012582	TGG	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116375
95	NC_012582	TTC	2	6	8221	8226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116375
96	NC_012582	GAT	2	6	8240	8245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116375
97	NC_012582	TCTT	2	8	8296	8303	0 %	75 %	0 %	25 %	227116375
98	NC_012582	AAG	2	6	8314	8319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116375
99	NC_012582	CTAT	2	8	8335	8342	25 %	50 %	0 %	25 %	227116375
100	NC_012582	TTGA	2	8	8480	8487	25 %	50 %	25 %	0 %	227116375
101	NC_012582	CAT	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116375
102	NC_012582	TGCT	2	8	8562	8569	0 %	50 %	25 %	25 %	227116375
103	NC_012582	GTG	2	6	8625	8630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116375
104	NC_012582	T	6	6	8720	8725	0 %	100 %	0 %	0 %	227116375
105	NC_012582	AAG	2	6	9094	9099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116376
106	NC_012582	CTT	2	6	9122	9127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116376
107	NC_012582	GAA	2	6	9179	9184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116376
108	NC_012582	AAG	2	6	9223	9228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116376
109	NC_012582	AAT	2	6	9284	9289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116376
110	NC_012582	CTGA	2	8	9318	9325	25 %	25 %	25 %	25 %	227116376
111	NC_012582	T	6	6	9362	9367	0 %	100 %	0 %	0 %	227116376
112	NC_012582	TGAAG	2	10	9386	9395	40 %	20 %	40 %	0 %	227116376
113	NC_012582	ATGA	2	8	9417	9424	50 %	25 %	25 %	0 %	227116376
114	NC_012582	GGC	2	6	9488	9493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116376
115	NC_012582	AT	3	6	9563	9568	50 %	50 %	0 %	0 %	227116376
116	NC_012582	TCACA	2	10	9797	9806	40 %	20 %	0 %	40 %	227116377
117	NC_012582	TCTA	2	8	9885	9892	25 %	50 %	0 %	25 %	227116377
118	NC_012582	TGC	2	6	9969	9974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116377
119	NC_012582	CTT	2	6	9978	9983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116377
120	NC_012582	TTA	2	6	10134	10139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116378
121	NC_012582	TGA	2	6	10188	10193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116378
122	NC_012582	A	8	8	10223	10230	100 %	0 %	0 %	0 %	227116378
123	NC_012582	GTT	2	6	10336	10341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116378
124	NC_012582	A	6	6	10384	10389	100 %	0 %	0 %	0 %	227116378
125	NC_012582	TCA	2	6	10449	10454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116378
126	NC_012582	TG	3	6	10481	10486	0 %	50 %	50 %	0 %	227116378
127	NC_012582	AGA	2	6	10617	10622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116378
128	NC_012582	TGA	2	6	10735	10740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116379
129	NC_012582	CAT	2	6	10806	10811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116379
130	NC_012582	AGA	2	6	10855	10860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116379
131	NC_012582	GGTG	2	8	10882	10889	0 %	25 %	75 %	0 %	227116379
132	NC_012582	CATTT	2	10	10948	10957	20 %	60 %	0 %	20 %	227116379
133	NC_012582	GCC	2	6	10972	10977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116379
134	NC_012582	GA	3	6	10998	11003	50 %	0 %	50 %	0 %	227116379
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142	NC_012582	ATA	2	6	11294	11299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116379
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262	NC_012582	TTC	2	6	18838	18843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116385
263	NC_012582	TGC	2	6	18943	18948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116385
264	NC_012582	TCA	2	6	18982	18987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116385
265	NC_012582	TC	3	6	19051	19056	0 %	50 %	0 %	50 %	227116385
266	NC_012582	ACC	2	6	19119	19124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116385
267	NC_012582	CT	3	6	19195	19200	0 %	50 %	0 %	50 %	227116385
268	NC_012582	AAC	2	6	19237	19242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116385
269	NC_012582	TGC	2	6	19649	19654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116386
270	NC_012582	T	6	6	19662	19667	0 %	100 %	0 %	0 %	227116386
271	NC_012582	CTT	2	6	19727	19732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116386
272	NC_012582	T	6	6	19750	19755	0 %	100 %	0 %	0 %	227116386
273	NC_012582	CAA	2	6	19756	19761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116386
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279	NC_012582	CAT	2	6	20101	20106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116386
280	NC_012582	AAT	2	6	20162	20167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116386
281	NC_012582	ATC	2	6	20237	20242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116386
282	NC_012582	TTG	2	6	20259	20264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116386
283	NC_012582	ATC	2	6	20369	20374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116386
284	NC_012582	AAC	2	6	20384	20389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116386
285	NC_012582	ATG	2	6	20398	20403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116386
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287	NC_012582	AGC	2	6	20474	20479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116386
288	NC_012582	ATC	2	6	20480	20485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116386
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293	NC_012582	CTT	2	6	20803	20808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116386
294	NC_012582	TCT	2	6	20827	20832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116386
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361	NC_012582	GTTA	2	8	25568	25575	25 %	50 %	25 %	0 %	227116392
362	NC_012582	AAT	2	6	25588	25593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116392
363	NC_012582	GTTT	2	8	25609	25616	0 %	75 %	25 %	0 %	227116392
364	NC_012582	T	6	6	25708	25713	0 %	100 %	0 %	0 %	227116392
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379	NC_012582	CATC	2	8	26528	26535	25 %	25 %	0 %	50 %	227116392
380	NC_012582	TATT	2	8	26662	26669	25 %	75 %	0 %	0 %	227116392
381	NC_012582	ATA	2	6	26681	26686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116392
382	NC_012582	ATC	2	6	26691	26696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116392
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387	NC_012582	GAA	2	6	27031	27036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116392
388	NC_012582	CATTT	2	10	27108	27117	20 %	60 %	0 %	20 %	227116392
389	NC_012582	CT	3	6	27224	27229	0 %	50 %	0 %	50 %	227116392
390	NC_012582	TTC	2	6	27299	27304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116392
391	NC_012582	AGT	2	6	27318	27323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116392
392	NC_012582	CTG	2	6	27338	27343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116392
393	NC_012582	TCT	2	6	27351	27356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116392
394	NC_012582	TTC	2	6	27490	27495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116393
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481	NC_012582	AG	3	6	32282	32287	50 %	0 %	50 %	0 %	227116395
482	NC_012582	CAG	2	6	32455	32460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116395
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