MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 50518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012582	TGG	2	6	217245	217250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116578
3502	NC_012582	GAA	2	6	217370	217375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116578
3503	NC_012582	TTGG	2	8	217411	217418	0 %	50 %	50 %	0 %	227116578
3504	NC_012582	GCC	2	6	217512	217517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116578
3505	NC_012582	GAA	2	6	217553	217558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116578
3506	NC_012582	TGGTC	2	10	217576	217585	0 %	40 %	40 %	20 %	227116578
3507	NC_012582	GC	3	6	217616	217621	0 %	0 %	50 %	50 %	227116578
3508	NC_012582	CGT	2	6	217718	217723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116578
3509	NC_012582	CAT	2	6	217786	217791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116578
3510	NC_012582	GCCGA	2	10	217793	217802	20 %	0 %	40 %	40 %	227116578
3511	NC_012582	GGT	2	6	217919	217924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116578
3512	NC_012582	GC	4	8	217946	217953	0 %	0 %	50 %	50 %	227116578
3513	NC_012582	CGCGA	2	10	217957	217966	20 %	0 %	40 %	40 %	227116578
3514	NC_012582	ACCT	2	8	217990	217997	25 %	25 %	0 %	50 %	227116578
3515	NC_012582	CACC	2	8	218160	218167	25 %	0 %	0 %	75 %	227116578
3516	NC_012582	AGC	2	6	218169	218174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116578
3517	NC_012582	GCA	2	6	218188	218193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116578
3518	NC_012582	AAG	2	6	218204	218209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116578
3519	NC_012582	GCA	2	6	218258	218263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116578
3520	NC_012582	ACA	2	6	218315	218320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116579
3521	NC_012582	AAAC	2	8	218372	218379	75 %	0 %	0 %	25 %	227116579
3522	NC_012582	ACG	2	6	218446	218451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116579
3523	NC_012582	AGC	2	6	218479	218484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116579
3524	NC_012582	A	6	6	218545	218550	100 %	0 %	0 %	0 %	227116579
3525	NC_012582	GAT	2	6	218661	218666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116579
3526	NC_012582	CGG	2	6	218698	218703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116579
3527	NC_012582	GAT	2	6	218748	218753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116579
3528	NC_012582	CAC	2	6	218846	218851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116579
3529	NC_012582	AGA	2	6	219044	219049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116579
3530	NC_012582	CTG	2	6	219069	219074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116579
3531	NC_012582	TGTGCG	2	12	219221	219232	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	227116579
3532	NC_012582	CAA	2	6	219254	219259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116579
3533	NC_012582	GGC	2	6	219290	219295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116579
3534	NC_012582	GCA	2	6	219308	219313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116579
3535	NC_012582	CAA	2	6	219368	219373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116579
3536	NC_012582	TGA	2	6	219385	219390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116579
3537	NC_012582	AAG	2	6	219391	219396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116579
3538	NC_012582	AAC	2	6	219438	219443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116579
3539	NC_012582	TGT	2	6	219487	219492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116579
3540	NC_012582	TGA	2	6	219577	219582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116579
3541	NC_012582	TTGG	2	8	219583	219590	0 %	50 %	50 %	0 %	227116579
3542	NC_012582	TAC	2	6	219681	219686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116579
3543	NC_012582	GCA	2	6	219748	219753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116579
3544	NC_012582	GAA	2	6	219761	219766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116579
3545	NC_012582	GCG	2	6	219792	219797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116579
3546	NC_012582	ATC	2	6	219861	219866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116579
3547	NC_012582	TGG	2	6	219898	219903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116579
3548	NC_012582	ATT	2	6	220249	220254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116580
3549	NC_012582	GCG	2	6	220276	220281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116580
3550	NC_012582	CCT	2	6	220301	220306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116580
3551	NC_012582	TGG	2	6	220349	220354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116580
3552	NC_012582	ATC	2	6	220387	220392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116580
3553	NC_012582	GCA	3	9	220469	220477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116580
3554	NC_012582	ATGT	2	8	220519	220526	25 %	50 %	25 %	0 %	227116580
3555	NC_012582	GGTT	2	8	220543	220550	0 %	50 %	50 %	0 %	227116580
3556	NC_012582	CTGGG	2	10	220585	220594	0 %	20 %	60 %	20 %	227116580
3557	NC_012582	CTT	2	6	220602	220607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116580
3558	NC_012582	CAA	2	6	220758	220763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116580
3559	NC_012582	GTGG	2	8	220813	220820	0 %	25 %	75 %	0 %	227116580
3560	NC_012582	TGG	2	6	220838	220843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116580
3561	NC_012582	CTT	2	6	220890	220895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116580
3562	NC_012582	TTG	2	6	220952	220957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116580
3563	NC_012582	ATCG	2	8	221060	221067	25 %	25 %	25 %	25 %	227116581
3564	NC_012582	TAT	2	6	221109	221114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116581
3565	NC_012582	AGC	2	6	221139	221144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116581
3566	NC_012582	GC	3	6	221182	221187	0 %	0 %	50 %	50 %	227116581
3567	NC_012582	CCA	2	6	221200	221205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116581
3568	NC_012582	TC	3	6	221216	221221	0 %	50 %	0 %	50 %	227116581
3569	NC_012582	ATGG	2	8	221258	221265	25 %	25 %	50 %	0 %	227116581
3570	NC_012582	TTG	2	6	221286	221291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116581
3571	NC_012582	CCA	2	6	221482	221487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116581
3572	NC_012582	TGG	2	6	221491	221496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116581
3573	NC_012582	TGG	2	6	221531	221536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116581
3574	NC_012582	TTC	2	6	221541	221546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116581
3575	NC_012582	GGT	2	6	221558	221563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116581
3576	NC_012582	TGG	2	6	221569	221574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116581
3577	NC_012582	ATC	2	6	221577	221582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116581
3578	NC_012582	CG	3	6	221606	221611	0 %	0 %	50 %	50 %	227116581
3579	NC_012582	GTGC	2	8	221616	221623	0 %	25 %	50 %	25 %	227116581
3580	NC_012582	GAA	2	6	221639	221644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116581
3581	NC_012582	A	6	6	221643	221648	100 %	0 %	0 %	0 %	227116581
3582	NC_012582	GGC	2	6	221780	221785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116581
3583	NC_012582	TCCT	2	8	221790	221797	0 %	50 %	0 %	50 %	227116581
3584	NC_012582	CT	3	6	221834	221839	0 %	50 %	0 %	50 %	227116581
3585	NC_012582	TGG	2	6	221877	221882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116581
3586	NC_012582	GTATTG	2	12	221904	221915	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227116581
3587	NC_012582	CTTG	2	8	221933	221940	0 %	50 %	25 %	25 %	227116581
3588	NC_012582	GTAA	2	8	221984	221991	50 %	25 %	25 %	0 %	227116581
3589	NC_012582	TGC	2	6	222180	222185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116582
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3591	NC_012582	GGC	2	6	222260	222265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116582
3592	NC_012582	CT	3	6	222344	222349	0 %	50 %	0 %	50 %	227116582
3593	NC_012582	CAC	2	6	222392	222397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116582
3594	NC_012582	GC	4	8	222457	222464	0 %	0 %	50 %	50 %	227116582
3595	NC_012582	A	6	6	222522	222527	100 %	0 %	0 %	0 %	227116582
3596	NC_012582	AGCA	2	8	222541	222548	50 %	0 %	25 %	25 %	227116582
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3601	NC_012582	CGC	3	9	222716	222724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116582
3602	NC_012582	CCAA	2	8	222726	222733	50 %	0 %	0 %	50 %	227116582
3603	NC_012582	AGC	2	6	222750	222755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116582
3604	NC_012582	ATG	2	6	222898	222903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116582
3605	NC_012582	TGTA	2	8	222914	222921	25 %	50 %	25 %	0 %	227116582
3606	NC_012582	TTA	2	6	222966	222971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116582
3607	NC_012582	GCA	2	6	222986	222991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116582
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3610	NC_012582	GT	4	8	223095	223102	0 %	50 %	50 %	0 %	227116582
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3612	NC_012582	TCA	2	6	223316	223321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116583
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3614	NC_012582	CGG	2	6	223413	223418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116583
3615	NC_012582	GGTG	2	8	223514	223521	0 %	25 %	75 %	0 %	227116583
3616	NC_012582	TGT	2	6	223572	223577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116583
3617	NC_012582	AG	3	6	223591	223596	50 %	0 %	50 %	0 %	227116583
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3621	NC_012582	TCA	2	6	223905	223910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116583
3622	NC_012582	GAT	2	6	223927	223932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116583
3623	NC_012582	GCT	2	6	224061	224066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116583
3624	NC_012582	GCTCA	2	10	224068	224077	20 %	20 %	20 %	40 %	227116583
3625	NC_012582	A	6	6	224077	224082	100 %	0 %	0 %	0 %	227116583
3626	NC_012582	ACC	2	6	224137	224142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116583
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3642	NC_012582	TCAG	2	8	225152	225159	25 %	25 %	25 %	25 %	227116584
3643	NC_012582	GTA	2	6	225214	225219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116584
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3655	NC_012582	TGA	2	6	226020	226025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116585
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3735	NC_012582	AAAG	2	8	229956	229963	75 %	0 %	25 %	0 %	227116587
3736	NC_012582	CAT	2	6	230027	230032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116587
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3738	NC_012582	GCTT	2	8	230913	230920	0 %	50 %	25 %	25 %	227116588
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3742	NC_012582	CAGACA	2	12	231092	231103	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227116588
3743	NC_012582	GCTG	2	8	231105	231112	0 %	25 %	50 %	25 %	227116588
3744	NC_012582	A	6	6	231138	231143	100 %	0 %	0 %	0 %	227116588
3745	NC_012582	TCA	2	6	231173	231178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116588
3746	NC_012582	CGG	2	6	231199	231204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116588
3747	NC_012582	T	7	7	231250	231256	0 %	100 %	0 %	0 %	227116588
3748	NC_012582	TAAA	2	8	231288	231295	75 %	25 %	0 %	0 %	227116588
3749	NC_012582	GCC	2	6	231306	231311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116588
3750	NC_012582	GCT	2	6	231341	231346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116588
3751	NC_012582	ATC	2	6	231421	231426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116588
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3753	NC_012582	TAA	2	6	231492	231497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116588
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3757	NC_012582	CGT	2	6	231777	231782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116589
3758	NC_012582	GCTG	2	8	231892	231899	0 %	25 %	50 %	25 %	227116589
3759	NC_012582	GTT	2	6	231955	231960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116589
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3762	NC_012582	GCA	2	6	232045	232050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116589
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3765	NC_012582	CTG	2	6	232148	232153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116589
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3768	NC_012582	TGA	2	6	232309	232314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116589
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3771	NC_012582	GTGG	2	8	232512	232519	0 %	25 %	75 %	0 %	227116590
3772	NC_012582	A	6	6	232538	232543	100 %	0 %	0 %	0 %	227116590
3773	NC_012582	CGG	2	6	232729	232734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116591
3774	NC_012582	TTGA	2	8	232784	232791	25 %	50 %	25 %	0 %	227116591
3775	NC_012582	TTGC	2	8	232834	232841	0 %	50 %	25 %	25 %	227116591
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3778	NC_012582	GTT	2	6	233015	233020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116591
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3782	NC_012582	CAA	2	6	233104	233109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116591
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3859	NC_012582	ATCG	2	8	237223	237230	25 %	25 %	25 %	25 %	227116593
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3863	NC_012582	GC	3	6	237461	237466	0 %	0 %	50 %	50 %	227116594
3864	NC_012582	ACTT	2	8	237517	237524	25 %	50 %	0 %	25 %	227116594
3865	NC_012582	TGC	3	9	237598	237606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116594
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3988	NC_012582	TGC	2	6	244773	244778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116600
3989	NC_012582	CTG	2	6	244805	244810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116600
3990	NC_012582	GCG	3	9	244856	244864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116600
3991	NC_012582	TGGT	2	8	244916	244923	0 %	50 %	50 %	0 %	227116600
3992	NC_012582	TTA	2	6	244967	244972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116600
3993	NC_012582	GC	3	6	245000	245005	0 %	0 %	50 %	50 %	227116600
3994	NC_012582	CAG	2	6	245026	245031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116600
3995	NC_012582	GCT	2	6	245035	245040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116600
3996	NC_012582	TGC	2	6	245052	245057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116600
3997	NC_012582	GCC	2	6	245126	245131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116600
3998	NC_012582	GTC	2	6	245163	245168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116600
3999	NC_012582	CT	3	6	245192	245197	0 %	50 %	0 %	50 %	227116600
4000	NC_012582	TGT	2	6	245262	245267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116600

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