MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012580	TGAA	2	8	851769	851776	50 %	25 %	25 %	0 %	475645788
13502	NC_012580	GCG	2	6	851787	851792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	475645788
13503	NC_012580	ACG	2	6	851807	851812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645788
13504	NC_012580	GATTG	2	10	851882	851891	20 %	40 %	40 %	0 %	475645788
13505	NC_012580	CGC	2	6	851894	851899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	475645788
13506	NC_012580	GGT	3	9	851958	851966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645788
13507	NC_012580	CAT	2	6	852074	852079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645788
13508	NC_012580	ACG	2	6	852162	852167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645788
13509	NC_012580	GAC	2	6	852202	852207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645788
13510	NC_012580	GAC	2	6	852265	852270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645788
13511	NC_012580	TGG	2	6	852820	852825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812491
13512	NC_012580	ACA	2	6	852838	852843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812491
13513	NC_012580	GAC	2	6	852862	852867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812491
13514	NC_012580	CG	3	6	852937	852942	0 %	0 %	50 %	50 %	227812491
13515	NC_012580	ACC	2	6	852973	852978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812491
13516	NC_012580	GCT	2	6	853015	853020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812491
13517	NC_012580	CAAAGC	2	12	853092	853103	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227812491
13518	NC_012580	ACC	2	6	853147	853152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812491
13519	NC_012580	TAC	2	6	853196	853201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812491
13520	NC_012580	CACG	2	8	853251	853258	25 %	0 %	25 %	50 %	227812491
13521	NC_012580	CAC	2	6	853356	853361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812491
13522	NC_012580	GTTG	2	8	853452	853459	0 %	50 %	50 %	0 %	227812491
13523	NC_012580	CCAC	2	8	853505	853512	25 %	0 %	0 %	75 %	227812491
13524	NC_012580	GCA	2	6	853544	853549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812491
13525	NC_012580	A	6	6	853549	853554	100 %	0 %	0 %	0 %	227812491
13526	NC_012580	TTC	2	6	853555	853560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812491
13527	NC_012580	GCC	2	6	853603	853608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812491
13528	NC_012580	AAG	2	6	853673	853678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812491
13529	NC_012580	CAAG	2	8	853767	853774	50 %	0 %	25 %	25 %	227812491
13530	NC_012580	GTG	2	6	853816	853821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812491
13531	NC_012580	TTC	2	6	854114	854119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812492
13532	NC_012580	CCG	3	9	854136	854144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812492
13533	NC_012580	T	6	6	854217	854222	0 %	100 %	0 %	0 %	227812492
13534	NC_012580	TTTC	2	8	854295	854302	0 %	75 %	0 %	25 %	227812492
13535	NC_012580	TCA	2	6	854339	854344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812492
13536	NC_012580	ACCA	2	8	854362	854369	50 %	0 %	0 %	50 %	227812492
13537	NC_012580	GA	3	6	854461	854466	50 %	0 %	50 %	0 %	227812492
13538	NC_012580	CAG	2	6	854494	854499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812492
13539	NC_012580	AGAT	2	8	854612	854619	50 %	25 %	25 %	0 %	227812492
13540	NC_012580	CAA	2	6	854665	854670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812492
13541	NC_012580	AAC	2	6	854709	854714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812492
13542	NC_012580	GCA	2	6	854756	854761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812492
13543	NC_012580	CAG	2	6	854926	854931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812492
13544	NC_012580	ATC	2	6	854960	854965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812492
13545	NC_012580	AAC	2	6	855197	855202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812493
13546	NC_012580	TGG	2	6	855216	855221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812493
13547	NC_012580	GCTC	2	8	855227	855234	0 %	25 %	25 %	50 %	227812493
13548	NC_012580	TGG	3	9	855250	855258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812493
13549	NC_012580	TCA	2	6	855313	855318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812493
13550	NC_012580	TGG	2	6	855378	855383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812493
13551	NC_012580	TACT	2	8	855429	855436	25 %	50 %	0 %	25 %	227812493
13552	NC_012580	TCC	2	6	855450	855455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812493
13553	NC_012580	CTG	2	6	855503	855508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812494
13554	NC_012580	CGG	2	6	855531	855536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812494
13555	NC_012580	CTA	2	6	855581	855586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812494
13556	NC_012580	CTT	2	6	855614	855619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812494
13557	NC_012580	TGA	2	6	855753	855758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812494
13558	NC_012580	GAT	2	6	855818	855823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812494
13559	NC_012580	AGA	2	6	855841	855846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812494
13560	NC_012580	TGC	2	6	855883	855888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812494
13561	NC_012580	TCG	2	6	855913	855918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812494
13562	NC_012580	GCT	2	6	855934	855939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812494
13563	NC_012580	CAA	2	6	856070	856075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812495
13564	NC_012580	TGT	2	6	856203	856208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812495
13565	NC_012580	CAGT	2	8	856231	856238	25 %	25 %	25 %	25 %	227812495
13566	NC_012580	ACG	2	6	856253	856258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812495
13567	NC_012580	GGA	2	6	856260	856265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227812495
13568	NC_012580	CAT	2	6	856352	856357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812495
13569	NC_012580	TTCAAT	2	12	856394	856405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227812495
13570	NC_012580	CAG	2	6	856414	856419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812495
13571	NC_012580	GGCGC	2	10	856425	856434	0 %	0 %	60 %	40 %	227812495
13572	NC_012580	CCA	2	6	856449	856454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812495
13573	NC_012580	CG	3	6	856509	856514	0 %	0 %	50 %	50 %	227812495
13574	NC_012580	GCT	2	6	856525	856530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812495
13575	NC_012580	TCG	2	6	856693	856698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812495
13576	NC_012580	CAAT	2	8	856708	856715	50 %	25 %	0 %	25 %	227812495
13577	NC_012580	GCA	2	6	856771	856776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812495
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13579	NC_012580	CAC	2	6	856997	857002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812495
13580	NC_012580	CTG	2	6	857093	857098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812495
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13582	NC_012580	TGG	2	6	857139	857144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812495
13583	NC_012580	ATA	2	6	857184	857189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812495
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13585	NC_012580	GCCA	2	8	857398	857405	25 %	0 %	25 %	50 %	475645789
13586	NC_012580	TCA	2	6	857424	857429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645789
13587	NC_012580	CATG	2	8	857459	857466	25 %	25 %	25 %	25 %	475645789
13588	NC_012580	GAC	2	6	857467	857472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645789
13589	NC_012580	ATG	2	6	857494	857499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645789
13590	NC_012580	CCG	2	6	857531	857536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	475645789
13591	NC_012580	CGC	2	6	857548	857553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	475645789
13592	NC_012580	TCA	2	6	857577	857582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645789
13593	NC_012580	CGC	2	6	857607	857612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	475645789
13594	NC_012580	TGCC	2	8	857685	857692	0 %	25 %	25 %	50 %	475645789
13595	NC_012580	ATG	2	6	857717	857722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645789
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13598	NC_012580	AAT	2	6	857794	857799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	475645789
13599	NC_012580	CCA	2	6	857834	857839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	475645789
13600	NC_012580	GCA	2	6	857915	857920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645789
13601	NC_012580	TCT	2	6	857970	857975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645789
13602	NC_012580	CCG	2	6	858002	858007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	475645789
13603	NC_012580	TAA	3	9	858048	858056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	475645789
13604	NC_012580	TGC	2	6	858058	858063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645789
13605	NC_012580	ACC	2	6	858113	858118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	475645789
13606	NC_012580	TGC	2	6	858152	858157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645789
13607	NC_012580	T	6	6	858197	858202	0 %	100 %	0 %	0 %	475645789
13608	NC_012580	CAT	2	6	858228	858233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645789
13609	NC_012580	ATC	2	6	858250	858255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645789
13610	NC_012580	TCC	2	6	858507	858512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812497
13611	NC_012580	CG	3	6	858545	858550	0 %	0 %	50 %	50 %	227812497
13612	NC_012580	TCA	2	6	858607	858612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812497
13613	NC_012580	GC	3	6	858673	858678	0 %	0 %	50 %	50 %	227812497
13614	NC_012580	GC	3	6	858686	858691	0 %	0 %	50 %	50 %	227812497
13615	NC_012580	GCA	2	6	858832	858837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812497
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13617	NC_012580	CTGA	2	8	859046	859053	25 %	25 %	25 %	25 %	227812497
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13974	NC_012580	CA	3	6	884393	884398	50 %	0 %	0 %	50 %	227812527
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13980	NC_012580	TTC	2	6	885212	885217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812528
13981	NC_012580	TC	3	6	885289	885294	0 %	50 %	0 %	50 %	227812528
13982	NC_012580	CGTTT	2	10	885342	885351	0 %	60 %	20 %	20 %	227812528
13983	NC_012580	AAAC	2	8	885373	885380	75 %	0 %	0 %	25 %	227812528
13984	NC_012580	AAG	2	6	885416	885421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812528
13985	NC_012580	GTAT	2	8	885437	885444	25 %	50 %	25 %	0 %	227812528
13986	NC_012580	GAT	2	6	885457	885462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812528
13987	NC_012580	CGG	2	6	885470	885475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812528
13988	NC_012580	ACT	2	6	885515	885520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812528
13989	NC_012580	TGA	2	6	885594	885599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812528
13990	NC_012580	CGC	2	6	885621	885626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812528
13991	NC_012580	TATCTC	2	12	885646	885657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227812528
13992	NC_012580	CAGA	2	8	885770	885777	50 %	0 %	25 %	25 %	227812528
13993	NC_012580	GAT	2	6	885780	885785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812528
13994	NC_012580	GCA	2	6	885796	885801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812528
13995	NC_012580	CAA	2	6	885919	885924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812528
13996	NC_012580	GTATG	2	10	885939	885948	20 %	40 %	40 %	0 %	227812528
13997	NC_012580	TAC	2	6	885976	885981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812528
13998	NC_012580	GTGA	2	8	885991	885998	25 %	25 %	50 %	0 %	227812528
13999	NC_012580	GCA	2	6	885999	886004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812528
14000	NC_012580	TGC	2	6	886052	886057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812528

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