MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012580	TGC	2	6	240453	240458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811842
4002	NC_012580	GCA	2	6	240571	240576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811842
4003	NC_012580	AGC	2	6	240582	240587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811842
4004	NC_012580	GCA	2	6	240647	240652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811842
4005	NC_012580	TCATT	2	10	240660	240669	20 %	60 %	0 %	20 %	227811842
4006	NC_012580	TCACT	2	10	240672	240681	20 %	40 %	0 %	40 %	227811842
4007	NC_012580	GCG	3	9	240740	240748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811842
4008	NC_012580	TG	3	6	240795	240800	0 %	50 %	50 %	0 %	227811842
4009	NC_012580	GAA	2	6	240851	240856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811842
4010	NC_012580	CGA	2	6	240882	240887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811842
4011	NC_012580	GT	3	6	240897	240902	0 %	50 %	50 %	0 %	227811842
4012	NC_012580	GC	4	8	240907	240914	0 %	0 %	50 %	50 %	227811842
4013	NC_012580	AAGC	2	8	241040	241047	50 %	0 %	25 %	25 %	227811842
4014	NC_012580	A	6	6	241070	241075	100 %	0 %	0 %	0 %	227811842
4015	NC_012580	TCA	2	6	241145	241150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811842
4016	NC_012580	GGT	2	6	241282	241287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811842
4017	NC_012580	TCGC	2	8	241405	241412	0 %	25 %	25 %	50 %	227811842
4018	NC_012580	TGG	2	6	241422	241427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811842
4019	NC_012580	TC	3	6	241454	241459	0 %	50 %	0 %	50 %	227811842
4020	NC_012580	GTG	2	6	241538	241543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811842
4021	NC_012580	CAAC	2	8	241573	241580	50 %	0 %	0 %	50 %	227811842
4022	NC_012580	GAC	2	6	241582	241587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811842
4023	NC_012580	TC	3	6	241642	241647	0 %	50 %	0 %	50 %	227811842
4024	NC_012580	TGG	2	6	241665	241670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811842
4025	NC_012580	CT	3	6	242060	242065	0 %	50 %	0 %	50 %	475645768
4026	NC_012580	TTC	2	6	242073	242078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645768
4027	NC_012580	CAA	2	6	242116	242121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645768
4028	NC_012580	GGAT	2	8	242189	242196	25 %	25 %	50 %	0 %	475645768
4029	NC_012580	A	6	6	242338	242343	100 %	0 %	0 %	0 %	475645768
4030	NC_012580	TGG	2	6	242367	242372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645768
4031	NC_012580	CCA	2	6	242375	242380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	475645768
4032	NC_012580	GTG	2	6	242474	242479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645768
4033	NC_012580	GTGA	2	8	242497	242504	25 %	25 %	50 %	0 %	475645768
4034	NC_012580	TGG	2	6	242534	242539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645768
4035	NC_012580	TGAT	2	8	242543	242550	25 %	50 %	25 %	0 %	475645768
4036	NC_012580	CT	3	6	242554	242559	0 %	50 %	0 %	50 %	475645768
4037	NC_012580	GGC	2	6	242598	242603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	475645768
4038	NC_012580	CAC	2	6	242607	242612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	475645768
4039	NC_012580	TAT	2	6	242638	242643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	475645768
4040	NC_012580	TAC	2	6	242704	242709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645768
4041	NC_012580	ATG	2	6	242798	242803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645768
4042	NC_012580	TGA	2	6	242847	242852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645768
4043	NC_012580	A	7	7	242986	242992	100 %	0 %	0 %	0 %	227811844
4044	NC_012580	CG	3	6	243122	243127	0 %	0 %	50 %	50 %	227811844
4045	NC_012580	TC	3	6	243144	243149	0 %	50 %	0 %	50 %	227811844
4046	NC_012580	CAG	2	6	243181	243186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811844
4047	NC_012580	GCG	2	6	243265	243270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811844
4048	NC_012580	G	6	6	243301	243306	0 %	0 %	100 %	0 %	227811844
4049	NC_012580	GTG	2	6	243321	243326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811844
4050	NC_012580	CTG	2	6	243371	243376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811844
4051	NC_012580	AGC	2	6	243377	243382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811844
4052	NC_012580	GCA	2	6	243579	243584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811844
4053	NC_012580	TGG	2	6	243608	243613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811844
4054	NC_012580	GAT	2	6	243646	243651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811844
4055	NC_012580	CAG	2	6	243670	243675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811844
4056	NC_012580	TAT	2	6	243685	243690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811844
4057	NC_012580	AGC	2	6	243737	243742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811844
4058	NC_012580	CAG	2	6	243754	243759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811844
4059	NC_012580	AGC	2	6	243767	243772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811844
4060	NC_012580	GGC	2	6	243791	243796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811844
4061	NC_012580	TGATGG	2	12	243927	243938	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227811845
4062	NC_012580	CATC	2	8	243957	243964	25 %	25 %	0 %	50 %	227811845
4063	NC_012580	CAT	2	6	243978	243983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811845
4064	NC_012580	GT	3	6	244158	244163	0 %	50 %	50 %	0 %	227811845
4065	NC_012580	TGA	2	6	244181	244186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811845
4066	NC_012580	TATCGC	2	12	244188	244199	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227811845
4067	NC_012580	CTGC	2	8	244235	244242	0 %	25 %	25 %	50 %	227811845
4068	NC_012580	ACT	2	6	244333	244338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811845
4069	NC_012580	AG	3	6	244357	244362	50 %	0 %	50 %	0 %	227811845
4070	NC_012580	GTG	2	6	244409	244414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811845
4071	NC_012580	AAC	2	6	244429	244434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811845
4072	NC_012580	GCG	2	6	244611	244616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811845
4073	NC_012580	GACCA	2	10	244685	244694	40 %	0 %	20 %	40 %	227811845
4074	NC_012580	AGCC	2	8	244724	244731	25 %	0 %	25 %	50 %	227811845
4075	NC_012580	GCA	2	6	244875	244880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811845
4076	NC_012580	AG	3	6	245083	245088	50 %	0 %	50 %	0 %	227811845
4077	NC_012580	ATC	2	6	245158	245163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811845
4078	NC_012580	TCG	2	6	245166	245171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811845
4079	NC_012580	CG	3	6	245210	245215	0 %	0 %	50 %	50 %	227811845
4080	NC_012580	TGGCT	2	10	245262	245271	0 %	40 %	40 %	20 %	227811845
4081	NC_012580	CTG	2	6	245274	245279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811845
4082	NC_012580	ATC	2	6	245314	245319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811845
4083	NC_012580	CG	3	6	245445	245450	0 %	0 %	50 %	50 %	227811845
4084	NC_012580	GCT	2	6	245478	245483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811845
4085	NC_012580	GCCC	2	8	245572	245579	0 %	0 %	25 %	75 %	227811845
4086	NC_012580	CA	3	6	245685	245690	50 %	0 %	0 %	50 %	227811845
4087	NC_012580	AC	3	6	245838	245843	50 %	0 %	0 %	50 %	227811845
4088	NC_012580	CTT	2	6	245853	245858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811845
4089	NC_012580	ATC	2	6	245879	245884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811845
4090	NC_012580	TTACCG	2	12	245918	245929	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227811845
4091	NC_012580	CG	3	6	245982	245987	0 %	0 %	50 %	50 %	227811845
4092	NC_012580	TTG	2	6	246035	246040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811845
4093	NC_012580	TAA	2	6	246062	246067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811845
4094	NC_012580	T	6	6	246074	246079	0 %	100 %	0 %	0 %	227811845
4095	NC_012580	CTG	2	6	246096	246101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811845
4096	NC_012580	ATC	2	6	246277	246282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811845
4097	NC_012580	GCT	2	6	246414	246419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811845
4098	NC_012580	TCC	2	6	246473	246478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227811845
4099	NC_012580	AATT	2	8	246556	246563	50 %	50 %	0 %	0 %	227811845
4100	NC_012580	CAC	2	6	246574	246579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811845
4101	NC_012580	CTG	2	6	246614	246619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811845
4102	NC_012580	A	6	6	246620	246625	100 %	0 %	0 %	0 %	227811845
4103	NC_012580	GGC	2	6	246634	246639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811845
4104	NC_012580	T	7	7	246651	246657	0 %	100 %	0 %	0 %	227811845
4105	NC_012580	TTA	3	9	246845	246853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811846
4106	NC_012580	TGC	2	6	246890	246895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811846
4107	NC_012580	TCAA	2	8	246929	246936	50 %	25 %	0 %	25 %	227811846
4108	NC_012580	ACTA	2	8	246940	246947	50 %	25 %	0 %	25 %	227811846
4109	NC_012580	TCA	2	6	246953	246958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811846
4110	NC_012580	ATA	2	6	246978	246983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811846
4111	NC_012580	GCTG	2	8	247626	247633	0 %	25 %	50 %	25 %	227811847
4112	NC_012580	GCA	2	6	247773	247778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811847
4113	NC_012580	CGTT	2	8	247873	247880	0 %	50 %	25 %	25 %	227811847
4114	NC_012580	ACG	2	6	248036	248041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811847
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4116	NC_012580	TC	3	6	248182	248187	0 %	50 %	0 %	50 %	227811847
4117	NC_012580	CCG	2	6	248234	248239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811847
4118	NC_012580	ATC	2	6	248270	248275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811847
4119	NC_012580	GTCA	2	8	248358	248365	25 %	25 %	25 %	25 %	227811847
4120	NC_012580	ATT	2	6	248815	248820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	475645769
4121	NC_012580	TGC	2	6	248830	248835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645769
4122	NC_012580	ACC	2	6	248876	248881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	475645769
4123	NC_012580	GTT	2	6	249037	249042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	475645769
4124	NC_012580	TGATTG	2	12	249084	249095	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	475645769
4125	NC_012580	ACG	2	6	249117	249122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645769
4126	NC_012580	TGC	2	6	249154	249159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645769
4127	NC_012580	CAG	2	6	249194	249199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645769
4128	NC_012580	CAT	2	6	249280	249285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645769
4129	NC_012580	CAAC	2	8	249292	249299	50 %	0 %	0 %	50 %	475645769
4130	NC_012580	GGC	2	6	249335	249340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	475645769
4131	NC_012580	GAC	2	6	249346	249351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645769
4132	NC_012580	AG	3	6	249424	249429	50 %	0 %	50 %	0 %	475645769
4133	NC_012580	TGATC	2	10	249439	249448	20 %	40 %	20 %	20 %	475645769
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4135	NC_012580	GTG	2	6	249509	249514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645769
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4139	NC_012580	TGA	2	6	249839	249844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811850
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4143	NC_012580	TTCA	2	8	250098	250105	25 %	50 %	0 %	25 %	227811850
4144	NC_012580	CAT	2	6	250148	250153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811850
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4149	NC_012580	GTT	2	6	250556	250561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811850
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4153	NC_012580	CTG	3	9	250696	250704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811851
4154	NC_012580	CTG	2	6	250717	250722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811851
4155	NC_012580	GCG	2	6	250726	250731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811851
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4157	NC_012580	CGT	2	6	250783	250788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811851
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4159	NC_012580	GTC	2	6	250836	250841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811851
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4161	NC_012580	GTG	2	6	250933	250938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811851
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4165	NC_012580	CTTT	2	8	251120	251127	0 %	75 %	0 %	25 %	227811851
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4232	NC_012580	ATG	2	6	255147	255152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811854
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4234	NC_012580	TGGC	2	8	255300	255307	0 %	25 %	50 %	25 %	227811854
4235	NC_012580	GCC	2	6	255308	255313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811854
4236	NC_012580	AAGA	2	8	255314	255321	75 %	0 %	25 %	0 %	227811854
4237	NC_012580	TGA	2	6	255409	255414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811854
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4240	NC_012580	GTC	2	6	255580	255585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811855
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4242	NC_012580	GT	3	6	255746	255751	0 %	50 %	50 %	0 %	227811855
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4365	NC_012580	GCA	2	6	263246	263251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811865
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4367	NC_012580	GGC	2	6	263355	263360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811865
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4372	NC_012580	GCTGC	2	10	263589	263598	0 %	20 %	40 %	40 %	227811865
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4392	NC_012580	TTG	2	6	264664	264669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811867
4393	NC_012580	TTG	2	6	264679	264684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811867
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4479	NC_012580	ATCA	2	8	269461	269468	50 %	25 %	0 %	25 %	227811871
4480	NC_012580	GAT	2	6	269469	269474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811871
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4484	NC_012580	AACCA	2	10	269561	269570	60 %	0 %	0 %	40 %	227811871
4485	NC_012580	CCG	2	6	269624	269629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811871
4486	NC_012580	CAA	2	6	269674	269679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811871
4487	NC_012580	CTT	2	6	269748	269753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811871
4488	NC_012580	CG	3	6	269771	269776	0 %	0 %	50 %	50 %	227811871
4489	NC_012580	T	6	6	269832	269837	0 %	100 %	0 %	0 %	227811871
4490	NC_012580	GATA	2	8	269858	269865	50 %	25 %	25 %	0 %	227811871
4491	NC_012580	GAT	2	6	269872	269877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811871
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4493	NC_012580	GTC	2	6	270200	270205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811872
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