MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_012580	TGC	2	6	604754	604759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812259
9503	NC_012580	AATCGA	2	12	604823	604834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227812259
9504	NC_012580	ATGGCG	2	12	604866	604877	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227812259
9505	NC_012580	TCA	2	6	604924	604929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812259
9506	NC_012580	AAT	2	6	604970	604975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812259
9507	NC_012580	CTG	2	6	605006	605011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812259
9508	NC_012580	AAT	2	6	605045	605050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812259
9509	NC_012580	GCA	2	6	605091	605096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812259
9510	NC_012580	CGT	2	6	605155	605160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812259
9511	NC_012580	CGCT	2	8	605182	605189	0 %	25 %	25 %	50 %	227812259
9512	NC_012580	CAA	2	6	605243	605248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812259
9513	NC_012580	GATC	2	8	605263	605270	25 %	25 %	25 %	25 %	227812259
9514	NC_012580	CCA	2	6	605293	605298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812259
9515	NC_012580	CAG	2	6	605374	605379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812259
9516	NC_012580	CTT	2	6	605407	605412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812259
9517	NC_012580	CCG	2	6	605517	605522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812259
9518	NC_012580	CAA	2	6	605582	605587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812259
9519	NC_012580	AAT	2	6	605594	605599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812259
9520	NC_012580	CGGA	2	8	605618	605625	25 %	0 %	50 %	25 %	227812259
9521	NC_012580	ACG	2	6	605669	605674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812260
9522	NC_012580	CCAAA	2	10	605687	605696	60 %	0 %	0 %	40 %	227812260
9523	NC_012580	CAAAG	2	10	605762	605771	60 %	0 %	20 %	20 %	227812260
9524	NC_012580	TGG	2	6	605821	605826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812260
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9526	NC_012580	CAA	2	6	606050	606055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812260
9527	NC_012580	ACCCA	2	10	606069	606078	40 %	0 %	0 %	60 %	227812260
9528	NC_012580	GCG	2	6	606080	606085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812260
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9532	NC_012580	CAA	2	6	606193	606198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812260
9533	NC_012580	GCT	2	6	606244	606249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812260
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9539	NC_012580	TCG	2	6	606579	606584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812260
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9541	NC_012580	TTC	2	6	606651	606656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812260
9542	NC_012580	TTC	2	6	606743	606748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812260
9543	NC_012580	TCG	2	6	606784	606789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812260
9544	NC_012580	ATTT	2	8	606805	606812	25 %	75 %	0 %	0 %	227812260
9545	NC_012580	TGT	2	6	606813	606818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812260
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9548	NC_012580	CATC	2	8	607003	607010	25 %	25 %	0 %	50 %	227812260
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9553	NC_012580	TTG	2	6	607250	607255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812260
9554	NC_012580	GTT	2	6	607360	607365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812260
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9558	NC_012580	TACA	2	8	607585	607592	50 %	25 %	0 %	25 %	227812261
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9589	NC_012580	TC	3	6	609781	609786	0 %	50 %	0 %	50 %	227812264
9590	NC_012580	TTTA	2	8	609788	609795	25 %	75 %	0 %	0 %	227812264
9591	NC_012580	A	6	6	609921	609926	100 %	0 %	0 %	0 %	227812264
9592	NC_012580	CAAC	2	8	609934	609941	50 %	0 %	0 %	50 %	227812264
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9988	NC_012580	TGCCGT	2	12	633600	633611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812283
9989	NC_012580	ATT	2	6	633628	633633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812283
9990	NC_012580	AAC	2	6	633785	633790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812284
9991	NC_012580	TCA	2	6	633798	633803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812284
9992	NC_012580	GCCGTT	2	12	633830	633841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812284
9993	NC_012580	ATC	2	6	633917	633922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812284
9994	NC_012580	CAT	2	6	633940	633945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812284
9995	NC_012580	AAT	2	6	633998	634003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812284
9996	NC_012580	CTTTGC	2	12	634018	634029	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227812284
9997	NC_012580	TGGCA	2	10	634030	634039	20 %	20 %	40 %	20 %	227812284
9998	NC_012580	GA	5	10	634058	634067	50 %	0 %	50 %	0 %	227812284
9999	NC_012580	TGG	2	6	634147	634152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812284
10000	NC_012580	GATT	2	8	634156	634163	25 %	50 %	25 %	0 %	227812284

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