MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012580	GCG	2	6	822151	822156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812461
13002	NC_012580	ATCC	2	8	822168	822175	25 %	25 %	0 %	50 %	227812461
13003	NC_012580	CTG	2	6	822304	822309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812461
13004	NC_012580	AAT	2	6	822328	822333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812461
13005	NC_012580	GCC	2	6	822346	822351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812461
13006	NC_012580	CAT	2	6	822360	822365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812461
13007	NC_012580	CAG	3	9	822396	822404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812461
13008	NC_012580	ATA	2	6	822461	822466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812461
13009	NC_012580	CTT	2	6	822510	822515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812461
13010	NC_012580	ACA	2	6	822647	822652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812461
13011	NC_012580	CAA	2	6	822667	822672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812461
13012	NC_012580	TCG	2	6	822692	822697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812461
13013	NC_012580	TTA	2	6	822775	822780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812461
13014	NC_012580	G	7	7	823021	823027	0 %	0 %	100 %	0 %	227812461
13015	NC_012580	CAA	2	6	823066	823071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812461
13016	NC_012580	GAC	2	6	823075	823080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812461
13017	NC_012580	TGA	2	6	823128	823133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812461
13018	NC_012580	GAT	2	6	823186	823191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812461
13019	NC_012580	GCCGC	2	10	823220	823229	0 %	0 %	40 %	60 %	227812461
13020	NC_012580	CCA	2	6	823281	823286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812461
13021	NC_012580	AAG	2	6	823328	823333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812461
13022	NC_012580	AGA	2	6	823416	823421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812461
13023	NC_012580	CAT	2	6	823443	823448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812461
13024	NC_012580	TGC	2	6	823463	823468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812461
13025	NC_012580	TACCC	2	10	823475	823484	20 %	20 %	0 %	60 %	227812461
13026	NC_012580	AGG	2	6	823515	823520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227812461
13027	NC_012580	ATGG	2	8	823534	823541	25 %	25 %	50 %	0 %	227812461
13028	NC_012580	CAT	2	6	823593	823598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812461
13029	NC_012580	AAG	2	6	823648	823653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812461
13030	NC_012580	CCA	2	6	823697	823702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812461
13031	NC_012580	CTG	2	6	823729	823734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812461
13032	NC_012580	GCA	2	6	823740	823745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812461
13033	NC_012580	TCA	2	6	823752	823757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812461
13034	NC_012580	TTTC	2	8	823774	823781	0 %	75 %	0 %	25 %	227812461
13035	NC_012580	GAT	2	6	824206	824211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812462
13036	NC_012580	CAG	2	6	824227	824232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812462
13037	NC_012580	A	6	6	824409	824414	100 %	0 %	0 %	0 %	227812462
13038	NC_012580	GCA	2	6	824443	824448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812462
13039	NC_012580	AGC	2	6	824541	824546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812462
13040	NC_012580	CCA	2	6	824573	824578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812462
13041	NC_012580	CTTGC	2	10	824601	824610	0 %	40 %	20 %	40 %	227812462
13042	NC_012580	ATC	2	6	824654	824659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812462
13043	NC_012580	CCA	3	9	824713	824721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812462
13044	NC_012580	CTG	2	6	824783	824788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812462
13045	NC_012580	GCG	2	6	824889	824894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812462
13046	NC_012580	TTA	2	6	824896	824901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812462
13047	NC_012580	ACC	2	6	824937	824942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812462
13048	NC_012580	TGC	2	6	824943	824948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812462
13049	NC_012580	TGG	2	6	824961	824966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812462
13050	NC_012580	GCC	2	6	824974	824979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812462
13051	NC_012580	GCG	2	6	824981	824986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812462
13052	NC_012580	ATCTG	2	10	825052	825061	20 %	40 %	20 %	20 %	227812462
13053	NC_012580	CAA	2	6	825064	825069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812462
13054	NC_012580	GGC	2	6	825145	825150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812462
13055	NC_012580	TCA	2	6	825189	825194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812462
13056	NC_012580	ATC	2	6	825332	825337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812462
13057	NC_012580	TGA	2	6	825349	825354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812462
13058	NC_012580	TGA	2	6	825363	825368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812462
13059	NC_012580	AAG	2	6	825408	825413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812462
13060	NC_012580	TGC	2	6	825477	825482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812462
13061	NC_012580	TTG	2	6	825538	825543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812462
13062	NC_012580	TGC	2	6	825639	825644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812462
13063	NC_012580	CGA	2	6	825762	825767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812463
13064	NC_012580	CAGC	2	8	825780	825787	25 %	0 %	25 %	50 %	227812463
13065	NC_012580	GGC	2	6	825817	825822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812463
13066	NC_012580	AGCC	2	8	825856	825863	25 %	0 %	25 %	50 %	227812463
13067	NC_012580	TGG	2	6	825901	825906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812463
13068	NC_012580	G	6	6	825905	825910	0 %	0 %	100 %	0 %	227812463
13069	NC_012580	TG	3	6	825919	825924	0 %	50 %	50 %	0 %	227812463
13070	NC_012580	GCT	2	6	825966	825971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812463
13071	NC_012580	GGT	2	6	826191	826196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812463
13072	NC_012580	TGC	2	6	826247	826252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812463
13073	NC_012580	CAC	2	6	826320	826325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812463
13074	NC_012580	AAC	2	6	826334	826339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812463
13075	NC_012580	CGC	2	6	826404	826409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812463
13076	NC_012580	GTG	2	6	826520	826525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812464
13077	NC_012580	CA	3	6	826527	826532	50 %	0 %	0 %	50 %	227812464
13078	NC_012580	TTG	2	6	826590	826595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812464
13079	NC_012580	TGA	2	6	826678	826683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812464
13080	NC_012580	CAT	3	9	826723	826731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812464
13081	NC_012580	TGG	2	6	826735	826740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812464
13082	NC_012580	CCG	2	6	826765	826770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812464
13083	NC_012580	TGG	2	6	826822	826827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812464
13084	NC_012580	GAA	2	6	826829	826834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812464
13085	NC_012580	TGGG	2	8	826952	826959	0 %	25 %	75 %	0 %	227812464
13086	NC_012580	AAGATG	2	12	827163	827174	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227812464
13087	NC_012580	GTTG	2	8	827182	827189	0 %	50 %	50 %	0 %	227812464
13088	NC_012580	AGA	2	6	827190	827195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812464
13089	NC_012580	CTG	2	6	827205	827210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812464
13090	NC_012580	TC	3	6	827292	827297	0 %	50 %	0 %	50 %	227812464
13091	NC_012580	ACAA	2	8	827376	827383	75 %	0 %	0 %	25 %	227812464
13092	NC_012580	GCT	2	6	827410	827415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812464
13093	NC_012580	ATC	2	6	827426	827431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812464
13094	NC_012580	GTG	2	6	827520	827525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812464
13095	NC_012580	ATC	2	6	827531	827536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812464
13096	NC_012580	CCTT	2	8	827715	827722	0 %	50 %	0 %	50 %	227812464
13097	NC_012580	CTG	2	6	827756	827761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812464
13098	NC_012580	ATCG	2	8	827804	827811	25 %	25 %	25 %	25 %	227812464
13099	NC_012580	GTG	2	6	827817	827822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812464
13100	NC_012580	TTC	2	6	827825	827830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812464
13101	NC_012580	CTA	2	6	827868	827873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812464
13102	NC_012580	ACG	2	6	827877	827882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812464
13103	NC_012580	CGA	2	6	828038	828043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812465
13104	NC_012580	CAA	2	6	828051	828056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812465
13105	NC_012580	CAA	2	6	828139	828144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812465
13106	NC_012580	AAG	2	6	828152	828157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812465
13107	NC_012580	TGCTT	2	10	828444	828453	0 %	60 %	20 %	20 %	227812466
13108	NC_012580	CAA	2	6	828464	828469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812466
13109	NC_012580	CAA	2	6	828481	828486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812466
13110	NC_012580	ACT	2	6	828516	828521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812466
13111	NC_012580	TGC	2	6	828522	828527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812466
13112	NC_012580	GTG	2	6	828622	828627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812466
13113	NC_012580	TGCGC	2	10	828678	828687	0 %	20 %	40 %	40 %	227812466
13114	NC_012580	TC	3	6	828737	828742	0 %	50 %	0 %	50 %	227812466
13115	NC_012580	ACT	3	9	828755	828763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812466
13116	NC_012580	ATGG	2	8	829065	829072	25 %	25 %	50 %	0 %	227812466
13117	NC_012580	ACAG	2	8	829084	829091	50 %	0 %	25 %	25 %	227812466
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13240	NC_012580	CTT	2	6	835562	835567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812472
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13243	NC_012580	CGC	2	6	835653	835658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812472
13244	NC_012580	TTG	2	6	835677	835682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812472
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13248	NC_012580	TAAGG	2	10	835854	835863	40 %	20 %	40 %	0 %	227812472
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13252	NC_012580	CTG	2	6	836031	836036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812472
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13354	NC_012580	TTGG	2	8	842593	842600	0 %	50 %	50 %	0 %	227812480
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13357	NC_012580	GCCT	2	8	842741	842748	0 %	25 %	25 %	50 %	227812480
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13479	NC_012580	AAGCCA	2	12	850496	850507	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	475645788
13480	NC_012580	GCT	2	6	850550	850555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645788
13481	NC_012580	ACTTT	2	10	850568	850577	20 %	60 %	0 %	20 %	475645788
13482	NC_012580	TCTT	2	8	850708	850715	0 %	75 %	0 %	25 %	475645788
13483	NC_012580	GCACC	2	10	850733	850742	20 %	0 %	20 %	60 %	475645788
13484	NC_012580	TGA	2	6	850753	850758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645788
13485	NC_012580	AGC	2	6	850786	850791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645788
13486	NC_012580	CA	4	8	850826	850833	50 %	0 %	0 %	50 %	475645788
13487	NC_012580	GGGTT	2	10	850917	850926	0 %	40 %	60 %	0 %	475645788
13488	NC_012580	T	7	7	850956	850962	0 %	100 %	0 %	0 %	475645788
13489	NC_012580	TGA	2	6	851014	851019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645788
13490	NC_012580	CAT	2	6	851030	851035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645788
13491	NC_012580	CTGC	2	8	851092	851099	0 %	25 %	25 %	50 %	475645788
13492	NC_012580	AGC	2	6	851104	851109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645788
13493	NC_012580	TGC	2	6	851158	851163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645788
13494	NC_012580	CGCC	2	8	851215	851222	0 %	0 %	25 %	75 %	475645788
13495	NC_012580	GTA	2	6	851283	851288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645788
13496	NC_012580	TGGC	2	8	851437	851444	0 %	25 %	50 %	25 %	475645788
13497	NC_012580	CTT	2	6	851462	851467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645788
13498	NC_012580	TTGG	2	8	851602	851609	0 %	50 %	50 %	0 %	475645788
13499	NC_012580	CTTCA	2	10	851625	851634	20 %	40 %	0 %	40 %	475645788
13500	NC_012580	GATACG	2	12	851691	851702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	475645788

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