MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 50518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012582	GCAA	2	8	94159	94166	50 %	0 %	25 %	25 %	227116464
1502	NC_012582	GCC	2	6	94214	94219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116465
1503	NC_012582	TAA	2	6	94230	94235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116465
1504	NC_012582	CAT	2	6	94262	94267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116465
1505	NC_012582	ATGC	2	8	94292	94299	25 %	25 %	25 %	25 %	227116465
1506	NC_012582	GATAGC	2	12	94315	94326	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227116465
1507	NC_012582	CAT	2	6	94333	94338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116465
1508	NC_012582	GGC	2	6	94441	94446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116465
1509	NC_012582	CAGA	2	8	94508	94515	50 %	0 %	25 %	25 %	227116465
1510	NC_012582	TTC	2	6	94559	94564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116465
1511	NC_012582	CGC	2	6	94600	94605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116465
1512	NC_012582	CCG	2	6	94719	94724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116465
1513	NC_012582	TCAT	2	8	94815	94822	25 %	50 %	0 %	25 %	227116465
1514	NC_012582	TACG	2	8	94885	94892	25 %	25 %	25 %	25 %	227116465
1515	NC_012582	ATT	2	6	94962	94967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116465
1516	NC_012582	CTA	2	6	95040	95045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116466
1517	NC_012582	TTG	2	6	95071	95076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116466
1518	NC_012582	TCAA	2	8	95084	95091	50 %	25 %	0 %	25 %	227116466
1519	NC_012582	GC	3	6	95220	95225	0 %	0 %	50 %	50 %	227116466
1520	NC_012582	TCT	2	6	95243	95248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116466
1521	NC_012582	CCA	2	6	95355	95360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116466
1522	NC_012582	GTG	2	6	95366	95371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116466
1523	NC_012582	AAT	2	6	95383	95388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116466
1524	NC_012582	CGT	2	6	95403	95408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1525	NC_012582	AAGT	2	8	95551	95558	50 %	25 %	25 %	0 %	227116466
1526	NC_012582	TGTT	2	8	95651	95658	0 %	75 %	25 %	0 %	227116466
1527	NC_012582	TGC	2	6	95801	95806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1528	NC_012582	CTT	2	6	95844	95849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116466
1529	NC_012582	T	6	6	95944	95949	0 %	100 %	0 %	0 %	227116466
1530	NC_012582	GCT	2	6	95961	95966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1531	NC_012582	GTG	2	6	95973	95978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116466
1532	NC_012582	TGC	2	6	96065	96070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1533	NC_012582	AGC	2	6	96095	96100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1534	NC_012582	CCA	2	6	96120	96125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116466
1535	NC_012582	CTG	3	9	96127	96135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1536	NC_012582	CTT	2	6	96144	96149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116466
1537	NC_012582	GC	3	6	96185	96190	0 %	0 %	50 %	50 %	227116466
1538	NC_012582	CTG	2	6	96214	96219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1539	NC_012582	TGC	2	6	96341	96346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1540	NC_012582	GCT	2	6	96357	96362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1541	NC_012582	GCT	2	6	96369	96374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1542	NC_012582	TGC	2	6	96380	96385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1543	NC_012582	CTG	2	6	96400	96405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1544	NC_012582	GTT	2	6	96411	96416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116466
1545	NC_012582	GCT	2	6	96447	96452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116466
1546	NC_012582	CCA	2	6	96457	96462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116466
1547	NC_012582	CACT	2	8	96489	96496	25 %	25 %	0 %	50 %	227116466
1548	NC_012582	ATGA	2	8	96663	96670	50 %	25 %	25 %	0 %	227116467
1549	NC_012582	CG	3	6	96675	96680	0 %	0 %	50 %	50 %	227116467
1550	NC_012582	GGCTT	2	10	96690	96699	0 %	40 %	40 %	20 %	227116467
1551	NC_012582	TGT	2	6	96706	96711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116467
1552	NC_012582	TGC	2	6	96818	96823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116467
1553	NC_012582	TAC	2	6	96873	96878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116467
1554	NC_012582	GATT	2	8	96889	96896	25 %	50 %	25 %	0 %	227116467
1555	NC_012582	GCT	2	6	96938	96943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116467
1556	NC_012582	GGC	2	6	97001	97006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116467
1557	NC_012582	GTG	3	9	97071	97079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116467
1558	NC_012582	CTG	2	6	97143	97148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116467
1559	NC_012582	CTG	2	6	97155	97160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116467
1560	NC_012582	CTG	2	6	97230	97235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116467
1561	NC_012582	CAC	2	6	97292	97297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116467
1562	NC_012582	GGTT	2	8	97302	97309	0 %	50 %	50 %	0 %	227116467
1563	NC_012582	CGCA	2	8	97391	97398	25 %	0 %	25 %	50 %	227116467
1564	NC_012582	CAT	2	6	97451	97456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116467
1565	NC_012582	ATT	2	6	97500	97505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116467
1566	NC_012582	CAG	2	6	97521	97526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116467
1567	NC_012582	GCC	2	6	97625	97630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116468
1568	NC_012582	AGCC	2	8	97632	97639	25 %	0 %	25 %	50 %	227116468
1569	NC_012582	CATC	2	8	97645	97652	25 %	25 %	0 %	50 %	227116468
1570	NC_012582	CCA	2	6	97728	97733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116468
1571	NC_012582	CTT	2	6	97939	97944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116468
1572	NC_012582	ACT	2	6	97949	97954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116468
1573	NC_012582	CAA	2	6	97955	97960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116468
1574	NC_012582	TGG	2	6	97990	97995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116468
1575	NC_012582	GCA	2	6	98032	98037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116468
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1577	NC_012582	GC	3	6	98103	98108	0 %	0 %	50 %	50 %	227116468
1578	NC_012582	CCG	2	6	98274	98279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116468
1579	NC_012582	ACC	2	6	98286	98291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116468
1580	NC_012582	TGG	2	6	98317	98322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116468
1581	NC_012582	GCT	2	6	98380	98385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116468
1582	NC_012582	AGT	2	6	98569	98574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116468
1583	NC_012582	CGC	2	6	98576	98581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116468
1584	NC_012582	CCA	2	6	98613	98618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116468
1585	NC_012582	T	6	6	98645	98650	0 %	100 %	0 %	0 %	227116468
1586	NC_012582	AGC	2	6	98661	98666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116468
1587	NC_012582	CGC	2	6	98687	98692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116468
1588	NC_012582	TGC	2	6	98696	98701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116468
1589	NC_012582	CGC	2	6	98714	98719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116468
1590	NC_012582	AAT	2	6	98729	98734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116468
1591	NC_012582	TCA	2	6	98755	98760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116468
1592	NC_012582	CGA	2	6	98914	98919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116469
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1594	NC_012582	ATG	2	6	98999	99004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116469
1595	NC_012582	GTG	2	6	99005	99010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116469
1596	NC_012582	GTG	2	6	99069	99074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116469
1597	NC_012582	TTG	2	6	99095	99100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116469
1598	NC_012582	ATG	2	6	99126	99131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116469
1599	NC_012582	AGCG	2	8	99138	99145	25 %	0 %	50 %	25 %	227116469
1600	NC_012582	ATC	2	6	99219	99224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116469
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1603	NC_012582	T	7	7	99335	99341	0 %	100 %	0 %	0 %	227116470
1604	NC_012582	AAC	2	6	99372	99377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116470
1605	NC_012582	CTTCT	2	10	99431	99440	0 %	60 %	0 %	40 %	227116470
1606	NC_012582	GAAG	2	8	99466	99473	50 %	0 %	50 %	0 %	227116470
1607	NC_012582	AGT	2	6	99484	99489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116470
1608	NC_012582	TTA	2	6	99519	99524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116470
1609	NC_012582	TCT	2	6	99538	99543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116470
1610	NC_012582	CGTGG	2	10	99592	99601	0 %	20 %	60 %	20 %	227116470
1611	NC_012582	TCAC	2	8	99639	99646	25 %	25 %	0 %	50 %	227116470
1612	NC_012582	TGC	2	6	99669	99674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116470
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1614	NC_012582	A	7	7	99769	99775	100 %	0 %	0 %	0 %	227116470
1615	NC_012582	ACA	2	6	99820	99825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116470
1616	NC_012582	A	6	6	99827	99832	100 %	0 %	0 %	0 %	227116470
1617	NC_012582	TCA	2	6	99890	99895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116471
1618	NC_012582	A	7	7	99932	99938	100 %	0 %	0 %	0 %	227116471
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1620	NC_012582	GCA	2	6	100212	100217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116472
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1622	NC_012582	GT	3	6	100312	100317	0 %	50 %	50 %	0 %	227116472
1623	NC_012582	CT	3	6	100348	100353	0 %	50 %	0 %	50 %	227116472
1624	NC_012582	CAG	2	6	100486	100491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116473
1625	NC_012582	CG	3	6	100630	100635	0 %	0 %	50 %	50 %	227116473
1626	NC_012582	GGC	2	6	100662	100667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116473
1627	NC_012582	GCTTG	2	10	100673	100682	0 %	40 %	40 %	20 %	227116473
1628	NC_012582	CTA	2	6	100694	100699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116473
1629	NC_012582	TCTT	2	8	100704	100711	0 %	75 %	0 %	25 %	227116473
1630	NC_012582	GCT	2	6	100712	100717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116473
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1632	NC_012582	TCTA	2	8	101002	101009	25 %	50 %	0 %	25 %	227116473
1633	NC_012582	TGG	2	6	101020	101025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116473
1634	NC_012582	CTG	3	9	101040	101048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116473
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1640	NC_012582	ATGC	2	8	101459	101466	25 %	25 %	25 %	25 %	227116474
1641	NC_012582	CT	4	8	101479	101486	0 %	50 %	0 %	50 %	227116474
1642	NC_012582	TGC	2	6	101532	101537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116474
1643	NC_012582	GCT	2	6	101554	101559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116474
1644	NC_012582	GCT	2	6	101596	101601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116474
1645	NC_012582	GGCT	2	8	101608	101615	0 %	25 %	50 %	25 %	227116474
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1649	NC_012582	CG	3	6	101731	101736	0 %	0 %	50 %	50 %	227116474
1650	NC_012582	GAC	2	6	101809	101814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116474
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1655	NC_012582	T	7	7	102187	102193	0 %	100 %	0 %	0 %	227116475
1656	NC_012582	TCGGA	2	10	102253	102262	20 %	20 %	40 %	20 %	227116475
1657	NC_012582	TGC	2	6	102270	102275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116475
1658	NC_012582	CAT	2	6	102280	102285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116475
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1746	NC_012582	AGT	2	6	107272	107277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116479
1747	NC_012582	TGC	2	6	107293	107298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116479
1748	NC_012582	TTCAC	2	10	107326	107335	20 %	40 %	0 %	40 %	227116479
1749	NC_012582	ATTG	2	8	107491	107498	25 %	50 %	25 %	0 %	227116480
1750	NC_012582	CG	4	8	107514	107521	0 %	0 %	50 %	50 %	227116480
1751	NC_012582	GAC	2	6	107588	107593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116480
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1754	NC_012582	CTA	2	6	107687	107692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116480
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1759	NC_012582	ATG	2	6	107913	107918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116480
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1762	NC_012582	GCTG	2	8	108084	108091	0 %	25 %	50 %	25 %	227116480
1763	NC_012582	ATTACC	2	12	108250	108261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116480
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1765	NC_012582	GA	3	6	108309	108314	50 %	0 %	50 %	0 %	227116480
1766	NC_012582	CTGCG	2	10	108321	108330	0 %	20 %	40 %	40 %	227116480
1767	NC_012582	AC	3	6	108556	108561	50 %	0 %	0 %	50 %	227116481
1768	NC_012582	GCC	2	6	108674	108679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116481
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1776	NC_012582	CGT	2	6	109069	109074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116481
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1864	NC_012582	TCT	2	6	115125	115130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116487
1865	NC_012582	ACCA	2	8	115189	115196	50 %	0 %	0 %	50 %	227116487
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1868	NC_012582	CAT	2	6	115369	115374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116487
1869	NC_012582	CAT	2	6	115489	115494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116487
1870	NC_012582	AAT	2	6	115574	115579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116487
1871	NC_012582	GCC	2	6	115583	115588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116487
1872	NC_012582	AACT	2	8	115880	115887	50 %	25 %	0 %	25 %	227116487
1873	NC_012582	CTT	3	9	115894	115902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116487
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1876	NC_012582	AAT	2	6	115967	115972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116487
1877	NC_012582	GAT	2	6	115990	115995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116487
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1882	NC_012582	TGA	2	6	116121	116126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116487
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1886	NC_012582	CTTG	2	8	116616	116623	0 %	50 %	25 %	25 %	227116487
1887	NC_012582	GCA	2	6	116924	116929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116488
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1904	NC_012582	CACT	2	8	123994	124001	25 %	25 %	0 %	50 %	227116490
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1985	NC_012582	AGC	2	6	127922	127927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116496
1986	NC_012582	T	6	6	127957	127962	0 %	100 %	0 %	0 %	227116496
1987	NC_012582	CAC	2	6	127997	128002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116496
1988	NC_012582	GT	3	6	128074	128079	0 %	50 %	50 %	0 %	227116496
1989	NC_012582	GAT	2	6	128121	128126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116496
1990	NC_012582	CCG	2	6	128243	128248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116496
1991	NC_012582	GTG	2	6	128255	128260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116496
1992	NC_012582	CTG	2	6	128478	128483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116497
1993	NC_012582	CTTTT	2	10	128486	128495	0 %	80 %	0 %	20 %	227116497
1994	NC_012582	CCA	2	6	128496	128501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116497
1995	NC_012582	TGG	2	6	128702	128707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116497
1996	NC_012582	GCA	2	6	128757	128762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116497
1997	NC_012582	TGA	2	6	128805	128810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116497
1998	NC_012582	CAT	2	6	128817	128822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116497
1999	NC_012582	A	6	6	128873	128878	100 %	0 %	0 %	0 %	227116497
2000	NC_012582	TGC	2	6	128908	128913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116497

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