MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012580	TGGT	2	8	90755	90762	0 %	50 %	50 %	0 %	227811707
1502	NC_012580	GCA	2	6	90782	90787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811707
1503	NC_012580	CAAT	2	8	90800	90807	50 %	25 %	0 %	25 %	227811707
1504	NC_012580	ATC	2	6	90853	90858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811707
1505	NC_012580	AG	3	6	90922	90927	50 %	0 %	50 %	0 %	227811707
1506	NC_012580	TCG	2	6	90959	90964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811707
1507	NC_012580	CGG	2	6	91035	91040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811707
1508	NC_012580	T	6	6	91062	91067	0 %	100 %	0 %	0 %	227811707
1509	NC_012580	CTG	2	6	91155	91160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811707
1510	NC_012580	T	6	6	91249	91254	0 %	100 %	0 %	0 %	227811707
1511	NC_012580	GAT	2	6	91327	91332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811707
1512	NC_012580	ATTG	2	8	91350	91357	25 %	50 %	25 %	0 %	227811707
1513	NC_012580	GT	3	6	91386	91391	0 %	50 %	50 %	0 %	227811707
1514	NC_012580	CAC	2	6	91461	91466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811707
1515	NC_012580	CGA	2	6	91505	91510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811707
1516	NC_012580	TTG	2	6	91538	91543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811707
1517	NC_012580	A	6	6	91586	91591	100 %	0 %	0 %	0 %	227811707
1518	NC_012580	TCA	2	6	91598	91603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811707
1519	NC_012580	GCG	2	6	91604	91609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811707
1520	NC_012580	CTT	2	6	91626	91631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811707
1521	NC_012580	CGAA	2	8	91711	91718	50 %	0 %	25 %	25 %	227811707
1522	NC_012580	TCA	2	6	91721	91726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811707
1523	NC_012580	ATG	2	6	91750	91755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811707
1524	NC_012580	TCT	2	6	91760	91765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811707
1525	NC_012580	ATTG	2	8	91848	91855	25 %	50 %	25 %	0 %	227811707
1526	NC_012580	ATC	2	6	91907	91912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811707
1527	NC_012580	GTC	2	6	91951	91956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811707
1528	NC_012580	AAAT	2	8	92009	92016	75 %	25 %	0 %	0 %	227811707
1529	NC_012580	TTGC	2	8	92087	92094	0 %	50 %	25 %	25 %	227811707
1530	NC_012580	CTG	2	6	92171	92176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811707
1531	NC_012580	C	7	7	92302	92308	0 %	0 %	0 %	100 %	227811707
1532	NC_012580	CTGA	2	8	92311	92318	25 %	25 %	25 %	25 %	227811707
1533	NC_012580	CAGC	2	8	92613	92620	25 %	0 %	25 %	50 %	227811708
1534	NC_012580	CTT	2	6	92754	92759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811708
1535	NC_012580	ATA	2	6	92765	92770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811708
1536	NC_012580	AAT	2	6	92782	92787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811708
1537	NC_012580	TGG	3	9	92829	92837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811708
1538	NC_012580	C	6	6	92901	92906	0 %	0 %	0 %	100 %	227811708
1539	NC_012580	AGCAC	2	10	92907	92916	40 %	0 %	20 %	40 %	227811708
1540	NC_012580	CGC	2	6	92989	92994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811708
1541	NC_012580	GCT	2	6	93039	93044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811708
1542	NC_012580	TGA	2	6	93057	93062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811708
1543	NC_012580	GTG	3	9	93098	93106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811708
1544	NC_012580	GCA	2	6	93201	93206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811708
1545	NC_012580	A	6	6	93288	93293	100 %	0 %	0 %	0 %	227811708
1546	NC_012580	CAG	2	6	93337	93342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811708
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1549	NC_012580	TGG	2	6	93396	93401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811708
1550	NC_012580	TGC	2	6	93415	93420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811708
1551	NC_012580	CTT	2	6	93435	93440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811708
1552	NC_012580	CGC	2	6	93600	93605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811709
1553	NC_012580	GAT	3	9	93623	93631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811709
1554	NC_012580	ATTT	2	8	93660	93667	25 %	75 %	0 %	0 %	227811709
1555	NC_012580	TGG	2	6	93752	93757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811709
1556	NC_012580	TGA	2	6	93856	93861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811709
1557	NC_012580	GGGC	2	8	93913	93920	0 %	0 %	75 %	25 %	227811709
1558	NC_012580	GT	3	6	93943	93948	0 %	50 %	50 %	0 %	227811709
1559	NC_012580	ATG	2	6	93961	93966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811709
1560	NC_012580	CT	3	6	93985	93990	0 %	50 %	0 %	50 %	227811709
1561	NC_012580	TC	3	6	93995	94000	0 %	50 %	0 %	50 %	227811709
1562	NC_012580	ATT	2	6	94023	94028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811709
1563	NC_012580	TGGC	2	8	94047	94054	0 %	25 %	50 %	25 %	227811709
1564	NC_012580	TGC	2	6	94090	94095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811709
1565	NC_012580	TGA	2	6	94126	94131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811709
1566	NC_012580	CAA	2	6	94215	94220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811709
1567	NC_012580	AGT	2	6	94227	94232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811709
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1569	NC_012580	TAT	2	6	94363	94368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811709
1570	NC_012580	GCT	3	9	94463	94471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811709
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1574	NC_012580	GT	3	6	94723	94728	0 %	50 %	50 %	0 %	227811709
1575	NC_012580	A	6	6	94740	94745	100 %	0 %	0 %	0 %	227811709
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1595	NC_012580	T	6	6	96047	96052	0 %	100 %	0 %	0 %	227811711
1596	NC_012580	AG	3	6	96065	96070	50 %	0 %	50 %	0 %	227811711
1597	NC_012580	ATC	3	9	96294	96302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811711
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1606	NC_012580	CTAAG	2	10	96650	96659	40 %	20 %	20 %	20 %	227811711
1607	NC_012580	CAT	2	6	96780	96785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811712
1608	NC_012580	TTAA	2	8	96808	96815	50 %	50 %	0 %	0 %	227811712
1609	NC_012580	AGC	2	6	96865	96870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811712
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1612	NC_012580	CAT	2	6	97008	97013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811712
1613	NC_012580	GAC	2	6	97024	97029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811712
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1615	NC_012580	ACAA	2	8	97112	97119	75 %	0 %	0 %	25 %	227811712
1616	NC_012580	CAA	3	9	97216	97224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811713
1617	NC_012580	AAT	2	6	97241	97246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811713
1618	NC_012580	TTA	2	6	97337	97342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811713
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1621	NC_012580	CCAT	2	8	97874	97881	25 %	25 %	0 %	50 %	227811714
1622	NC_012580	GAAG	2	8	97909	97916	50 %	0 %	50 %	0 %	227811714
1623	NC_012580	TGG	2	6	97971	97976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811714
1624	NC_012580	CAC	2	6	98116	98121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811714
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1626	NC_012580	CAG	2	6	98289	98294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811714
1627	NC_012580	GTTG	2	8	98371	98378	0 %	50 %	50 %	0 %	227811714
1628	NC_012580	CCG	2	6	98418	98423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811714
1629	NC_012580	GGC	2	6	98437	98442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811714
1630	NC_012580	AGTG	2	8	98485	98492	25 %	25 %	50 %	0 %	227811714
1631	NC_012580	GGT	2	6	98512	98517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811714
1632	NC_012580	GA	3	6	98564	98569	50 %	0 %	50 %	0 %	227811714
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1634	NC_012580	AAAC	2	8	98601	98608	75 %	0 %	0 %	25 %	227811714
1635	NC_012580	GCC	2	6	98653	98658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811714
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1641	NC_012580	TGG	2	6	99465	99470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811716
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1743	NC_012580	TGGATG	2	12	106738	106749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227811724
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1746	NC_012580	CCAG	2	8	106954	106961	25 %	0 %	25 %	50 %	227811725
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1763	NC_012580	GCT	2	6	107929	107934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811726
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1988	NC_012580	GATT	2	8	121423	121430	25 %	50 %	25 %	0 %	227811737
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1993	NC_012580	TAT	2	6	121802	121807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811737
1994	NC_012580	T	6	6	121844	121849	0 %	100 %	0 %	0 %	227811737
1995	NC_012580	TGG	2	6	121885	121890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811737
1996	NC_012580	GATG	2	8	121934	121941	25 %	25 %	50 %	0 %	227811737
1997	NC_012580	TGA	2	6	122238	122243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811738
1998	NC_012580	GCA	2	6	122280	122285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811738
1999	NC_012580	AGTG	2	8	122353	122360	25 %	25 %	50 %	0 %	227811738
2000	NC_012580	GAA	2	6	122408	122413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811738

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